Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14933
- Subject:
- NM_001033057.2
- Aligned Length:
- 4386
- Identities:
- 4379
- Gaps:
- 6
Alignment
Query 1 ATGTCCAAAGTGATCCAGAAGAAGAACCACTGGACTAGCAGGGTTCACGAATGCACCGTGAAGCGGGGACCCCA 74
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Sbjct 1 ATGTCCAAAGTGATCCAGAAGAAGAACCACTGGACTAGCAGGGTTCACGAATGCACCGTGAAGCGGGGACCCCA 74
Query 75 GGGCGAGCTGGGGGTGACGGTGCTGGGAGGCGCGGAGCACGGGGAGTTTCCGTACGTCGGAGCGGTGGCGGCGG 148
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Sbjct 75 GGGCGAGCTGGGGGTGACGGTGCTGGGAGGCGCGGAGCACGGGGAGTTTCCGTACGTCGGAGCGGTGGCGGCGG 148
Query 149 TCGAGGCAGCGGGGCTTCCCGGCGGCGGCGAGGGCCCGAGGCTGGGCGAAGGGGAGCTGCTTCTGGAGGTGCAG 222
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Sbjct 149 TCGAGGCAGCGGGGCTTCCCGGCGGCGGCGAGGGCCCGAGGCTGGGCGAAGGGGAGCTGCTTCTGGAGGTGCAG 222
Query 223 GGGGTCCGGGTGTCCGGCTTGCCCCGCTATGACGTGCTGGGGGTCATCGACAGCTGCAAGGAGGCCGTCACCTT 296
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Sbjct 223 GGGGTCCGGGTGTCCGGCTTGCCCCGCTATGACGTGCTGGGGGTCATCGACAGCTGCAAGGAGGCCGTCACCTT 296
Query 297 CAAGGCCGTCAGACAAGGAGGAAGGCTGAACAAGGACCTGCGACATTTTCTCAATCAGCGATTCCAGAAGGGGT 370
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Sbjct 297 CAAGGCCGTCAGACAAGGAGGAAGGCTGAACAAGGACCTGCGACATTTTCTCAATCAGCGATTCCAGAAGGGGT 370
Query 371 CTCCTGATCATGAGCTCCAGCAGACCATAAGGGATAACCTTTACCGCCATGCTGTGCCTTGCACAACCCGATCT 444
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Sbjct 371 CTCCTGATCATGAGCTCCAGCAGACCATAAGGGATAACCTTTACCGCCATGCTGTGCCTTGCACAACCCGATCT 444
Query 445 CCCAGAGAAGGAGAAGTGCCTGGCGTGGACTATAACTTTCTGACTGTGAAGGAGTTCTTGGACCTCGAGCAGAG 518
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Sbjct 445 CCCAGAGAAGGAGAAGTGCCTGGCGTGGACTATAACTTTCTGACTGTGAAGGAGTTCTTGGACCTCGAGCAGAG 518
Query 519 TGGGACTCTTCTGGAAGTCGGCACCTATGAAGGAAACTATTATGGGACACCCAAGCCTCCTAGCCAGCCAGTCA 592
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Sbjct 519 TGGGACTCTTCTGGAAGTCGGCACCTATGAAGGAAACTATTATGGGACACCCAAGCCTCCTAGCCAGCCAGTCA 592
Query 593 GTGGGAAAGTGATCACGACGGATGCCTTGCACAGCCTTCAGTCTGGCTCTAAGCAGTCGACCCCGAAGCGAACC 666
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Sbjct 593 GTGGGAAAGTGATCACGACGGATGCCTTGCACAGCCTTCAGTCTGGCTCTAAGCAGTCGACCCCGAAGCGAACC 666
Query 667 AAGTCCTAC-ATGATATGCAAAATGCTGGCATAGTCCACGCGGAGAATGAGGAGGAGGATGACGTTCCTGAAAT 739
