Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14897
- Subject:
- XM_006524199.3
- Aligned Length:
- 2715
- Identities:
- 2070
- Gaps:
- 363
Alignment
Query 1 ATGAACCCCGGCTTCGATTTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATTCAGCGCATCGGCAGCGG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTTAACACTGGTGAATTAGCAGCAATTAAAGTAATAAAATTGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AACCAGGAGAAGACTTTGCAGTTGTGCAGCAAGAAATTATCATGATGAAAGACTGTAAACACCCAAATATTGTT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAGCTTTGGATTTGCATGGAGTTTTGTGGAGGTGGTTCTTTACA 296
|||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------ATGGAATTCTGTGGAGGTGGCTCTTTACA 29
Query 297 GGATATTTATCACGTAACTGGACCTCTGTCAGAACTGCAAATTGCATATGTTAGCAGAGAAACACTGCAGGGAT 370
|||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 30 GGACATATATCATGTAACTGGACCCCTTTCAGAACTGCAGATTGCATATGTTAGCAGAGAAACTCTACAGGGAT 103
Query 371 TATATTATCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACAGAGATATAAAGGGAGCTAACATTCTATTAACGGATAATGGT 444
|.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 104 TGTATTACCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACCGAGATATAAAGGGCGCTAACATTCTCCTAACGGATAATGGT 177
Query 445 CATGTGAAATTGGCTGATTTTGGAGTATCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCTTTCATTGG 518
||.||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 178 CACGTGAAACTAGCTGATTTTGGAGTTTCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCCTTCATTGG 251
Query 519 CACACCATATTGGATGGCTCCAGAAGTTGCAGCTGTTGAGAGGAAGGGGGGTTACAATCAACTCTGTGATCTCT 592
.||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 252 AACGCCATATTGGATGGCCCCAGAAGTCGCGGCTGTTGAGAGGAAAGGCGGGTACAATCAACTGTGTGACCTCT 325
Query 593 GGGCAGTGGGAATCACTGCCATAGAACTTGCAGAGCTTCAGCCTCCTATGTTTGACTTACACCCAATGAGAGCA 666
||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.|||||.|||||.|||
Sbjct 326 GGGCGGTGGGCATCACTGCCATCGAGCTGGCGGAGCTCCAGCCACCCATGTTTGACCTTCACCCGATGAGGGCA 399
Query 667 TTATTTCTAATGACAAAAAGCAATTTTCAGCCTCCTAAACTAAAGGATAAAATGAAATGGTCAAATAGTTTTCA 740
||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..||||.||||||||||||||.||
Sbjct 400 TTGTTTCTAATGACAAAAAGCAATTTCCAGCCTCCTAAACTAAAAGATAAGTTGAAGTGGTCAAATAGTTTCCA 473
Query 741 TCACTTTGTGAAAATGGCACTTACCAAAAATCCGAAAAAAAGACCTACTGCTGAAAAATTATTACAGCATCCTT 814
|||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|.|||.|||||..|.|||||||||||.|
Sbjct 474 TCATTTTGTGAAGATGGCTCTTACCAAAAATCCAAAGAAAAGACCCAATGCAGAAAAGCTGTTACAGCATCCCT 547
Query 815 TTGTAACACAACATTTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGCTGTTGGATAAAGTAAATAATCCAGATCATTCCACT 888
||||.|||||.|.|.|||||||||||||||||||||||.||.||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 548 TTGTCACACAGCCTCTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGTTGCTGGACAAAGTGAATAATCCAGACCATTCCACA 621
Query 889 TACCATGATTTCGATGATGATGATCCTGAGCCTCTTGTTGCTGTACCACATAGAATTCACTCAACAAGTAGAAA 962
|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||..|||||.||||||||
Sbjct 622 TACCACGATTTTGATGATGATGACCCAGAGCCTCTTGTTGCCGTACCACATAGAATTCCTTCAACGAGTAGAAA 695
Query 963 CGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAACCTTTGGCCAAGTGAAATTTGATCCACCCTTAAGAAAGGAGA 1036
