Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14983
- Subject:
- XM_017030297.1
- Aligned Length:
- 1972
- Identities:
- 1471
- Gaps:
- 281
Alignment
Query 1 ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC 74
|||||.|.|.|||||.|||.||||.|.|||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||..|
Sbjct 1 ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCC 74
Query 75 CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGAT-AGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGT 147
|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| |||| ||||||..|||||||||.||||||||
Sbjct 75 CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCT-GGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGT 147
Query 148 CAGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCC--GGAAGAGACAGAAC 219
||||||..||.||||.|..||||||||||.|||.||||.||||||..|||| |.|||| || |.|||.|.|||
Sbjct 148 CAGGGGAGCCAGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGCATAAAGAGGGAAGCCCA-GAGCCCTTGG-ACAGAAATAAC 219
Query 220 CCACTGGAGCCTGGAGC-----CAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACAG-------TGCAGG 281
||||||||.|| | ||||||||..|||..|||.|||||| ||||||| ||||||
Sbjct 220 CCACTGGAACC-----CAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCC-------ATGACAGAGCACCATGCAGG 281
Query 282 GCGATACCGCTGCTACTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGACAG 355
|.|||||||||||.|||||.|.|.|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||..|||||
Sbjct 282 GAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGATGGTGATGACAG 355
Query 356 GATTCTATGCAG--AACCCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGTGACCCTCC 427
||..||| ||| |||||||.||.|.|||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||
Sbjct 356 GAGCCTA--CAGCAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCC 427
Query 428 AGTGTGATACACTGGACGGACTTCTCAC--GTTTGTTCTTGTTG-AGGA---AGAACAGAAGCTCCCCAGGACC 495
..||||...|||.|.|.||| |.|||| .||||||| ||.|| |||| ||||||..||||||||.|||||
Sbjct 428 GATGTGGCTCACAGAAGGGA--TATCACCATTTTGTTC-TGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACC 498
Query 496 CTGTACTCACAGAAGCTCCCCAAAGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCAGCTGCAG 569
|||.||||||||.||||||.||...||...|.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||..|||
Sbjct 499 CTGGACTCACAGCAGCTCCACAGTCGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGACCCCCAGCCACAG 572
Query 570 GTGGAGGTTCAGATGCTATTACTATTACAGGAAAAACCCTC-AGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTCCTGGAG 642
|||||||||||.|||||||||||||||.| .|||.||||.| .|||||||||..||||||||||||.|||||||
Sbjct 573 GTGGAGGTTCACATGCTATTACTATTATA-CAAACACCCCCTGGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAG 645
Query 643 ATTCTGGTCCCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCCGCGGAGGC-- 714
||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.|||||.||||||..| |||
Sbjct 646 ATTCTGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTG--GGCAG 717
Query 715 AGCCTGACCCTGCAGTGTCGCTCTGATGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCT 788
|||||||||||.||||||.||||||||||||||||..|||.|||.||||||||.|||||||||||||.||||.|
Sbjct 718 AGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTT 791
Query 789 CGTCCAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCT 862
|.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 792 CCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCCCT 865
Query 863 CCCACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCC-CCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCT 935
||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||| ||.| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 866 CCAATGGGGGCCAGTACAGGTGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGA-GTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCT 938
Query 936 GGCCATCCTGATCGCAGGACTGATCCCTGACATACCCG---CCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCT 1006
|..|||||||||.|||||||.||||..||||| ||| ||||.||.|..|||||||||||||..|||||||
Sbjct 939 GAACATCCTGATGGCAGGACAGATCTATGACA---CCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCT 1009
Query 1007 CAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCA 1080
|||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||.|.|||||||||.||.|||||||.||.||||||
Sbjct 1010 CAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCA 1083
Query 1081 GCCCATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAGTAC-CAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTG 1153
|||||||||||.|||.||||.|..||||.|||| .|| ||.|||...||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1084 GCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAG-CTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTG 1156
Query 1154 TGACCTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATGCTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTC-CAGCCC 1226
|||||||||||||.|..||.||||||.|.||||||.||.||..|||.|||.|||||.|||||||||| || |||
Sbjct 1157 TGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTCA-CCC 1229
Query 1227 TAGTTACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCCTCTGG-GGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCC-C 1298
.|||.|.||||.||||||||||||||||||||.|||||| ||.| ||||||||.||||.||||| .||.||| |
Sbjct 1230 CAGTGAGCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCT-CCAGCCTCCCACCCACAGG-GCCGCCCTC 1301
Query 1299 CACACCTGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGG 1372
|||||| ||||||||||||..||||||
Sbjct 1302 CACACC------------------------------------------------TGGTCTGGGAAGATACCTGG 1327
Query 1373 GGGTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATCGG 1446
.||||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1328 AGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAG 1401
Query 1447 CATCAGAGCAAACACAGGACATCGGCCC------------ATTTCTACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAGA 1508
|.|||.|||||||||||||||||.|.|| |||||.|.|||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 1402 CGTCACAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGA 1475
Query 1509 GCCCAAGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCTGACATCCAGGAGGAAATTCTCAATGCTGCCG 1582
||||||||||..||||||||.||.||||.|||||||||.|||||||.|||||||.||||..|||.|||||||||
Sbjct 1476 GCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCG 1549
Query 1583 TGAAGGACACACAGCCCAAGGACGGGGTGG-------------------------------------------- 1612
||||||||||||||.|..|||||.||||||
Sbjct 1550 TGAAGGACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTG 1623
Query 1613 -------------------------------------------------------------------------- 1612
Sbjct 1624 ACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATT 1697
Query 1613 --------------------------------------AGATGGATGCTCGGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCC 1648
|||||||..||..|||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1698 CCTGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCC 1771
Query 1649 AGGATGTGACCTACGCCCAGCTACACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAA 1722
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1772 AGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAA 1845
Query 1723 AGGGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCCCTGGCCATCCAC 1770
.||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct 1846 GGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1893