Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14933
• Subject: NM_001029850.4
• Aligned Length: 4475
• Identities: 3885
• Gaps: 157

Alignment

Query    1  ATGTCCAAAGTGATCCAGAAGAAGAACCACTGGACTAGCAGGGTTCACGAATGCACCGTGAAGCGGGGACCCCA  74
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGAAAGTGATCCAGAAGAAGAACCACTGGACTGGCCGCGTTCACGAGTGCACCGTGAAGCGGGGACCCCA  74

Query   75  GGGCGAGCTGGGGGTGACGGTGCTGGGAGGCGCGGAGCACGGGGAGTTTCCGTACGTCGGAGCGGTGGCGGCGG  148
            |||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  GGGCGAGCTGGGGGTGACGGTCCTGGGGGGCGCGGAGCATGGGGAGTTTCCGTACGTGGGGGCGGTGGCGGCGG  148

Query  149  TCGAGGCAGCGGGGCTTCCCGGCGGCGGCGAGGGCCCGAGGCTGGGCGAAGGGGAGCTGCTTCTGGAGGTGCAG  222
            .||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||.|||||.||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  CCGAGGCGGCGGGGCTTCCCGGCGGTGGCGAGGGGCCGAAGCTGGCCGAAGGTGAGCTGCTGCTGGAGGTGCAG  222

Query  223  GGGGTCCGGGTGTCCGGCTTGCCCCGCTATGACGTGCTGGGGGTCATCGACAGCTGCAAGGAGGCCGTCACCTT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGGTCCGGGTGTCCGGCTTGCCCCGCTATGACGTGCTGGGAGTCATCGACAGCTGCAAGGAGGCCGTCACCTT  296

Query  297  CAAGGCCGTCAGACAAGGAGGAAGGCTGAACAAGGACCTGCGACATTTTCTCAATCAGCGATTCCAGAAGGGGT  370
            |||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct  297  CAAAGCCGTCAGACAAGGAGGAAGGCTCAACAAGGACCTACGACATTTCCTCAACCAACGGTTCCAGAAGGGGT  370

Query  371  CTCCTGATCATGAGCTCCAGCAGACCATAAGGGATAACCTTTACCGCCATGCTGTGCCTTGCACAACCCGATCT  444
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  CTCCAGATCATGAGCTCCAGCAGACCATAAGGGACAACCTCTACCGCCATGCTGTGCCTTGCACAACCCGGTCT  444

Query  445  CCCAGAGAAGGAGAAGTGCCTGGCGTGGACTATAACTTTCTGACTGTGAAGGAGTTCTTGGACCTCGAGCAGAG  518
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCAGAGAAGGAGAAGTGCCTGGTGTGGATTACAGCTTTCTGACTGTGAAGGAGTTCTTGGACCTCGAGCAGAG  518

Query  519  TGGGACTCTTCTGGAAGTCGGCACCTATGAAGGAAACTATTATGGGACACCCAAGCCTCCTAGCCAGCCAGTCA  592
            .|||||.||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGGGACCCTGTTGGAAGTCGGCACCTATGAAGGAAACTATTATGGGACACCCAAACCTCCTAGCCAGCCAGTCA  592

Query  593  GTGGGAAAGTGATCACGACGGATGCCTTGCACAGCCTTCAGTCTGGCTCTAAGCAGTCGACCCCGAAGCGAACC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  593  GTGGGAAAGTGATCACGACGGATGCCTTGCACAGCCTGCAGTCTGGCTCCAAGCAGTCGACCCCTAAGCGAACA  666

Query  667  AAGTCCTAC-ATGATATGCAAAATGCTGGCATAGTCCACGCGGAGAATGAGGAGGAGGATGACGTTCCTGAAAT  739
            ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct  667  AAGTCCTACAATGATATGCAAAATGCTGGCATAGTCCACCCGGAGAATGAGGAGGAGGAGGATGTCCCTGAAAT  740

Query  740  GAACAGCAGCTTTACAGCCGATTCTGGTGAACAAGAGGAGCACACTCTCCAAGAAACAGCATTACCACCTGTGA  813
            ||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||.||.|..|.||.|||||||
Sbjct  741  GAACAGTAGCTTTACAGCCGACTCTGGAGACCAGGACGAGCACACTCTCCAAGAAGCAACGCTCCCGCCTGTGA  814

