Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14897
- Subject:
- XM_006524197.2
- Aligned Length:
- 2619
- Identities:
- 2324
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGAACCCCGGCTTCGATTTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATTCAGCGCATCGGCAGCGG 74
||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAACCCGGGCTTCGATCTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATCCAGCGCATCGGCAGCGG 74
Query 75 CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTTAACACTGGTGAATTAGCAGCAATTAAAGTAATAAAATTGG 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 75 CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTCAACACTGGAGAATTAGCAGCAATTAAAGTGATAAAATTGG 148
Query 149 AACCAGGAGAAGACTTTGCAGTTGTGCAGCAAGAAATTATCATGATGAAAGACTGTAAACACCCAAATATTGTT 222
|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 149 AACCAGGAGAAGACTTTGCGGTTGTACAGCAAGAAATCATTATGATGAAAGACTGCAAACACCCAAACATTGTT 222
Query 223 GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAGCTTTGGATTTGCATGGAGTTTTGTGGAGGTGGTTCTTTACA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 223 GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAACTTTGGATTTGCATGGAATTCTGTGGAGGTGGCTCTTTACA 296
Query 297 GGATATTTATCACGTAACTGGACCTCTGTCAGAACTGCAAATTGCATATGTTAGCAGAGAAACACTGCAGGGAT 370
|||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 297 GGACATATATCATGTAACTGGACCCCTTTCAGAACTGCAGATTGCATATGTTAGCAGAGAAACTCTACAGGGAT 370
Query 371 TATATTATCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACAGAGATATAAAGGGAGCTAACATTCTATTAACGGATAATGGT 444
|.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 371 TGTATTACCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACCGAGATATAAAGGGCGCTAACATTCTCCTAACGGATAATGGT 444
Query 445 CATGTGAAATTGGCTGATTTTGGAGTATCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCTTTCATTGG 518
||.||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445 CACGTGAAACTAGCTGATTTTGGAGTTTCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCCTTCATTGG 518
Query 519 CACACCATATTGGATGGCTCCAGAAGTTGCAGCTGTTGAGAGGAAGGGGGGTTACAATCAACTCTGTGATCTCT 592
.||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 519 AACGCCATATTGGATGGCCCCAGAAGTCGCGGCTGTTGAGAGGAAAGGCGGGTACAATCAACTGTGTGACCTCT 592
Query 593 GGGCAGTGGGAATCACTGCCATAGAACTTGCAGAGCTTCAGCCTCCTATGTTTGACTTACACCCAATGAGAGCA 666
||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.|||||.|||||.|||
Sbjct 593 GGGCGGTGGGCATCACTGCCATCGAGCTGGCGGAGCTCCAGCCACCCATGTTTGACCTTCACCCGATGAGGGCA 666
Query 667 TTATTTCTAATGACAAAAAGCAATTTTCAGCCTCCTAAACTAAAGGATAAAATGAAATGGTCAAATAGTTTTCA 740
||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..||||.||||||||||||||.||
Sbjct 667 TTGTTTCTAATGACAAAAAGCAATTTCCAGCCTCCTAAACTAAAAGATAAGTTGAAGTGGTCAAATAGTTTCCA 740
Query 741 TCACTTTGTGAAAATGGCACTTACCAAAAATCCGAAAAAAAGACCTACTGCTGAAAAATTATTACAGCATCCTT 814
|||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|.|||.|||||..|.|||||||||||.|
Sbjct 741 TCATTTTGTGAAGATGGCTCTTACCAAAAATCCAAAGAAAAGACCCAATGCAGAAAAGCTGTTACAGCATCCCT 814
Query 815 TTGTAACACAACATTTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGCTGTTGGATAAAGTAAATAATCCAGATCATTCCACT 888
||||.|||||.|.|.|||||||||||||||||||||||.||.||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 815 TTGTCACACAGCCTCTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGTTGCTGGACAAAGTGAATAATCCAGACCATTCCACA 888
Query 889 TACCATGATTTCGATGATGATGATCCTGAGCCTCTTGTTGCTGTACCACATAGAATTCACTCAACAAGTAGAAA 962
|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||..|||||.||||||||
Sbjct 889 TACCACGATTTTGATGATGATGACCCAGAGCCTCTTGTTGCCGTACCACATAGAATTCCTTCAACGAGTAGAAA 962
Query 963 CGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAACCTTTGGCCAAGTGAAATTTGATCCACCCTTAAGAAAGGAGA 1036
.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 963 TGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAAACTTTGGCCAGGTAAAATTTGATCCGCCCTTAAGGAAGGAGA 1036
Query 1037 CAGAACCACATCATGAACTTGATCTGCAACTGGAATATGGACAAGGACACCAAGGTGGTTACTTTTTAGGTGCA 1110
||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|...||.|||.|||||||..