.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 696 TGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAAACTTTGGCCAGGTAAAATTTGATCCGCCCTTAAGGAAGGAGA 769
Query 1037 CAGAACCACATCATGAACTT------------------------------------------------------ 1056
||||.||||||||.||||||
Sbjct 770 CAGAGCCACATCACGAACTTCCCGACAGTGATGGTTTTTTCGACAGTTCAGAAGAAATATACTACACTGCAAGA 843
Query 1057 ---------GATCTGCAACTGGAATATGGACAAGGACACCAAGGTGGTTACTTTTTAGGTGCAAACAA------ 1115
|||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|...||.|||.|||||||..|||||
Sbjct 844 TCTAATCTGGATCTGCAACTAGAGTACGGACAAGGACACCAAAGCCATTGCTTCTTAGGTGGCAACAAGAACTG 917
Query 1116 ---------------------------GAGTCTTCTCAAGTCTGTTGAAGAAGAATTGCATCAGCGAGGACACG 1162
|||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct 918 TATTCTATATAACGAGTCATTGGCAAGGAGTCTTCTGAAGTCTGTTGAAGAGGAATTACATCAGCGAGGACATG 991
Query 1163 TCGCACATTTAGAAGATGATGAAGGAGATGATGATGAATCTAAACACTCAACTCTGAAAGCAAAAATTCCACCT 1236
|.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.|||||..|||||||||||.|.||.|||
Sbjct 992 TGGCACACTTAGAAGATGACGAAGGCGACGATGACGACTCTAAGCATTCAACCATGAAAGCAAAAGTCCCGCCT 1065
Query 1237 CCTTTGCCACCAAAGCCTAAGTCTATCTTCATACCACAGGAAATGCATTCTACTGAGGATGAAAATCAAGGAAC 1310
|||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|..||||||.|||||||.|..|||||||||||
Sbjct 1066 CCTCTGCCACCAAAGCCTAAATCCATCTTCATACCACAGGATACACATTCTGCTGAGGACGGTAATCAAGGAAC 1139
Query 1311 AATCAAGAGATGTCCCATGTCAGGGAGCCCAGCAAAGCCATCCCAAGTTCCACCTAGACCACCACCTCCCAGAT 1384
||||||||||||||||...|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 1140 AATCAAGAGATGTCCCTCATCAGGGAGCCCGGCAAAGCCATCCCACGTTCCACCTAGACCACCTCCGCCCAGGT 1213
Query 1385 TACCCCCACACAAACCTGTTGCCTTAGGAAATGGAATGAGCTCCTTCCAGTTAAATGGTGAACGAGATGGCTCA 1458
||||.|||||.||.||||.||..||||||||||||.|||.||||||||||.||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 1214 TACCGCCACAGAAGCCTGCTGTTTTAGGAAATGGAGTGAACTCCTTCCAGCTAAATGGTGAGCGAGACGGATCA 1287
Query 1459 TTATGTCAACAACAGAATGAACATAGAGGCACAAACCTTTCAAGAAAAGAAAAGAAAGATGTACCAAAGCCTAT 1532
||||.|||.||.||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.||
Sbjct 1288 TTATATCAGCAGCAGAGTGAGCAAAGAGGCACAAACCTTTCAAGAAAGGAGAAGAAGGACGTCCCGAAACCAAT 1361
Query 1533 TAGTAATGGTCTTCCTCCAACACCTAAAGTGCATATGGGTGCATGTTTTTCAAAAGTTTTTAATGGGTGTCCCT 1606
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1362 TAGTAATGGTCTTCCCCCAACACCTAAAGTGCATATGGGAGCGTGTTTTTCAAAGGTTTTTAATGGATGTCCCT 1435
Query 1607 TGAAAATTCACTGTGCATCATCATGGATAAACCCAGATACTAGAGATCAGTACTTGATATTTGGTGCCGAAGAA 1680
|||||||.||||||||..||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1436 TGAAAATCCACTGTGCCACATCCTGGATAAACCCAGACACGAGAGACCAGTACTTGATATTTGGCGCTGAAGAG 1509
Query 1681 GGGATTTATACCCTCAATCTTAATGAACTTCATGAAACATCAATGGAACAGCTATTCCCTCGAAGGTGTACATG 1754
||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 1510 GGCATTTATACCCTTAATCTCAATGAACTTCATGAAACATCAATGGAACAGCTGTTCCCCCGCAGGTGTACGTG 1583
Query 1755 GTTGTATGTAATGAACAATTGCTTGCTATCAATATCTGGTAAAGCTTCTCAGCTTTATTCCCATAATTTACCAG 1828
