Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14783
- Subject:
- XM_011245520.1
- Aligned Length:
- 993
- Identities:
- 791
- Gaps:
- 96
Alignment
Query 1 ATGGAGACGGTCATTTCTTCAGATAGCTCCCCAGCTGTGGAAAATGAGCATCCTCAAGAGACCCCAGAATCCAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CAATAGCGTGTATACTTCCTTCATGAAGTCTCATCGCTGCTATGACCTGATTCCCACAAGCTCCAAATTGGTTG 148
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1 ----------------------ATGAAGTCTCATCGCTGCTATGACCTAATTCCCACAAGTTCCAAGTTGGTGG 52
Query 149 TATTTGATACGTCCCTGCAGGTGAAGAAAGCTTTTTTTGCTTTGGTGACTAACGGTGTACGAGCTGCCCCTTTA 222
|||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||||||||..|||||||.||.|||||.||.||.||||||||.
Sbjct 53 TATTTGACACTTCGCTACAGGTAAAGAAAGCCTTTTTTGCCCTGGTGACCAATGGTGTTCGTGCCGCCCCTTTG 126
Query 223 TGGGATAGTAAGAAGCAAAGTTTTGTGGGCATGCTGACCATCACTGATTTCATCAATATCCTGCACCGCTACTA 296
|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||..|||||||.|||||
Sbjct 127 TGGGACAGTAAGAAGCAGAGTTTTGTGGGCATGCTGACCATCACCGACTTCATCAACATTTTGCACCGATACTA 200
Query 297 TAAATCAGCCTTGGTACAGATCTATGAGCTAGAAGAACACAAGATAGAAACTTGGAGAGAGGTGTATCTCCAGG 370
|||.||||||.||||.||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 201 TAAGTCAGCCCTGGTGCAGATCTACGAACTGGAGGAGCACAAGATAGAGACGTGGAGAGAGGTGTACCTGCAGG 274
Query 371 ACTCCTTTAAACCGCTTGTCTGCATTTCTCCTAATGCCAGCTTGTTTGATGCTGTCTCTTCATTAATTCGGAAC 444
||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 275 ACTCCTTTAAGCCACTTGTCTGCATCTCTCCAAATGCCAGCTTGTTTGATGCTGTCTCTTCATTAATTCGAAAT 348
Query 445 AAGATCCACAGGCTGCCAGTTATTGACCCAGAATCAGGCAATACTTTGTACATCCTCACCCACAAGCGCATTCT 518
||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.||
Sbjct 349 AAGATCCACAGGCTCCCAGTTATCGACCCAGAGTCAGGCAACACCTTGTACATCCTTACTCACAAGCGGATCCT 422
Query 519 GAAGTTCCTCAAATTGTTTATCACTGAGTTCCCCAAGCCAGAGTTCATGTCCAAGTCTCTGGAAGAGCTACAGA 592
.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||..|||||||.||||
Sbjct 423 CAAGTTCCTCAAGTTGTTTATCACCGAGTTCCCCAAGCCGGAATTCATGTCTAAGTCTCTCCAAGAGCTGCAGA 496
Query 593 TTGGCACCTATGCCAATATTGCTATGGTTCGCACTACCACCCCCGTCTATGTGGCTCTGGGGATTTTTGTACAG 666
||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 497 TTGGCACCTATGCCAATATTGCCATGGTCCGTACTACCACGCCTGTCTACGTGGCTCTGGGCATCTTTGTACAG 570
Query 667 CATCGAGTCTCAGCCCTGCCAGTGGTGGATGAGAAGGGGCGTGTGGTGGACATCTACTCCAAGTTTGATGTTAT 740
||.||||||||.|||.|.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 571 CACCGAGTCTCCGCCTTACCTGTAGTGGATGAGAAAGGGCGTGTGGTGGACATCTACTCCAAGTTTGATGTGAT 644
Query 741 CAATCTGGCAGCAGAAAAGACCTACAACAACCTAGATGTATCTGTGACTAAAGCCTTGCAACATCGATCACATT 814
||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||.|||||.||.||.|
Sbjct 645 CAATTTGGCAGCCGAAAAGACCTACAACAACCTAGATGTGTCTGTGACAAAAGCCCTGCAGCATCGGTCCCACT 718
Query 815 ACTTTGAGGGTGTTCTCAAGTGCTACCTGCATGAGACTCTGGAGACCATCATCAACAGGCTAGTGGAAGCAGAG 888
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 719 ACTTTGAGGGTGTTCTCAAATGCTACCTGCATGAGACTCTGGAAACCATCATCAATAGGCTGGTGGAGGCAGAG 792
Query 889 GTTCACCGACTTGTAGTGGTGGATGAAAATGATGTGGTCAAGGGAATTGTATCACTGTCTGACATCCTGCAGGC 962
||||||||.||.||.||||||||||||.|.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||.|.|||||
Sbjct 793 GTTCACCGTCTGGTGGTGGTGGATGAACACGACGTGGTCAAGGGCATCGTTTCGCTGTCTGACATCTTACAGGC 866
Query 963 CCTGGTGCTCACAGGTGGAGAGAAGAAGCCC 993
.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 867 TCTGGTGCTCACGGGTGGAGAGAAGAAGCCC 897