Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14933
• Subject: NM_001286784.1
• Aligned Length: 4475
• Identities: 3884
• Gaps: 160

Alignment

Query    1  ATGTCCAAAGTGATCCAGAAGAAGAACCACTGGACTAGCAGGGTTCACGAATGCACCGTGAAGCGGGGACCCCA  74
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGAAAGTGATCCAGAAGAAGAACCACTGGACTGGCCGCGTTCACGAGTGCACCGTGAAGCGGGGACCCCA  74

Query   75  GGGCGAGCTGGGGGTGACGGTGCTGGGAGGCGCGGAGCACGGGGAGTTTCCGTACGTCGGAGCGGTGGCGGCGG  148
            |||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  GGGCGAGCTGGGGGTGACGGTCCTGGGGGGCGCGGAGCATGGGGAGTTTCCGTACGTGGGGGCGGTGGCGGCGG  148

Query  149  TCGAGGCAGCGGGGCTTCCCGGCGGCGGCGAGGGCCCGAGGCTGGGCGAAGGGGAGCTGCTTCTGGAGGTGCAG  222
            .||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||.|||||.||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  CCGAGGCGGCGGGGCTTCCCGGCGGTGGCGAGGGGCCGAAGCTGGCCGAAGGTGAGCTGCTGCTGGAGGTGCAG  222

Query  223  GGGGTCCGGGTGTCCGGCTTGCCCCGCTATGACGTGCTGGGGGTCATCGACAGCTGCAAGGAGGCCGTCACCTT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGGTCCGGGTGTCCGGCTTGCCCCGCTATGACGTGCTGGGAGTCATCGACAGCTGCAAGGAGGCCGTCACCTT  296

Query  297  CAAGGCCGTCAGACAAGGAGGAAGGCTGAACAAGGACCTGCGACATTTTCTCAATCAGCGATTCCAGAAGGGGT  370
            |||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct  297  CAAAGCCGTCAGACAAGGAGGAAGGCTCAACAAGGACCTACGACATTTCCTCAACCAACGGTTCCAGAAGGGGT  370

Query  371  CTCCTGATCATGAGCTCCAGCAGACCATAAGGGATAACCTTTACCGCCATGCTGTGCCTTGCACAACCCGATCT  444
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  CTCCAGATCATGAGCTCCAGCAGACCATAAGGGACAACCTCTACCGCCATGCTGTGCCTTGCACAACCCGGTCT  444

Query  445  CCCAGAGAAGGAGAAGTGCCTGGCGTGGACTATAACTTTCTGACTGTGAAGGAGTTCTTGGACCTCGAGCAGAG  518
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCAGAGAAGGAGAAGTGCCTGGTGTGGATTACAGCTTTCTGACTGTGAAGGAGTTCTTGGACCTCGAGCAGAG  518

Query  519  TGGGACTCTTCTGGAAGTCGGCACCTATGAAGGAAACTATTATGGGACACCCAAGCCTCCTAGCCAGCCAGTCA  592
            .|||||.||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGGGACCCTGTTGGAAGTCGGCACCTATGAAGGAAACTATTATGGGACACCCAAACCTCCTAGCCAGCCAGTCA  592

Query  593  GTGGGAAAGTGATCACGACGGATGCCTTGCACAGCCTTCAGTCTGGCTCTAAGCAGTCGACCCCGAAGCGAACC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  593  GTGGGAAAGTGATCACGACGGATGCCTTGCACAGCCTGCAGTCTGGCTCCAAGCAGTCGACCCCTAAGCGAACA  666

Query  667  AAGTCCTAC-ATGATATGCAAAATGCTGGCATAGTCCACGCGGAGAATGAGGAGGAGGATGACGTTCCTGAAAT  739
            ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct  667  AAGTCCTACAATGATATGCAAAATGCTGGCATAGTCCACCCGGAGAATGAGGAGGAGGAGGATGTCCCTGAAAT  740

Query  740  GAACAGCAGCTTTACAGCCGATTCTGGTGAACAAGAGGAGCACACTCTCCAAGAAACAGCATTACCACCTGTGA  813
            ||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||.||.|..|.||.|||||||
Sbjct  741  GAACAGTAGCTTTACAGCCGACTCTGGAGACCAGGACGAGCACACTCTCCAAGAAGCAACGCTCCCGCCTGTGA  814

