Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14856
- Subject:
- NM_009316.1
- Aligned Length:
- 1818
- Identities:
- 1598
- Gaps:
- 81
Alignment
Query 1 ATGTCTACAGCCTCTGCCGCCTCCTCCTCCTCCTCGTCTTCGGCCGGTGAGATGATCGAAGCCCCTTCCCAGGT 74
|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1 ATGTCGACAGCCTCCGCCGCCTCGTCCTCCTCCTCGTCTTCTGCCAGTGAGATGATCGAAGCGCCGTCGCAGGT 74
Query 75 CCTCAACTTTGAAGAGATCGACTACAAGGAGATCGAGGTGGAAGAGGTTGTTGGAAGAGGAGCCTTTGGAGTTG 148
|||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 75 CCTGAACTTCGAAGAGATCGACTACAAGGAGATCGAGGTGGAAGAGGTTGTCGGAAGAGGAGCTTTTGGAGTAG 148
Query 149 TTTGCAAAGCTAAGTGGAGAGCAAAAGATGTTGCTATTAAACAAATAGAAAGTGAATCTGAGAGGAAAGCGTTT 222
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 149 TTTGCAAAGCTAAGTGGAGAGCAAAAGATGTCGCTATTAAACAGATAGAAAGTGAGTCTGAGAGGAAGGCTTTC 222
Query 223 ATTGTAGAGCTTCGGCAGTTATCCCGTGTGAACCATCCTAATATTGTAAAGCTTTATGGAGCCTGCTTGAATCC 296
|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|.||||||||||||.|||||||
Sbjct 223 ATTGTGGAGCTCCGGCAGTTGTCACGTGTGAACCATCCTAACATTGTCAAGTTGTATGGAGCCTGCCTGAATCC 296
Query 297 AGTGTGTCTTGTGATGGAATATGCTGAAGGGGGCTCTTTATATAATGTGCTGCATGGTGCTGAACCATTGCCAT 370
|||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 AGTATGTCTTGTGATGGAATATGCAGAGGGGGGCTCATTGTATAATGTGCTGCATGGTGCTGAACCATTGCCTT 370
Query 371 ATTATACTGCTGCCCACGCAATGAGTTGGTGTTTACAGTGTTCCCAAGGAGTGGCTTATCTTCACAGCATGCAA 444
|.||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct 371 ACTACACTGCTGCTCATGCCATGAGCTGGTGTTTACAGTGTTCCCAAGGAGTGGCTTACCTGCACAGCATGCAG 444
Query 445 CCCAAAGCGCTAATTCACAGGGACCTGAAACCACCAAACTTACTGCTGGTTGCAGGGGGGACAGTTCTAAAAAT 518
|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 CCCAAAGCGCTGATTCACAGGGACCTCAAGCCTCCAAACTTGCTGCTGGTTGCAGGAGGGACAGTTCTAAAAAT 518
Query 519 TTGTGATTTTGGTACAGCCTGTGACATTCAGACACACATGACCAATAACAAGGGGAGTGCTGCTTGGATGGCAC 592
.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 519 CTGCGATTTTGGTACAGCTTGTGACATCCAAACACACATGACCAATAATAAAGGGAGTGCTGCTTGGATGGCGC 592
Query 593 CTGAAGTTTTTGAAGGTAGTAATTACAGTGAAAAATGTGACGTCTTCAGCTGGGGTATTATTCTTTGGGAAGTG 666
|||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 593 CTGAAGTATTTGAAGGTAGCAATTACAGTGAAAAGTGTGATGTCTTCAGCTGGGGTATTATCCTCTGGGAAGTG 666
Query 667 ATAACGCGTCGGAAACCCTTTGATGAGATTGGTGGCCCAGCTTTCCGAATCATGTGGGCTGTTCATAATGGTAC 740
|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 667 ATAACACGCCGGAAACCCTTCGATGAGATCGGTGGCCCAGCTTTCAGAATCATGTGGGCTGTTCATAATGGCAC 740
Query 741 TCGACCACCACTGATAAAAAATTTACCTAAGCCCATTGAGAGCCTGATGACTCGTTGTTGGTCTAAAGATCCTT 814
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||.||.||.|
Sbjct 741 TCGACCACCACTGATCAAAAATTTACCTAAGCCCATTGAGAGCTTGATGACACGCTGTTGGTCTAAGGACCCAT 814
Query 815 CCCAGCGCCCTTCAATGGAGGAAATTGTGAAAATAATGACTCACTTGATGCGGTACTTTCCAGGAGCAGATGAG 888
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 815 CTCAGCGCCCTTCAATGGAGGAAATTGTGAAAATAATGACTCACTTGATGCGGTACTTCCCAGGAGCGGATGAG 888
