Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15059
- Subject:
- XM_011240154.1
- Aligned Length:
- 2528
- Identities:
- 1861
- Gaps:
- 360
Alignment
Query 1 ATGGGAAATTATAAATCTAGACCAACCCAAACTTGTACTGATGAATGGAAGAAAAAAGTCAGTGAATCATATGT 74
|||||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||.
Sbjct 1 ATGGGGAATTACAAATCCAGACCGACACAGACTTGTTCTGATGAATGGAAGAAGAAAGTTAGTGAATCTTATGC 74
Query 75 TATCACAATAGAAAGATTAGAAGATGACCTGCAGATCAAGGAAAAAGAACTGACAGAACTAAGGAATATATTTG 148
|||.|.|||||||||..|.||||||||||||||||||||.|||||.|||.|...|||||||||..|.||.||||
Sbjct 75 TATTATAATAGAAAGGCTGGAAGATGACCTGCAGATCAAAGAAAATGAATTTCAAGAACTAAGACACATCTTTG 148
Query 149 GCTCTGATGAAGCCTTCAGTAAAGTCAATTTAAATTACCGCACTGAAAATGGGCTGTCTCTACTTCATTTATGT 222
|||||||.||||||||||||.||||||.|||||||||||||||.||...|||.|||||.|||||.||..|.||.
Sbjct 149 GCTCTGACGAAGCCTTCAGTGAAGTCAGTTTAAATTACCGCACAGAGCGTGGCCTGTCCCTACTGCACCTCTGC 222
Query 223 TGCATTTGTGGAGGCAAGAAATCACATATTCGAACTCTTATGTTGAAAGGGCTCCGCCCATCTCGACTGACAAG 296
||....||.||.|||||.||.||.|||||.||..|.||||||||.|||||||||||.|||||..||||||||||
Sbjct 223 TGTGCCTGCGGTGGCAACAAGTCGCATATCCGTGCCCTTATGTTAAAAGGGCTCCGTCCATCCAGACTGACAAG 296
Query 297 AAATGGATTTACAGCCTTGCATTTAGCAGTTTACAAGGATAATGC--AGAATTGATCACTTCTCTGCTTCACAG 368
||||||.|||.||||..||||.||.||.||||||||||||| || .|||.|.||||||||.|||.|.||.||
Sbjct 297 AAATGGGTTTCCAGCTCTGCACTTGGCTGTTTACAAGGATA--GCCTGGAACTTATCACTTCACTGTTGCATAG 368
Query 369 TGGAGCTGATATACAGCAGGTTGGATACGGTGGCCTCACTGCCCTCCATATTGCTACAATAGCTGGCCACCTAG 442
.|||||.|||.|.|||||.|..|||||.||.||||||||.||||||||.||.|||.||||||||||.||||.||
Sbjct 369 CGGAGCAGATGTTCAGCAAGCGGGATATGGCGGCCTCACAGCCCTCCACATCGCTGCAATAGCTGGGCACCCAG 442
Query 443 AGGCTGCTGATGTGCTGTTGCAACATGGAGCTAATGTCAATATTCAAGATGCAGTTTTTTTCACTCCATTGCAT 516
||||.|..||.||||||.||||.||||||||.|||||.||..|||||||||||||.||.|||||.|||.||||.
Sbjct 443 AGGCCGTGGAAGTGCTGCTGCAGCATGGAGCCAATGTGAACGTTCAAGATGCAGTCTTCTTCACCCCACTGCAC 516
Query 517 ATTGCAGCGTACTATGGACATGAACAGGTAACTCGCCTTCTTTTGAAATTTGGTGCTGATGTAAATGTAAGTGG 590
||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||..|..|.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 517 ATCGCAGCCTATTACGGGCACGAGCAGGTAACCAGTGTCCTTTTGAAGTTTGGAGCTGATGTCAATGTAAGCGG 590
Query 591 TGAAGTTGGAGATAGACCCCTCCACCTAGCATCTGCAAAAGGATTCTTGAATATTGCAAAACTCTTGATGGAAG 664
||||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||..|||||| .|||.||
Sbjct 591 TGAAGTTGGAGACAGGCCTCTGCACCTGGCCTCTGCAAAAGGGTTCTTCAACATTGTGAAACTC---CTGGTAG 661
Query 665 AACGCAGCAAAGCAGATGTGAATGCTCAAGATAATGAAGACCATGTCCCACTCCATTTCTGTTCTCGATTTGGA 738
||.|.|.||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 662 AAGGGAACAAAGCCGACGTGAACGCTCAGGACAATGAAGACCATGTCCCTCTGCACTTCTGTTCTCGATTTGGA 735
Query 739 CACCATGATATAGTTAAGTATCTGCTGCAAAGTGATTTGGAAGTTCAACCTCATGTTGTTAATATCTATGGAGA 812