Query  814  ATAGTAGCATCATCGCTGCTCCCATCACGGACCCTTCTCAGAAGTTCCCTCAATACCTACCTCTTTCTGCAGAG  887
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATAGTAGCATCCTCGCTGCTCCCATCACGGACCCTTCTCAGAAGTTCCCTCAGTACCTACCTCTTTCTGCAGAG  888

Query  888  GATAATTTAGGTCCTCTACCTGAAAACTGGGAGATGGCCTATACTGAAAATGGAGAAGTCTATTTTATAGACCA  961
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  889  GATAATTTAGGTCCTCTACCTGAAAACTGGGAGATGGCCTATACTGAAAATGGAGAAGTCTATTTCATAGACCA  962

Query  962  TAACACGAAAACAACATCTTGGTTAGACCCTCGGTGCCTAAACAAGCAGCAGAAGCCACTGGAAGAGTGTGAAG  1035
            .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  963  CAACACGAAAACAACATCATGGTTAGACCCTCGGTGCCTGAACAAACAGCAGAAGCCTCTGGAAGAATGTGAAG  1036

Query 1036  ATGATGAAGGGGTACACACCGAGGAGCTGGACAGTGAACTAGAACTGCCTGCTGGTTGGGAAAAGATTGAAGAC  1109
            |||||||    ||                                ||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGATGA----GT--------------------------------TGCCTGCTGGCTGGGAAAAGATTGAAGAC  1074

Query 1110  CCTGTCTATGGTATCTACTATGTAGACCACATCAACAGGAAGACACAATATGAGAACCCGGTTCTAGAAGCCAA  1183
            ||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 1075  CCTGTCTACGGTGTCTACTATGTAGACCACATCAACAGGAAGACGCAATATGAAAACCCAGTCCTAGAAGCCAA  1148

Query 1184  ACGGAAGAAGCAGCTTGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC  1257
            |||||||||.|||||||                  ||||||||||||||||||||||||..||||..|.|||||
Sbjct 1149  ACGGAAGAAACAGCTTG------------------AACAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCCTCAGCCACCGCAGC  1204

Query 1258  AGCAGACAGAAGAATGGACAGAAGATCACTCAGCCCTTGTGCCTCCTGTTATTCCAAACCACCCTCCAAGCAAT  1331
                  |||||||.||||||||.|||||..||.|..||||||||||||||..|||...|||.||.||.||||||
Sbjct 1205  ------CAGAAGAGTGGACAGAGGATCATGCATCTGTTGTGCCTCCTGTTGCTCCTTCCCATCCCCCGAGCAAT  1272

Query 1332  CCAGAGCCAGCCAGAGAAGTTCCACTTCAGGGCAAACCCTTTTTTACACGAAACCCTTCTGAGTTGAAAGGCAA  1405
            ||.|||||||||||.|||..||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||.||||||||||
Sbjct 1273  CCGGAGCCAGCCAGGGAAACTCCACTTCAGGGCAAACCTTTTTTTACAAGAAACCCCTCTGAGCTGAAAGGCAA  1346

Query 1406  GTTCATTCACACAAAGCTGCGGAAAAGCAGTCGTGGCTTTGGCTTCACGGTGGTTGGAGGGGATGAACCTGATG  1479
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 1347  GTTCATTCACACGAAGCTACGGAAAAGCAGCCGAGGCTTTGGCTTCACGGTGGTTGGAGGAGACGAGCCTGATG  1420

Query 1480  AGTTTCTCCAGATCAAGAGCTTGGTCCTAGATGGTCCTGCTGCATTGGATGGCAAGATGGAAACAGGGGATGTG  1553
            ||||.||.||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1421  AGTTCCTGCAGATCAAGAGCCTCGTCCTCGATGGTCCTGCCGCACTGGATGGCAAGATGGAGACAGGGGATGTA  1494

