Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14919
• Subject: XM_017011416.2
• Aligned Length: 3022
• Identities: 3008
• Gaps: 5

Alignment

Query    1  ATGGCCGCCGCGGAGACCCAGTCGCTACGGGAGCAGCCAGAGATGGAAGATGCTAATTCTGAAAAGAGTATAAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCGCCGCGGAGACCCAGTCGCTACGGGAGCAGCCAGAGATGGAAGATGCTAATTCTGAAAAGAGTATAAA  74

Query   75  TGAAGAAAATGGAGAAGTATCAGAAGACCAGTCTCAAAATAAGCACAGTCGTCACAAAAAAAAGAAGCATAAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAAGAAAATGGAGAAGTATCAGAAGACCAGTCTCAAAATAAGCACAGTCGTCACAAAAAAAAGAAGCATAAAC  148

Query  149  ACAGAAGTAAACATAAGAAACATAAACATTCCTCAGAAGAAGACAAGGATAAAAAACATAAACATAAGCATAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACAGAAGTAAACATAAGAAACATAAACATTCCTCAGAAGAAGACAAGGATAAAAAACATAAACATAAGCATAAA  222

Query  223  CATAAGAAACACAAAAGAAAAGAGGTTATTGATGCTTCTGATAAAGAGGGTATGTCTCCAGCAAAAAGAACTAA  296
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATAAGAAACACAAAAGAAAAGAGATTATTGATGCTTCTGATAAAGAGGGTATGTCTCCAGCAAAAAGAACTAA  296

Query  297  ACTTGATGATTTAGCTTTGCTAGAAGACTTGGAAAAACAGAGAGCCTTGATTAAGGCCGAACTTGATAATGAGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACTTGATGATTTAGCTTTGCTAGAAGACTTGGAAAAACAGAGAGCCTTGATTAAGGCCGAACTTGATAATGAGT  370

Query  371  TAATGGAAGGAAAGGTCCAGTCTGGTATGGGGCTCATTTTGCAAGGTTATGAGTCTGGCTCTGAAGAAGAGGGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAATGGAAGGAAAGGTCCAGTCTGGTATGGGGCTCATTTTGCAAGGTTATGAGTCTGGCTCTGAAGAAGAGGGG  444

Query  445  GAAATTCATGAAAAGGCAAGAAATGGAAATAGGTCTAGTACTAGATCTTCAAGTACAAAGGGGAAACTTGAACT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAATTCATGAAAAGGCAAGAAATGGAAATAGGTCTAGTACTAGATCTTCAAGTACAAAGGGGAAACTTGAACT  518

Query  519  TGTGGACAATAAAATTACTACAAAGAAACGAAGTAAAAGCAGATCCAAAGAACGGACTAGACATAGGTCTGATA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTGGACAATAAAATTACTACAAAGAAACGAAGTAAAAGCAGATCCAAAGAACGGACTAGACATAGGTCTGATA  592

Query  593  AAAAGAAAAGTAAGGGGGGTATTGAAATCGTTAAAGAGAAAACAACTAGGAGCAAGTCAAAGGAGAGGAAAAAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAAAGAAAAGTAAGGGGGGTATTGAAATCGTTAAAGAGAAAACAACTAGGAGCAAGTCAAAGGAGAGGAAAAAA  666

Query  667  TCTAAAAGCCCATCCAAAAGAAGTAAGTCTCAAGATCAAGCAAGGAAATCAAAATCCCCTACCCTTAGAAGGCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTAAAAGCCCATCCAAAAGAAGTAAGTCTCAAGATCAAGCAAGGAAATCAAAATCCCCTACCCTTAGAAGGCG  740

Query  741  ATCTCAAGAGAAAATTGGTAAGGCCAGATCTCCTACTGATGATAAGGGTTAAAATTGAAGATAAAAGTAAATCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATCTCAAGAGAAAATTGGTAAGGCCAGATCTCCTACTGATGATAA-GGTTAAAATTGAAGATAAAAGTAAATCA  813

Query  815  AAAGATAGGAAAAAATCCCCAATTATAAATGAAAGTAGAAGTCGCGATCGAGGTAAAAAATCCAGATCCCCAGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  AAAGATAGGAAAAAATCCCCAATTATAAATGAAAGTAGAAGTCGCGATCGAGGTAAAAAATCCAGATCCCCAGT  887

Query  889  TGATTTAAGAGGTAAATCCAAAGACAGAAGGTCACGGTCCAAAGAGAGAAAATCAAAACGGTCTGAAACTGATA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  TGATTTAAGAGGTAAATCCAAAGACAGAAGGTCACGGTCCAAAGAGAGAAAATCAAAACGGTCTGAAACTGATA  961

Query  963  AAGAAAAGAAGCCAATTAAATCTCCCTCTAAAGATGCTTCATCTGGGAAAGAAAATAGGTCACCCAGCAGAAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  AAGAAAAGAAGCCAATTAAATCTCCCTCTAAAGATGCTTCATCTGGGAAAGAAAATAGGTCACCCAGCAGAAGA  1035