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Sbjct 667 AAGTCCTACAATGATATGCAAAATGCTGGCATAGTCCACGCGGAGAATGAGGAGGAGGATGACGTTCCTGAAAT 740
Query 740 GAACAGCAGCTTTACAGCCGATTCTGGTGAACAAGAGGAGCACACTCTCCAAGAAACAGCATTACCACCTGTGA 813
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Sbjct 741 GAACAGCAGCTTTACAGCCGATTCTGGTGAACAAGAGGAGCACACTCTCCAAGAAACAGCATTACCACCTGTGA 814
Query 814 ATAGTAGCATCATCGCTGCTCCCATCACGGACCCTTCTCAGAAGTTCCCTCAATACCTACCTCTTTCTGCAGAG 887
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Sbjct 815 ATAGTAGCATCATCGCTGCTCCCATCACGGACCCTTCTCAGAAGTTCCCTCAATACCTACCTCTTTCTGCAGAG 888
Query 888 GATAATTTAGGTCCTCTACCTGAAAACTGGGAGATGGCCTATACTGAAAATGGAGAAGTCTATTTTATAGACCA 961
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Sbjct 889 GATAATTTAGGTCCTCTACCTGAAAACTGGGAGATGGCCTATACTGAAAATGGAGAAGTCTATTTTATAGACCA 962
Query 962 TAACACGAAAACAACATCTTGGTTAGACCCTCGGTGCCTAAACAAGCAGCAGAAGCCACTGGAAGAGTGTGAAG 1035
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Sbjct 963 TAACACGAAAACAACATCTTGGTTAGACCCTCGGTGCCTAAACAAGCAGCAGAAGCCACTGGAAGAGTGTGAAG 1036
Query 1036 ATGATGAAGGGGTACACACCGAGGAGCTGGACAGTGAACTAGAACTGCCTGCTGGTTGGGAAAAGATTGAAGAC 1109
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Sbjct 1037 ATGATGAAGGGGTACACACCGAGGAGCTGGACAGTGAACTAGAACTGCCTGCTGGTTGGGAAAAGATTGAAGAC 1110
Query 1110 CCTGTCTATGGTATCTACTATGTAGACCACATCAACAGGAAGACACAATATGAGAACCCGGTTCTAGAAGCCAA 1183
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Sbjct 1111 CCTGTCTATGGTATCTACTATGTAGACCACATCAACAGGAAGACACAATATGAGAACCCGGTTCTAGAAGCCAA 1184
Query 1184 ACGGAAGAAGCAGCTTGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC 1257
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Sbjct 1185 ACGGAAGAAGCAGCTTGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC 1258
Query 1258 AGCAGACAGAAGAATGGACAGAAGATCACTCAGCCCTTGTGCCTCCTGTTATTCCAAACCACCCTCCAAGCAAT 1331
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Sbjct 1259 AGCAGACAGAAGAATGGACAGAAGATCACTCAGCCCTTGTGCCTCCTGTTATTCCAAACCACCCTCCAAGCAAT 1332
Query 1332 CCAGAGCCAGCCAGAGAAGTTCCACTTCAGGGCAAACCCTTTTTTACACGAAACCCTTCTGAGTTGAAAGGCAA 1405
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Sbjct 1333 CCAGAGCCAGCCAGAGAAGTTCCACTTCAGGGCAAACCCTTTTTTACACGAAACCCTTCTGAGTTGAAAGGCAA 1406
Query 1406 GTTCATTCACACAAAGCTGCGGAAAAGCAGTCGTGGCTTTGGCTTCACGGTGGTTGGAGGGGATGAACCTGATG 1479
