Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14897
• Subject: XM_006524195.2
• Aligned Length: 2652
• Identities: 2324
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ATGAACCCCGGCTTCGATTTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATTCAGCGCATCGGCAGCGG  74
            ||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACCCGGGCTTCGATCTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATCCAGCGCATCGGCAGCGG  74

Query   75  CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTTAACACTGGTGAATTAGCAGCAATTAAAGTAATAAAATTGG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTCAACACTGGAGAATTAGCAGCAATTAAAGTGATAAAATTGG  148

Query  149  AACCAGGAGAAGACTTTGCAGTTGTGCAGCAAGAAATTATCATGATGAAAGACTGTAAACACCCAAATATTGTT  222
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  149  AACCAGGAGAAGACTTTGCGGTTGTACAGCAAGAAATCATTATGATGAAAGACTGCAAACACCCAAACATTGTT  222

Query  223  GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAGCTTTGGATTTGCATGGAGTTTTGTGGAGGTGGTTCTTTACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  223  GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAACTTTGGATTTGCATGGAATTCTGTGGAGGTGGCTCTTTACA  296

Query  297  GGATATTTATCACGTAACTGGACCTCTGTCAGAACTGCAAATTGCATATGTTAGCAGAGAAACACTGCAGGGAT  370
            |||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  297  GGACATATATCATGTAACTGGACCCCTTTCAGAACTGCAGATTGCATATGTTAGCAGAGAAACTCTACAGGGAT  370

Query  371  TATATTATCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACAGAGATATAAAGGGAGCTAACATTCTATTAACGGATAATGGT  444
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||
Sbjct  371  TGTATTACCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACCGAGATATAAAGGGCGCTAACATTCTCCTAACGGATAATGGT  444

Query  445  CATGTGAAATTGGCTGATTTTGGAGTATCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCTTTCATTGG  518
            ||.||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  CACGTGAAACTAGCTGATTTTGGAGTTTCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCCTTCATTGG  518

Query  519  CACACCATATTGGATGGCTCCAGAAGTTGCAGCTGTTGAGAGGAAGGGGGGTTACAATCAACTCTGTGATCTCT  592
            .||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  519  AACGCCATATTGGATGGCCCCAGAAGTCGCGGCTGTTGAGAGGAAAGGCGGGTACAATCAACTGTGTGACCTCT  592

Query  593  GGGCAGTGGGAATCACTGCCATAGAACTTGCAGAGCTTCAGCCTCCTATGTTTGACTTACACCCAATGAGAGCA  666
            ||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.|||||.|||||.|||
Sbjct  593  GGGCGGTGGGCATCACTGCCATCGAGCTGGCGGAGCTCCAGCCACCCATGTTTGACCTTCACCCGATGAGGGCA  666

Query  667  TTATTTCTAATGACAAAAAGCAATTTTCAGCCTCCTAAACTAAAGGATAAAATGAAATGGTCAAATAGTTTTCA  740
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..||||.||||||||||||||.||
Sbjct  667  TTGTTTCTAATGACAAAAAGCAATTTCCAGCCTCCTAAACTAAAAGATAAGTTGAAGTGGTCAAATAGTTTCCA  740

Query  741  TCACTTTGTGAAAATGGCACTTACCAAAAATCCGAAAAAAAGACCTACTGCTGAAAAATTATTACAGCATCCTT  814
            |||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|.|||.|||||..|.|||||||||||.|
Sbjct  741  TCATTTTGTGAAGATGGCTCTTACCAAAAATCCAAAGAAAAGACCCAATGCAGAAAAGCTGTTACAGCATCCCT  814

Query  815  TTGTAACACAACATTTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGCTGTTGGATAAAGTAAATAATCCAGATCATTCCACT  888
            ||||.|||||.|.|.|||||||||||||||||||||||.||.||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct  815  TTGTCACACAGCCTCTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGTTGCTGGACAAAGTGAATAATCCAGACCATTCCACA  888

Query  889  TACCATGATTTCGATGATGATGATCCTGAGCCTCTTGTTGCTGTACCACATAGAATTCACTCAACAAGTAGAAA  962
            |||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||..|||||.||||||||
Sbjct  889  TACCACGATTTTGATGATGATGACCCAGAGCCTCTTGTTGCCGTACCACATAGAATTCCTTCAACGAGTAGAAA  962