|.|||||||.||||||||||||.||||.|||.|.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct 1584 GCTGTATGTGATGAACAATTGCCTGCTGTCAGTCTCGGGCAAAGCCTCTCAGCTTTACTCCCACAACTTACCGG 1657
Query 1829 GGCTTTTTGATTATGCAAGACAAATGCAAAAGTTACCTGTTGCTATTCCAGCACACAAACTCCCTGACAGAATA 1902
|||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||.|||||
Sbjct 1658 GGCTTTTCGATTATGCAAGACAGATGCAGAAGCTTCCAGTAGCCATCCCAGCACACAAGCTCCCCGACCGAATA 1731
Query 1903 CTGCCAAGGAAATTTTCTGTATCAGCAAAAATCCCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGTTGTGTTGTAAGAAA 1976
|||||.|||||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1732 CTGCCCAGGAAATTTGCTGTATCAGCAAAGATTCCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGCTGCGTGGTGAGAAA 1805
Query 1977 TCCTTACACGGGCCATAAATACCTATGTGGAGCACTTCAGACTAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAACCAA 2050
||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1806 TCCTTACACGGGCCATAAGTACCTGTGCGGGGCGCTTCAGACCAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAGCCAA 1879
Query 2051 TGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGATTTTCCTATACCATGTCCACTTAGAATGTTTGAAATGCTGGTA 2124
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||..|.||||||||.||||||||.
Sbjct 1880 TGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGAGTTTCCTATGCCGTGTCCACTCCGGATGTTTGAGATGCTGGTG 1953
Query 2125 GTTCCTGAACAGGAGTACCCTTTAGTTTGTGTTGGTGTCAGTAGAGGTAGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGATT 2198
||.|||||.||||||||||||.|.||.||||||||.|||||.|||||..||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1954 GTCCCTGAGCAGGAGTACCCTCTGGTCTGTGTTGGCGTCAGCAGAGGGCGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGGTT 2027
Query 2199 TGAGACGGTCAATCCAAATTCTACCTCTTCATGGTTTACAGAATCAGATACCCCACAGACAAATGTTACTCATG 2272
|||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||.||||.|||||||..||.|||||||
Sbjct 2028 TGAGACGGTCAATCCCAATTCTACCTCGTCGTGGTTTACAGAGTCAGATGCCCCGCAGACAAGCGTCACTCATG 2101
Query 2273 TAACCCAACTGGAGAGAGATACCATCCTTGTATGCTTGGACTGTTGTATAAAAATAGTAAATCTCCAAGGAAGA 2346
|.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 2102 TGACCCAGCTGGAGAGAGACACCATCCTTGTGTGCTTGGATTGTTGTATAAAAATAGTCAATCTCCAAGGAAGG 2175
Query 2347 TTAAAATCTAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTCACCTTTGATTTCCAGATTGAATCAATAGTGTGCCTACAAGA 2420
||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||
Sbjct 2176 TTGAAATCCAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTCACCTTCGATTTCCAGATAGAGTCCATAGTTTGTCTACAAGA 2249
Query 2421 CAGTGTGCTAGCTTTCTGGAAACATGGAATGCAAGGTAGAAGTTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTT 2494
||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2250 CAGTGTGCTAGCGTTCTGGAAACACGGGATGCAAGGTAGAAGCTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTT 2323
Query 2495 CAGATAGCACAAGAATTTTCAGGCTGCTTGGATCTGACAGGGTCGTGGTTTTGGAAAGTAGGCCAACTGATAAC 2568
||||||.|||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2324 CAGATAACACAAGAATCTTCAGACTCCTTGGATCTGACAGGGTTGTGGTTTTGGAAAGTCGGCCAACTGATAAC 2397
Query 2569 CCCACAGCAAATAGCAATTTGTACATCCTGGCGGGTCATGAAAACAGTTAC 2619
||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 2398 CCAACAGCAAATAGCAATTTATACATCTTGGCGGGTCACGAAAACAGCTAC 2448