Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14833
• Subject: XM_006534315.3
• Aligned Length: 1575
• Identities: 1043
• Gaps: 462

Alignment

Query    1  ATGAGGCGACGAAGGAGGCGGGACGGCTTTTACCCAGCCCCGGACTTCCGAGACAGGGAAGCTGAGGACATGGC  74
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGCGACGACGGAGGCGGGACGGCTTTTACCTAGCGCCTGACTTCCGACACAGGGAAGCTGAGGACATGGC  74

Query   75  AGGAGTGTTTGACATAGACCTGGACCAGCCAGAGGACGCGGGCTCTGAGGATGAGCTGGAGGAGGGGGGTCAGT  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct   75  AGGAGTGTTTGACATAGACCTGGACCAGCCAGAAGATGCAGGCTCTGAGGATGAGCTGGAGGAGGG--------  140

Query  149  TAAATGAAAGCATGGACCATGGGGGAGTTGGACCATATGAACTTGGCATGGAACATTGTGAGAAATTTGAAATC  222
                                                                                      
Sbjct  141  --------------------------------------------------------------------------  140

Query  223  TCAGAAACTAGTGTGAACAGAGGGCCAGAAAAAATCAGACCAGAATGTTTTGAGCTACTTCGGGTACTTGGTAA  296
                                                                                      
Sbjct  141  --------------------------------------------------------------------------  140

Query  297  AGGGGGCTATGGAAAGGTTTTTCAAGTACGAAAAGTAACAGGAGCAAATACTGGGAAAATATTTGCCATGAAGG  370
                                                                                      
Sbjct  141  --------------------------------------------------------------------------  140

Query  371  TGCTTAAAAAGGCAATGATAGTAAGAAATGCTAAAGATACAGCTCATACAAAAGCAGAACGGAATATTCTGGAG  444
                      ||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  141  ----------GGCAATGATAGTGAGGAATGCTAAGGACACGGCCCACACGAAAGCAGAGCGGAACATTCTGGAG  204

Query  445  GAAGTAAAGCATCCCTTCATCGTGGATTTAATTTATGCCTTTCAGACTGGTGGAAAACTCTACCTCATCCTTGA  518
            |||||.||.||.||.|||||.|||||..|.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct  205  GAAGTGAAACACCCTTTCATTGTGGACCTGATTTATGCCTTTCAGACCGGAGGAAAGCTCTACCTCATCCTCGA  278

Query  519  GTATCTCAGTGGAGGAGAACTATTTATGCAGTTAGAAAGAGAGGGAATATTTATGGAAGACACTGCCTGCTTTT  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct  279  GTATCTCAGTGGAGGAGAACTATTTATGCAGTTAGAAAGAGAGGGAATATTCATGGAAGACACAGCGTGCTTTT  352

Query  593  ACTTGGCAGAAATCTCCATGGCTTTGGGGCATTTACATCAAAAGGGGATCATCTACAGAGACCTGAAGCCGGAG  666
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  353  ACTTGGCTGAAATCTCCATGGCTTTGGGGCATTTACATCAAAAAGGGATCATCTACAGAGACCTGAAGCCGGAG  426

Query  667  AATATCATGCTTAATCACCAAGGTCATGTGAAACTAACAGACTTTGGACTATGCAAAGAATCTATTCATGATGG  740
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  427  AACATCATGCTTAATCACCAAGGTCACGTGAAACTAACAGACTTTGGACTATGCAAAGAATCTATTCATGATGG  500

Query  741  AACAGTCACACACACATTTTGTGGAACAATAGAATACATGGCCCCTGAAATCTTGATGAGAAGTGGCCACAATC  814
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  501  AACAGTCACGCACACATTTTGTGGAACAATAGAATACATGGCCCCTGAAATCTTAATGAGAAGCGGCCACAACC  574

Query  815  GTGCTGTGGATTGGTGGAGTTTGGGAGCATTAATGTATGACATGCTGACTGGAGCACCCCCATTCACTGGGGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  575  GTGCTGTGGATTGGTGGAGTTTGGGAGCATTAATGTATGACATGCTGACTGGAGCACCTCCATTCACTGGGGAG  648

Query  889  AATAGAAAGAAAACAATTGACAAAATCCTCAAATGTAAACTCAATTTGCCTCCCTACCTCACACAAGAAGCCAG  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct  649  AATAGAAAGAAAACAATTGACAAAATCCTCAAATGTAAACTTAATTTGCCTCCCTACCTCACACAAGAAGCTCG  722

Query  963  AGATCTGCTTAAAAAGCTGCTGAAAAGAAATGCTGCTTCTCGTCTGGGAGCTGGTCCTGGGGACGCTGGAGAAG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  723  AGATCTGCTTAAAAAGCTGCTGAAAAGAAATGCTGCTTCTCGTCTTGGAGCTGGCCCTGGGGATGCTGGAGAAG  796

Query 1037  TTCAAGCTCATCCATTCTTTAGACACATTAACTGGGAAGAACTTCTGGCTCGAAAGGTGGAGCCCCCCTTTAAA  1110
            |.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct  797  TCCAAGCTCATCCTTTTTTCAGACACATTAACTGGGAAGAACTTCTGGCTCGGAAGGTGGAACCTCCCTTTAAG  870

Query 1111  CCTCTGTTGCAATCTGAAGAGGATGTAAGTCAGTTTGATTCCAAGTTTACACGTCAGACACCTGTCGACAGCCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  871  CCTCTGTTGCAATCTGAAGAGGATGTGAGTCAGTTTGATTCAAAGTTTACACGTCAGACACCTGTTGACAGCCC  944

Query 1185  AGATGACTCAACTCTCAGTGAAAGTGCCAATCAGGTCTTTCTGGGTTTTACATATGTGGCTCCATCTGTACTTG  1258
            .||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  945  TGATGACTCCACTCTCAGTGAAAGTGCCAACCAGGTCTTTCTGGGTTTTACATATGTGGCTCCATCTGTACTTG  1018

Query 1259  AAAGTGTGAAAGAAAAGTTTTCCTTTGAACCAAAAATCCGATCACCTCGAAGATTTATTGGCAGCCCACGAACA  1332
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1019  AAAGTGTGAAAGAAAAGTTTTCATTTGAACCAAAAATCCGATCTCCTAGAAGATTTATTGGTAGTCCACGAACA  1092

Query 1333  CCTGTCAG---------------TACTG--------------CTATGTGC------------------------  1353
            ||||||||               |.|||              |.|.||||                        
Sbjct 1093  CCTGTCAGCCCAGTCAAATTCTCTCCTGGGGATTTCTGGGGACGAGGTGCTTCAGCCAGCACGGCAAATCCTCA  1166

Query 1354  --------------------------------------------------------------------------  1353
                                                                                      
Sbjct 1167  GACCCCTGTGGAATACCCAATGGAAACAAGTGGGATAGAGCAGATGGATGTGACAGTGAGCGGGGAAGCATCAG  1240

Query 1354  --------------------------------------------------------------------------  1353
                                                                                      
Sbjct 1241  CGCCACTTCCAATCCGACAACCCAACTCCGGGCCGTACAAAAAACAAGCTTTTCCTATGATCTCCAAACGGCCA  1314

Query 1354  ---------------------  1353
                                 
Sbjct 1315  GAGCACCTGCGGATGAATCTA  1335