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Sbjct 1407 GTTCATTCACACAAAGCTGCGGAAAAGCAGTCGTGGCTTTGGCTTCACGGTGGTTGGAGGGGATGAACCTGATG 1480
Query 1480 AGTTTCTCCAGATCAAGAGCTTGGTCCTAGATGGTCCTGCTGCATTGGATGGCAAGATGGAAACAGGGGATGTG 1553
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Sbjct 1481 AGTTTCTCCAGATCAAGAGCTTGGTCCTAGATGGTCCTGCTGCATTGGATGGCAAGATGGAAACAGGGGATGTG 1554
Query 1554 ATTGTAAGTGTGAATGACACCTGTGTTTTGGGACACACACATGCTCAAGTTGTGAAGATCTTCCAGTCCATCCC 1627
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Sbjct 1555 ATTGTAAGTGTGAATGACACCTGTGTTTTGGGACACACACATGCTCAAGTTGTGAAGATCTTCCAGTCCATCCC 1628
Query 1628 CATTGGTGCCAGCGTGGACCTTGAACTCTGCCGAGGTTATCCATTGCCTTTTGATCCAGATGACCCCAATACAA 1701
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Sbjct 1629 CATTGGTGCCAGCGTGGACCTTGAACTCTGCCGAGGTTATCCATTGCCTTTTGATCCAGATGACCCCAATACAA 1702
Query 1702 GTTTAGTGACCTCGGTAGCCATTTTGGATAAAGAACCAATTATTGTGAATGGGCAAGAGACCTATGATTCACCA 1775
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Sbjct 1703 GTTTAGTGACCTCGGTAGCCATTTTGGATAAAGAACCAATTATTGTGAATGGGCAAGAGACCTATGATTCACCA 1776
Query 1776 GCTAGCCACAGTAGTAAAACAGGCAAAGTCAATGGCATGAAGGATGCCAGGCCAAGCAGCCCAGCGGACGTGGC 1849
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Sbjct 1777 GCTAGCCACAGTAGTAAAACAGGCAAAGTCAATGGCATGAAGGATGCCAGGCCAAGCAGCCCAGCGGACGTGGC 1850
Query 1850 TTCAAATAGTTCTCATGGTTATCCTAATGACACTGTTTCTTTGGCTTCCTCCATAGCCACTCAGCCAGAACTCA 1923
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Sbjct 1851 TTCAAATAGTTCTCATGGTTATCCTAATGACACTGTTTCTTTGGCTTCCTCCATAGCCACTCAGCCAGAACTCA 1924
Query 1924 TAACTGTTCATATTGTCAAAGGGCCAATGGGCTTTGGTTTTACTATCGCAGACAGTCCTGGTGGGGGTGGCCAA 1997
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Sbjct 1925 TAACTGTTCATATTGTCAAAGGGCCAATGGGCTTTGGTTTTACTATCGCAGACAGTCCTGGTGGGGGTGGCCAA 1998
Query 1998 AGAGTGAAACAGATTGTTGACAGCCCAAGGTGCCGAGGCCTGAAAGAAGGGGATCTCATAGTGGAAGTTAATAA 2071
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Sbjct 1999 AGAGTGAAACAGATTGTTGACAGCCCAAGGTGCCGAGGCCTGAAAGAAGGGGATCTCATAGTGGAAGTTAATAA 2072
Query 2072 GAAGAACGTGCAGGCCCTAACTCACAACCAAGTGGTGGATATGCTGGTTGAGTGTCCTAAGGGAAGTGAGGTCA 2145
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Sbjct 2073 GAAGAACGTGCAGGCCCTAACTCACAACCAAGTGGTGGATATGCTGGTTGAGTGTCCTAAGGGAAGTGAGGTCA 2146
Query 2146 CATTGTTGGTGCAACGAGGAGGGCTGCCAGTTCCCAAGAAGAGCCCAAAGTCGCAACCACTGGAAAGGAAAGAC 2219
