Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14949
- Subject:
- NM_133985.2
- Aligned Length:
- 1581
- Identities:
- 1431
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGTCCGAGGACTCGAGCGCCCTGCCCTGGTCCATCAACAGGGACGATTACGAGCTGCAGGAGGTGATCGGGAG 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGTCCGAGGACTCGAGCGCCCTGCCCTGGTCCATCAACAGGGACGACTACGAGCTGCAGGAGGTGATAGGGAG 74
Query 75 TGGAGCAACTGCTGTAGTCCAAGCAGCTTATTGTGCCCCTAAAAAGGAGAAAGTGGCAATCAAACGGATAAACC 148
||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||.||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 75 TGGAGCAACTGCCGTGGTCCAAGCAGCTTACTGTGCCCCCAAAAAGGAGAGAGTGGCGATCAAGCGGATAAACC 148
Query 149 TTGAGAAATGTCAAACTAGCATGGATGAACTCCTGAAAGAAATTCAAGCCATGAGTCAATGCCATCATCCTAAT 222
|.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 149 TGGAGAAGTGTCAGACCAGCATGGATGAGCTCCTGAAAGAAATCCAGGCCATGAGCCAATGCCATCATCCTAAC 222
Query 223 ATTGTATCTTACTACACATCTTTTGTGGTAAAAGATGAGCTGTGGCTTGTCATGAAGCTGCTAAGTGGAGGTTC 296
|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATTGTGTCTTACTACACATCTTTTGTGGTAAAGGATGAGCTGTGGCTCGTCATGAAGCTGCTAAGTGGAGGTTC 296
Query 297 TGTTCTGGATATTATTAAGCACATTGTGGCAAAAGGGGAACACAAAAGTGGAGTCCTAGATGAATCTACCATTG 370
||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||.||..|.|||||||
Sbjct 297 TGTTCTGGATATTATTAAACACATTGTGGCAAAGGGGGAACATAAGAGTGGAGTTCTGGACGAGCCAACCATTG 370
Query 371 CTACGATACTCCGAGAAGTACTGGAAGGGCTGGAATATCTGCATAAAAATGGACAGATCCACAGAGATGTGAAA 444
||||.||.|||||||||||..|.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 CTACAATCCTCCGAGAAGTCTTAGAAGGACTGGAGTACCTGCATAAGAATGGGCAGATTCACAGAGATGTGAAA 444
Query 445 GCTGGAAACATTCTTCTTGGAGAAGATGGCTCAGTACAGATTGCAGACTTTGGGGTTAGTGCTTTTTTAGCAAC 518
|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 445 GCTGGAAACATTCTTCTAGGAGAAGACGGCTCTGTGCAGATTGCAGATTTCGGCGTCAGTGCTTTTTTAGCCAC 518
Query 519 TGGTGGTGATATTACCCGAAATAAAGTGAGAAAGACCTTTGTTGGCACCCCTTGTTGGATGGCACCTGAAGTTA 592
|||||||||.||||||.||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 519 TGGTGGTGACATTACCAGAAATAAAGTGAGAAAAACGTTTGTTGGCACCCCGTGCTGGATGGCACCCGAAGTTA 592
Query 593 TGGAACAGGTCCGTGGTTATGATTTCAAAGCTGATATTTGGAGTTTTGGAATTACAGCAATTGAATTGGCTACA 666
||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||.||||.|||
Sbjct 593 TGGAGCAGGTTCGAGGTTATGATTTTAAAGCTGATATTTGGAGTTTTGGAATCACTGCGATTGAACTGGCCACA 666
Query 667 GGGGCGGCTCCTTATCATAAATATCCACCAATGAAGGTTTTAATGCTGACACTGCAGAACGATCCTCCTTCTTT 740
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 667 GGGGCAGCTCCTTATCATAAATATCCACCAATGAAGGTTTTAATGCTGACGCTCCAGAATGATCCTCCTTCTTT 740
Query 741 GGAAACTGGTGTTCAAGATAAAGAAATGCTGAAAAAATATGGAAAATCATTTAGAAAAATGATTTCATTGTGCC 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGAAACTGGTGTTCAAGATAAAGAAATGCTGAAGAAATATGGAAAATCATTTAGAAAAATGATTTCATTGTGCC 814
