Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14842
• Subject: NM_031878.2
• Aligned Length: 1458
• Identities: 1283
• Gaps: 40

Alignment

Query    1  ----------------ATGCTGCCCGGA-----CCGGCGCTGCGGGGACC-GGGTCCGGCGCA--GTAC-----  45
                            |||...|.||||     |||.|.||     |||| |.||||..| ||  ||.|     
Sbjct    1  ATGGAGGGTATGGGCTATGGACCTCGGAGGGCTCCGCCACT-----GACCTGTGTCCCTC-CACTGTTCCACTT  68

Query   46  ----CAGCGACCTGGCATGTCACCAGGGAACCGGATGCCCATGGCTGGCTTGCAGGTGGGACCCCCTGCTGGCT  115
                |||||.|||||||||||||||||.|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct   69  TCCTCAGCGTCCTGGCATGTCACCAGGAAGCAGGATGCCCATGGCTGGCTTGCAGGTGGGACCTCCTGCCGGTT  142

Query  116  CCCCATTTGGTGCAGCAGCTCCGCTTCGACCTGGCATGCCACCCACCATGATGGATCCATTCCGAAAACGCCTG  189
            ||||||||||..||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  143  CCCCATTTGGCACAGCTGCTCCGCTCCGACCTGGCATGCCACCTACCATGATGGATCCATTCCGAAAACGCCTG  216

Query  190  CTTGTGCCCCAGGCGCAGCCTCCCAT-ACTGCCCGGCGCCNGGGGTTAAAGAGGAGGAAGATGGCAGATAAGGT  262
            ||||||||.|||||.|||||.||.|| .||||||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  217  CTTGTGCCTCAGGCCCAGCCCCCGATGCCTGCCCAGCGCCGAGGGTTAAAGAGGAGGAAGATGGCAGATAAGGT  290

Query  263  TCTACCTCAGCGAATCCGGGAGCTTGTTCCAGAGTCTCAGGCGTACATGGATCTCTTGGCTTTTGAGCGGAAGC  336
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||.||||||
Sbjct  291  TCTACCTCAGCGAATCCGGGAGCTTGTCCCAGAGTCTCAGGCATACATGGATCTTTTAGCTTTCGAGAGGAAGC  364

Query  337  TGGACCAGACCATTGCTCGCAAGCGGATGGAGATCCAGGAGGCCATCAAAAAGCCTCTGACACAAAAGCGAAAG  410
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  365  TGGACCAGACCATCGCTCGCAAGCGGATGGAGATTCAAGAGGCCATCAAGAAGCCTCTGACGCAAAAGCGAAAA  438

Query  411  CTTCGGATCTACATTTCCAATACGTTCAGTCCCAGCAAGGCGGAAGGCGATAGTGCAGGAACTGCAGGGACCCC  484
            |||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||.|||.||||||||.||||||||
Sbjct  439  CTTCGGATCTATATTTCCAATACATTCAGCCCCAGCAAGGCGGATGGAGATAATGCGGGAACTGCGGGGACCCC  512

Query  485  TGGGGGAACCCCAGCAGGGGACAAGGTGGCTTCCTGGGAACTCCGAGTGGAAGGAAAACTGCTGGATGATCCTA  558
            ||||||||||||.||||..|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  513  TGGGGGAACCCCGGCAGCAGACAAGGTGGCCTCCTGGGAGCTTCGAGTAGAGGGGAAACTGCTGGATGATCCTA  586

Query  559  GCAAACAGAAGAGGAAGTTTTCTTCATTCTTTAAGAGCCTCGTCATTGAGCTGGACAAGGAGCTGTACGGGCCT  632
            |||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||.||||||||||.||.||.|||||.
Sbjct  587  GCAAACAGAAGAGGAAGTTCTCATCATTCTTTAAGAGCCTTGTGATTGAGTTGGACAAGGAACTCTATGGGCCG  660

