Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14800
- Subject:
- NM_001109891.1
- Aligned Length:
- 1139
- Identities:
- 1003
- Gaps:
- 134
Alignment
Query 1 ATGGCGGCGGCGGCGGCTCAGGGGGGCGGGGGCGGGGAGCCCCGTAGAACCGAGGGGGTCGGCCCGGGGGTCCC 74
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Sbjct 1 ATGGCGGCGGCGGCGGCTCAGGGGGGCGGGGGCGGGGAGCCCCGTAGAACCGAGGGGGTCGGCCCGGGGGTCCC 74
Query 75 GGGGGAGGTGGAGATGGTGAAGGGGCAGCCGTTCGACGTGGGCCCGCGCTACACGCAGTTGCAGTACATCGGCG 148
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Sbjct 75 GGGGGAGGTGGAGATGGTGAAGGGGCAGCCGTTCGACGTGGGCCCGCGCTACACGCAGTTGCAGTACATCGGCG 148
Query 149 AGGGCGCGTACGGCATGGTCAGCTCGGCCTATGACCACGTGCGCAAGACTCGCGTGGCCATCAAGAAGATCAGC 222
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Sbjct 149 AGGGCGCGTACGGCATGGTCAGCTCGGCCTATGACCACGTGCGCAAGACTCGCGTGGCCATCAAGAAGATCAGC 222
Query 223 CCCTTCGAACATCAGACCTACTGCCAGCGCACGCTCCGGGAGATCCAGATCCTGCTGCGCTTCCGCCATGAGAA 296
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Sbjct 223 CCCTTCGAACATCAGACCTACTGCCAGCGCACGCTCCGGGAGATCCAGATCCTGCTGCGCTTCCGCCATGAGAA 296
Query 297 TGTCATCGGCATCCGAGACATTCTGCGGGCGTCCACCCTGGAAGCCATGAGAGATGTCTACATTGTGCAGGACC 370
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Sbjct 297 TGTCATCGGCATCCGAGACATTCTGCGGGCGTCCACCCTGGAAGCCATGAGAGATGTCTACATTGTGCAGGACC 370
Query 371 TGATGGAGACTGACCTGTACAAGTTGCTGAAAAGGCCAGCAGCTGAGCAATGACCATAATCTGCTACTTCCTCT 444
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Sbjct 371 TGATGGAGACTGACCTGTACAAGTTGCTGAAAA-GCCAGCAGCTGAGCAATGACCAT-ATCTGCTACTTCCTCT 442
Query 445 ACCAGATCCTGCGGGGCCTCAAGTACATCCACTCCGCCAACGTGCTCCACCGAGATCTAAAGCCCTCCAACCTG 518
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Sbjct 443 ACCAGATCCTGCGGGGCCTCAAGTACATCCACTCCGCCAACGTGCTCCACCGAGATCTAAAGCCCTCCAACCTG 516
Query 519 CTCATCAACACCACNTGCGACNTTAAGATTTGTGATTTCGGCCTGGCCCGGATTGCCGATCCTGAGCATGACCA 592
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Sbjct 517 CTCATCAACACCACCTGCGACCTTAAGATTTGTGATTTCGGCCTGGCCCGGATTGCCGATCCTGAGCATGACCA 590
Query 593 CACCGGCTTCCTGACGGAGTATGTGGCTACGCGCTGGTACCGGGCCCCAGAGATCATGCTGAACTCCAAGGGCT 666
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Sbjct 591 CACCGGCTTCCTGACGGAGTATGTGGCTACGCGCTGGTACCGGGCCCCAGAGATCATGCTGAACTCCAAGGGCT 664
Query 667 ATACCAAGTCCATCGACATCTGGTCTGTGGGCTGCATTCTGGCTGAGATGCTCTCTAACCGGCCCATCTTCCCT 740
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Sbjct 665 ATACCAAGTCCATCGACATCTGGTCTGTGGGCTGCATTCTGGCTGAGATGCTCTCTAACCGGCCCATCTTCCCT 738
Query 741 GGCAAGCACTACCTGGATCAGCTCAACCACATTCTGGGCATCCTGGGCTCCCCATCCCAGGAGGACCTGAATTG 814
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Sbjct 739 GGCAAGCACTACCTGGATCAGCTCAACCACATTCTG-------------------------------------- 774
Query 815 TATCATCAACATGAAGGCCCGAAACTACCTACAGTCTCTGCCCTCCAAGACCAAGGTGGCTTGGGCCAAGCTTT 888
Sbjct 775 -------------------------------------------------------------------------- 774
Query 889 TCCCCAAGTCAGACTCCAAAGCCCTTGACCTGCTGGACCGGATGTTAACCTTTAACCCCAATAAACGGATCACA 962
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Sbjct 775 --------------------GCCCTTGACCTGCTGGACCGGATGTTAACCTTTAACCCCAATAAACGGATCACA 828
Query 963 GTGGAGGAAGCGCTGGCTCACCCCTACCTGGAGCAGTACTATGACCCGACGGATGAGCCAGTGGCCGAGGAGCC 1036
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Sbjct 829 GTGGAGGAAGCGCTGGCTCACCCCTACCTGGAGCAGTACTATGACCCGACGGATGAGCCAGTGGCCGAGGAGCC 902
Query 1037 CTTCACCTTCGCCATGGAGCTGGATGACCTACCTAAGGAGCGGCTGAAGGAGCTCATCTTCCAGGAGACAGCAC 1110
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Sbjct 903 CTTCACCTTCGCCATGGAGCTGGATGACCTACCTAAGGAGCGGCTGAAGGAGCTCATCTTCCAGGAGACAGCAC 976
Query 1111 GCTTCCAGCCCGGAGTGCTGGAGGCCCCC 1139
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Sbjct 977 GCTTCCAGCCCGGAGTGCTGGAGGCCCCC 1005