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Sbjct 2147 CATTGTTGGTGCAACGAGGAGGGCTGCCAGTTCCCAAGAAGAGCCCAAAGTCGCAACCACTGGAAAGGAAAGAC 2220
Query 2220 AGCCAGAATAGTTCTCAGCACAGTGTTTCCAGCCACCGAAGCCTGCACACAGCATCCCCAAGCCACAGCACACA 2293
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Sbjct 2221 AGCCAGAATAGTTCTCAGCACAGTGTTTCCAGCCACCGAAGCCTGCACACAGCATCCCCAAGCCACAGCACACA 2294
Query 2294 GGTGCTCCCCGAGTTCCCACCTGCAGAGGCCCAAGCTCCAGATCAAACTGACAGCTCTGGCCAGAAAAAACCAG 2367
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Sbjct 2295 GGTGCTCCCCGAGTTCCCACCTGCAGAGGCCCAAGCTCCAGATCAAACTGACAGCTCTGGCCAGAAAAAACCAG 2368
Query 2368 ATCCTTTTAAAATCTGGGCCCAGTCCAGGAGCATGTATGAAAACCGACTTCCAGATTACCAGGAACAGGACATC 2441
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Sbjct 2369 ATCCTTTTAAAATCTGGGCCCAGTCCAGGAGCATGTATGAAAACCGACTTCCAGATTACCAGGAACAGGACATC 2442
Query 2442 TTCCTCTGGAGAAAAGAGACTGGATTTGGATTTAGGATTCTGGGTGGAAATGAACCAGGGGAACCTATTTATAT 2515
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Sbjct 2443 TTCCTCTGGAGAAAAGAGACTGGATTTGGATTTAGGATTCTGGGTGGAAATGAACCAGGGGAACCTATTTATAT 2516
Query 2516 TGGTCACATCGTACCACTGGGTGCTGCTGATACTGACGGCCGCCTGAGGTCTGGAGATGAATTAATCTGTGTGG 2589
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Sbjct 2517 TGGTCACATCGTACCACTGGGTGCTGCTGATACTGACGGCCGCCTGAGGTCTGGAGATGAATTAATCTGTGTGG 2590
Query 2590 ATGGGACGCCAGTAATTGGAAAATCACACCAGCTTGTGGTCCAGCTTATGCAACAAGCTGCCAAGCAAGGCCAC 2663
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Sbjct 2591 ATGGGACGCCAGTAATTGGAAAATCACACCAGCTTGTGGTCCAGCTTATGCAACAAGCTGCCAAGCAAGGCCAC 2664
Query 2664 GTCAATCTCACGGTGCGGCGTAAAGTGGTTTTTGCGGTGCCCAAAACCGAGAACGAGGTGCCCTCGCCAGCCTC 2737
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Sbjct 2665 GTCAATCTCACGGTGCGGCGTAAAGTGGTTTTTGCGGTGCCCAAAACCGAGAACGAGGTGCCCTCGCCAGCCTC 2738
Query 2738 CTCTCATCACAGTAGCAACCAGCCGGCCTCGCTGACAGAAGAGAAGCGCACTCCGCAGGGCAGCCAGAACTCGC 2811
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Sbjct 2739 CTCTCATCACAGTAGCAACCAGCCGGCCTCGCTGACAGAAGAGAAGCGCACTCCGCAGGGCAGCCAGAACTCGC 2812
Query 2812 TGAACACGGTGAGCTCGGGCAGCGGCAGCACCAGCGGCATCGGCAGTGGCGGCGGCGGGGGCAGCGGCGTGGTC 2885
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Sbjct 2813 TGAACACGGTGAGCTCGGGCAGCGGCAGCACCAGCGGCATCGGCAGTGGCGGCGGCGGGGGCAGCGGCGTGGTC 2886
Query 2886 AGCACCGTGGTGCAGCCCTACGACGTGGAGATCCGGCGCGGGGAGAACGAGGGCTTCGGCTTCGTCATCGTGTC 2959
