Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14884
- Subject:
- XM_011538725.3
- Aligned Length:
- 2728
- Identities:
- 1620
- Gaps:
- 1079
Alignment
Query 1 ATGGCTTGCCTCCATGAGACCCGAACACCCTCTCCTTCCTTTGGGGGCTTTGTGTCTACCCTAAGTGAGGCATC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTTGCCTCCATGAGACCCGAACACCCTCTCCTTCCTTTGGGGGCTTTGTGTCTACCCTAAGTGAGGCATC 74
Query 75 CATGCGCAAGCTGGACCCAGACACTTCTGACTGCACTCCCGAGAAGGACCTGACGCCTACCCAGTGTGTACTTC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATGCGCAAGCTGGACCCAGACACTTCTGACTGCACTCCCGAGAAGGACCTGACGCCTACCCAGTGTGTACTTC 148
Query 149 GAGATGTGGTACCCCTTGGTGGGCAGGGTGGGGGAGGGCCCAGCCCCTCCCCAGGTGGAGAGCCGCCCCCTGAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GAGATGTGGTACCCCTTGGTGGGCAGGGTGGGGGAGGGCCCAGCCCCTCCCCAGGTGGAGAGCCGCCCCCTGAG 222
Query 223 CCTTTTGCCAACAGTGTCCTGCAGCTACATGAGCAGGATGCAGGGGGCCCAGGGGGAGCAGCTGGGTCACCTGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCTTTTGCCAACAGTGTCCTGCAGCTACATGAGCAGGATGCAGGGGGCCCAGGGGGAGCAGCTGGGTCACCTGA 296
Query 297 GAGTCGGGCATCCAGAGTTCGAGCTGACGAGGTGCGACTGCAGTGCCAGAGTGGCAGTGGCTTCCTTGAGGGCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAGTCGGGCATCCAGAGTTCGAGCTGACGAGGTGCGACTGCAGTGCCAGAGTGGCAGTGGCTTCCTTGAGGGCC 370
Query 371 TCTTTGGCTGCCTGCGCCCTGTCTGGACCATGATTGGCAAAGCCTACTCCACTGAGCACAAGCAGCAGCAGGAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCTTTGGCTGCCTGCGCCCTGTCTGGACCATGATTGGCAAAGCCTACTCCACTGAGCACAAGCAGCAGCAGGAA 444
Query 445 GACCTTTGGGAGGTCCCCTTTGAGGAAATCCTGGACCTGCAGTGGGTGGGCTCAGGGGCCCAGGGTGCTGTCTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GACCTTTGGGAGGTCCCCTTTGAGGAAATCCTGGACCTGCAGTGGGTGGGCTCAGGGGCCCAGGGTGCTGTCTT 518
Query 519 CCTGGGGCGCTTCCACGGGGAGGAGGTGGCTGTGAAGAAGGTGCGAGACCTCAAAGAAACCGACATCAAGCACT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCTGGGGCGCTTCCACGGGGAGGAGGTGGCTGTGAAGAAGGTGCGAGACCTCAAAGAAACCGACATCAAGCACT 592
Query 593 TGCGAAAGCTGAAGCACCCCAACATCATCACTTTCAAGGGTGTGTGCACCCAGGCTCCCTGCTACTGCATCCTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGCGAAAGCTGAAGCACCCCAACATCATCACTTTCAAGGGTGTGTGCACCCAGGCTCCCTGCTACTGCATCCTC 666
Query 667 ATGGAGTTCTGCGCCCAGGGCCAGCTGTATGAGGTACTGCGGGCTGGCCGCCCTGTCACCCCCTCCTTACTGGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATGGAGTTCTGCGCCCAGGGCCAGCTGTATGAGGTACTGCGGGCTGGCCGCCCTGTCACCCCCTCCTTACTGGT 740