Query 1037  CCTGGTCGTAGTCCTAAAAGAAGAAGTTTGTCTCCAAAACCACGTGATAAATCAAGAAGAAGCAGGTCTCCACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  CCTGGTCGTAGTCCTAAAAGAAGAAGTTTGTCTCCAAAACCACGTGATAAATCAAGAAGAAGCAGGTCTCCACT  1109

Query 1111  TTTGAATGATAGAAGATCTAAGCAGAGCAAATCCCCCTCGCGGACACTGTCTCCTGGGAGAAGAGCCAAGAGCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  TTTGAATGATAGAAGATCTAAGCAGAGCAAATCCCCCTCGCGGACACTGTCTCCTGGGAGAAGAGCCAAGAGCC  1183

Query 1185  GATCCTTAGAAAGAAAACGACGAGAACCAGAGAGGAGACGACTTTCTTCTCCAAGAACACGACCTCGAGATGAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  GATCCTTAGAAAGAAAACGACGAGAACCAGAGAGGAGACGACTTTCTTCTCCAAGAACACGACCTCGAGATGAT  1257

Query 1259  ATCCTCAGTAGACGTGAAAGATCAAAAGATGCCAGCCCCATCAATAGATGGTCTCCAACCCGAAGAAGAAGTAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  ATCCTCAGTAGACGTGAAAGATCAAAAGATGCCAGCCCCATCAATAGATGGTCTCCAACCCGAAGAAGAAGTAG  1331

Query 1333  ATCTCCCATTAGAAGGAGGTCTCGTTCCCCACTCAGACGTAGCAGGTCTCCAAGAAGAAGAAGCAGATCTACTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1332  ATCTCCCATTAGAAGGAGGTCTCGTTCCCCACTCAGACGTAGCAGGTCTCCAAGAAGAAGAAGCAGATCTCCTC  1405

Query 1407  GGAGAAGGGACAGAGGTCGGAGGAGCAGATCACGCTTGCGAAGGCGGTCTCGATCACGCGGTGGTCGTAGACGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  GGAGAAGGGACAGAGGTCGGAGGAGCAGATCACGCTTGCGAAGGCGGTCTCGATCACGCGGTGGTCGTAGACGA  1479

Query 1481  AGGAGCAGAAGCAAAGTAAAGGAAGATAAATTTAAAGGAAGTCTTTCTGAAGGAATGAAAGTTGAGCAGGAATC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  AGGAGCAGAAGCAAAGTAAAGGAAGATAAATTTAAAGGAAGTCTTTCTGAAGGAATGAAAGTTGAGCAGGAATC  1553

Query 1555  TTCGTCTGATGATAACCTTGAAGACTTTGATGTAGAGGAAGAAGATGAAGAAGCCCTAATAGAACAGAGAAGAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  TTCGTCTGATGATAACCTTGAAGACTTTGATGTAGAGGAAGAAGATGAAGAAGCCCTAATAGAACAGAGAAGAA  1627

Query 1629  TCCAAAGGCAGGCAATTGTTCAGAAATATAAATACCTTGCTGAAGATAGCAACATGTCTGTGCCATCTGAACCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628  TCCAAAGGCAGGCAATTGTTCAGAAATATAAATACCTTGCTGAAGATAGCAACATGTCTGTGCCATCTGAACCA  1701

Query 1703  AGCAGCCCCCAGAGCAGTACGAGAACACGATCACCATCTCCAGATGACATTCTGGAGCGAGTAGCTGCTGATGT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702  AGCAGCCCCCAGAGCAGTACGAGAACACGATCACCATCTCCAGATGACATTCTGGAGCGAGTAGCTGCTGATGT  1775

Query 1777  TAAAGAGTATGAACGGGAAAATGTTGATACATTTGAGGCCTCAGTGAAAGCCAAGCATAATCTAATGACAGTTG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776  TAAAGAGTATGAACGGGAAAATGTTGATACATTTGAGGCCTCAGTGAAAGCCAAGCATAATCTAATGACAGTTG  1849

Query 1851  AACAGAATAATGGTTCATCTCAGAAGAAGTTGTTGGCACCTGATATGTTTACAGAATCTGATGATATGTTTGCT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850  AACAGAATAATGGTTCATCTCAGAAGAAGTTGTTGGCACCTGATATGTTTACAGAATCTGATGATATGTTTGCT  1923

Query 1925  GCGTATTTTGATAGTGCTCGTCTTCGGGCCGCTGGCATTGGAAAAGATTTCAAAGAGAATCCCAACCTCAGAGA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924  GCGTATTTTGATAGTGCTCGTCTTCGGGCCGCTGGCATTGGAAAAGATTTCAAAGAGAATCCCAACCTCAGAGA  1997