Sbjct 1037 CAGAGCCACATCACGAACTTGATCTGCAACTAGAGTACGGACAAGGACACCAAAGCCATTGCTTCTTAGGTGGC 1110
Query 1111 AACAAGAGTCTTCTCAAGTCTGTTGAAGAAGAATTGCATCAGCGAGGACACGTCGCACATTTAGAAGATGATGA 1184
||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct 1111 AACAAGAGTCTTCTGAAGTCTGTTGAAGAGGAATTACATCAGCGAGGACATGTGGCACACTTAGAAGATGACGA 1184
Query 1185 AGGAGATGATGATGAATCTAAACACTCAACTCTGAAAGCAAAAATTCCACCTCCTTTGCCACCAAAGCCTAAGT 1258
|||.||.|||||.||.|||||.||.|||||..|||||||||||.|.||.||||||.||||||||||||||||.|
Sbjct 1185 AGGCGACGATGACGACTCTAAGCATTCAACCATGAAAGCAAAAGTCCCGCCTCCTCTGCCACCAAAGCCTAAAT 1258
Query 1259 CTATCTTCATACCACAGGAAATGCATTCTACTGAGGATGAAAATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCATGTCA 1332
|.|||||||||||||||||.|..||||||.|||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||...|||
Sbjct 1259 CCATCTTCATACCACAGGATACACATTCTGCTGAGGACGGTAATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCTCATCA 1332
Query 1333 GGGAGCCCAGCAAAGCCATCCCAAGTTCCACCTAGACCACCACCTCCCAGATTACCCCCACACAAACCTGTTGC 1406
||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||.||.
Sbjct 1333 GGGAGCCCGGCAAAGCCATCCCACGTTCCACCTAGACCACCTCCGCCCAGGTTACCGCCACAGAAGCCTGCTGT 1406
Query 1407 CTTAGGAAATGGAATGAGCTCCTTCCAGTTAAATGGTGAACGAGATGGCTCATTATGTCAACAACAGAATGAAC 1480
.||||||||||||.|||.||||||||||.||||||||||.|||||.||.|||||||.|||.||.||||.|||.|
Sbjct 1407 TTTAGGAAATGGAGTGAACTCCTTCCAGCTAAATGGTGAGCGAGACGGATCATTATATCAGCAGCAGAGTGAGC 1480
Query 1481 ATAGAGGCACAAACCTTTCAAGAAAAGAAAAGAAAGATGTACCAAAGCCTATTAGTAATGGTCTTCCTCCAACA 1554
|.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481 AAAGAGGCACAAACCTTTCAAGAAAGGAGAAGAAGGACGTCCCGAAACCAATTAGTAATGGTCTTCCCCCAACA 1554
Query 1555 CCTAAAGTGCATATGGGTGCATGTTTTTCAAAAGTTTTTAATGGGTGTCCCTTGAAAATTCACTGTGCATCATC 1628
|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||..||||
Sbjct 1555 CCTAAAGTGCATATGGGAGCGTGTTTTTCAAAGGTTTTTAATGGATGTCCCTTGAAAATCCACTGTGCCACATC 1628
Query 1629 ATGGATAAACCCAGATACTAGAGATCAGTACTTGATATTTGGTGCCGAAGAAGGGATTTATACCCTCAATCTTA 1702
.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 1629 CTGGATAAACCCAGACACGAGAGACCAGTACTTGATATTTGGCGCTGAAGAGGGCATTTATACCCTTAATCTCA 1702
Query 1703 ATGAACTTCATGAAACATCAATGGAACAGCTATTCCCTCGAAGGTGTACATGGTTGTATGTAATGAACAATTGC 1776
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||.|||||||.||||||||||||
Sbjct 1703 ATGAACTTCATGAAACATCAATGGAACAGCTGTTCCCCCGCAGGTGTACGTGGCTGTATGTGATGAACAATTGC 1776
Query 1777 TTGCTATCAATATCTGGTAAAGCTTCTCAGCTTTATTCCCATAATTTACCAGGGCTTTTTGATTATGCAAGACA 1850
.||||.|||.|.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1777 CTGCTGTCAGTCTCGGGCAAAGCCTCTCAGCTTTACTCCCACAACTTACCGGGGCTTTTCGATTATGCAAGACA 1850
Query 1851 AATGCAAAAGTTACCTGTTGCTATTCCAGCACACAAACTCCCTGACAGAATACTGCCAAGGAAATTTTCTGTAT 1924
