Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14861
• Subject: NM_009370.3
• Aligned Length: 1529
• Identities: 1358
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ATGGAGGCGGCGGTCGCTGCTCCGCGTCCCCGGCTGCTCCTCCTCGTGCTGGCGGCGGTGGCGGCGGCGGCGGC  74
            |||||||||||||.|||||||||.||||..|.||.|||||||.|||||.|            ||.|||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGCGGCGGCCGCTGCTCCACGTCGTCCGCAGCTCCTCATCGTGTT------------GGTGGCGGCGGC  62

Query   75  GGCGCTGCTCCCGGGGGCGACGGCGTTACAGTGTTTCTGCCACCTCTGTACAAAAGACAATTTTACTTGTGTGA  148
            |.||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||.||
Sbjct   63  GACGCTGCTCCCGGGGGCGAAGGCATTACAGTGTTTCTGCCACCTCTGTACAAAGGATAATTTTACCTGTGAGA  136

Query  149  CAGATGGGCTCTGCTTTGTCTCTGTCACAGAGACCACAGACAAAGTTATACACAACAGCATGTGTATAGCTGAA  222
            |||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  137  CAGATGGTCTTTGCTTTGTCTCAGTCACTGAGACCACAGACAAAGTTATACACAATAGTATGTGTATAGCTGAA  210

Query  223  ATTGACTTAATTCCTCGAGATAGGCCGTTTGTATGTGCACCCTCTTCAAAAACTGGGTCTGTGACTACAACATA  296
            ||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.||.|||||||||||
Sbjct  211  ATTGACCTAATTCCTCGAGACAGGCCATTTGTATGTGCACCATCTTCAAAAACAGGGGCAGTTACTACAACATA  284

Query  297  TTGCTGCAATCAGGACCATTGCAATAAAATAGAACTTCCAACTA------------CTGTAAAGTCA-TCACCT  357
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||            |.|.|||| || |||.||
Sbjct  285  TTGCTGCAATCAGGACCACTGCAATAAAATAGAACTCCCAACTACAGGACCTTTTTCAGAAAAG-CAGTCAGCT  357

Query  358  GGCCTTGGTCCTGTGGAACTGGCAGCTGTCATTGCTGGACCAGTGTGCTTCGTCTGCATCTCACTCATGTTGAT  431
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||.|||.||||
Sbjct  358  GGCCTTGGTCCTGTGGAGCTGGCAGCTGTCATTGCTGGTCCAGTCTGCTTCGTCTGCATTGCACTTATGCTGAT  431

Query  432  GGTCTATATCTGCCACAACCGCACTGTCATTCACCATCGAGTGCCAAATGAAGAGGACCCTTCATTAGATCGCC  505
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||
Sbjct  432  GGTCTATATCTGCCATAACCGCACTGTCATTCACCACCGTGTGCCAAATGAAGAGGATCCATCACTAGATCGCC  505

Query  506  CTTTTATTTCAGAGGGTACTACGTTGAAAGACTTAATTTATGATATGACAACGTCAGGTTCTGGCTCAGGTTTA  579
            ||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct  506  CTTTCATTTCAGAGGGCACCACCTTAAAAGATTTAATTTATGATATGACAACATCAGGGTCTGGATCAGGTTTA  579

Query  580  CCATTGCTTGTTCAGAGAACAATTGCGAGAACTATTGTGTTACAAGAAAGCATTGGCAAA-GTCGATTTGGAGA  652
            |||.||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||| ||||.||||||||
Sbjct  580  CCACTGCTTGTTCAAAGAACAATTGCCAGGACCATTGTGTTACAAGAAAGCATTGGCAAAGGTCGGTTTGGAGA  653

Query  653  AGTTTGGAGAGGAAAGTGGCGGGGAGAAGAAGTTGCTGTTAAGATATTCTCCTCTAGAGAAGNACGTT--NGGT  724
            |||||||.||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||..||||  .|||
Sbjct  654  AGTTTGGCGAGGCAAATGGCGGGGAGAAGAAGTTGCTGTGAAGATATTCTCTTCTAGAGAAGAGCGTTCATGGT  727

