Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14983
• Subject: XM_011526359.2
• Aligned Length: 2010
• Identities: 1767
• Gaps: 240

Alignment

Query    1  ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC  74

Query   75  CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGATAGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGATAGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGTC  148

Query  149  AGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCCGGAAGAGACAGAACCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCCGGAAGAGACAGAACCCA  222

Query  223  CTGGAGCCTGGAGCCAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACAGTGCAGGGCGATACCGCTGCTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGGAGCCTGGAGCCAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACAGTGCAGGGCGATACCGCTGCTA  296

Query  297  CTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGACAGGATTCTATGCAGAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGACAGGATTCTATGCAGAAC  370

Query  371  CCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGTGACCCTCCAGTGTGATACACTGGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGTGACCCTCCAGTGTGATACACTGGAC  444

Query  445  GGACTTCTCACGTTTGTTCTTGTTGAGGAAGAACAGAAGCTCCCCAGGACCCTGTACTCACAGAAGCTCCCCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGACTTCTCACGTTTGTTCTTGTTGAGGAAGAACAGAAGCTCCCCAGGACCCTGTACTCACAGAAGCTCCCCAA  518

Query  519  AGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCAGCTGCAGGTGGAGGTTCAGATGCTATTACT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCAGCTGCAGGTGGAGGTTCAGATGCTATTACT  592

Query  593  ATTACAGGAAAAACCCTCAGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTCCTGGAGATTCTGGTCCCAGGCGTGTCTAGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATTACAGGAAAAACCCTCAGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTCCTGGAGATTCTGGTCCCAGGCGTGTCTAGG  666

Query  667  AAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCCGCGGAGGCAGCCTGACCCTGCAGTGTCGCTCTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCCGCGGAGGCAGCCTGACCCTGCAGTGTCGCTCTGA  740

Query  741  TGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTCGTCCAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTCGTCCAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCC  814

Query  815  AGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGATGCTAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGATGCTAC  888

Query  889  GGTGCACACAACCTCTCCCCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGCCATCCTGATCGCAGGACTGATCCC  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGTGCACACAACCTCTCCCCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACTGATCCC  962

Query  963  TGACATACCCGCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGACATACCCGCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGT  1036

Query 1037  CATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCCCATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCCCATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAG  1110

Query 1111  TACCAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TACCAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATG  1184

Query 1185  CTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGCCCTAGTTACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGCCCTAGTTACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGAC  1258

Query 1259  CCTCTGGGGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCCCCACACCT---GGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACC  1329
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCTCTGGGGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCCCCACACCTGCAGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACC  1332

Query 1330  CCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGT  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGT  1406

Query 1404  CCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATCGGCATCAGAGCAAACACAGGACATCGGCCCATT  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATCGGCATCAGAGCAAACACAGGACATCGGCCCATT  1480

Query 1478  TCTACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAGAGCCCAAGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCT  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCTACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAGAGCCCAAGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCT  1554

Query 1552  GACATCCAGGAGGAAATTCTCAATGCTGCCGTGAAGGACACACAGCCCAAGGACGGGGTGGAGATGGATGCT--  1623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 1555  GACATCCAGGAGGAAATTCTCAATGCTGCCGTGAAGGACACACAGCCCAAGGACGGGGTGGAGATGGATGCTCC  1628

Query 1624  --------------------------------------------------------------------------  1623
                                                                                      
Sbjct 1629  GCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAA  1702

Query 1624  --------------------------------------------------------------------------  1623
                                                                                      
Sbjct 1703  TGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCAGAAGAGGACAGACAG  1776

Query 1624  --------------------------------------------------------------------------  1623
                                                                                      
Sbjct 1777  ATGGACACTGAGAGAGTCCTTTCCTCTCCAGGCCCCCAGGCCTCCCCCACCCCCACCACGTTCCTTCCCTCTCA  1850

Query 1624  -------------CGGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTACACAGCTTGACCC  1684
                         |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1851  CTCTCCCCCGCTGCAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCC  1924

Query 1685  TCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAAGGGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCC  1758
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAAGGGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCC  1998

Query 1759  CTGGCCATCCAC  1770
            ||||||||||||
Sbjct 1999  CTGGCCATCCAC  2010