Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14856
• Subject: NM_172688.3
• Aligned Length: 1737
• Identities: 1593
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCTACAGCCTCTGCCGCCTCCTCCTCCTCCTCGTCTTCGGCCGGTGAGATGATCGAAGCCCCTTCCCAGGT  74
            |||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct    1  ATGTCGACAGCCTCCGCCGCCTCGTCCTCCTCCTCGTCTTCTGCCAGTGAGATGATCGAAGCGCCGTCGCAGGT  74

Query   75  CCTCAACTTTGAAGAGATCGACTACAAGGAGATCGAGGTGGAAGAGGTTGTTGGAAGAGGAGCCTTTGGAGTTG  148
            |||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct   75  CCTGAACTTCGAAGAGATCGACTACAAGGAGATCGAGGTGGAAGAGGTTGTCGGAAGAGGAGCTTTTGGAGTAG  148

Query  149  TTTGCAAAGCTAAGTGGAGAGCAAAAGATGTTGCTATTAAACAAATAGAAAGTGAATCTGAGAGGAAAGCGTTT  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct  149  TTTGCAAAGCTAAGTGGAGAGCAAAAGATGTCGCTATTAAACAGATAGAAAGTGAGTCTGAGAGGAAGGCTTTC  222

Query  223  ATTGTAGAGCTTCGGCAGTTATCCCGTGTGAACCATCCTAATATTGTAAAGCTTTATGGAGCCTGCTTGAATCC  296
            |||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|.||||||||||||.|||||||
Sbjct  223  ATTGTGGAGCTCCGGCAGTTGTCACGTGTGAACCATCCTAACATTGTCAAGTTGTATGGAGCCTGCCTGAATCC  296

Query  297  AGTGTGTCTTGTGATGGAATATGCTGAAGGGGGCTCTTTATATAATGTGCTGCATGGTGCTGAACCATTGCCAT  370
            |||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  AGTATGTCTTGTGATGGAATATGCAGAGGGGGGCTCATTGTATAATGTGCTGCATGGTGCTGAACCATTGCCTT  370

Query  371  ATTATACTGCTGCCCACGCAATGAGTTGGTGTTTACAGTGTTCCCAAGGAGTGGCTTATCTTCACAGCATGCAA  444
            |.||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct  371  ACTACACTGCTGCTCATGCCATGAGCTGGTGTTTACAGTGTTCCCAAGGAGTGGCTTACCTGCACAGCATGCAG  444

Query  445  CCCAAAGCGCTAATTCACAGGGACCTGAAACCACCAAACTTACTGCTGGTTGCAGGGGGGACAGTTCTAAAAAT  518
            |||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCAAAGCGCTGATTCACAGGGACCTCAAGCCTCCAAACTTGCTGCTGGTTGCAGGAGGGACAGTTCTAAAAAT  518

Query  519  TTGTGATTTTGGTACAGCCTGTGACATTCAGACACACATGACCAATAACAAGGGGAGTGCTGCTTGGATGGCAC  592
            .||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  CTGCGATTTTGGTACAGCTTGTGACATCCAAACACACATGACCAATAATAAAGGGAGTGCTGCTTGGATGGCGC  592

Query  593  CTGAAGTTTTTGAAGGTAGTAATTACAGTGAAAAATGTGACGTCTTCAGCTGGGGTATTATTCTTTGGGAAGTG  666
            |||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  593  CTGAAGTATTTGAAGGTAGCAATTACAGTGAAAAGTGTGATGTCTTCAGCTGGGGTATTATCCTCTGGGAAGTG  666

Query  667  ATAACGCGTCGGAAACCCTTTGATGAGATTGGTGGCCCAGCTTTCCGAATCATGTGGGCTGTTCATAATGGTAC  740
            |||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  ATAACACGCCGGAAACCCTTCGATGAGATCGGTGGCCCAGCTTTCAGAATCATGTGGGCTGTTCATAATGGCAC  740

Query  741  TCGACCACCACTGATAAAAAATTTACCTAAGCCCATTGAGAGCCTGATGACTCGTTGTTGGTCTAAAGATCCTT  814
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||.||.||.|
Sbjct  741  TCGACCACCACTGATCAAAAATTTACCTAAGCCCATTGAGAGCTTGATGACACGCTGTTGGTCTAAGGACCCAT  814

Query  815  CCCAGCGCCCTTCAATGGAGGAAATTGTGAAAATAATGACTCACTTGATGCGGTACTTTCCAGGAGCAGATGAG  888
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  815  CTCAGCGCCCTTCAATGGAGGAAATTGTGAAAATAATGACTCACTTGATGCGGTACTTCCCAGGAGCGGATGAG  888

