Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14983
- Subject:
- XM_006726313.4
- Aligned Length:
- 1973
- Identities:
- 1473
- Gaps:
- 280
Alignment
Query 1 ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC 74
|||||.|.|.|||||.|||.||||.|.|||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||..|
Sbjct 1 ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCC 74
Query 75 CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGAT-AGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGT 147
|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| |||| ||||||..|||||||||.||||||||
Sbjct 75 CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCT-GGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGT 147
Query 148 CAGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCC--GGAAGAGACAGAAC 219
||||||..|||||||.|..||||||||||.||||||||.||||||..|||| |.|||| || |.|||.|.|||
Sbjct 148 CAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGGAAGCCCA-GAGCCCTTGG-ACAGAAATAAC 219
Query 220 CCACTGGAGCCTGGAGC-----CAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACAG-------TGCAGG 281
||||||||.|| | ||||||||..|||..|||.|||||| ||||||| |||.||
Sbjct 220 CCACTGGAACC-----CAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCC-------ATGACAGAGCACCATGCGGG 281
Query 282 GCGATACCGCTGCTACTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGACAG 355
|.|||||||||||.|||||.|.|.|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..|||||
Sbjct 282 GAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAG 355
Query 356 GATTCTATGCA--GAACCCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGTGACCCTCC 427
||||||| || .|||||||.||.|.|||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||
Sbjct 356 GATTCTA--CAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCC 427
Query 428 AGTGTGATACACTGGACGGACTTCTCAC--GTTTGTTCTTGTTG-AGGA---AGAACAGAAGCTCCCCAGGACC 495
..||||...|||.|.|.||| |.|||| .||||||| ||.|| |||| ||||||..||||||||.|||||
Sbjct 428 GATGTGGCTCACAGAAGGGA--TATCACCATTTTGTTC-TGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACC 498
Query 496 CTGTACTCACAGAAGCTCCCCAAAGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCAGCTGCAG 569
|||.||||||||.||||||.||..|||...|.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||..|||
Sbjct 499 CTGGACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAACCCCAGCCACAG 572
Query 570 GTGGAGGTTCAGATGCTATTACTATTACAGGAAAAACCCTCAGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTCCTGGAGA 643
|||||||||||.|||||||||||||||.|.|||.|.|||.|||||||||||..||||||||||||.||||||||
Sbjct 573 GTGGAGGTTCACATGCTATTACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGA 646
Query 644 TTCTGGTCCCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCCGCGGAGGC--A 715
|||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.|||||.||||||..| ||| |
Sbjct 647 TTCTGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTG--GGCAGA 718
Query 716 GCCTGACCCTGCAGTGTCGCTCTGATGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTC 789
||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||.|||.||||||||.|||||||||||||.||||.||
Sbjct 719 GCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTC 792
Query 790 GTCCAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTC 863
.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 793 CTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCCCTC 866
Query 864 CCACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCC-CCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTG 936
||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||| ||.| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 867 CCACGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGA-GTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTG 939
Query 937 GCCATCCTGATCGCAGGACTGATCCCTGACATACCCG---CCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTC 1007
..|||||||||.|||||||.||||..||||| ||| ||||.||.|..|||||||||||||..||||||||
Sbjct 940 AACATCCTGATGGCAGGACAGATCTATGACA---CCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTC 1010
Query 1008 AGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCAG 1081
||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||.|.|||||||||.||.|||||||.||.|||||||
Sbjct 1011 AGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAG 1084
Query 1082 CCCATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAGTAC-CAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTGT 1154
||||||||||.|||.||||.|..||||.|||| .|| ||.|||...||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1085 CCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAG-CTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGT 1157
Query 1155 GACCTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATGCTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGCCCTA 1228
||||||||||||.|..||.||||||.|.||||||.||.||..|||.|||.|||||.||||||||||...|||.|
Sbjct 1158 GACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTCCCCA 1231
Query 1229 GTTACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCCTCTGG-GGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCC-CCA 1300
||.|.||||.|||.|||.||||||||||||.|||||| ||.| ||||||||.||||.||||| .||.||| |||
Sbjct 1232 GTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCT-CCAGCCTCCCACCCACAGG-GCCGCCCTCCA 1303
Query 1301 CACCTGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGG 1374
|||| ||||||||||||..||||||.|
Sbjct 1304 CACC------------------------------------------------TGGTCTGGGAAGATACCTGGAG 1329
Query 1375 GTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATCGGCA 1448
|||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 1330 GTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCG 1403
Query 1449 TCAGAGCAAACACAGGACATCGGCCC------------ATTTCTACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAGAGC 1510
|||.|||||||||||||||||.|.|| |||||.|.|||||||||||||||||||.|.||||||
Sbjct 1404 TCACAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGC 1477
Query 1511 CCAAGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCTGACATCCAGGAGGAAATTCTCAATGCTGCCGTG 1584
||||||||..||||||||.||.||||.|||||||||.|||||||.|||||||.||||..|||.|||||||||||
Sbjct 1478 CCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTG 1551
Query 1585 AAGGACACACAGCCCAAGGACGGGGTGG---------------------------------------------- 1612
||||||||||||.|..|||||.||||||
Sbjct 1552 AAGGACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGT 1625
Query 1613 -------------------------------------------------------------------------- 1612
Sbjct 1626 GACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAAT 1699
Query 1613 ---------------------------------------AGATGGATGCTCGGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCC 1647
|||||||..||..|||||||||||||||||||.||
Sbjct 1700 TCCTGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCC 1773
Query 1648 CAGGATGTGACCTACGCCCAGCTACACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGA 1721
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 CAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGA 1847
Query 1722 AAGGGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCCCTGGCCATCCAC 1770
|.||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct 1848 AGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1896