Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14805
• Subject: NM_001310683.1
• Aligned Length: 1278
• Identities: 869
• Gaps: 321

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGCAAAAGCAAGGTGGACAACCAGTTCTACAGTGTGGAAGTGGGGGACTCAACCTTCACCGTTCTTAAGCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTACCAGAACCTGAAGCCAATTGGCTCTGGGGCTCAGGGAATAGTCTGTGCTGCGTACGACGCTGTCCTTGACA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTTCCAGAACCAAACTCACGCCAAGAGGGCTTACCGGGAGCTG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTATTAGCTTATTAAATGTTTTTACACCCCAGAAAACACTGGA  296

Query    1  -------------------------ATGGAACTGATGGATGCCAACTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAG  49
                                     ||||||||||||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||..|.|
Sbjct  297  GGAGTTCCAAGATGTCTACTTAGTGATGGAACTGATGGACGCCAACCTGTGTCAGGTGATTCAGATGGAGCTGG  370

Query   50  ACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAATGTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATT  123
            ||||.|||||.|||||||||.||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.
Sbjct  371  ACCACGAGCGGATGTCTTACTTGCTGTACCAGATGCTGTGTGGCATCAAGCACCTCCACTCCGCTGGGATCATC  444

Query  124  CACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCAAGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGC  197
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  445  CACAGGGACTTAAAACCCAGTAACATTGTAGTCAAGTCTGATTGCACACTGAAAATCCTCGACTTCGGACTGGC  518

Query  198  CAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCATATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCC  271
            |||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGGACAGCGGGTACAAGCTTCATGATGACTCCGTATGTGGTGACGCGATATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCC  592

Query  272  TGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTGGATATATGGTCTGTGGGATGCATTATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAA  345
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGGCATGGGCTACAAGGAGAACGTGGACATATGGTCTGTGGGATGCATCATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAA  666

Query  346  ATCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATTGACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAGA  419
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.||.||||||||
Sbjct  667  ATCCTCTTTCCCGGAAGGGACTATATTGACCAGTGGAACAAAGTCATCGAGCAGCTAGGAACTCCGTGTCCAGA  740

Query  420  ATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGTAAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTCC  493
            .|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  741  GTTCATGAAGAAATTGCAGCCCACAGTCAGAAACTACGTGGAGAATCGGCCCAAGTACGCAGGACTCACCTTCC  814

Query  494  CCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGAC  567
            ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  815  CCAAGCTCTTTCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGATTCTGAGCACAATAAACTTAAAGCCAGCCAAGCCAGGGAT  888

Query  568  TTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGACCCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACAT  641
            ||||||||.||||||.||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||..|.||||||||.|||||
Sbjct  889  TTGTTGTCTAAGATGTTAGTGATTGACCCAGCGAAGAGGATATCGGTGGACGACGCACTGCAGCATCCGTACAT  962

Query  642  CAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGTGGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGAG  715
            ||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||.|
Sbjct  963  CAACGTTTGGTACGACCCGGCTGAAGTGGAGGCGCCTCCGCCTCAGATATATGATAAGCAGCTGGATGAAAGGG  1036

Query  716  AACACACAATTGAAGAATGGAAAGAACTTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGGT  789
            |.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1037  AGCACACCATCGAAGAATGGAAAGAACTTATCTACAAGGAGGTAATGAACTCAGAAGAGAAGACTAAGAATGGC  1110

Query  790  GTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCAGGTGCAGCAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCTCGTCTGT  863
            |||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTAGTCAAAGGCCAGCCCTCGCCTTCAGGTGCAGCAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCTCGTCTGT  1184

Query  864  CAATGACATCTCCTCCATGTCCACCGACCAGACCCTGGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAAGCCTCGGCAG  937
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1185  CAACGACATCTCCTCCATGTCCACCGACCAGACCCTCGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAGGCCTCGGCGG  1258

Query  938  GACCCCTGGGTTGTTGCAGG  957
            ||||..||||||||||||||
Sbjct 1259  GACCGTTGGGTTGTTGCAGG  1278