Query  963  CGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAACCTTTGGCCAAGTGAAATTTGATCCACCCTTAAGAAAGGAGA  1036
            .|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  963  TGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAAACTTTGGCCAGGTAAAATTTGATCCGCCCTTAAGGAAGGAGA  1036

Query 1037  CAGAACCACATCATGAACTTGATCTGCAACTGGAATATGGACAAGGACACCAAGGTGGTTACTTTTTAGGTGCA  1110
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|...||.|||.|||||||..
Sbjct 1037  CAGAGCCACATCACGAACTTGATCTGCAACTAGAGTACGGACAAGGACACCAAAGCCATTGCTTCTTAGGTGGC  1110

Query 1111  AACAA---------------------------------GAGTCTTCTCAAGTCTGTTGAAGAAGAATTGCATCA  1151
            |||||                                 |||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1111  AACAAGAACTGTATTCTATATAACGAGTCATTGGCAAGGAGTCTTCTGAAGTCTGTTGAAGAGGAATTACATCA  1184

Query 1152  GCGAGGACACGTCGCACATTTAGAAGATGATGAAGGAGATGATGATGAATCTAAACACTCAACTCTGAAAGCAA  1225
            |||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.|||||..|||||||||
Sbjct 1185  GCGAGGACATGTGGCACACTTAGAAGATGACGAAGGCGACGATGACGACTCTAAGCATTCAACCATGAAAGCAA  1258

Query 1226  AAATTCCACCTCCTTTGCCACCAAAGCCTAAGTCTATCTTCATACCACAGGAAATGCATTCTACTGAGGATGAA  1299
            ||.|.||.||||||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|..||||||.|||||||.|..
Sbjct 1259  AAGTCCCGCCTCCTCTGCCACCAAAGCCTAAATCCATCTTCATACCACAGGATACACATTCTGCTGAGGACGGT  1332

Query 1300  AATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCATGTCAGGGAGCCCAGCAAAGCCATCCCAAGTTCCACCTAGACCACC  1373
            |||||||||||||||||||||||||||...|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1333  AATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCTCATCAGGGAGCCCGGCAAAGCCATCCCACGTTCCACCTAGACCACC  1406

Query 1374  ACCTCCCAGATTACCCCCACACAAACCTGTTGCCTTAGGAAATGGAATGAGCTCCTTCCAGTTAAATGGTGAAC  1447
            .||.|||||.|||||.|||||.||.||||.||..||||||||||||.|||.||||||||||.||||||||||.|
Sbjct 1407  TCCGCCCAGGTTACCGCCACAGAAGCCTGCTGTTTTAGGAAATGGAGTGAACTCCTTCCAGCTAAATGGTGAGC  1480

Query 1448  GAGATGGCTCATTATGTCAACAACAGAATGAACATAGAGGCACAAACCTTTCAAGAAAAGAAAAGAAAGATGTA  1521
            ||||.||.|||||||.|||.||.||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.
Sbjct 1481  GAGACGGATCATTATATCAGCAGCAGAGTGAGCAAAGAGGCACAAACCTTTCAAGAAAGGAGAAGAAGGACGTC  1554

Query 1522  CCAAAGCCTATTAGTAATGGTCTTCCTCCAACACCTAAAGTGCATATGGGTGCATGTTTTTCAAAAGTTTTTAA  1595
            ||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1555  CCGAAACCAATTAGTAATGGTCTTCCCCCAACACCTAAAGTGCATATGGGAGCGTGTTTTTCAAAGGTTTTTAA  1628

Query 1596  TGGGTGTCCCTTGAAAATTCACTGTGCATCATCATGGATAAACCCAGATACTAGAGATCAGTACTTGATATTTG  1669
            |||.||||||||||||||.||||||||..||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGGATGTCCCTTGAAAATCCACTGTGCCACATCCTGGATAAACCCAGACACGAGAGACCAGTACTTGATATTTG  1702

Query 1670  GTGCCGAAGAAGGGATTTATACCCTCAATCTTAATGAACTTCATGAAACATCAATGGAACAGCTATTCCCTCGA  1743
            |.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1703  GCGCTGAAGAGGGCATTTATACCCTTAATCTCAATGAACTTCATGAAACATCAATGGAACAGCTGTTCCCCCGC  1776

