Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14919
- Subject:
- XM_011514970.3
- Aligned Length:
- 3025
- Identities:
- 2463
- Gaps:
- 545
Alignment
Query 1 ATGGCCGCCGCGGAGACCCAGTCGCTACGGGAGCAGCCAGAGATGGAAGATGCTAATTCTGAAAAGAGTATAAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCGCCGCGGAGACCCAGTCGCTACGGGAGCAGCCAGAGATGGAAGATGCTAATTCTGAAAAGAGTATAAA 74
Query 75 TGAAGAAAATGGAGAAGTATCAGAAGACCAGTCTCAAAATAAGCACAGTCGTCACAAAAAAAAGAAGCATAAAC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGAAGAAAATGGAGAAGTATCAGAAGACCAGTCTCAAAATAAGCACAGTCGTCACAAAAAAAAGAAGCATAAAC 148
Query 149 ACAGAAGTAAACATAAGAAACATAAACATTCCTCAGAAGAAGACAAGGATAAAAAACATAAACATAAGCATAAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACAGAAGTAAACATAAGAAACATAAACATTCCTCAGAAGAAGACAAGGATAAAAAACATAAACATAAGCATAAA 222
Query 223 CATAAGAAACACAAAAGAAAAGAGGTTATTGATGCTTCTGATAAAGAGGGTATGTCTCCAGCAAAAAGAACTAA 296
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CATAAGAAACACAAAAGAAAAGAGATTATTGATGCTTCTGATAAAGAGGGTATGTCTCCAGCAAAAAGAACTAA 296
Query 297 ACTTGATGATTTAGCTTTGCTAGAAGACTTGGAAAAACAGAGAGCCTTGATTAAGGCCGAACTTGATAATGAGT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACTTGATGATTTAGCTTTGCTAGAAGACTTGGAAAAACAGAGAGCCTTGATTAAGGCCGAACTTGATAATGAGT 370
Query 371 TAATGGAAGGAAAGGTCCAGTCTGGTATGGGGCTCATTTTGCAAGGTTATGAGTCTGGCTCTGAAGAAGAGGGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TAATGGAAGGAAAGGTCCAGTCTGGTATGGGGCTCATTTTGCAAGGTTATGAGTCTGGCTCTGAAGAAGAGGGG 444
Query 445 GAAATTCATGAAAAGGCAAGAAATGGAAATAGGTCTAGTACTAGATCTTCAAGTACAAAGGGGAAACTTGAACT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAATTCATGAAAAGGCAAGAAATGGAAATAGGTCTAGTACTAGATCTTCAAGTACAAAGGGGAAACTTGAACT 518
Query 519 TGTGGACAATAAAATTACTACAAAGAAACGAAGTAAAAGCAGATCCAAAGAACGGACTAGACATAGGTCTGATA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGTGGACAATAAAATTACTACAAAGAAACGAAGTAAAAGCAGATCCAAAGAACGGACTAGACATAGGTCTGATA 592
Query 593 AAAAGAAAAGTAAGGGGGGTATTGAAATCGTTAAAGAGAAAACAACTAGGAGCAAGTCAAAGGAGAGGAAAAAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAAAGAAAAGTAAGGGGGGTATTGAAATCGTTAAAGAGAAAACAACTAGGAGCAAGTCAAAGGAGAGGAAAAAA 666
Query 667 TCTAAAAGCCCATCCAAAAGAAGTAAGTCTCAAGATCAAGCAAGGAAATCAAAATCCCCTACCCTTAGAAGGCG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCTAAAAGCCCATCCAAAAGAAGTAAGTCTCAAGATCAAGCAAGGAAATCAAAATCCCCTACCCTTAGAAGGCG 740
Query 741 ATCTCAAGAGAAAATTGGTAAGGCCAGATCTCCTACTGATGATAAGGGTTAAAATTGAAGATAAAAGTAAATCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATCTCAAGAGAAAATTGGTAAGGCCAGATCTCCTACTGATGATAA-GGTTAAAATTGAAGATAAAAGTAAATCA 813
Query 815 AAAGATAGGAAAAAATCCCCAATTATAAATGAAAGTAGAAGTCGCGATCGAGGTAAAAAATCCAGATCCCCAGT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 AAAGATAGGAAAAAATCCCCAATTATAAATGAAAGTAGAAGTCGCGATCGAGGTAAAAAATCCAGATCCCCAGT 887
Query 889 TGATTTAAGAGGTAAATCCAAAGACAGAAGGTCACGGTCCAAAGAGAGAAAATCAAAACGGTCTGAAACTGATA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 TGATTTAAGAGGTAAATCCAAAGACAGAAGGTCACGGTCCAAAGAGAGAAAATCAAAACGGTCTGAAACTGATA 961
