Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14983
- Subject:
- XM_006726280.2
- Aligned Length:
- 1974
- Identities:
- 1467
- Gaps:
- 285
Alignment
Query 1 ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC 74
|||||.|.|.|||||.|||.||||.|.|||||.|||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||..|
Sbjct 1 ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCATGCAGGCAGGGCC 74
Query 75 CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGAT-AGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGT 147
|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| |||| ||||||..|||||||||.||||||||
Sbjct 75 CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCT-GGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGT 147
Query 148 CAGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCC-GGAAGAGACAGAACC 220
||.|||..|||||||.|..|||||||||..||||||||.||||||..|||| |.|||| ||.|.|||.|.||||
Sbjct 148 CAAGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCAACTGGATAAAGAGGGAAGCCCA-GAGCCCTGGGACAGAAATAACC 220
Query 221 CACTGGAGCCTGGAGC-----CAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACA-------GTGCAGGG 282
|||||||.|| | ||||||||..|||..|||.|||||| |||||| .|||||||
Sbjct 221 CACTGGAACC-----CAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCC-------ATGACACAGCACCATGCAGGG 282
Query 283 CGATACCGCTGCTACTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGACAGG 356
.|||||||||||.|||||.|.|.|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..||||||
Sbjct 283 AGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAGG 356
Query 357 ATTCTATGCA--GAACCCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGTGACCCTCCA 428
|||||| || .|||||||.||.|.|||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||.
Sbjct 357 ATTCTA--CAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCG 428
Query 429 GTGTGATACACTGGACGGACTTCTCAC--GTTTGTTCTTGTTG-AGGA---AGAACAGAAGCTCCCCAGGACCC 496
.||||...|||.|.|.||| |.|||| .||||||| ||.|| |||| ||||||..||||||||.||||||
Sbjct 429 ATGTGGCTCACAGAAGGGA--TATCACCATTTTGTTC-TGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCC 499
Query 497 TGTACTCACAGAAGCTCCCCAAAGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCAGCTGCAGG 570
||.||||||||.||||||.||..|||...|.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||..||||
Sbjct 500 TGGACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGACCCCCAGCCACAGG 573
Query 571 TGGAGGTTCAGATGCTATTACTATTACAGGAAAAACCCTC-AGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTCCTGGAGA 643
||||||||||.|||||||||||||||.| .|||.||||.| .|||||||||..||||||||||||.||||||||
Sbjct 574 TGGAGGTTCACATGCTATTACTATTATA-CAAACACCCCCTGGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGA 646
Query 644 TTCTGGTCCCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCCGCGGAGGC--A 715
|||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.|||||.||||||..| ||| |
Sbjct 647 TTCTGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTG--GGCAGA 718
Query 716 GCCTGACCCTGCAGTGTCGCTCTGATGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTC 789
||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||.|||.||||||||.|||||||||||||.||||.||
Sbjct 719 GCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTC 792
Query 790 GTCCAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTC 863
.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 CTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTC 866
Query 864 CCACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCC-CCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTG 936
|.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||| ||.| |||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 867 CTACGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGA-GTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTG 939
Query 937 GCCATCCTGATCGCAGGACTGATCCCTGACATACCCG---CCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTC 1007
|.||||||||||.||||||.||||..||||| ||| ||||.||.|..|||||||||||||..||||||||
Sbjct 940 GACATCCTGATCACAGGACAGATCTATGACA---CCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTC 1010
Query 1008 AGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGCATCAGATA----GACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGG 1077
|||||||||||||||||||||||||||||||.|| .|.|| |||||||||.||.|||||||.||.|||
Sbjct 1011 AGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACGG----GGGTATTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGG 1080
Query 1078 GCAGCCCATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAGTAC-CAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTC 1150
||||||||||||||.|||.||||.|..||||.|||| .|| ||.|||...||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1081 GCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAG-CTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTC 1153
Query 1151 CTGTGACCTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATGCTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGC 1224
||||||||||||||||.|..||.||||||.|.||||||.||.||..|||.|||.|||||.||||||||||...|
Sbjct 1154 CTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTC 1227
Query 1225 CCTAGTTACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCCTCTGG-GGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCC 1297
||.|||.|.||||.|||.|||.||||||||||||.|||||| ||.| ||||||||.||||.||||| .||.|||
Sbjct 1228 CCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCT-CCAGCCTCCCACCCACAGG-GCCGCCC 1299
Query 1298 -CCACACCTGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCT 1370
||||||| ||||||||||||..||||
Sbjct 1300 TCCACACC------------------------------------------------TGGTCTGGGAAGATACCT 1325
Query 1371 GGGGGTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATC 1444
||.||||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1326 GGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTC 1399
Query 1445 GGCATCAGAGCAAACACAGGACATCGGCCC------------ATTTCTACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCA 1506
.||.|||.|||||||||||||||||.|.|| |||||.|.|||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 1400 AGCGTCACAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACA 1473
Query 1507 GAGCCCAAGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCTGACATCCAGGAGGAAATTCTCAATGCTGC 1580
||||||||||||..||||||||.||.||||.|||||||||.|||||||.|||||||.||||..|||.|||||||
Sbjct 1474 GAGCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGC 1547
Query 1581 CGTGAAGGACACACAGCCCAAGGACGGGGTGG------------------------------------------ 1612
.|||||||||||||||.|..|||||.||||||
Sbjct 1548 TGTGAAGGACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAG 1621
Query 1613 -------------------------------------------------------------------------- 1612
Sbjct 1622 TGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAA 1695
Query 1613 ----------------------------------------AGATGGATGCTCGGGCTGCTGCATCTGAAGCCCC 1646
|||||||..||..|||||||||||||||||||.|
Sbjct 1696 TTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTC 1769
Query 1647 CCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTACACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGG 1720
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1770 CCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGG 1843
Query 1721 AAAGGGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCCCTGGCCATCCAC 1770
||.||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct 1844 AAGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1893