Query 1554  ATTGTAAGTGTGAATGACACCTGTGTTTTGGGACACACACATGCTCAAGTTGTGAAGATCTTCCAGTCCATCCC  1627
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1495  ATTGTGAGTGTGAATGACACCTGTGTTTTGGGACACACACATGCTCAAGTTGTGAAAATCTTCCAGTCCATTCC  1568

Query 1628  CATTGGTGCCAGCGTGGACCTTGAACTCTGCCGAGGTTATCCATTGCCTTTTGATCCAGATGACCCCAATACAA  1701
            ||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 1569  CATTGGTGCCAGTGTGGACCTTGAACTCTGCAGAGGTTATCCATTGCCTTTTGACCCGGATGACCCTAATACAA  1642

Query 1702  GTTTAGTGACCTCGGTAGCCATTTTGGATAAAGAACCAATTATTGTGAATGGGCAAGAGACCTATGATTCACCA  1775
            ||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1643  GTTTAGTGACCTCGGTGGCCATTTTGGACAAAGAACCAATTATTGTAAATGGACAAGAGACCTACGATTCACCA  1716

Query 1776  GCTAGCCACAGTAGTAAAACAGGCAAAGTCAATGGCATGAAGGATGCCAGGCCAAGCAGCCCAGCGGACGTGGC  1849
            ||.||||||||||||||||||||||||||||...||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1717  GCGAGCCACAGTAGTAAAACAGGCAAAGTCAGCAGCATGAAGGATGCCAGGCCAAGCAGCCCTGCTGATGTGGC  1790

Query 1850  TTCAAATAGTTCTCATGGTTATCCTAATGACACTGTTTCTTTGGCTTCCTCCATAGCCACTCAGCCAGAACTCA  1923
            |||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 1791  TTCCAACAGCTCTCATGGTTATCCCAACGACACAGTCTCCTTGGCTTCCTCCATAGCCACCCAGCCAGAGCTAA  1864

Query 1924  TAACTGTTCATATTGTCAAAGGGCCAATGGGCTTTGGTTTTACTATCGCAGACAGTCCTGGTGGGGGTGGCCAA  1997
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1865  TAACTGTTCACATAGTCAAAGGGCCAATGGGATTTGGCTTTACGATCGCAGACAGTCCCGGTGGGGGTGGCCAA  1938

Query 1998  AGAGTGAAACAGATTGTTGACAGCCCAAGGTGCCGAGGCCTGAAAGAAGGGGATCTCATAGTGGAAGTTAATAA  2071
            |||||||||||||||||||||||.|||.|.|||.|||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 1939  AGAGTGAAACAGATTGTTGACAGTCCACGCTGCAGAGGCCTCAAAGAAGGGGATCTTATCGTGGAGGTGAATAA  2012

Query 2072  GAAGAACGTGCAGGCCCTAACTCACAACCAAGTGGTGGATATGCTGGTTGAGTGTCCTAAGGGAAGTGAGGTCA  2145
            ||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 2013  GAAGAACGTGCAGGCCCTGACGCACAATCAAGTCGTGGATATGCTGATTGAATGTCCCAAGGGAAGTGAGGTCA  2086

Query 2146  CATTGTTGGTGCAACGAGGAGGGCTGCCAGTTCCCAAGAAGAGCCCAAAGTCGCAACCACTGGAAAGGAAAGAC  2219
            ||.||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 2087  CACTGTTGGTGCAGCGAGGAGGGCTACCAGTTCCCAAGAAGAGCCCAAAGTCGCAGCCACTGGAGAGGAAAGAC  2160

Query 2220  AGCCAGAATAGTTCTCAGCACAGTGTTTCCAGCCACCGAAGCCTGCACACAGCATCCCCAAGCCACAGCACACA  2293
            |||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||.|||.|||
Sbjct 2161  AGCCAGAATAGCTCCCAGCACAGCGTCTCCAGCCACCGGAGCCTGCACACTGCGTCCCCGAGCCACGGCATACA  2234

Query 2294  GGTGCTCCCCGAGTTCCCACCTGCAGAGGCCCAAGCTCCAGATCAAACTGACAGCTCTGGCCAGAAAAAACCAG  2367
            |||||||||.||||.||.|||||||||.||||..|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 2235  GGTGCTCCCTGAGTACCTACCTGCAGACGCCCCTGCTCCAGATCAGACCGACAGCTCTGGGCAGAAAAAGCCAG  2308