Query  814  ATAGTAGCATCATCGCTGCTCCCATCACGGACCCTTCTCAGAAGTTCCCTCAATACCTACCTCTTTCTGCAGAG  887
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATAGTAGCATCCTCGCTGCTCCCATCACGGACCCTTCTCAGAAGTTCCCTCAGTACCTACCTCTTTCTGCAGAG  888

Query  888  GATAATTTAGGTCCTCTACCTGAAAACTGGGAGATGGCCTATACTGAAAATGGAGAAGTCTATTTTATAGACCA  961
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  889  GATAATTTAGGTCCTCTACCTGAAAACTGGGAGATGGCCTATACTGAAAATGGAGAAGTCTATTTCATAGACCA  962

Query  962  TAACACGAAAACAACATCTTGGTTAGACCCTCGGTGCCTAAACAAGCAGCAGAAGCCACTGGAAGAGTGTGAAG  1035
            .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  963  CAACACGAAAACAACATCATGGTTAGACCCTCGGTGCCTGAACAAACAGCAGAAGCCTCTGGAAGAATGTGAAG  1036

Query 1036  ATGATGAAGGGGTACACACCGAGGAGCTGGACAGTGAACTAGAACTGCCTGCTGGTTGGGAAAAGATTGAAGAC  1109
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGATGAAGGGGTACACACCGAGGAGCTGGACAGTGAACTAGAGTTGCCTGCTGGCTGGGAAAAGATTGAAGAC  1110

Query 1110  CCTGTCTATGGTATCTACTATGTAGACCACATCAACAGGAAGACACAATATGAGAACCCGGTTCTAGAAGCCAA  1183
            ||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 1111  CCTGTCTACGGTGTCTACTATGTAGACCACATCAACAGGAAGACGCAATATGAAAACCCAGTCCTAGAAGCCAA  1184

Query 1184  ACGGAAGAAGCAGCTTGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC  1257
            |||||||||.|||||||                  ||||||||||||||||||||||||..||||..|.|||||
Sbjct 1185  ACGGAAGAAACAGCTTG------------------AACAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCCTCAGCCACCGCAGC  1240

Query 1258  AGCAGACAGAAGAATGGACAGAAGATCACTCAGCCCTTGTGCCTCCTGTTATTCCAAACCACCCTCCAAGCAAT  1331
                  |||||||.||||||||.|||||..||.|..||||||||||||||..|||...|||.||.||.||||||
Sbjct 1241  ------CAGAAGAGTGGACAGAGGATCATGCATCTGTTGTGCCTCCTGTTGCTCCTTCCCATCCCCCGAGCAAT  1308

Query 1332  CCAGAGCCAGCCAGAGAAGTTCCACTTCAGGGCAAACCCTTTTTTACACGAAACCCTTCTGAGTTGAAAGGCAA  1405
            ||.|||||||||||.|||..||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||.||||||||||
Sbjct 1309  CCGGAGCCAGCCAGGGAAACTCCACTTCAGGGCAAACCTTTTTTTACAAGAAACCCCTCTGAGCTGAAAGGCAA  1382

Query 1406  GTTCATTCACACAAAGCTGCGGAAAAGCAGTCGTGGCTTTGGCTTCACGGTGGTTGGAGGGGATGAACCTGATG  1479
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 1383  GTTCATTCACACGAAGCTACGGAAAAGCAGCCGAGGCTTTGGCTTCACGGTGGTTGGAGGAGACGAGCCTGATG  1456

Query 1480  AGTTTCTCCAGATCAAGAGCTTGGTCCTAGATGGTCCTGCTGCATTGGATGGCAAGATGGAAACAGGGGATGTG  1553
            ||||.||.||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1457  AGTTCCTGCAGATCAAGAGCCTCGTCCTCGATGGTCCTGCCGCACTGGATGGCAAGATGGAGACAGGGGATGTA  1530