Query 1744  AGGTGTACATGGTTGTATGTAATGAACAATTGCTTGCTATCAATATCTGGTAAAGCTTCTCAGCTTTATTCCCA  1817
            ||||||||.|||.|||||||.||||||||||||.||||.|||.|.||.||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1777  AGGTGTACGTGGCTGTATGTGATGAACAATTGCCTGCTGTCAGTCTCGGGCAAAGCCTCTCAGCTTTACTCCCA  1850

Query 1818  TAATTTACCAGGGCTTTTTGATTATGCAAGACAAATGCAAAAGTTACCTGTTGCTATTCCAGCACACAAACTCC  1891
            .||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|.||.||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 1851  CAACTTACCGGGGCTTTTCGATTATGCAAGACAGATGCAGAAGCTTCCAGTAGCCATCCCAGCACACAAGCTCC  1924

Query 1892  CTGACAGAATACTGCCAAGGAAATTTTCTGTATCAGCAAAAATCCCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGTTGT  1965
            |.|||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1925  CCGACCGAATACTGCCCAGGAAATTTGCTGTATCAGCAAAGATTCCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGCTGC  1998

Query 1966  GTTGTAAGAAATCCTTACACGGGCCATAAATACCTATGTGGAGCACTTCAGACTAGCATTGTTCTATTAGAATG  2039
            ||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GTGGTGAGAAATCCTTACACGGGCCATAAGTACCTGTGCGGGGCGCTTCAGACCAGCATTGTTCTATTAGAATG  2072

Query 2040  GGTTGAACCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGATTTTCCTATACCATGTCCACTTAGAATGTTTG  2113
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||..|.|||||||
Sbjct 2073  GGTTGAGCCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGAGTTTCCTATGCCGTGTCCACTCCGGATGTTTG  2146

Query 2114  AAATGCTGGTAGTTCCTGAACAGGAGTACCCTTTAGTTTGTGTTGGTGTCAGTAGAGGTAGAGACTTCAACCAA  2187
            |.||||||||.||.|||||.||||||||||||.|.||.||||||||.|||||.|||||..||||||||||||||
Sbjct 2147  AGATGCTGGTGGTCCCTGAGCAGGAGTACCCTCTGGTCTGTGTTGGCGTCAGCAGAGGGCGAGACTTCAACCAA  2220

Query 2188  GTGGTTCGATTTGAGACGGTCAATCCAAATTCTACCTCTTCATGGTTTACAGAATCAGATACCCCACAGACAAA  2261
            ||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||.||||.|||||||.
Sbjct 2221  GTGGTTCGGTTTGAGACGGTCAATCCCAATTCTACCTCGTCGTGGTTTACAGAGTCAGATGCCCCGCAGACAAG  2294

Query 2262  TGTTACTCATGTAACCCAACTGGAGAGAGATACCATCCTTGTATGCTTGGACTGTTGTATAAAAATAGTAAATC  2335
            .||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 2295  CGTCACTCATGTGACCCAGCTGGAGAGAGACACCATCCTTGTGTGCTTGGATTGTTGTATAAAAATAGTCAATC  2368

Query 2336  TCCAAGGAAGATTAAAATCTAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTCACCTTTGATTTCCAGATTGAATCAATAGTG  2409
            ||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 2369  TCCAAGGAAGGTTGAAATCCAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTCACCTTCGATTTCCAGATAGAGTCCATAGTT  2442

Query 2410  TGCCTACAAGACAGTGTGCTAGCTTTCTGGAAACATGGAATGCAAGGTAGAAGTTTTAGATCTAATGAGGTAAC  2483
            ||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  TGTCTACAAGACAGTGTGCTAGCGTTCTGGAAACACGGGATGCAAGGTAGAAGCTTTAGATCTAATGAGGTAAC  2516

Query 2484  ACAAGAAATTTCAGATAGCACAAGAATTTTCAGGCTGCTTGGATCTGACAGGGTCGTGGTTTTGGAAAGTAGGC  2557
            |||||||||||||||||.|||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||
Sbjct 2517  ACAAGAAATTTCAGATAACACAAGAATCTTCAGACTCCTTGGATCTGACAGGGTTGTGGTTTTGGAAAGTCGGC  2590

Query 2558  CAACTGATAACCCCACAGCAAATAGCAATTTGTACATCCTGGCGGGTCATGAAAACAGTTAC  2619
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 2591  CAACTGATAACCCAACAGCAAATAGCAATTTATACATCTTGGCGGGTCACGAAAACAGCTAC  2652