Query 2368  ATCCTTTTAAAATCTGGGCCCAGTCCAGGAGCATGTATGAAAACCGAC--------------------------  2415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                          
Sbjct 2309  ATCCTTTTAAAATCTGGGCCCAGTCCAGGAGCATGTATGAAAACCGACCTATGTCACCTTCGCCTGCATCAGGA  2382

Query 2416  ----------------------------------------------------------TTCCAGATTACCAGGA  2431
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct 2383  TTGAGCAAGGGTGAAAGAGACAGAGAAATCAATTCCACGAATTTTGGAGAATGTCAGATTCCAGATTACCAGGA  2456

Query 2432  ACAGGACATCTTCCTCTGGAGAAAAGAGACTGGATTTGGATTTAGGATTCTGGGTGGAAATGAACCAGGGGAAC  2505
            |||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2457  ACAGGACATCTTCCTCTGGAGAAAAGAAACCGGATTTGGATTTAGGATTCTGGGTGGAAATGAACCAGGGGAAC  2530

Query 2506  CTATTTATATTGGTCACATCGTACCACTGGGTGCTGCTGATACTGACGGCCGCCTGAGGTCTGGAGATGAATTA  2579
            |.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2531  CCATTTATATCGGTCACATCGTACCGCTGGGTGCTGCTGACACAGACGGCCGCCTGAGGTCTGGAGATGAATTA  2604

Query 2580  ATCTGTGTGGATGGGACGCCAGTAATTGGAAAATCACACCAGCTTGTGGTCCAGCTTATGCAACAAGCTGCCAA  2653
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2605  ATCTGTGTGGATGGGACACCAGTAATTGGGAAATCACACCAGCTCGTGGTCCAGCTTATGCAACAAGCTGCCAA  2678

Query 2654  GCAAGGCCACGTCAATCTCACGGTGCGGCGTAAAGTGGTTTTTGCGGTGCCCAAAACCGAGAACGAGGTGCCCT  2727
            |||||||||.|||||||||||.|||.||||.||||||||.|||||.||.||||||.|.|||||.||||||||||
Sbjct 2679  GCAAGGCCATGTCAATCTCACAGTGAGGCGGAAAGTGGTCTTTGCCGTCCCCAAAGCAGAGAATGAGGTGCCCT  2752

Query 2728  CGCCAGCCTCCTCTCATCACAGTAGCAACCAGCCGGCCTCGCTGACAGAAGAGAAGCGCACTCCGCAGGGCAGC  2801
            |.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 2753  CACCAGCCTCATCACACCACAGTAGCAACCAGCCCGCGTCCCTGACGGAGGAGAAACGCACACCGCAAGGCAGC  2826

Query 2802  CAGAACTCGCTGAACACGGTGAGCTCGGGCAGCGGCAGCACCAGCGGCATCGGCAGTGGCGGCGGCGGGGGCAG  2875
            ||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2827  CAGAACTCTCTGAACACTGTGAGCTCTGGCAGCGGCAGCACCAGTGGCATTGGCAGTGGTGGCGGCGGGGGCAG  2900

Query 2876  CGGCGTGGTCAGCACCGTGGTGCAGCCCTACGACGTGGAGATCCGGCGCGGGGAGAACGAGGGCTTCGGCTTCG  2949
            |||.|||||.|||.|.|||.||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 2901  CGGTGTGGTGAGCGCTGTGCTGCAGCCCTATGATGTGGAGATTCGGCGTGGGGAGAACGAGGGCTTTGGGTTTG  2974

Query 2950  TCATCGTGTCCTCGGTGAGCAGGCCCGAAGCAGGCACGACCTTTGGCAATGCATGTGTGGCTATGCCTCACAAA  3023
            |||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2975  TCATCGTGTCCTCCGTGAGCAGACCCGAAGCGGGCACAACCTTCGGCAATGCATGTGTGGCTATGCCTCACAAA  3048