Query 889 CCATTACAGTATCCTTGTCAGTATTCAGATGAAGGACAGAGCAACTCTGCCACCAGTACAGGCTCATTCATGGA 962
||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 889 CCGTTACAGTATCCTTGTCAGTACTCTGATGAAGGGCAGAGCAACTCAGCCACCAGCACAGGCTCATTCATGGA 962
Query 963 CATTGCTTCTACAAATACGAGTAACAAAAGTGACACTAATATGGAGCAAGTTCCTGCCACAAATGATACTATTA 1036
||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 963 CATTGCTTCTACAAATACCAGTAATAAAAGTGACACAAATATGGAACAGGTTCCTGCCACAAACGACACTATTA 1036
Query 1037 AGCGCTTAGAATCAAAATTGTTGAAAAATCAGGCAAAGCAACAGAGTGAATCTGGACGTTTAAGCTTGGGAGCC 1110
|.|||||.||.||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||
Sbjct 1037 AACGCTTGGAGTCAAAACTTTTGAAAAACCAGGCAAAGCAACAGAGTGAATCTGGACGCCTGAGCTTGGGAGCC 1110
Query 1111 TCCCGTGGGAGCAGTGTGGAGAGCTTGCCCCCAACCTCTGAGGGCAAGAGGATGAGTGCTGACATGTCTGAAAT 1184
||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCTCGTGGGAGCAGTGTGGAGAGCTTGCCCCCCACTTCCGAGGGCAAGAGGATGAGTGCTGACATGTCTGAAAT 1184
Query 1185 AGAAGCTAGGATC------------GCC-------------------------------------------GCA 1203
||||||.|||||| ||| |||
Sbjct 1185 AGAAGCCAGGATCGTGGCGACTGCAGCCTATTCCAAGCCTAAACGGGGCCACCGTAAAACCGCTTCATTTGGCA 1258
Query 1204 AC-----------------------CA---CAGGCAACGGACAGCCAAGACGTAGATCCATCCAAGACTTGACT 1251
|| || ||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACATTCTGGATGTCCCTGAGATCGTCATATCAGGTAACGGGCAACCAAGGCGTAGATCCATCCAAGACTTGACT 1332
Query 1252 GTAACTGGAACAGAACCTGGTCAGGTGAGCAGTAGGTCATCCAGTCCCAGTGTCAGAATGATTACTACCTCAGG 1325
||.|||||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333 GTTACTGGGACAGAACCTGGTCAGGTGAGCAGCCGGTCATCCAGCCCTAGTGTCAGAATGATCACTACCTCAGG 1406
Query 1326 ACCAACCTCAGAAAAGCCAACTCGAAGTCATCCATGGACCCCTGATGATTCCACAGATACCAATGGATCAGATA 1399
||||||||||||.||||||.||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1407 ACCAACCTCAGAGAAGCCAGCTCGCAGTCACCCGTGGACCCCTGATGATTCCACAGATACCAATGGCTCAGATA 1480
Query 1400 ACTCCATCCCAATGGCTTATCTTACACTGGATCACCAACTACAGCCTCTAGCACCGTGCCCAAACTCCAAAGAA 1473
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ACTCCATCCCAATGGCGTATCTTACACTGGATCACCAGCTACAGCCTCTAGCGCCGTGCCCAAACTCCAAAGAA 1554
Query 1474 TCTATGGCAGTGTTTGAACAGCATTGTAAAATGGCACAAGAATATATGAAAGTTCAAACAGAAATTGCATTGTT 1547
||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1555 TCCATGGCAGTGTTCGAACAACATTGTAAAATGGCACAGGAGTATATGAAAGTTCAAACCGAAATCGCATTGTT 1628
Query 1548 ATTACAGAGAAAGCAAGAACTAGTTGCAGAACTGGACCAGGATGAAAAGGACCAGCAAAATACATCTCGCCTGG 1621
|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1629 ACTACAGAGAAAGCAAGAACTAGTTGCAGAATTGGACCAGGATGAAAAGGACCAGCAAAATACATCTCGTCTGG 1702
Query 1622 TACAGGAACATAAAAAGCTTTTAGATGAAAACAAAAGCCTTTCTACTTACTACCAGCAATGCAAAAAACAACTA 1695
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TACAGGAACATAAAAAGCTTTTAGATGAAAACAAAAGCCTTTCTACTTATTACCAGCAATGCAAAAAACAACTA 1776
Query 1696 GAGGTCATCAGAAGTCAGCAGCAGAAACGACAAGGCACTTCA 1737
||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GAGGTCATCAGAAGCCAACAGCAGAAACGACAAGGCACTTCA 1818