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Sbjct 2887 AGCACCGTGGTGCAGCCCTACGACGTGGAGATCCGGCGCGGGGAGAACGAGGGCTTCGGCTTCGTCATCGTGTC 2960
Query 2960 CTCGGTGAGCAGGCCCGAAGCAGGCACGACCTTTGGCAATGCATGTGTGGCTATGCCTCACAAAATAGGTCGGA 3033
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Sbjct 2961 CTCGGTGAGCAGGCCCGAAGCAGGCACGACCTTTGGCAATGCATGTGTGGCTATGCCTCACAAAATAGGTCGGA 3034
Query 3034 TTATTGAGGGGAGCCCTGCTGACCGCTGTGGCAAGCTGAAAGTAGGAGACCGGATCTTGGCAGTAAATGGATGT 3107
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Sbjct 3035 TTATTGAGGGGAGCCCTGCTGACCGCTGTGGCAAGCTGAAAGTAGGAGACCGGATCTTGGCAGTAAATGGATGT 3108
Query 3108 TCCATCACCAACAAATCCCATTCAGACATTGTGAACCTAATCAAGGAAGCGGGAAACACAGTTACCCTCCGCAT 3181
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Sbjct 3109 TCCATCACCAACAAATCCCATTCAGACATTGTGAACCTAATCAAGGAAGCGGGAAACACAGTTACCCTCCGCAT 3182
Query 3182 CATTCCTGGGGATGAGTCCTCGAATGCCACCTTGCTGACCAATGCAGAGAAGATTGCCACCATCACCACCACAC 3255
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Sbjct 3183 CATTCCTGGGGATGAGTCCTCGAATGCCACCTTGCTGACCAATGCAGAGAAGATTGCCACCATCACCACCACAC 3256
Query 3256 ACACCCCTTCTCAGCAAGGGACCCAGGAGACAAGGAATACCACCAAACCAAAGCAGGAATCTCAATTTGAGTTC 3329
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Sbjct 3257 ACACCCCTTCTCAGCAAGGGACCCAGGAGACAAGGAATACCACCAAACCAAAGCAGGAATCTCAATTTGAGTTC 3330
Query 3330 AAAGCACCCCAAGCAACACAGGAGCAAGATTTTTACACTGTGGAACTGGAAAGAGGAGCCAAGGGATTTGGCTT 3403
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Sbjct 3331 AAAGCACCCCAAGCAACACAGGAGCAAGATTTTTACACTGTGGAACTGGAAAGAGGAGCCAAGGGATTTGGCTT 3404
Query 3404 TAGCCTTCGAGGAGGCCGAGAGTATAACATGGACCTCTATGTTCTGCGCTTAGCAGAGGACGGTCCTGCGGAGA 3477
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Sbjct 3405 TAGCCTTCGAGGAGGCCGAGAGTATAACATGGACCTCTATGTTCTGCGCTTAGCAGAGGACGGTCCTGCGGAGA 3478
Query 3478 GGTGTGGAAAGATGAGGATTGGTGATGAAATTTTAGAGATCAATGGTGAGACCACCAAAAACATGAAGCATTCT 3551
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Sbjct 3479 GGTGTGGAAAGATGAGGATTGGTGATGAAATTTTAGAGATCAATGGTGAGACCACCAAAAACATGAAGCATTCT 3552
Query 3552 CGAGCTATAGAACTGATTAAGAATGGTGGCCGCAGAGTTCGTCTGTTTCTGAAGCGGGGAGACGGCTCAGTACC 3625
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Sbjct 3553 CGAGCTATAGAACTGATTAAGAATGGTGGCCGCAGAGTTCGTCTGTTTCTGAAGCGGGGAGACGGCTCAGTACC 3626
Query 3626 AGATTATGACCCCAGCAGCGACCGCCACGGCCCCGCCACCGGTCCACAAGGTGTTCC-GAAGTGA-GGCCGGG- 3696
