Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14800
- Subject:
- NM_011952.2
- Aligned Length:
- 1142
- Identities:
- 1024
- Gaps:
- 5
Alignment
Query 1 AT---GGCGGCGGCGGCGGCTCAGGGGGGCGGGGGCGGGGAGCCCCGTAGAACCGAGGGGGTCGGCCCGGGGGT 71
|| |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|..||||.|..|||||||.|||||.|||
Sbjct 1 ATGGCGGCGGCGGCGGCGGCTCCGGGGGGCGGGGGCGGGGAGCCCAGGGGAACTGCTGGGGTCGTCCCGGTGGT 74
Query 72 CCCGGGGGAGGTGGAGATGGTGAAGGGGCAGCCGTTCGACGTGGGCCCGCGCTACACGCAGTTGCAGTACATCG 145
|||.||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 75 CCCCGGGGAGGTGGAGGTGGTGAAGGGGCAGCCATTCGATGTGGGCCCACGCTACACGCAGCTGCAGTACATCG 148
Query 146 GCGAGGGCGCGTACGGCATGGTCAGCTCGGCCTATGACCACGTGCGCAAGACTCGCGTGGCCATCAAGAAGATC 219
||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCGAGGGCGCGTACGGCATGGTCAGCTCAGCTTATGACCACGTGCGCAAGACCAGAGTGGCCATCAAGAAGATC 222
Query 220 AGCCCCTTCGAACATCAGACCTACTGCCAGCGCACGCTCCGGGAGATCCAGATCCTGCTGCGCTTCCGCCATGA 293
||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||..||||||||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 223 AGCCCCTTTGAGCATCAAACCTACTGTCAGCGCACGCTGAGGGAGATCCAGATCTTGCTGCGATTCCGCCATGA 296
Query 294 GAATGTCATCGGCATCCGAGACATTCTGCGGGCGTCCACCCTGGAAGCCATGAGAGATGTCTACATTGTGCAGG 367
||||||.||.||||||||||||||.||..|.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 297 GAATGTTATAGGCATCCGAGACATCCTCAGAGCGCCCACCCTGGAAGCCATGAGAGATGTTTACATTGTTCAGG 370
Query 368 ACCTGATGGAGACTGACCTGTACAAGTTGCTGAAAAGGCCAGCAGCTGAGCAATGACCATAATCTGCTACTTCC 441
||||.||||||||.||||||||||||.||||.|||| |||||||||||||||||||||| .|||||||||||||
Sbjct 371 ACCTCATGGAGACAGACCTGTACAAGCTGCTTAAAA-GCCAGCAGCTGAGCAATGACCA-CATCTGCTACTTCC 442
Query 442 TCTACCAGATCCTGCGGGGCCTCAAGTACATCCACTCCGCCAACGTGCTCCACCGAGATCTAAAGCCCTCCAAC 515
|||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||.
Sbjct 443 TCTACCAGATCCTCCGGGGCCTCAAGTATATACACTCAGCCAATGTGCTGCACCGGGACCTGAAGCCTTCCAAT 516
Query 516 CTGCTCATCAACACCACNTGCGACNTTAAGATTTGTGATTTCGGCCTGGCCCGGATTGCCGATCCTGAGCATGA 589
|||||.|||||||||||.||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 517 CTGCTTATCAACACCACCTGCGACCTTAAGATCTGTGATTTTGGCCTGGCCCGGATTGCTGACCCTGAGCACGA 590
Query 590 CCACACCGGCTTCCTGACGGAGTATGTGGCTACGCGCTGGTACCGGGCCCCAGAGATCATGCTGAACTCCAAGG 663
||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 591 CCACACTGGCTTTCTGACGGAGTATGTGGCCACACGCTGGTACCGAGCCCCAGAGATCATGCTTAATTCCAAGG 664
Query 664 GCTATACCAAGTCCATCGACATCTGGTCTGTGGGCTGCATTCTGGCTGAGATGCTCTCTAACCGGCCCATCTTC 737
||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 665 GCTACACCAAATCCATCGACATCTGGTCTGTGGGCTGCATTCTGGCTGAGATGCTCTCCAACCGGCCCATCTTC 738
Query 738 CCTGGCAAGCACTACCTGGATCAGCTCAACCACATTCTGGGCATCCTGGGCTCCCCATCCCAGGAGGACCTGAA 811
||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||.||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 739 CCCGGCAAGCACTACCTGGACCAGCTCAACCACATTCTAGGTATCTTGGGTTCCCCATCCCAGGAGGACCTTAA 812
Query 812 TTGTATCATCAACATGAAGGCCCGAAACTACCTACAGTCTCTGCCCTCCAAGACCAAGGTGGCTTGGGCCAAGC 885
|||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 TTGCATCATTAACATGAAGGCCCGAAACTACCTGCAGTCTCTGCCCTCGAAAACCAAGGTGGCTTGGGCCAAGC 886
Query 886 TTTTCCCCAAGTCAGACTCCAAAGCCCTTGACCTGCTGGACCGGATGTTAACCTTTAACCCCAATAAACGGATC 959
|.||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct 887 TCTTTCCTAAATCTGACTCCAAAGCTCTTGACCTGCTGGACCGGATGTTAACCTTCAACCCAAACAAGCGCATC 960
Query 960 ACAGTGGAGGAAGCGCTGGCTCACCCCTACCTGGAGCAGTACTATGACCCGACGGATGAGCCAGTGGCCGAGGA 1033
|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 961 ACAGTAGAGGAAGCGCTGGCTCACCCTTACCTGGAACAGTACTACGATCCGACAGATGAGCCAGTGGCCGAGGA 1034
Query 1034 GCCCTTCACCTTCGCCATGGAGCTGGATGACCTACCTAAGGAGCGGCTGAAGGAGCTCATCTTCCAGGAGACAG 1107
|||.||||||||||.||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct 1035 GCCATTCACCTTCGACATGGAGCTGGATGACCTCCCCAAGGAGCGGCTGAAGGAGTTGATCTTCCAGGAGACAG 1108
Query 1108 CACGCTTCCAGCCCGGAGTGCTGGAGGCCCCC 1139
|.|||||||||||.||.|.||..||||.||||
Sbjct 1109 CCCGCTTCCAGCCAGGGGCGCCAGAGGGCCCC 1140