Query 1999  TAACTGGACCGATGCAGAAGGCTATTATCGTGTGAACATAGGTGAAGTCCTAGATAAACGTTACAATGTGTATG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998  TAACTGGACCGATGCAGAAGGCTATTATCGTGTGAACATAGGTGAAGTCCTAGATAAACGTTACAATGTGTATG  2071

Query 2073  GCTACACTGGGCAAGGTGTATTCAGTAATGTTGTACGAGCCAGAGATAATGCAAGAGCCAACCAAGAAGTGGCT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072  GCTACACTGGGCAAGGTGTATTCAGTAATGTTGTACGAGCCAGAGATAATGCAAGAGCCAACCAAGAAGTGGCT  2145

Query 2147  GTAAAGATCATCAGAAACAATGAGCTCATGCAAAAGACTGGTTTAAAAGAATTAGAGTTCTTGAAAAAACTTAA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146  GTAAAGATCATCAGAAACAATGAGCTCATGCAAAAGACTGGTTTAAAAGAATTAGAGTTCTTGAAAAAACTTAA  2219

Query 2221  TGATGCTGATCCTGATGACAAAATTCATTGTCTGAGA-TCTTCAGGCAC-TCTATCACCAGCAGCATC-TTGTC  2291
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||.||||||||| |||||
Sbjct 2220  TGATGCTGATCCTGATGACAAATTTCATTGTCTGAGACTCTTCAGGCACTTCTATCACAAGCAGCATCTTTGTC  2293

Query 2292  TGGTATTCGAGCCTCTCAGCATGAACTTACGAGAGGTG-TAAAAAAATATGTNAAAGATGTTGGTCTTCATATT  2364
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 2294  TGGTATTCGAGCCTCTCAGCATGAACTTACGAGAGGTGTTAAAAAAATATGGTAAAGATGTTGGTCTTCATATT  2367

Query 2365  AAGNCTGTAAGATCCTATAGTCAGCAGTTGTTCCTGGCATTGAAACTCCTTAAAAGATGCAATATCNTACATGC  2438
            ||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2368  AAAGCTGTAAGATCCTATAGTCAGCAGTTGTTCCTGGCATTGAAACTCCTTAAAAGATGCAATATCCTACATGC  2441

Query 2439  AGATATCAAGCCAGACAATATCCTGGTTAATGAATCCAAAACTATTTTAAAGCTTTGCGATTTTGGGTCGGCTT  2512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2442  AGATATCAAGCCAGACAATATCCTGGTTAATGAATCCAAAACTATTTTAAAGCTTTGCGATTTTGGGTCGGCTT  2515

Query 2513  CACATGTTGCGGATAATGACATAACACCTTATCTTGTCAGTAGATTTTATCGTGCTCCTGAAATCATTATAGGT  2586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516  CACATGTTGCGGATAATGACATAACACCTTATCTTGTCAGTAGATTTTATCGTGCTCCTGAAATCATTATAGGT  2589

Query 2587  AAAAGCTATGACTATGGTATAGATATGTGGTCTGTAGGTTGCACCTTATACGAACTCTATACTGGAAAAATTTT  2660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2590  AAAAGCTATGACTATGGTATAGATATGTGGTCTGTAGGTTGCACCTTATACGAACTCTATACTGGAAAAATTTT  2663

Query 2661  ATTCCCTGGCAAAACCAATAACCATATGCTGAAGCTTGCAATGGATCTCAAAGGAAAGATGCCAAATAAGATGA  2734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2664  ATTCCCTGGCAAAACCAATAACCATATGCTGAAGCTTGCAATGGATCTCAAAGGAAAGATGCCAAATAAGATGA  2737

Query 2735  TTCGAAAAGGTGTGTTCAAAGATCAGCATTTTGATCAAAATCTCAACTTCATGTACATAGAAGTTGATAAAGTA  2808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2738  TTCGAAAAGGTGTGTTCAAAGATCAGCATTTTGATCAAAATCTCAACTTCATGTACATAGAAGTTGATAAAGTA  2811

Query 2809  ACAGAGAGGGAGAAAGTTACTGTTATGAGCACCATTAATCCAACTAAGGACCTGTTGGCTGACTTGATTGGGTG  2882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2812  ACAGAGAGGGAGAAAGTTACTGTTATGAGCACCATTAATCCAACTAAGGACCTGTTGGCTGACTTGATTGGGTG  2885

Query 2883  CCAGAGACTTCCTGAAGACCAACGTAAGAAAGTACACCAGCTAAAGGACTTGTTGGACCAGATTCTGATGTTGG  2956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2886  CCAGAGACTTCCTGAAGACCAACGTAAGAAAGTACACCAGCTAAAGGACTTGTTGGACCAGATTCTGATGTTGG  2959

Query 2957  ACCCAGCTAAACGAATTAGCATCAACCAGGCCCTACAGCACGCCTTCATCCAGGAAAAAATT  3018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2960  ACCCAGCTAAACGAATTAGCATCAACCAGGCCCTACAGCACGCCTTCATCCAGGAAAAAATT  3021