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Sbjct 3627 AGAATATGACCCCAGCAGCGACCGCCACGGCCCCGCCACCGGTCCACAAGGTGTTCCGGAAGTGAGGGCCGGGC 3700
Query 3697 CCGACCG-CGGCAGCAT-CGTCATTGGAGTCCAGTTACCCACCCGATCTTCACAAATCATCACCACATGGGGAA 3768
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Sbjct 3701 CCGACCGCCGGCAGCATCCGTCATTGGAGTCCAGTTACCCACCCGATCTTCACAAATCATCACCACATGGGGAA 3774
Query 3769 AAGCGGGCACACGCAAGGGATCCGAAAGGCAGCAGAGAGTATAGCAGACAACCCAATGAACACCACACCTGGAA 3842
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Sbjct 3775 AAGCGGGCACACGCAAGGGATCCGAAAGGCAGCAGAGAGTATAGCAGACAACCCAATGAACACCACACCTGGAA 3848
Query 3843 TGGGACTTCGAGGAAACCCGACAGCGGGGCATGCCGACCCAAGGACCGGGCGCCGGAGGGACGGAGGGACGCGC 3916
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Sbjct 3849 TGGGACTTCGAGGAAACCCGACAGCGGGGCATGCCGACCCAAGGACCGGGCGCCGGAGGGACGGAGGGACGCGC 3922
Query 3917 AGGCCGAGCGCGCGGCAGCCGCCAACGGCCCCAAGAGGCGGTCCCCAGAGAAGCGGAGGGAGGGCACCCGCAGC 3990
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Sbjct 3923 AGGCCGAGCGCGCGGCAGCCGCCAACGGCCCCAAGAGGCGGTCCCCAGAGAAGCGGAGGGAGGGCACCCGCAGC 3996
Query 3991 GCCGACAACACTTTGGAGAGGAGGGAGAAGCACGAGAAGAGACGAGACGTCTCTCCGGAGCGGAGGCGAGAGCG 4064
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Sbjct 3997 GCCGACAACACTTTGGAGAGGAGGGAGAAGCACGAGAAGAGACGAGACGTCTCTCCGGAGCGGAGGCGAGAGCG 4070
Query 4065 GTCACCCACCCGCAGGAGAGACGGCTCCCCCAGCCGGCGGAGACGGTCTCTGGAGAGACTCCTGGAGCAGAGGA 4138
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Sbjct 4071 GTCACCCACCCGCAGGAGAGACGGCTCCCCCAGCCGGCGGAGACGGTCTCTGGAGAGACTCCTGGAGCAGAGGA 4144
Query 4139 GGTCCCCCGAGCGCAGGAGAGGGGGCTCGCCCGAGCGCAGGGCCAAGTCCACCGACCGGAGGCGCGCACGCTCC 4212
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Sbjct 4145 GGTCCCCCGAGCGCAGGAGAGGGGGCTCGCCCGAGCGCAGGGCCAAGTCCACCGACCGGAGGCGCGCACGCTCC 4218
Query 4213 CCCGAGCGCAGGAGAGAGCGGTCCCTGGACAAAAGGAACAGAGAGGACAGAGCCAGCCACCGAGAAAGGGAAGA 4286
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Sbjct 4219 CCCGAGCGCAGGAGAGAGCGGTCCCTGGACAAAAGGAACAGAGAGGACAGAGCCAGCCACCGAGAAAGGGAAGA 4292
Query 4287 GGCGAATCTGAAACAGGATGCCGGCAGAAGTTCCAGACATCCCCCGGAGCAGAGAAGGCGACCTTACAAAGAAT 4360
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Sbjct 4293 GGCGAATCTGAAACAGGATGCCGGCAGAAGTTCCAGACATCCCCCGGAGCAGAGAAGGCGACCTTACAAAGAAT 4366
Query 4361 GTAGCACCGACCTCAGTATC 4380
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Sbjct 4367 GTAGCACCGACCTCAGTATC 4386