|||||..|||||||.|..||..||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||..||||.||||||||.||
Sbjct 736 CACCACAATATAGTGAGCTACTTGCTCCAGAGTGACTTGGAGGTTCAGCCTCACGTCATTAACATCTATGGTGA 809
Query 813 TACCCCCTTACACCTGGCATGCTACAATGGCAAATTTGAAGTTGCCAAGGAAATCATCCAAATATCAGGAACAG 886
.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||..||||..||.|||||||.|
Sbjct 810 CACTCCTTTGCACCTGGCGTGCTACAATGGAAATTTTGAAGTTGCCAAGGAAATTGTCCACGTAACAGGAACTG 883
Query 887 AAAGTCTGACTAAGGAAAACATCTTCAGTGAAACAGCTTTTCATAGTGCTTGTACCTATGGCAAGAGCATTGAC 960
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 884 AAAGTCTGACTAAGGAAAACATCTTCAGTGAGACAGCTTTTCACAGTGCTTGTACCTATGGCAAGAACATTGAC 957
Query 961 CTAGTCAAATTTCTTCTTGATCAGAATGTCATAAACATCAACCACCAAGGAAGGGATGGGCACACTGGATTACA 1034
||.||||||||.||||||||||||||||...|.|||||.|||||.|.||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 958 CTGGTCAAATTCCTTCTTGATCAGAATGCTGTGAACATTAACCATCGAGGAAGAGATGGGCACACAGGATTACA 1031
Query 1035 CTCTGCTTGCTACCACGGTCACATTCGCCTGGTTCAGTTCTTACTGGATAATGGAGCTGATATGAATCTAGTGG 1108
|||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1032 CTCTGCTTGCTACCATGGCCACATACGCCTGGTTCAGTTCCTACTGGATAATGGTGCAGATATGAATCTAGTTG 1105
Query 1109 CTTGTGATCCCAGCAGGTCTAGTGGTGAAAAAGATGAGCAGACATGTTTGATGTGGGCTTATGAAAAAGGGCAT 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1106 CTTGTGATCCCAGCAGGTCTAGTGGTGAAAAAGATGAGCAGACATGTTTGATGTGGGCTTATGAGAAAGGACAT 1179
Query 1183 GATGCCATTGTCACACTCCTGAAGCATTATAAGAGACCACAAGATGAATTGCCCTGTAATGAATATTCTCAGCC 1256
|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||..||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1180 GATGCCATTGTTACACTCCTGAAGCACTATAAGAGACCCCAGGATGAGCTGCCATGTAACGAATATTCTCAGCC 1253
Query 1257 TGGAGGAGATGGCTCCTATGTGTCTGTTCCATCACCCTTGGGGAAGATTAAAAGCATGACAAAAGAGAAGGCAG 1330
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254 TGGAGGAGATGGCTCCTATGTGTCTGTCCCATCCCCCTTGGGGAAGATTAAAAGCATGACAAAAGAGAAGGCAG 1327
Query 1331 ATATTCTCCTCCTAAGAGCTGGATTGCCTTCACATTTCCATCTTCAGCTCTCAGAAATTGAGTTCCATGAGATT 1404
||.||||||||||.||.||||.|||.||.||.|.|||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1328 ATGTTCTCCTCCTGAGGGCTGAATTACCCTCCCGTTTCCATCTGCAGCTCTCGGAAATTGAATTCCATGAGATT 1401
Query 1405 ATTGGCTCAGGTTCTTTTGGGAAAGTATATAAAGGACGATGCAGAAATAAAATAGTGGCTATAAAACGTTATCG 1478
||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 1402 ATCGGCTCAGGTTCTTTTGGGAAAGTCTATAAAGGGCGATGCAGAAATAAAATAGTGGCAATCAAACGATACCG 1475
Query 1479 AGCCAATACCTACTGCTCCAAGTCAGATGTGGATATGTTTTGCCGAGAGGTGTCCATTCTCTGCCAGCTCAATC 1552
||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1476 AGCCAACACCTACTGCTCCAAGTCAGACGTGGATATGTTTTGCCGAGAAGTGTCCATCCTCTGCCAGCTCAATC 1549
Query 1553 ATCCCTGCGTAATTCAGTTTGTGGGTGCTTGCTTGAATGATCCCAGCCAGTTTGCCATTGTCACTCAATACATA 1626
|.||||||||..||||||||||||||||.|||.||.||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1550 ACCCCTGCGTGGTTCAGTTTGTGGGTGCCTGCCTGGATGACCCCAGCCAGTTTGCCATTGTCACACAATACATT 1623