Query 963 AAGAAAAGAAGCCAATTAAATCTCCCTCTAAAGATGCTTCATCTGGGAAAGAAAATAGGTCACCCAGCAGAAGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 AAGAAAAGAAGCCAATTAAATCTCCCTCTAAAGATGCTTCATCTGGGAAAGAAAATAGGTCACCCAGCAGAAGA 1035
Query 1037 CCTGGTCGTAGTCCTAAAAGAAGAAGTTTGTCTCCAAAACCACGTGATAAATCAAGAAGAAGCAGGTCTCCACT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 CCTGGTCGTAGTCCTAAAAGAAGAAGTTTGTCTCCAAAACCACGTGATAAATCAAGAAGAAGCAGGTCTCCACT 1109
Query 1111 TTTGAATGATAGAAGATCTAAGCAGAGCAAATCCCCCTCGCGGACACTGTCTCCTGGGAGAAGAGCCAAGAGCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 TTTGAATGATAGAAGATCTAAGCAGAGCAAATCCCCCTCGCGGACACTGTCTCCTGGGAGAAGAGCCAAGAGCC 1183
Query 1185 GATCCTTAGAAAGAAAACGACGAGAACCAGAGAGGAGACGACTTTCTTCTCCAAGAACACGACCTCGAGATGAT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 GATCCTTAGAAAGAAAACGACGAGAACCAGAGAGGAGACGACTTTCTTCTCCAAGAACACGACCTCGAGATGAT 1257
Query 1259 ATCCTCAGTAGACGTGAAAGATCAAAAGATGCCAGCCCCATCAATAGATGGTCTCCAACCCGAAGAAGAAGTAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 ATCCTCAGTAGACGTGAAAGATCAAAAGATGCCAGCCCCATCAATAGATGGTCTCCAACCCGAAGAAGAAGTAG 1331
Query 1333 ATCTCCCATTAGAAGGAGGTCTCGTTCCCCACTCAGACGTAGCAGGTCTCCAAGAAGAAGAAGCAGATCTACTC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1332 ATCTCCCATTAGAAGGAGGTCTCGTTCCCCACTCAGACGTAGCAGGTCTCCAAGAAGAAGAAGCAGATCTCCTC 1405
Query 1407 GGAGAAGGGACAGAGGTCGGAGGAGCAGATCACGCTTGCGAAGGCGGTCTCGATCACGCGGTGGTCGTAGACGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 GGAGAAGGGACAGAGGTCGGAGGAGCAGATCACGCTTGCGAAGGCGGTCTCGATCACGCGGTGGTCGTAGACGA 1479
Query 1481 AGGAGCAGAAGCAAAGTAAAGGAAGATAAATTTAAAGGAAGTCTTTCTGAAGGAATGAAAGTTGAGCAGGAATC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 AGGAGCAGAAGCAAAGTAAAGGAAGATAAATTTAAAGGAAGTCTTTCTGAAGGAATGAAAGTTGAGCAGGAATC 1553
Query 1555 TTCGTCTGATGATAACCTTGAAGACTTTGATGTAGAGGAAGAAGATGAAGAAGCCCTAATAGAACAGAGAAGAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 TTCGTCTGATGATAACCTTGAAGACTTTGATGTAGAGGAAGAAGATGAAGAAGCCCTAATAGAACAGAGAAGAA 1627
Query 1629 TCCAAAGGCAGGCAATTGTTCAGAAATATAAATACCTTGCTGAAGATAGCAACATGTCTGTGCCATCTGAACCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 TCCAAAGGCAGGCAATTGTTCAGAAATATAAATACCTTGCTGAAGATAGCAACATGTCTGTGCCATCTGAACCA 1701
Query 1703 AGCAGCCCCCAGAGCAGTACGAGAACACGATCACCATCTCCAGATGACATTCTGGAGCGAGTAGCTGCTGATGT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 AGCAGCCCCCAGAGCAGTACGAGAACACGATCACCATCTCCAGATGACATTCTGGAGCGAGTAGCTGCTGATGT 1775
Query 1777 TAAAGAGTATGAACGGGAAAATGTTGATACATTTGAGGCCTCAGTGAAAGCCAAGCATAATCTAATGACAGTTG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 TAAAGAGTATGAACGGGAAAATGTTGATACATTTGAGGCCTCAGTGAAAGCCAAGCATAATCTAATGACAGTTG 1849
Query 1851 AACAGAATAATGGTTCATCTCAGAAGAAGTTGTTGGCACCTGATATGTTTACAGAATCTGATGATATGTTTGCT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 AACAGAATAATGGTTCATCTCAGAAGAAGTTGTTGGCACCTGATATGTTTACAGAATCTGATGATATGTTTGCT 1923
Query 1925 GCGTATTTTGATAGTGCTCGTCTTCGGGCCGCTGGCATTGGAAAAGATTTCAAAGAGAATCCCAACCTCAGAGA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 GCGTATTTTGATAGTGCTCGTCTTCGGGCCGCTGGCATTGGAAAAGATTTCAAAGAGAATCCCAACCTCAGAGA 1997