Query 3024  ATAGGTCGGATTATTGAGGGGAGCCCTGCTGACCGCTGTGGCAAGCTGAAAGTAGGAGACCGGATCTTGGCAGT  3097
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3049  ATAGGTCGGATTATTGAGGGGAGCCCTGCTGACCGCTGTGGCAAGCTGAAAGTAGGAGACCGGATCTTGGCAGT  3122

Query 3098  AAATGGATGTTCCATCACCAACAAATCCCATTCAGACATTGTGAACCTAATCAAGGAAGCGGGAAACACAGTTA  3171
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 3123  AAATGGATGTTCCATCACCAACAAATCCCATTCTGACATTGTCAACCTAATCAAAGAAGCGGGCAACACAGTGA  3196

Query 3172  CCCTCCGCATCATTCCTGGGGATGAGTCCTCGAATGCCACCTTGCTGACCAATGCAGAGAAGATTGCCACCATC  3245
            |.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||..|||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 3197  CTCTCCGCATCATCCCCGGGGATGAGTCCTCAAATGCCACGCTGCTGACTAATGCTGAGAAGATTGCCACCATC  3270

Query 3246  ACCACCACACACACCCCTTCTCAGCAAGGGACCCAGGAGACAAGGAATACCACCAAACCAAAGCAGGAATCTCA  3319
            ||||||||.||..||||.||||||||.|||||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 3271  ACCACCACTCATGCCCCCTCTCAGCAGGGGACCCAGGAAACAAGGACCACCACCAAACCAAAGCAGGATTCTCA  3344

Query 3320  ATTTGAGTTCAAAGCACCCCAAGCAACACAGGAGCAAGATTTTTACACTGTGGAACTGGAAAGAGGAGCCAAGG  3393
            .|||||||||||||.|||.||.||..||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||.|||||||
Sbjct 3345  GTTTGAGTTCAAAGGACCGCAGGCTGCACAGGAGCAAGATTTCTACACTGTGGAATTGGAAAGAGGGGCCAAGG  3418

Query 3394  GATTTGGCTTTAGCCTTCGAGGAGGCCGAGAGTATAACATGGACCTCTATGTTCTGCGCTTAGCAGAGGACGGT  3467
            |||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 3419  GATTTGGCTTTAGTCTTCGAGGGGGCCGAGAATATAACATGGATCTTTATGTTCTGCGCTTGGCAGAGGATGGT  3492

Query 3468  CCTGCGGAGAGGTGTGGAAAGATGAGGATTGGTGATGAAATTTTAGAGATCAATGGTGAGACCACCAAAAACAT  3541
            |||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3493  CCTGCAGAAAGATGTGGGAAGATGAGGATTGGCGATGAAATTCTAGAGATCAATGGTGAGACCACCAAAAACAT  3566

Query 3542  GAAGCATTCTCGAGCTATAGAACTGATTAAGAATGGTGGCCGCAGAGTTCGTCTGTTTCTGAAGCGGGGAGACG  3615
            |||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||..|||||||||||
Sbjct 3567  GAAACACTCTCGGGCCATAGAACTGATCAAGAATGGCGGCCGCAGGGTCCGTCTGTTTCTGCGGCGGGGAGACG  3640

Query 3616  GCTCAGTACCAGATTATGACCCCAGCAGCGACCGCCACGGCCCCGCCACCGGTCCACAAGGTGTTCC-GAAGTG  3688
            |||||||.|||||.||||||||||||||||||.|..||||||||.||||||||.||||||||||||| ||||||
Sbjct 3641  GCTCAGTCCCAGAATATGACCCCAGCAGCGACAGGAACGGCCCCTCCACCGGTGCACAAGGTGTTCCGGAAGTG  3714

Query 3689  AGGCCGGG-----CCGACCGC-GGCAGCATCGTCA---TTGGAGTCCAGTTACCCACCCGATCTTCACAAATCA  3753
            ||||||||     |.||||.| |.|.|||||  ||   |||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 3715  AGGCCGGGGCCGCCAGACCACAGACCGCATC--CAGCCTTGGAGTCCAGTTACCCACCCGAACTTCACAAATCA  3786