Query 1554  ATTGTAAGTGTGAATGACACCTGTGTTTTGGGACACACACATGCTCAAGTTGTGAAGATCTTCCAGTCCATCCC  1627
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1531  ATTGTGAGTGTGAATGACACCTGTGTTTTGGGACACACACATGCTCAAGTTGTGAAAATCTTCCAGTCCATTCC  1604

Query 1628  CATTGGTGCCAGCGTGGACCTTGAACTCTGCCGAGGTTATCCATTGCCTTTTGATCCAGATGACCCCAATACAA  1701
            ||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 1605  CATTGGTGCCAGTGTGGACCTTGAACTCTGCAGAGGTTATCCATTGCCTTTTGACCCGGATGACCCTAATACAA  1678

Query 1702  GTTTAGTGACCTCGGTAGCCATTTTGGATAAAGAACCAATTATTGTGAATGGGCAAGAGACCTATGATTCACCA  1775
            ||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1679  GTTTAGTGACCTCGGTGGCCATTTTGGACAAAGAACCAATTATTGTAAATGGACAAGAGACCTACGATTCACCA  1752

Query 1776  GCTAGCCACAGTAGTAAAACAGGCAAAGTCAATGGCATGAAGGATGCCAGGCCAAGCAGCCCAGCGGACGTGGC  1849
            ||.||||||||||||||||||||||||||||...||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1753  GCGAGCCACAGTAGTAAAACAGGCAAAGTCAGCAGCATGAAGGATGCCAGGCCAAGCAGCCCTGCTGATGTGGC  1826

Query 1850  TTCAAATAGTTCTCATGGTTATCCTAATGACACTGTTTCTTTGGCTTCCTCCATAGCCACTCAGCCAGAACTCA  1923
            |||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 1827  TTCCAACAGCTCTCATGGTTATCCCAACGACACAGTCTCCTTGGCTTCCTCCATAGCCACCCAGCCAGAGCTAA  1900

Query 1924  TAACTGTTCATATTGTCAAAGGGCCAATGGGCTTTGGTTTTACTATCGCAGACAGTCCTGGTGGGGGTGGCCAA  1997
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1901  TAACTGTTCACATAGTCAAAGGGCCAATGGGATTTGGCTTTACGATCGCAGACAGTCCCGGTGGGGGTGGCCAA  1974

Query 1998  AGAGTGAAACAGATTGTTGACAGCCCAAGGTGCCGAGGCCTGAAAGAAGGGGATCTCATAGTGGAAGTTAATAA  2071
            |||||||||||||||||||||||.|||.|.|||.|||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 1975  AGAGTGAAACAGATTGTTGACAGTCCACGCTGCAGAGGCCTCAAAGAAGGGGATCTTATCGTGGAGGTGAATAA  2048

Query 2072  GAAGAACGTGCAGGCCCTAACTCACAACCAAGTGGTGGATATGCTGGTTGAGTGTCCTAAGGGAAGTGAGGTCA  2145
            ||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 2049  GAAGAACGTGCAGGCCCTGACGCACAATCAAGTCGTGGATATGCTGATTGAATGTCCCAAGGGAAGTGAGGTCA  2122

Query 2146  CATTGTTGGTGCAACGAGGAGGGCTGCCAGTTCCCAAGAAGAGCCCAAAGTCGCAACCACTGGAAAGGAAAGAC  2219
            ||.||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 2123  CACTGTTGGTGCAGCGAGGAGGGCTACCAGTTCCCAAGAAGAGCCCAAAGTCGCAGCCACTGGAGAGGAAAGAC  2196

Query 2220  AGCCAGAATAGTTCTCAGCACAGTGTTTCCAGCCACCGAAGCCTGCACACAGCATCCCCAAGCCACAGCACACA  2293
            |||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||.|||.|||
Sbjct 2197  AGCCAGAATAGCTCCCAGCACAGCGTCTCCAGCCACCGGAGCCTGCACACTGCGTCCCCGAGCCACGGCATACA  2270

Query 2294  GGTGCTCCCCGAGTTCCCACCTGCAGAGGCCCAAGCTCCAGATCAAACTGACAGCTCTGGCCAGAAAAAACCAG  2367
            |||||||||.||||.||.|||||||||.||||..|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 2271  GGTGCTCCCTGAGTACCTACCTGCAGACGCCCCTGCTCCAGATCAGACCGACAGCTCTGGGCAGAAAAAGCCAG  2344

