Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14928
• Subject: NM_023058.3
• Aligned Length: 1500
• Identities: 1259
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ATGCTAGAACGGCCTCCTGCACTGGCCATGCCCATGCCCACGGAGGGCACCCCGCCACCTCTGAGTGGCACCCC  74
                                       |||.||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||
Sbjct    1  ---------------------------ATGACCATGCCCACCGAGGGCACCCCACCACCCCTAAGTGGTACCCC  47

Query   75  CATCCCAGTCCCAGCCTACTTCCGCCACGCAGAACCTGGATTCTCCCTCAAGAGGCCCAGGGGGCTCAGCCGGA  148
            |||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..||||.|||||.||||
Sbjct   48  CATCCCAGTTCCAGCTTACTTCCGACACGCAGAGCCTGGTTTCTCCCTCAAAAGGCCTGGGGGCCTCAGTCGGA  121

Query  149  GCCTCCCACCTCCGCCCCCTGCCAAGGGCAGCATTCCCATCAGCCGCCTCTTCCCTCCTCGGACCCCAGGCTGG  222
            ||||||||||||.||||||||||||||||.||||.||..|||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  122  GCCTCCCACCTCGGCCCCCTGCCAAGGGCTGCATCCCTGTCAGCCGTCTATTCCCCCCTCGCACCCCAGGCTGG  195

Query  223  CACCAGCTGCAGCCCCGGCGGGTGTCATTCCGGGGCGAGGCCTCAGAGACTCTGCAGAGCCCTGGGTATGACCC  296
            |||||||..|||||||||.|||||||.||||.|.|.|||.||||||||.|.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  196  CACCAGCCCCAGCCCCGGAGGGTGTCTTTCCTGTGTGAGACCTCAGAGCCCCTGCAGAGTCCTGGGTATGACCC  269

Query  297  AAGCCGGCCAGAGTCCTTCTTCCAGCAGAGCTTCCAGAGGCTCAGCCGCCTGGGCCATGGCTCCTACGGAGAGG  370
            .||||||||.|||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct  270  GAGCCGGCCCGAGTCCTTCTTTCAGCAGAACTTCCAGAGGCTCAGCCGCCTGGGTCATGGCTCATATGGAGAAG  343

Query  371  TCTTCAAGGTGCGCTCCAAGGAGGACGGCCGGCTCTATGCGGTAAAGCGTTCCATGTCACCATTCCGGGGCCCC  444
            ||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||.|||||.|.||||||.||||||||.||||||
Sbjct  344  TCTTCAAGGTGCGCTCTAAGGAAGATGGGCGACTCTATGCTGTTAAGCGCTACATGTCGCCATTCCGCGGCCCC  417

Query  445  AAGGACCGGGCCCGCAAGTTGGCCGAGGTGGGCAGCCACGAGAAGGTGGGGCAGCACCCATGCTGCGTGCGGCT  518
            ||.|||||..|.||.||..||||.|||||.||..||||.|||||.|||||||||||.|||..|||||||.|.||
Sbjct  418  AAAGACCGAACTCGTAAACTGGCTGAGGTAGGTGGCCATGAGAAAGTGGGGCAGCATCCACACTGCGTGAGACT  491

Query  519  GGAGCAGGCCTGGGAGGAGGGCGGCATCCTGTACCTGCAGACGGAGCTGTGCGGGCCCAGCCTGCAGCAACACT  592
            |||||.|||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  GGAGCGGGCCTGGGAGGAGGGTGGCATCCTATACCTGCAGACAGAACTCTGCGGGCCCAGCCTGCAGCAACACT  565

Query  593  GTGAGGCCTGGGGTGCCAGCCTGCCTGAGGCCCAGGTCTGGGGCTACCTGCGGGACACGCTGCTTGCCCTGGCC  666
            ||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||..||.||.||.||||.|
Sbjct  566  GTGAAGCCTGGGGGGCCAGCCTGCCAGAGGCCCAGGTCTGGGGCTACTTGCGGGACATTCTTCTGGCTCTGGAC  639

Query  667  CATCTGCACAGCCAGGGCCTGGTGCACCTTGATGTCAAGCCTGCCAACATCTTCCTGGGGCCCCGGGGCCGCTG  740
            |||||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct  640  CATCTACATAGTCAAGGCCTAGTTCACCTTGATGTCAAGCCTGCCAACATCTTCTTGGGCCCCCGGGGCCGCTG  713