Query 741 TGACTGGTCCATGGGCATCGCTGGTGGCATGAACTACCTGCACCTGCACAAGATTATCCACAGGGATCTCAAGT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGACTGGTCCATGGGCATCGCTGGTGGCATGAACTACCTGCACCTGCACAAGATTATCCACAGGGATCTCAAGT 814
Query 815 CACCCAACATGCTAATCACCTACGACGATGTGGTGAAGATCTCAGATTTTGGCACTTCCAAGGAGCTGAGTGAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CACCCAACATGCTAATCACCTACGACGATGTGGTGAAGATCTCAGATTTTGGCACTTCCAAGGAGCTGAGTGAC 888
Query 889 AAGAGCACCAAGATGTCCTTTGCAGGGACAGTAGCCTGGATGGCCCCTGAGGTGATCCGCAATGAACCTGTGTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGAGCACCAAGATGTCCTTTGCAGGGACAGTAGCCTGGATGGCCCCTGAGGTGATCCGCAATGAACCTGTGTC 962
Query 963 TGAGAAGGTCGACATCTGGTCCTTTGGCGTGGTGCTATGGGAACTGCTGACTGGTGAGATCCCCTACAAAGACG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGAGAAGGTCGACATCTGGTCCTTTGGCGTGGTGCTATGGGAACTGCTGACTGGTGAGATCCCCTACAAAGACG 1036
Query 1037 TAGATTCCTCAGCCATTATCTGGGGTGTGGGAAGCAACAGTCTCCATCTGCCCGTGCCCTCCAGTTGCCCAGAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TAGATTCCTCAGCCATTATCTGGGGTGTGGGAAGCAACAGTCTCCATCTGCCCGTGCCCTCCAGTTGCCCAGAT 1110
Query 1111 GGTTTCAAGATCCTGCTTCGCCAGTGCTGGAATAGCAAACCACGAAATCGCCCATCATTCCGACAGATCCTGCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGTTTCAAGATCCTGCTTCGCCAGTGCTGGAATAGCAAACCACGAAATCGCCCATCATTCCGACAGATCCTGCT 1184
Query 1185 GCATCTGGACATTGCCTCAGCTGATGTACTCTCCACACCCCAGGAGACTTACTTTAAGTCCCAGGCAGAGTGGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCATCTGGACATTGCCTCAGCTGATGTACTCTCCACACCCCAGGAGACTTACTTTAAGTCCCAGGCAGAGTGGC 1258
Query 1259 GGGAAGAAGTAAAACTGCACTTTGAAAAGATTAAGTCAGAAGGGACCTGTCTGCACCGCCTAGAAGAGGAACTG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGGAAGAAGTAAAACTGCACTTTGAAAAGATTAAGTCAGAAGGGACCTGTCTGCACCGCCTAGAAGAGGAACTG 1332
Query 1333 GTGATGAGGAGGAGGGAGGAGCTCAGACACGCCCTGGACATCAGGGAGCACTATGAAAGGAAGCTGGAGAGAGC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTGATGAGGAGGAGGGAGGAGCTCAGACACGCCCTGGACATCAGGGAGCACTATGAAAGGAAGCTGGAGAGAGC 1406
Query 1407 CAACAACCTGTATATGGAACTTAATGCCCTCATGTTGCAGCTGGAACTCAAGGAGAGGGAGCTGCTCAGGCGAG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CAACAACCTGTATATGGAACTTAATGCCCTCATGTTGCAGCTGGAACTCAAGGAGAGGGAGCTGCTCAGGCGAG 1480
Query 1481 AGCAAGCTTTAGAGCGGAGGTGCCCAGGCCTGCTGAAGCCACACCCTTCCCGGGGCCCCCAGCTTCCCTCCCTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| .|||.