.|||||.|||.|.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 1851 GATGCAGAAGCTTCCAGTAGCCATCCCAGCACACAAGCTCCCCGACCGAATACTGCCCAGGAAATTTGCTGTAT 1924
Query 1925 CAGCAAAAATCCCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGTTGTGTTGTAAGAAATCCTTACACGGGCCATAAATAC 1998
|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1925 CAGCAAAGATTCCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGCTGCGTGGTGAGAAATCCTTACACGGGCCATAAGTAC 1998
Query 1999 CTATGTGGAGCACTTCAGACTAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAACCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAA 2072
||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTGTGCGGGGCGCTTCAGACCAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAGCCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAA 2072
Query 2073 GCACATAGATTTTCCTATACCATGTCCACTTAGAATGTTTGAAATGCTGGTAGTTCCTGAACAGGAGTACCCTT 2146
|||||||||.||||||||.||.||||||||..|.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||.
Sbjct 2073 GCACATAGAGTTTCCTATGCCGTGTCCACTCCGGATGTTTGAGATGCTGGTGGTCCCTGAGCAGGAGTACCCTC 2146
Query 2147 TAGTTTGTGTTGGTGTCAGTAGAGGTAGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGATTTGAGACGGTCAATCCAAATTCT 2220
|.||.||||||||.|||||.|||||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2147 TGGTCTGTGTTGGCGTCAGCAGAGGGCGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGGTTTGAGACGGTCAATCCCAATTCT 2220
Query 2221 ACCTCTTCATGGTTTACAGAATCAGATACCCCACAGACAAATGTTACTCATGTAACCCAACTGGAGAGAGATAC 2294
|||||.||.|||||||||||.||||||.||||.|||||||..||.||||||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct 2221 ACCTCGTCGTGGTTTACAGAGTCAGATGCCCCGCAGACAAGCGTCACTCATGTGACCCAGCTGGAGAGAGACAC 2294
Query 2295 CATCCTTGTATGCTTGGACTGTTGTATAAAAATAGTAAATCTCCAAGGAAGATTAAAATCTAGCAGGAAATTGT 2368
|||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 2295 CATCCTTGTGTGCTTGGATTGTTGTATAAAAATAGTCAATCTCCAAGGAAGGTTGAAATCCAGCAGGAAATTGT 2368
Query 2369 CATCAGAACTCACCTTTGATTTCCAGATTGAATCAATAGTGTGCCTACAAGACAGTGTGCTAGCTTTCTGGAAA 2442
||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2369 CATCAGAACTCACCTTCGATTTCCAGATAGAGTCCATAGTTTGTCTACAAGACAGTGTGCTAGCGTTCTGGAAA 2442
Query 2443 CATGGAATGCAAGGTAGAAGTTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTTCAGATAGCACAAGAATTTTCAG 2516
||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||
Sbjct 2443 CACGGGATGCAAGGTAGAAGCTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTTCAGATAACACAAGAATCTTCAG 2516
Query 2517 GCTGCTTGGATCTGACAGGGTCGTGGTTTTGGAAAGTAGGCCAACTGATAACCCCACAGCAAATAGCAATTTGT 2590
.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 2517 ACTCCTTGGATCTGACAGGGTTGTGGTTTTGGAAAGTCGGCCAACTGATAACCCAACAGCAAATAGCAATTTAT 2590
Query 2591 ACATCCTGGCGGGTCATGAAAACAGTTAC 2619
|||||.||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 2591 ACATCTTGGCGGGTCACGAAAACAGCTAC 2619