Query  741  CAAGCTGGGTGACTTCGGACTGCTGGTGGAGCTGGGTACAGCAGGAGCTGGTGAGGTCCAGGAGGGAGACCCCC  814
            |||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||.||||.||.|||||.||||.||||||||||||.||.|
Sbjct  714  CAAGCTGGGCGACTTTGGACTACTGGTGGAGCTGGGTTCAGCCGGTGCTGGCGAGGCCCAGGAGGGAGATCCTC  787

Query  815  GCTACATGGCCCCCGAGCTGCTGCAGGGCTCCTATGGGACAGCAGCGGATGTGTTCAGTCTGGGCCTCACCATC  888
            |||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  788  GCTACATGGCCCCAGAACTGCTGCAGGGCTCTTATGGGACAGCAGCAGATGTGTTCAGTCTGGGTCTCACCATC  861

Query  889  CTGGAAGTGGCATGCAACATGGAGCTGCCCCACGGTGGGGAGGGCTGGCAGCAGCTGCGCCAGGGCTACCTGCC  962
            .||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct  862  TTGGAAGTGGCCTGTAACATGGAACTGCCCCATGGTGGGGAGGGCTGGCAGCAGCTGCGCCAGGGATACTTGCC  935

Query  963  CCCTGAGTTCACTGCCGGTCTGTCTTCCGAGCTGCGTTCTGTCCTTGTCATGATGCTGGAGCCAGACCCCAAGC  1036
            |||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct  936  CCCTGAGTTCACTGCTGGTCTGTCTTCTGAGCTGCGTTCTGTCCTCGCCATGATGCTGGAGCCTGACCCCCAGC  1009

Query 1037  TGCGGGCCACGGCCGAGGCCCTGCTGGCACTGCCTGTGTTGAGGCAGCCGCGGGCCTGGGGTGTGCTGTGGTGC  1110
            |.||.|||||.||.|||||||||.||||..|.||..||.||||||||||.||..|||||..|||.|||||||..
Sbjct 1010  TTCGAGCCACAGCTGAGGCCCTGTTGGCCTTACCCATGCTGAGGCAGCCACGTCCCTGGAATGTTCTGTGGTAT  1083

Query 1111  ATGGCAGCGGAGGCCCTGAGCCGAGGGTGGGCCCTGTGGCAGGCCCTGCTTGCCCTGCTCTGCTGGCTCTGGCA  1184
            |||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.|..|.||||||||||||||||||||
Sbjct 1084  ATGGCTGCGGAAGCCCTAAGTCGAGGCTGGGCCCTGTGGCAGGCCCTGGTCACTCTGCTCTGCTGGCTCTGGCA  1157

Query 1185  TGGGCTGGCTCACCCTGCCAGCTGGCTACAGCCCCTGGGCCCGCCAGCCACCCCGCCTGGCTCACCACCCTGCA  1258
            .|||||||..||.||||||||.|||||.|||||.|..|||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 1158  CGGGCTGGTGCATCCTGCCAGTTGGCTGCAGCCTCCAGGCCCACCGGCCACACCACCTGGCTCTCCACCTTGCA  1231

Query 1259  GTTTGCTCCTGGACAGCAGCCTCTCCAGCAACTGGGATGACGACAGCCTAGGGCCTTCACTCTCCCCTGAGGCT  1332
            |....|||||||||||||.|||||||||||.|||||||.|.||||||.||||.||.|||||||||||.|||.|.
Sbjct 1232  GCCCCCTCCTGGACAGCACCCTCTCCAGCAGCTGGGATAATGACAGCATAGGTCCCTCACTCTCCCCAGAGACC  1305

Query 1333  GTCCTGGCCCGG---ACTGTGGGGAGCACCTCCACCCCCCGGAGCAGGTGCACACCCAGGGATGCCCTGGACCT  1403
            ||||||.|||||   |||   .|.||.|||||.|||||.|||.||||||.||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1306  GTCCTGTCCCGGATCACT---AGAAGAACCTCTACCCCTCGGGGCAGGTACATACCTAGGGATGCCCTGGACCT  1376

Query 1404  AAGTGACATCAACTCAGAGCCTCCTCGGGGCTCCTTCCCCTCCTTTGAGCCTCGGAACCTCCTCAGCCTGTTTG  1477
            ||.|||..|..|||||||||||||..|.||..|||.||||.||||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 1377  AACTGATGTGGACTCAGAGCCTCCAAGAGGTCCCTGCCCCACCTTTGAGCCAAGGAACCTCCTCAGCCTGTTTG  1450

Query 1478  AGGACACCCTAGACCCAACC  1497
            |||||.|||||||||||.||
Sbjct 1451  AGGACTCCCTAGACCCAGCC  1470