Query 815 TTCAAAAAGATCCAGAAAAAAGACCAACAGCAGCAGAACTATTAAGGCACAAATTTTTCCAGAAAGCAAAGAAT 888
|||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTCAAAAGGATCCAGAAAAAAGGCCAACAGCAGCAGAACTGTTGAGGCACAAATTTTTCCAGAAAGCAAAGAAT 888
Query 889 AAAGAATTTCTTCAAGAAAAAACATTGCAGAGAGCACCAACCATTTCTGAAAGAGCAAAAAAGGTTCGGAGAGT 962
||||||||||||||||||||||.|.|.|||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||.||.|||||
Sbjct 889 AAAGAATTTCTTCAAGAAAAAATACTCCAGAGAGCACCTACCATTTCTGAAAGATCTAAAAAGGTCCGCAGAGT 962
Query 963 ACCAGGTTCCAGTGGGCGTCTTCATAAGACAGAGGATGGAGGCTGGGAGTGGAGTGATGATGAATTTGATGAAG 1036
.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 963 CCCCGGCTCCAGTGGCCGTCTCCATAAGACAGAGGACGGAGGCTGGGAGTGGAGTGACGATGAGTTTGATGAGG 1036
Query 1037 AAAGTGAGGAAGGGAAAGCAGCAATTTCACAACTCAGGTCTCCCCGAGTGAAAGAATCAATATCAAATTCTGAG 1110
|.||.||||||||||.|||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||.||||.|.|||||||
Sbjct 1037 AGAGCGAGGAAGGGAGAGCTGCCATTTCTCAGCTGAGGTCTCCCCGAGTAAAAGACTCATTATCCAGTTCTGAG 1110
Query 1111 CTCTTTCCAACAACTGATCCTGTGGGTACTTTGCTCCAAGTTCCAGAACAGATCTCTGCTCATCTACCTCAGCC 1184
|||||..|..||.||||.||..||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTCTTCGCGGCAGCTGAGCCCATGGGGACTTTGCTTCAAGTTCCAGAACAGATTTCTGCTCATCTACCTCAGCC 1184
Query 1185 AGCTGGGCAGATTGCTACACAGCCAACTCAAGTCTCTCTCCCACCCACCGCAGAGCCAGCAAAAACAGCTCAGG 1258
||||||.|||||..|.|||||||||.|||||||||||||||..|||.|.|||||||||||||||.||||.||||
Sbjct 1185 AGCTGGCCAGATGCCCACACAGCCAGCTCAAGTCTCTCTCCTGCCCCCTGCAGAGCCAGCAAAACCAGCACAGG 1258
Query 1259 CTTTGTCTTCAGGATCAGGTTCACAAGAAACCAAGATCCCAATCAGTCTAGTACTAAGATTAAGGAATTCCAAA 1332
||..||||||||||..|.|.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTCAGTCTTCAGGAGAACGGTCCCAGGAGACCAAGATCCCTATCAGTCTAGTGCTAAGATTAAGGAATTCCAAA 1332
Query 1333 AAAGAACTAAATGATATTCGATTTGAATTTACTCCTGGGAGAGATACAGCAGAGGGTGTCTCTCAGGAACTCAT 1406
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1333 AAAGAACTAAATGATATTCGATTTGAATTTACTCCTGGGAGAGATACAGCAGAGGGTGTTTCTCAGGAGCTCAT 1406
Query 1407 TTCTGCTGGCCTGGTCGACGGAAGGGATTTAGTAATAGTGGCAGCTAATTTGCAGAAAATTGTGGAAGAACCTC 1480
|||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1407 TTCTGCTGGCCTGGTTGATGGAAGGGATTTAGTAATAGTGGCAGCCAATCTGCAGAAGATTGTGGAAGAACCTC 1480
Query 1481 AGTCAAATCGATCTGTCACTTTCAAACTGGCATCTGGTGTCGAAGGCTCAGATATTCCTGATGATGGTAAACTG 1554
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481 AGTCAAACCGATCTGTCACTTTCAAACTGGCATCTGGTGTTGAAGGCTCGGATATTCCTGATGATGGCAAACTG 1554
Query 1555 ATAGGATTTGCCCAGCTCAGCATCAGC 1581
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATAGGATTTGCCCAGCTCAGCATCAGC 1581