Query 2368  ATCCTTTTAAAATCTGGGCCCAGTCCAGGAGCATGTATGAAAACCGAC--------------------------  2415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                          
Sbjct 2345  ATCCTTTTAAAATCTGGGCCCAGTCCAGGAGCATGTATGAAAACCGACCTATGTCACCTTCGCCTGCATCAGGA  2418

Query 2416  ----------------------------------------------------------TTCCAGATTACCAGGA  2431
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct 2419  TTGAGCAAGGGTGAAAGAGACAGAGAAATCAATTCCACGAATTTTGGAGAATGTCAGATTCCAGATTACCAGGA  2492

Query 2432  ACAGGACATCTTCCTCTGGAGAAAAGAGACTGGATTTGGATTTAGGATTCTGGGTGGAAATGAACCAGGGGAAC  2505
            |||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2493  ACAGGACATCTTCCTCTGGAGAAAAGAAACCGGATTTGGATTTAGGATTCTGGGTGGAAATGAACCAGGGGAAC  2566

Query 2506  CTATTTATATTGGTCACATCGTACCACTGGGTGCTGCTGATACTGACGGCCGCCTGAGGTCTGGAGATGAATTA  2579
            |.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2567  CCATTTATATCGGTCACATCGTACCGCTGGGTGCTGCTGACACAGACGGCCGCCTGAGGTCTGGAGATGAATTA  2640

Query 2580  ATCTGTGTGGATGGGACGCCAGTAATTGGAAAATCACACCAGCTTGTGGTCCAGCTTATGCAACAAGCTGCCAA  2653
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2641  ATCTGTGTGGATGGGACACCAGTAATTGGGAAATCACACCAGCTCGTGGTCCAGCTTATGCAACAAGCTGCCAA  2714

Query 2654  GCAAGGCCACGTCAATCTCACGGTGCGGCGTAAAGTGGTTTTTGCGGTGCCCAAAACCGAGAACGAGGTGCCCT  2727
            |||||||||.|||||||||||.|||.||||.||||||||.|||||.||.||||||.|.|||||.||||||||||
Sbjct 2715  GCAAGGCCATGTCAATCTCACAGTGAGGCGGAAAGTGGTCTTTGCCGTCCCCAAAGCAGAGAATGAGGTGCCCT  2788

Query 2728  CGCCAGCCTCCTCTCATCACAGTAGCAACCAGCCGGCCTCGCTGACAGAAGAGAAGCGCACTCCGCAGGGCAGC  2801
            |.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 2789  CACCAGCCTCATCACACCACAGTAGCAACCAGCCCGCGTCCCTGACGGAGGAGAAACGCACACCGCAAGGCAGC  2862

Query 2802  CAGAACTCGCTGAACACGGTGAGCTCGGGCAGCGGCAGCACCAGCGGCATCGGCAGTGGCGGCGGCGGGGGCAG  2875
            ||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2863  CAGAACTCTCTGAACACTGTGAGCTCTGGCAGCGGCAGCACCAGTGGCATTGGCAGTGGTGGCGGCGGGGGCAG  2936

Query 2876  CGGCGTGGTCAGCACCGTGGTGCAGCCCTACGACGTGGAGATCCGGCGCGGGGAGAACGAGGGCTTCGGCTTCG  2949
            |||.|||||.|||.|.|||.||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 2937  CGGTGTGGTGAGCGCTGTGCTGCAGCCCTATGATGTGGAGATTCGGCGTGGGGAGAACGAGGGCTTTGGGTTTG  3010

Query 2950  TCATCGTGTCCTCGGTGAGCAGGCCCGAAGCAGGCACGACCTTTGGCAATGCATGTGTGGCTATGCCTCACAAA  3023
            |||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||                                
Sbjct 3011  TCATCGTGTCCTCCGTGAGCAGACCCGAAGCGGGCACAACCT--------------------------------  3052