Query 3754  TCACCACATGGGGAAAAGCGGGCACACGCAAGGGATCCGAAAGGCAGCAGAGAGTATAGCAGACAACCCAATGA  3827
            ||||.|||||..||||||||.||||||||.|.||||||.|||||||.|||.|||.|.||||.|||||||||.||
Sbjct 3787  TCACAACATGCCGAAAAGCGAGCACACGCGAAGGATCCAAAAGGCAACAGGGAGCACAGCAAACAACCCAACGA  3860

Query 3828  ACACCACACCTGGAATGGGACTTCGAGGAAACCCGACAGCGGGGCATGCCGACCCAAGGACCGGGCGCCGGAGG  3901
            |||.||||||||||||||.|||||.||.||||..|||||||||||||||||.|||||.||||||.|.||.||.|
Sbjct 3861  ACATCACACCTGGAATGGAACTTCTAGAAAACAGGACAGCGGGGCATGCCGGCCCAAAGACCGGCCACCCGACG  3934

Query 3902  GACGGAGGGACGCGCAGGCCGAGCGCGCGGCAGCCGCCAACGGCCCCAAGAGGCGGTCCCCAGAGAAGCGGAGG  3975
            .|.||||.||.||||||.|.|||||   |.|||||.||||.||..|.||||||.||||.||.||||||||.|||
Sbjct 3935  CATGGAGAGAGGCGCAGCCAGAGCG---GACAGCCACCAATGGTTCAAAGAGGAGGTCACCGGAGAAGCGCAGG  4005

Query 3976  GAGGGCACCCGCAGCGCCGACAACACTTTGGAGAGGAGGGAGAAGCACGAGAAGAGACGAGACGTCTCTCCGGA  4049
            ||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||.||||..|.|||||.||
Sbjct 4006  GAAGGCACCCGCAGCGCTGACAACACTTTGGAAAGAAGGGAGAAGCATGAGAAGAGAAGAGAGATATCTCCCGA  4079

Query 4050  GCGGAGGCGAGAGCGGTCACCCACCCGCAGGAGAGACGGCTCCCCCAGCCGGCGGAGACGGTCTCTGGAGAGAC  4123
            |.|||.|||||||||.|||||||||||.||.|.|||..|||||||.|||||.|||.|..||||.||.||.||||
Sbjct 4080  GAGGAAGCGAGAGCGTTCACCCACCCGGAGAAAAGATAGCTCCCCGAGCCGCCGGCGGAGGTCCCTCGAAAGAC  4153

Query 4124  TCCTGGAGCAGAGGAGGTCCCCCGAGCGCAGGAGAGGGGGCTCGCCCGAGCGCAGGGCCAAGTCCACCGACCGG  4197
            |||||||.||.||..|||||||.||||||||.|||||||||||.||||||.|.||.|||||.|||||||||.||
Sbjct 4154  TCCTGGATCAAAGACGGTCCCCAGAGCGCAGAAGAGGGGGCTCCCCCGAGAGGAGAGCCAAATCCACCGACAGG  4227

Query 4198  AGGCGCGCACGCTCCCCCGAGCGCAGGAGAGAGCGGTCCCTGGACAAAAGGAACAGAGAGGACAGAGCCAGCCA  4271
            |||.|.||..|.|||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.|.||.||||..|...||||
Sbjct 4228  AGGAGGGCCAGGTCCCCTGAGCGCAGGCGAGAGCGGTCACTGGACAAAAGGAACCGGGACGACAAGGTTGGCCA  4301

Query 4272  CCGAGAAAGGGAAGAGGCGAATCTGAAACAGGATGCCGGCAGAAGTTCCAGACATCCCCCGGAGCAGAGAAGGC  4345
            |||||||||.||.|||||...||||||.|.|||.||.||.|||||..||.||.|||||||.|||||||||||||
Sbjct 4302  CCGAGAAAGAGAGGAGGCTGGTCTGAAGCTGGAAGCGGGGAGAAGCCCCCGAAATCCCCCAGAGCAGAGAAGGC  4375

Query 4346  GACCTTACAAAGAATGTAGCACCGACCTCAGTATC  4380
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 4376  GGCCTTACAAAGAATGTAGCACCGACCTCAGCATC  4410