Query  633  GACAATCACCTGGTGGAGTGGCACCGGATGCCCACCACCCAGGAGACAGATGGCTTCCAAGTAAAACGGCCTGG  706
            |||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||
Sbjct  661  GACAACCATCTGGTGGAGTGGCATCGGATGCCCACCACACAGGAAACAGATGGCTTTCAGGTGAAACGGCCAGG  734

Query  707  AGACCTCAACGTCAAGTGCACCCTCCTGCTCATGCTGGATCATCAGCCTCCCCAGTACAAATTGGACCCCCGAT  780
            |||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||.||||||||||..
Sbjct  735  AGATCTCAATGTCAAGTGCACCCTTCTGCTCATGCTGGATCATCAGCCTCCTCAGTATAAACTGGACCCCCGCC  808

Query  781  TGGCAAGGCTGCTGGGAGTGCACACGCAGACGAGGGCCGCCATCACGCAGGCCCTGTGGCTTTACATCAAGCAC  854
            ||||.|||.||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||.||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  809  TGGCGAGGTTGCTGGGAGTGCACACACAGACCAGGGCGGCAATCATGCAGGCACTGTGGCTTTACATCAAACAC  882

Query  855  AACCAGCTGCAGGATGGGCACGAGCGGGAGTACATCAACTGCAACCGTTACTTCCGCCAGATCTTCAGTTGTGG  928
            ||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  AACCAGCTGCAGGACGGCCATGAGCGCGAGTACATCAACTGCAATCGTTACTTCCGCCAGATCTTCAGTTGTGG  956

Query  929  CCGACTCAGTTTCTCCAAGATTCCCATGAAGCTGGCAGGGTTGCTGCAGCATCCAGACCCCATTGTCATCAACC  1002
            |||||||.||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct  957  CCGACTCCGTTTCTCCGAGATTCCCATGAAGCTGGCTGGATTGCTGCAGCATCCAGACCCCATTGTTATTAATC  1030

Query 1003  ATGTCATTAGTGTCGACCCTAACGACCAGAAGAAGACAGCCTGTTACGACATCGATGTGGAGGTGGACGACCCA  1076
            |||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1031  ATGTCATTAGTGTGGATCCTAATGACCAAAAGAAGACAGCCTGCTATGACATTGATGTAGAGGTTGATGACCCA  1104

Query 1077  CTGAAGGCCCAAATGAGCAATTTTCTGGCCTCTACCACCAATCAGCAGGAGATCGCCTCCCTTGATGTCAAGAT  1150
            |||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1105  CTGAAGGCCCAGATGAGCAACTTCCTGGCCTCTACCACCAACCAGCAGGAGATTGCTTCTCTTGACGTCAAGAT  1178

Query 1151  CCATGAGACCATTGAGTCCATCAACCAGCTGAAGACCCAGAGAGATTTCATGCTCAGTTTTAGCACCGACCCCC  1224
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1179  CCATGAGACCATTGAGTCCATCAACCAGCTAAAGACCCAGAGGGATTTCATGCTCAGCTTTAGCACCGAGCCCC  1252

Query 1225  AGGACTTCATCCAGGAATGGCTCCGTTCCCAGCGCCGAGACCTCAAGATCATCACTGATGTGATTGGAAATCCT  1298
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1253  AGGACTTCATCCAGGAGTGGCTCCGTTCCCAACGCCGAGACCTCAAGATCATCACAGATGTGATTGGAAACCCT  1326

Query 1299  GAGGAGGAGAGACGAGCTGCTTTCTACCACCAGCCCTGGGCCCAGGAAGCAGTAGGCAGGCACATCTTTGCCAA  1372
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1327  GAGGAGGAGAGACGAGCTGCTTTCTACCACCAGCCCTGGGCTCAGGAAGCAGTGGGGAGGCACATCTTTGCCAA  1400

Query 1373  GGTGCAGCAGCGAAGGCAGGAACTGGAACAGGTGCTGGGAATTCGCCTGACC  1424
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401  GGTGCAGCAGCGAAGGCAGGAACTGGAACAGGTGCTGGGAATTCGCCTGACC  1452