Query 1627 TCAGGGGGTTCTCTGTTCTCCCTCCTTCATGAGCAGAAGAGGATTCTTGATTTGCAGTCTAAATTAATTATTGC 1700
|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1624 TCAGGAGGCTCTCTGTTCTCCCTGCTTCATGAACAGAAGAGAATTCTTGACTTGCAGTCTAAATTAATCATTGC 1697
Query 1701 AGTAGATGTTGCCAAAGGCATGGAGTACCTTCACAACCTGACACAGCCAATTATACATCGTGA-CTGAAACAGT 1773
||||||.||||||||.||||||||||||||.||||.|.||||.||||||||.|||||.||.|| ||| ||||||
Sbjct 1698 AGTAGACGTTGCCAAGGGCATGGAGTACCTGCACAGCTTGACCCAGCCAATCATACACCGCGACCTG-AACAGT 1770
Query 1774 CAC-ATATTTCTTTCTCTATGAGGATGGGCATGCTGTGTGGGCAGATTTTGAGA-AATCAAGATTTCTACAGTC 1845
||| ||||| .|||||||||||||.||.|||||||||..||||||||||| || |||||||||||||.|||||
Sbjct 1771 CACAATATT--CTTCTCTATGAGGACGGCCATGCTGTGGTGGCAGATTTTG-GAGAATCAAGATTTCTGCAGTC 1841
Query 1846 TCTGGATGAAGACAACATGACAAAACAACCTGGGAACCTCCGTTGGATGGCTCNTGAGGTGTTCACGCAGTGCA 1919
.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.|..|||||||||||.|||||||
Sbjct 1842 CCTGGATGAAGACAACATGACAAAGCAGCCAGGGAACCTGCGCTGGATGGCCCCCGAGGTGTTCACACAGTGCA 1915
Query 1920 CTCGGTACACCATCAAAGCAGATGTCTTCAGCTATGCTCTGTGTCTGTGGGAAATTCTCACTGGCGAAATTCCA 1993
|.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||..|.||||||||.|||||||||
Sbjct 1916 CGCGCTACACCATCAAGGCTGATGTCTTCAGTTACGCCCTGTGTCTGTGGGAGCTCCTCACTGGAGAAATTCCA 1989
Query 1994 TTCGCTCATCTCAAGCCAGCGGCTGCGGCAGCAGACATGGCTTACCACCACATCAGACCTCCCATTGGCTATTC 2067
|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1990 TTCGCTCATCTGAAGCCAGCCGCTGCAGCAGCAGATATGGCGTACCACCACATCAGACCTCCCATCGGCTACTC 2063
Query 2068 CATTCCCAAGCCCATATCATCTCTGCTGATACGAGGGTGGAACGCATGTCCTGAAGG-----------AAGAC- 2129
|||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||.| |||||
Sbjct 2064 CATCCCCAAGCCAATCTCATCTCTGCTGATGCGGGGCTGGAATGCATGTCCCGAATGCCTGTGTAATCAAGACT 2137
Query 2130 --CC--GAATTTTCTGAAGTTGTCATGAAGTTAGAAGAGTGTCTCT-GCAACATTGAGCTGATGTCTCCTGCAT 2198
|| |||| |||..|||.|| |..|||.||.||.| |.|| ||.|.||..||||
Sbjct 2138 GGCCTGGAAT---------TTGCGATGGAG--ACCAGACTGACTTTGGGAA----GACCCGAGTTCTC------ 2190
Query 2199 CAAGTAACAGCAGTGGGTCTCTCTCACCTTCTTCTTCTTCTGATTGCCTGGTGAACCGGGGAGGACCTGGCCGG 2272
Sbjct 2191 -------------------------------------------------------------------------- 2190
Query 2273 AGTCATGTGGCAGCATTAAGAAGTCGTTTCGAATTGGAATATGCTCTAAATGCAAGGTCCTATGCTGCTTTGTC 2346
Sbjct 2191 -------------------------------------------------------------------------- 2190
Query 2347 CCAAAGTGCTGGACAATATTCCTCTCAAGGTCTGTCTTTGGAGGAGATGAAAAGAAGTCTTCAATACACACCCA 2420
Sbjct 2191 -------------------------------------------------------------------------- 2190
Query 2421 TTGACAAATATGGCTATGTATCCGATCCCATGAGCTCAATGCATTTTCATTCTTGCCGAAATAGTAGCAGCTTT 2494
Sbjct 2191 -------------------------------------------------------------------------- 2190
Query 2495 GAGGACAGCAGC 2506
Sbjct 2191 ------------ 2190