Query 3024  ATAGGTCGGATTATTGAGGGGAGCCCTGCTGACCGCTGTGGCAAGCTGAAAGTAGGAGACCGGATCTTGGCAGT  3097
             |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3053  -TCGGTCGGATTATTGAGGGGAGCCCTGCTGACCGCTGTGGCAAGCTGAAAGTAGGAGACCGGATCTTGGCAGT  3125

Query 3098  AAATGGATGTTCCATCACCAACAAATCCCATTCAGACATTGTGAACCTAATCAAGGAAGCGGGAAACACAGTTA  3171
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 3126  AAATGGATGTTCCATCACCAACAAATCCCATTCTGACATTGTCAACCTAATCAAAGAAGCGGGCAACACAGTGA  3199

Query 3172  CCCTCCGCATCATTCCTGGGGATGAGTCCTCGAATGCCACCTTGCTGACCAATGCAGAGAAGATTGCCACCATC  3245
            |.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||..|||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 3200  CTCTCCGCATCATCCCCGGGGATGAGTCCTCAAATGCCACGCTGCTGACTAATGCTGAGAAGATTGCCACCATC  3273

Query 3246  ACCACCACACACACCCCTTCTCAGCAAGGGACCCAGGAGACAAGGAATACCACCAAACCAAAGCAGGAATCTCA  3319
            ||||||||.||..||||.||||||||.|||||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 3274  ACCACCACTCATGCCCCCTCTCAGCAGGGGACCCAGGAAACAAGGACCACCACCAAACCAAAGCAGGATTCTCA  3347

Query 3320  ATTTGAGTTCAAAGCACCCCAAGCAACACAGGAGCAAGATTTTTACACTGTGGAACTGGAAAGAGGAGCCAAGG  3393
            .|||||||||||||.|||.||.||..||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||.|||||||
Sbjct 3348  GTTTGAGTTCAAAGGACCGCAGGCTGCACAGGAGCAAGATTTCTACACTGTGGAATTGGAAAGAGGGGCCAAGG  3421

Query 3394  GATTTGGCTTTAGCCTTCGAGGAGGCCGAGAGTATAACATGGACCTCTATGTTCTGCGCTTAGCAGAGGACGGT  3467
            |||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 3422  GATTTGGCTTTAGTCTTCGAGGGGGCCGAGAATATAACATGGATCTTTATGTTCTGCGCTTGGCAGAGGATGGT  3495

Query 3468  CCTGCGGAGAGGTGTGGAAAGATGAGGATTGGTGATGAAATTTTAGAGATCAATGGTGAGACCACCAAAAACAT  3541
            |||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3496  CCTGCAGAAAGATGTGGGAAGATGAGGATTGGCGATGAAATTCTAGAGATCAATGGTGAGACCACCAAAAACAT  3569

Query 3542  GAAGCATTCTCGAGCTATAGAACTGATTAAGAATGGTGGCCGCAGAGTTCGTCTGTTTCTGAAGCGGGGAGACG  3615
            |||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||..|||||||||||
Sbjct 3570  GAAACACTCTCGGGCCATAGAACTGATCAAGAATGGCGGCCGCAGGGTCCGTCTGTTTCTGCGGCGGGGAGACG  3643

Query 3616  GCTCAGTACCAGATTATGACCCCAGCAGCGACCGCCACGGCCCCGCCACCGGTCCACAAGGTGTTCC-GAAGTG  3688
            |||||||.|||||.||||||||||||||||||.|..||||||||.||||||||.||||||||||||| ||||||
Sbjct 3644  GCTCAGTCCCAGAATATGACCCCAGCAGCGACAGGAACGGCCCCTCCACCGGTGCACAAGGTGTTCCGGAAGTG  3717

Query 3689  AGGCCGGG-----CCGACCGC-GGCAGCATCGTCA---TTGGAGTCCAGTTACCCACCCGATCTTCACAAATCA  3753
            ||||||||     |.||||.| |.|.|||||  ||   |||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 3718  AGGCCGGGGCCGCCAGACCACAGACCGCATC--CAGCCTTGGAGTCCAGTTACCCACCCGAACTTCACAAATCA  3789

