Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15099
• Subject: NM_018638.5
• Aligned Length: 1356
• Identities: 1089
• Gaps: 267

Alignment

Query    1  ATGCTCTGCGGCCGCCCGCGGTCCAGCTCCGACAACAGGAATTTTCTCCGAGAGCGGGCCGGGCTCAGTTCAGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGCTGTCCAGACCCGGATCGGCAACAGTGCCGCCTCCAGACGTTCTCCTGCCGCTCGCCCGCCCGTCCCAGCGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCCCAGCCCTCCCGCGAGGGCGCCCCGGGACGGAAGGATCCACCAGTCTGTCGGCGCCCGCCGTTCTCGTGGTC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCCGTCGCCGTCGTCGTGGTGGTAGTCTCCGCCGTCGCCTGGGCCATGGCCAATTACATCCACGTCCCTCCCGG  296
                                                         |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------ATGGCCAATTACATCCACGTCCCTCCCGG  29

Query  297  CTCCCCGGAGGTGCCCAAGCTGAACGTCACCGTTCAGGATCAGGAGGAGCATCGCTGCCGGGAGGGGGCCCTGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   30  CTCCCCGGAGGTGCCCAAGCTGAACGTCACCGTTCAGGATCAGGAGGAGCATCGCTGCCGGGAGGGGGCCCTGA  103

Query  371  GCCTCCTGCAACACCTGCGGCCTCACTGGGACCCCCAGGAGGTGACCCTGCAGCTCTTCACAGATGGAATCACA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  104  GCCTCCTGCAACACCTGCGGCCTCACTGGGACCCCCAGGAGGTGACCCTGCAGCTCTTCACAGATGGAATCACA  177

Query  445  AATAAACTTATTGGCTGTTACGTGGGAAACACCATGGAGGATGTAGTCCTGGTGAGAATTTATGGCAATAAGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  178  AATAAACTTATTGGCTGTTACGTGGGAAACACCATGGAGGATGTAGTCCTGGTGAGAATTTATGGCAATAAGAC  251

Query  519  TGAGTTATTAGTCGATCGAGATGAGGAAGTAAAGAGTTTTCGAGTGTTGCAGGCTCATGGGTGTGCACCACAAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  252  TGAGTTATTAGTCGATCGAGATGAGGAAGTAAAGAGTTTTCGAGTGTTGCAGGCTCATGGGTGTGCACCACAAC  325

Query  593  TCTACTGTACCTTCAATAATGGACTATGCTATGAATTTATACAAGGAGAAGCACTGGATCCAAAGCATGTCTGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  326  TCTACTGTACCTTCAATAATGGACTATGCTATGAATTTATACAAGGAGAAGCACTGGATCCAAAGCATGTCTGC  399

Query  667  AACCCAGCCATTTTCAGGCTAATAGCTCGTCAGCTTGCTAAAATCCATGCTATTCATGCACACAATGGCTGGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  400  AACCCAGCCATTTTCAGGCTAATAGCTCGTCAGCTTGCTAAAATCCATGCTATTCATGCACACAATGGCTGGAT  473

Query  741  CCCCAAATCTAATCTTTGGCTAAAGATGGGAAAGTATTTCTCTCTCATTCCCACAGGATTTGCAGATGAAGACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  474  CCCCAAATCTAATCTTTGGCTAAAGATGGGAAAGTATTTCTCTCTCATTCCCACAGGATTTGCAGATGAAGACA  547

Query  815  TTAATAAAAGGTTCCTAAGTGATATCCCAAGCTCTCAGATTCTCCAGGAAGAGATGACTTGGATGAAGGAGATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  548  TTAATAAAAGGTTCCTAAGTGATATCCCAAGCTCTCAGATTCTCCAGGAAGAGATGACTTGGATGAAGGAGATT  621

Query  889  CTTTCCAACCTGGGCTCACCTGTTGTGCTTTGCCATAATGACCTATTGTGTAAGAATATAATCTACAATGAGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  622  CTTTCCAACCTGGGCTCACCTGTTGTGCTTTGCCATAATGACCTATTGTGTAAGAATATAATCTACAATGAGAA  695

Query  963  ACAAGGTGATGTACAGTTCATTGATTATGAATATTCTGGATACAACTACCTGGCATATGATATTGGAAATCATT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  696  ACAAGGTGATGTACAGTTCATTGATTATGAATATTCTGGATACAACTACCTGGCATATGATATTGGAAATCATT  769

Query 1037  TCAATGAATTTGCAGGTGTGAGTGATGTAGACTATAGTCTGTATCCAGATAGAGAACTACAGAGTCAGTGGCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  770  TCAATGAATTTGCAGGTGTGAGTGATGTAGACTATAGTCTGTATCCAGATAGAGAACTACAGAGTCAGTGGCTG  843

Query 1111  CGTGCTTACCTTGAAGCCTACAAAGAATTTAAGGGCTTTGGGACTGAAGTTACTGAAAAGGAGGTAGAAATACT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  844  CGTGCTTACCTTGAAGCCTACAAAGAATTTAAGGGCTTTGGGACTGAAGTTACTGAAAAGGAGGTAGAAATACT  917

Query 1185  CTTCATTCAAGTCAATCAGTTTGCATTGGCTTCTCATTTCTTTTGGGGATTGTGGGCTTTGATTCAAGCCAAAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  918  CTTCATTCAAGTCAATCAGTTTGCATTGGCTTCTCATTTCTTTTGGGGATTGTGGGCTTTGATTCAAGCCAAAT  991

Query 1259  ACTCCACTATTGAGTTTGATTTCCTTGGGTATGCAATTGTTCGTTTTAACCAGTACTTTAAAATGAAGCCTGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  992  ACTCCACTATTGAGTTTGATTTCCTTGGGTATGCAATTGTTCGTTTTAACCAGTACTTTAAAATGAAGCCTGAG  1065

Query 1333  GTTACTGCATTAAAAGTGCCTGAG  1356
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1066  GTTACTGCATTAAAAGTGCCTGAG  1089