Sbjct 1481 AGCAAGCTTTAGAGCGGAGGTGCCCAGGCCTGCTGAAGCCACACCCTTCCCGGGGCC------------TCCTG 1542
Query 1555 CATGAAAGCCACTCGTATTCCTTGTAC-ATAGAGAAATATTTATATAAATTATATATATATACATATATATATA 1627
||||.||.| || ||.||||| ..||||..|.| |.|
Sbjct 1543 CATGGAAAC----------------ACAATGGAGAA--GCTTATCAAGA----------------------AGA 1576
Query 1628 TATATGCGCCACATAA----TCA---------------ACAGA-------AAGATGG-GGCTGTCC-------- 1666
...|||.||||||.|| ||| .|||| ||||.|| |.||.|.|
Sbjct 1577 GGAATGTGCCACAGAAGCTGTCACCCCATAGCAAAAGGCCAGATATCCTCAAGACGGAGTCTTTGCTCCCTAAA 1650
Query 1667 -------CAGCCGTAAGTCAGG---------CTCG--------AGGG-------------AGACTGA-TCCCC- 1701
|||||.|.|||..|| ||.| |||| .|||.|| ||.||
Sbjct 1651 CTAGATGCAGCCCTGAGTGGGGTGGGGCTTCCTGGGTGTCCTAAGGGCCCCCCCTCACCAGGACGGAGTCGCCG 1724
Query 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Sbjct 1725 TGGCAAGACCCGTCACCGCAAGGCCAGCGCCAAGGGGAGCTGTGGGGACCTGCCTGGGCTTCGTACAGCTGTGC 1798
Query 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Sbjct 1799 CACCCCATGAACCTGGAGGACCAGGAAGCCCAGGGGGCCTAGGAGGGGGACCCTCAGCCTGGGAGGCCTGCCCT 1872
Query 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Sbjct 1873 CCCGCCCTCCGTGGGCTTCATCATGACCTCCTGCTCCGCAAAATGTCTTCATCGTCCCCAGACCTGCTGTCAGC 1946
Query 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Sbjct 1947 AGCACTAGGGTCCCGGGGCCGGGGGGCCACAGGCGGAGCTGGGGATCCTGGCTCACCACCTCCGGCCCGGGGTG 2020
Query 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Sbjct 2021 ACACCCCACCAAGTGAGGGCTCAGCCCCTGGCTCCACCAGCCCAGATTCACCTGGGGGAGCCAAAGGGGAACCA 2094
Query 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Sbjct 2095 CCTCCTCCAGTAGGGCCTGGTGAAGGTGTGGGGCTTCTGGGAACTGGAAGGGAAGGGACCTCAGGCCGGGGAGG 2168
Query 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Sbjct 2169 AAGCCGGGCTGGGTCCCAGCACTTGACCCCAGCTGCACTGCTGTACAGGGCTGCCGTCACCCGAAGTCAGAAAC 2242
Query 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Sbjct 2243 GTGGCATCTCATCGGAAGAGGAGGAAGGAGAGGTAGACAGTGAAGTAGAGCTGACATCAAGCCAGAGGTGGCCT 2316
Query 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Sbjct 2317 CAGAGCCTGAACATGCGCCAGTCACTATCTACCTTCAGCTCAGAGAATCCATCAGATGGGGAGGAAGGCACAGC 2390
Query 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Sbjct 2391 TAGTGAACCTTCCCCCAGTGGCACACCTGAAGTTGGCAGCACCAACACTGATGAGCGGCCAGATGAGCGGTCTG 2464
Query 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Sbjct 2465 ATGACATGTGCTCCCAGGGCTCAGAAATCCCACTGGACCCACCTCCTTCAGAGGTCATCCCTGGCCCTGAACCC 2538
Query 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Sbjct 2539 AGCTCCCTGCCCATTCCACACCAGGAACTTCTCAGAGAGCGGGGCCCTCCCAATTCTGAGGACTCAGACTGTGA 2612
Query 1702 ---------------------------------------------------------------- 1701
Sbjct 2613 CAGCACTGAATTGGACAACTCCAACAGCGTTGATGCCTTGCGGCCCCCAGCTTCCCTCCCTCCA 2676