Query 3754  TCACCACATGGGGAAAAGCGGGCACACGCAAGGGATCCGAAAGGCAGCAGAGAGTATAGCAGACAACCCAATGA  3827
            ||||.|||||..||||||||.||||||||.|.||||||.|||||||.|||.|||.|.||||.|||||||||.||
Sbjct 3790  TCACAACATGCCGAAAAGCGAGCACACGCGAAGGATCCAAAAGGCAACAGGGAGCACAGCAAACAACCCAACGA  3863

Query 3828  ACACCACACCTGGAATGGGACTTCGAGGAAACCCGACAGCGGGGCATGCCGACCCAAGGACCGGGCGCCGGAGG  3901
            |||.||||||||||||||.|||||.||.||||..|||||||||||||||||.|||||.||||||.|.||.||.|
Sbjct 3864  ACATCACACCTGGAATGGAACTTCTAGAAAACAGGACAGCGGGGCATGCCGGCCCAAAGACCGGCCACCCGACG  3937

Query 3902  GACGGAGGGACGCGCAGGCCGAGCGCGCGGCAGCCGCCAACGGCCCCAAGAGGCGGTCCCCAGAGAAGCGGAGG  3975
            .|.||||.||.||||||.|.|||||   |.|||||.||||.||..|.||||||.||||.||.||||||||.|||
Sbjct 3938  CATGGAGAGAGGCGCAGCCAGAGCG---GACAGCCACCAATGGTTCAAAGAGGAGGTCACCGGAGAAGCGCAGG  4008

Query 3976  GAGGGCACCCGCAGCGCCGACAACACTTTGGAGAGGAGGGAGAAGCACGAGAAGAGACGAGACGTCTCTCCGGA  4049
            ||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||.||||..|.|||||.||
Sbjct 4009  GAAGGCACCCGCAGCGCTGACAACACTTTGGAAAGAAGGGAGAAGCATGAGAAGAGAAGAGAGATATCTCCCGA  4082

Query 4050  GCGGAGGCGAGAGCGGTCACCCACCCGCAGGAGAGACGGCTCCCCCAGCCGGCGGAGACGGTCTCTGGAGAGAC  4123
            |.|||.|||||||||.|||||||||||.||.|.|||..|||||||.|||||.|||.|..||||.||.||.||||
Sbjct 4083  GAGGAAGCGAGAGCGTTCACCCACCCGGAGAAAAGATAGCTCCCCGAGCCGCCGGCGGAGGTCCCTCGAAAGAC  4156

Query 4124  TCCTGGAGCAGAGGAGGTCCCCCGAGCGCAGGAGAGGGGGCTCGCCCGAGCGCAGGGCCAAGTCCACCGACCGG  4197
            |||||||.||.||..|||||||.||||||||.|||||||||||.||||||.|.||.|||||.|||||||||.||
Sbjct 4157  TCCTGGATCAAAGACGGTCCCCAGAGCGCAGAAGAGGGGGCTCCCCCGAGAGGAGAGCCAAATCCACCGACAGG  4230

Query 4198  AGGCGCGCACGCTCCCCCGAGCGCAGGAGAGAGCGGTCCCTGGACAAAAGGAACAGAGAGGACAGAGCCAGCCA  4271
            |||.|.||..|.|||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.|.||.||||..|...||||
Sbjct 4231  AGGAGGGCCAGGTCCCCTGAGCGCAGGCGAGAGCGGTCACTGGACAAAAGGAACCGGGACGACAAGGTTGGCCA  4304

Query 4272  CCGAGAAAGGGAAGAGGCGAATCTGAAACAGGATGCCGGCAGAAGTTCCAGACATCCCCCGGAGCAGAGAAGGC  4345
            |||||||||.||.|||||...||||||.|.|||.||.||.|||||..||.||.|||||||.|||||||||||||
Sbjct 4305  CCGAGAAAGAGAGGAGGCTGGTCTGAAGCTGGAAGCGGGGAGAAGCCCCCGAAATCCCCCAGAGCAGAGAAGGC  4378

Query 4346  GACCTTACAAAGAATGTAGCACCGACCTCAGTATC  4380
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 4379  GGCCTTACAAAGAATGTAGCACCGACCTCAGCATC  4413