Query  725  TGNTNCCGTGAGGCAGAGATTTTATCAAANTGTAAATGTTACGTCATGAAAACATCCTGGGGATTNNTAGCAGC  798
            |    |||.|||||||||| |||||||.|.||| |||||||||.||||||||.||||| ||||||..|||||||
Sbjct  728  T----CCGAGAGGCAGAGA-TTTATCAGACTGT-AATGTTACGCCATGAAAATATCCT-GGGATTTATAGCAGC  794

Query  799  AGACATAAAAGACAATGGTACTTGGACTCAGCTCTGGTTGGTGTCAGATTATCATGAGCATGGATCCCTTTTTG  872
            |||||..|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  795  AGACAACAAAGACAATGGGACATGGACGCAGCTGTGGTTGGTGTCAGATTATCATGAGCATGGATCCCTTTTCG  868

Query  873  ATTACTTAAACAGATACACAGTTACTGTGGAAGGAATGATAAAACTTGCTCTGTCCACGGCGAGCGGTCTTGCC  946
            |||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct  869  ATTACTTGAATAGATACACTGTTACTGTGGAAGGAATGATCAAGCTTGCTCTGTCCACAGCAAGTGGTCTTGCC  942

Query  947  CATCTTCACATGGAGATTGTTGGTACCCAAGGAAAGCCAGCCATTGCTCATAGAGATTTGAAATCAAAGAATAT  1020
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  943  CATCTTCACATGGAGATTGTTGGTACCCAAGGAAAACCAGCTATTGCCCATAGAGATTTGAAATCAAAGAATAT  1016

Query 1021  CTTGGTAAAGAAGAATGGAACTTGCTGTATTGCAGACTTAGGACTGGCAGTAAGACATGATTCAGCCACAGATA  1094
            ||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1017  CTTGGTGAAGAAAAATGGAACCTGTTGTATTGCAGACTTGGGACTTGCTGTGAGACATGATTCTGCCACAGATA  1090

Query 1095  CCATTGATATTGCTCCAAACCACAGAGTGGGAACAAAAAGGTACATGGCCCCTGAAGTTCTCGATGATTCCATA  1168
            |.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1091  CAATTGATATTGCTCCAAACCACAGAGTAGGCACTAAAAGGTACATGGCCCCTGAAGTTCTAGATGATTCCATA  1164

Query 1169  AATATGAAACATTTTGAATCCTTCAAACGTGCTGACATCTATGCAATGGGCTTAGTATTCTGGGAAATTGCTCG  1242
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1165  AATATGAAACATTTTGAATCCTTCAAACGCGCTGACATCTATGCAATGGGCTTAGTGTTCTGGGAAATTGCTCG  1238

Query 1243  ACGATGTTCCATTGGTGGAATTCATGAAGATTACCAACTGCCTTATTATGATCTTGTACCTTCTGACCCATCAG  1316
            |||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||..||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1239  ACGCTGTTCTATTGGTGGAATCCATGAAGACTATCAGTTGCCTTATTATGATCTTGTACCTTCTGATCCATCGG  1312

Query 1317  TTGAAGAAATGAGAAAAGTTGTTTGTGAACAGAAGTTAAGGCCAAATATCCCAAACAGATGGCAGAGCTGTGAA  1390
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1313  TTGAAGAAATGAGAAAAGTAGTTTGCGAACAGAAGTTAAGGCCAAATATTCCAAACAGATGGCAGAGCTGTGAG  1386

Query 1391  GCCTTGAGAGTAATGGCTAAAATTATGAGAGAATGTTGGTATGCCAATGGAGCAGCTAGGCTTACAGCATTGCG  1464
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 1387  GCCTTGAGAGTGATGGCTAAAATTATGAGAGAATGCTGGTATGCCAATGGAGCAGCAAGGCTGACAGCTTTGCG  1460

Query 1465  GATTAAGAAAACATTATCGCAACTCAGTCAACAGGAAGGCATCAAAATG  1513
            .|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1461  AATTAAAAAAACATTGTCACAACTCAGCCAACAGGAAGGCATCAAAATG  1509