Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14811
• Subject: NM_001291777.1
• Aligned Length: 1377
• Identities: 1133
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGTCCTCCCTGGAACAGAAGCTGTCCCGCCTGGAAGCAAAGCTAAAGCAGGAGAACCGGGAGGCCCG  74
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCGTCCTCCCTGGAGCAGAAGCTGTCCCGCCTGGAAGCCAAGCTGAAGCAGGAGAACCGTGAGGCCCG  74

Query   75  GCGGAGGATCGACCTCAACCTGGATATCAGCCCCCAGCGGCCCAGGCCCACCCTGCAGCTCCCGCTGGCCAACG  148
            ..|||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct   75  CAGGAGGATCGACCTCAACTTGGATATCAGCCCACAGCGGCCCAGGCCCACCCTGCAACTCCCACTGGCCAACG  148

Query  149  ATGGGGGCAGCCGCTCGCCATCCTCAGAGAGCTCCCCGCAGCACCCCACGCCCCCCGCCCGGCCCCGCCACATG  222
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGGGGGCAGCCGCTCACCATCCTCAGAGAGCTCCCCACAGCACCCTACACCCCCCACCCGGCCCCGCCACATG  222

Query  223  CTGGGGCTCCCGTCAACCCTGTTCACACCCCGCAGCATGGAGAGCATTGAGATTGACCAGAAGCTGCAGGAGAT  296
            |||||||||||.||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGGGGCTCCCATCAACCTTGTTCACACCGCGCAGTATGGAGAGCATCGAGATTGACCAGAAGCTGCAGGAGAT  296

Query  297  CATGAAGCAGACGGGCTACCTGACCATCGGGGGCCAGCGCTACCAGGCAGAAATCAACGACCTGGAGAACTTGG  370
            ||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||||||
Sbjct  297  CATGAAGCAGACAGGGTACCTGACTATCGGGGGCCAGCGTTATCAGGCAGAAATCAATGACTTGGAGAACTTGG  370

Query  371  GCGAGATGGGCAGCGGCACCTGCGGCCAGGTGTGGAAGATGCGCTTCCGGAAGACCGGCCACGTCATTGCCGTT  444
            |.|||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||.|||
Sbjct  371  GTGAGATGGGCAGTGGTACCTGTGGTCAGGTGTGGAAGATGCGGTTCCGGAAGACAGGCCACATCATTGCTGTT  444

Query  445  AAGCAAATGCGGCGCTCCGGGAACAAGGAGGAGAACAAGCGCATCCTCATGGACCTGGATGTGGTGCTGAAGAG  518
            |||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||..|.||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct  445  AAGCAAATGCGGCGCTCTGGGAACAAGGAAGAGAATAAGCGCATTTTGATGGACCTGGATGTAGTACTCAAGAG  518

Query  519  CCACGACTGCCCCTACATCGTGCAGTGCTTTGGGACGTTCATCACCAACACGGATGTCTTCATCGCCATGGAGC  592
            |||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  519  CCATGACTGCCCTTACATCGTTCAGTGCTTTGGCACCTTCATCACCAACACAGACGTCTTTATTGCCATGGAGC  592

Query  593  TCATGGGCACCTGCGCTGAGAAGCTCAAGAAGCGGATGCAGGGCCCCATCCCCGAGCGCATTCTGGGCAAGATG  666
            ||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  593  TCATGGGCACATGTGCAGAGAAGCTGAAGAAACGAATGCAGGGCCCCATTCCAGAGCGAATCCTGGGCAAGATG  666

Query  667  ACAGTGGCGATTGTGAAGGCGCTGTACTACCTGAAGGAGAAGCACGGTGTCATCCACCGCGACGTCAAGCCCTC  740
            ||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  667  ACTGTGGCGATTGTGAAAGCACTGTACTATCTGAAGGAGAAGCATGGCGTCATCCATCGCGATGTCAAACCCTC  740

Query  741  CAACATCCTGCTGGACGAGCGGGGCCAGATCAAGCTCTGCGACTTCGGCATCAGCGGCCGCCTGGTGGACTCCA  814
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  741  CAACATCCTGCTAGATGAGCGGGGCCAGATCAAGCTCTGTGACTTTGGCATCAGTGGCCGCCTTGTTGACTCCA  814

Query  815  AAGCCAAGACGCGGAGCGCCGGCTGTGCCGCCTACATGGCACCCGAGCGCATTGACCCCCCAGACCCCACCAAG  888
            |||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct  815  AAGCCAAAACACGGAGTGCTGGCTGTGCTGCCTATATGGCTCCCGAGCGCATCGACCCTCCAGATCCCACCAAG  888

Query  889  CCGGACTATGACATCCGGGCCGACGTATGGAGCCTGGGCATCTCGTTGCCCTGCCCGTCTCCCTCCCAGGTGGA  962
            ||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||                     |||.|.||||||
Sbjct  889  CCTGACTATGACATCCGAGCTGATGTGTGGAGCCTGGGCAT---------------------CTCACTGGTGGA  941

Query  963  GCTGGCAACAGGACAGTTTCCCTACAAGAACTGCAAGACGGACTTTGAGGTCCTCACCAAAGTCCTACAGGAAG  1036
            ||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  GCTGGCAACAGGACAGTTCCCCTATAAGAACTGCAAGACGGACTTTGAGGTCCTCACCAAAGTCCTACAGGAAG  1015

Query 1037  AGCCCCCGCTTCTGCCCGGACACATGGGCTTCTCGGGGGACTTCCAGTCCTTCGTCAAAGACTGCCTTACTAAA  1110
            |||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1016  AGCCCCCACTCCTGCCTGGTCACATGGGCTTCTCAGGGGACTTCCAGTCATTTGTCAAAGACTGCCTTACTAAA  1089

Query 1111  GATCACAGGAAGAGACCAAAGTATAATAAGCTACTTGAACACAGCTTCATCAAGCGCTACGAGACGCTGGAGGT  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||..||.|||||
Sbjct 1090  GATCACAGGAAGAGACCAAAGTATAATAAGCTACTTGAACACAGCTTCATCAAGCACTATGAGATACTCGAGGT  1163

Query 1185  GGACGTGGCGTCCTGGTTCAAGGATGTCATGGCGAAGACTGAGTCACCGCGGACTAGCGGCGTCCTGAGCCAGC  1258
            |||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||..|||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 1164  GGATGTCGCGTCCTGGTTTAAGGATGTCATGGCGAAGACCGAGTCCCCAAGGACTAGTGGAGTCCTGAGTCAGC  1237

Query 1259  CCCACCTGCCCTTCTTCAGG------------------------------------------------------  1278
            .|||.||||||||||||||.                                                      
Sbjct 1238  ACCATCTGCCCTTCTTCAGTGGGAGTCTGGAGGAGTCTCCCACTTCCCCACCTTCTCCCAAGTCCTTCCCTCTG  1311

Query 1279  ---------------------------------------------  1278
                                                         
Sbjct 1312  TCACCAGCCATCCCTCAGGCCCAGGCAGAGTGGGTCTCGGGCAGG  1356