Query 1999 TAACTGGACCGATGCAGAAGGCTATTATCGTGTGAACATAGGTGAAGTCCTAGATAAACGTTACAATGTGTATG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998 TAACTGGACCGATGCAGAAGGCTATTATCGTGTGAACATAGGTGAAGTCCTAGATAAACGTTACAATGTGTATG 2071
Query 2073 GCTACACTGGGCAAGGTGTATTCAGTAATGTTGTACGAGCCAGAGATAATGCAAGAGCCAACCAAGAAGTGGCT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072 GCTACACTGGGCAAGGTGTATTCAGTAATGTTGTACGAGCCAGAGATAATGCAAGAGCCAACCAAGAAGTGGCT 2145
Query 2147 GTAAAGATCATCAGAAACAATGAGCTCATGCAAAAGACTGGTTTAAAAGAATTAGAGTTCTTGAAAAAACTTAA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146 GTAAAGATCATCAGAAACAATGAGCTCATGCAAAAGACTGGTTTAAAAGAATTAGAGTTCTTGAAAAAACTTAA 2219
Query 2221 TGATGCTGATCCTGATGACAAAATTCATTGTCTGAGA-TCTTCAGGCAC-TCTATCACCAGCAGCATC-TTGTC 2291
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||.||||||||| |||||
Sbjct 2220 TGATGCTGATCCTGATGACAAATTTCATTGTCTGAGACTCTTCAGGCACTTCTATCACAAGCAGCATCTTTGTC 2293
Query 2292 TGGTATTCGAGCCTCTCAGCATGAACTTACGAGAGGTG-TAAAAAAATATGTNAAAGATGTTGGTCTTCATATT 2364
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 2294 TGGTATTCGAGCCTCTCAGCATGAACTTACGAGAGGTGTTAAAAAAATATGGTAAAGATGTTGGTCTTCATATT 2367
Query 2365 AAGNCTGTAAGATCCTATAGTCAGCAGTTGTTCCTGGCATTGAAACTCCTTAAAAGATGCAATATCNTACATGC 2438
||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2368 AAAGCTGTAAGATCCTATAGTCAGCAGTTGTTCCTGGCATTGAAACTCCTTAAAAGATGCAATATCCTACATGC 2441
Query 2439 AGATATCAAGCCAGACAATATCCT---GGTTAATGAATCCAAAACTATTTTAAAGCTTTGCGATTTTGGGTCGG 2509
|||||||||||||||||||||||| ||..|..||.||...|| ||
Sbjct 2442 AGATATCAAGCCAGACAATATCCTGGGGGGAAGGGACTCTGGAA-TA--------------------------- 2487
Query 2510 CTTCACATGTTGCGGATAATGACATAACACCTTATCTTGTCAGTAGATTTTATCGTGCTCCTGAAATCATTATA 2583
Sbjct 2488 -------------------------------------------------------------------------- 2487
Query 2584 GGTAAAAGCTATGACTATGGTATAGATATGTGGTCTGTAGGTTGCACCTTATACGAACTCTATACTGGAAAAAT 2657
Sbjct 2488 -------------------------------------------------------------------------- 2487
Query 2658 TTTATTCCCTGGCAAAACCAATAACCATATGCTGAAGCTTGCAATGGATCTCAAAGGAAAGATGCCAAATAAGA 2731
Sbjct 2488 -------------------------------------------------------------------------- 2487
Query 2732 TGATTCGAAAAGGTGTGTTCAAAGATCAGCATTTTGATCAAAATCTCAACTTCATGTACATAGAAGTTGATAAA 2805
Sbjct 2488 -------------------------------------------------------------------------- 2487
Query 2806 GTAACAGAGAGGGAGAAAGTTACTGTTATGAGCACCATTAATCCAACTAAGGACCTGTTGGCTGACTTGATTGG 2879
Sbjct 2488 -------------------------------------------------------------------------- 2487
Query 2880 GTGCCAGAGACTTCCTGAAGACCAACGTAAGAAAGTACACCAGCTAAAGGACTTGTTGGACCAGATTCTGATGT 2953
Sbjct 2488 -------------------------------------------------------------------------- 2487
Query 2954 TGGACCCAGCTAAACGAATTAGCATCAACCAGGCCCTACAGCACGCCTTCATCCAGGAAAAAATT 3018
Sbjct 2488 ----------------------------------------------------------------- 2487