Query  889  CCATTACAGTATCCTTGTCAGTATTCAGATGAAGGACAGAGCAACTCTGCCACCAGTACAGGCTCATTCATGGA  962
            ||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  889  CCGTTACAGTATCCTTGTCAGTACTCTGATGAAGGGCAGAGCAACTCAGCCACCAGCACAGGCTCATTCATGGA  962

Query  963  CATTGCTTCTACAAATACGAGTAACAAAAGTGACACTAATATGGAGCAAGTTCCTGCCACAAATGATACTATTA  1036
            ||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  963  CATTGCTTCTACAAATACCAGTAATAAAAGTGACACAAATATGGAACAGGTTCCTGCCACAAACGACACTATTA  1036

Query 1037  AGCGCTTAGAATCAAAATTGTTGAAAAATCAGGCAAAGCAACAGAGTGAATCTGGACGTTTAAGCTTGGGAGCC  1110
            |.|||||.||.||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||
Sbjct 1037  AACGCTTGGAGTCAAAACTTTTGAAAAACCAGGCAAAGCAACAGAGTGAATCTGGACGCCTGAGCTTGGGAGCC  1110

Query 1111  TCCCGTGGGAGCAGTGTGGAGAGCTTGCCCCCAACCTCTGAGGGCAAGAGGATGAGTGCTGACATGTCTGAAAT  1184
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCTCGTGGGAGCAGTGTGGAGAGCTTGCCCCCCACTTCCGAGGGCAAGAGGATGAGTGCTGACATGTCTGAAAT  1184

Query 1185  AGAAGCTAGGATCGCCGCAACCACAGGCAACGGACAGCCAAGACGTAGATCCATCCAAGACTTGACTGTAACTG  1258
            ||||||.|||||||..||.||..||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1185  AGAAGCCAGGATCGTGGCGACTGCAGGTAACGGGCAACCAAGGCGTAGATCCATCCAAGACTTGACTGTTACTG  1258

Query 1259  GAACAGAACCTGGTCAGGTGAGCAGTAGGTCATCCAGTCCCAGTGTCAGAATGATTACTACCTCAGGACCAACC  1332
            |.|||||||||||||||||||||||..||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGACAGAACCTGGTCAGGTGAGCAGCCGGTCATCCAGCCCTAGTGTCAGAATGATCACTACCTCAGGACCAACC  1332

Query 1333  TCAGAAAAGCCAACTCGAAGTCATCCATGGACCCCTGATGATTCCACAGATACCAATGGATCAGATAACTCCAT  1406
            |||||.||||||.||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1333  TCAGAGAAGCCAGCTCGCAGTCACCCGTGGACCCCTGATGATTCCACAGATACCAATGGCTCAGATAACTCCAT  1406

Query 1407  CCCAATGGCTTATCTTACACTGGATCACCAACTACAGCCTCTAGCACCGTGCCCAAACTCCAAAGAATCTATGG  1480
            |||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1407  CCCAATGGCGTATCTTACACTGGATCACCAGCTACAGCCTCTAGCGCCGTGCCCAAACTCCAAAGAATCCATGG  1480

Query 1481  CAGTGTTTGAACAGCATTGTAAAATGGCACAAGAATATATGAAAGTTCAAACAGAAATTGCATTGTTATTACAG  1554
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|||||
Sbjct 1481  CAGTGTTCGAACAACATTGTAAAATGGCACAGGAGTATATGAAAGTTCAAACCGAAATCGCATTGTTACTACAG  1554

Query 1555  AGAAAGCAAGAACTAGTTGCAGAACTGGACCAGGATGAAAAGGACCAGCAAAATACATCTCGCCTGGTACAGGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1555  AGAAAGCAAGAACTAGTTGCAGAATTGGACCAGGATGAAAAGGACCAGCAAAATACATCTCGTCTGGTACAGGA  1628

Query 1629  ACATAAAAAGCTTTTAGATGAAAACAAAAGCCTTTCTACTTACTACCAGCAATGCAAAAAACAACTAGAGGTCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACATAAAAAGCTTTTAGATGAAAACAAAAGCCTTTCTACTTATTACCAGCAATGCAAAAAACAACTAGAGGTCA  1702

Query 1703  TCAGAAGTCAGCAGCAGAAACGACAAGGCACTTCA  1737
            |||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCAGAAGCCAACAGCAGAAACGACAAGGCACTTCA  1737