Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15099
• Subject: NM_029250.2
• Aligned Length: 1356
• Identities: 959
• Gaps: 267

Alignment

Query    1  ATGCTCTGCGGCCGCCCGCGGTCCAGCTCCGACAACAGGAATTTTCTCCGAGAGCGGGCCGGGCTCAGTTCAGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGCTGTCCAGACCCGGATCGGCAACAGTGCCGCCTCCAGACGTTCTCCTGCCGCTCGCCCGCCCGTCCCAGCGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCCCAGCCCTCCCGCGAGGGCGCCCCGGGACGGAAGGATCCACCAGTCTGTCGGCGCCCGCCGTTCTCGTGGTC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCCGTCGCCGTCGTCGTGGTGGTAGTCTCCGCCGTCGCCTGGGCCATGGCCAATTACATCCACGTCCCTCCCGG  296
                                                         |||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------ATGGCCAATTACATCCACGTCCCGCCCGG  29

Query  297  CTCCCCGGAGGTGCCCAAGCTGAACGTCACCGTTCAGGATCAGGAGGAGCATCGCTGCCGGGAGGGGGCCCTGA  370
            |||.||.||||||||.|||||..||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||
Sbjct   30  CTCGCCCGAGGTGCCGAAGCTCGACGTGACGGTGCAGGACCAGGAGGAGCAGCGCTGCCGCGACGGCGCCCTGA  103

Query  371  GCCTCCTGCAACACCTGCGGCCTCACTGGGACCCCCAGGAGGTGACCCTGCAGCTCTTCACAGATGGAATCACA  444
            ||||.||||..|||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  104  GCCTGCTGCGGCACCTGCGGCCGCACTGGGACCCCCGGGAGGTGACCCTGCAGCTGTTCACAGATGGGATCACA  177

Query  445  AATAAACTTATTGGCTGTTACGTGGGAAACACCATGGAGGATGTAGTCCTGGTGAGAATTTATGGCAATAAGAC  518
            ||.||.||.||.|.|||.||.|||||..||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  178  AACAAGCTCATCGCCTGCTATGTGGGTGACACCATGGAAGATGTAGTTCTGGTGAGGATTTACGGCAACAAGAC  251

Query  519  TGAGTTATTAGTCGATCGAGATGAGGAAGTAAAGAGTTTTCGAGTGTTGCAGGCTCATGGGTGTGCACCACAAC  592
            |||..|.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||.||||||||||.||.||||||||.||.|
Sbjct  252  TGAACTGTTAGTCGACCGAGACGAGGAAGTGAAAAGTTTCCGCGTGCTGCAGGCTCACGGCTGTGCACCTCAGC  325

Query  593  TCTACTGTACCTTCAATAATGGACTATGCTATGAATTTATACAAGGAGAAGCACTGGATCCAAAGCATGTCTGC  666
            |||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||..||||.||..|||||||||||
Sbjct  326  TCTACTGCACCTTTAATAACGGACTGTGCTATGAGTTTATCCAGGGCGAAGCTTTGGACCCGCAGCATGTCTGC  399

Query  667  AACCCAGCCATTTTCAGGCTAATAGCTCGTCAGCTTGCTAAAATCCATGCTATTCATGCACACAATGGCTGGAT  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  400  AACCCAGCCATTTTCAGGCTAATAGCTCGTCAGCTTGCTAAAATCCATGCTATTCATGCGCACAATGGCTGGAT  473

Query  741  CCCCAAATCTAATCTTTGGCTAAAGATGGGAAAGTATTTCTCTCTCATTCCCACAGGATTTGCAGATGAAGACA  814
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.|||
Sbjct  474  CCCCAAATCTAACCTATGGCTAAAGATGGGAAAATATTTCTCTCTCATTCCCACCGGATTTGCTGATGAAAACA  547

Query  815  TTAATAAAAGGTTCCTAAGTGATATCCCAAGCTCTCAGATTCTCCAGGAAGAGATGACTTGGATGAAGGAGATT  888
            ||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||.|||.|.
Sbjct  548  TTAATAAAAGGTTCCTGAGTGAGATCCCAAGCCCGCAGCTTCTGCAGGAGGAGATGACTTGGATGAAAGAGCTG  621

Query  889  CTTTCCAACCTGGGCTCACCTGTTGTGCTTTGCCATAATGACCTATTGTGTAAGAATATAATCTACAATGAGAA  962
            |||||.|.|||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  622  CTTTCAAGCCTGGGCTCACCTGTGGTCCTTTGCCATAACGACCTGTTGTGTAAGAATATAATCTACAACGAGAA  695

Query  963  ACAAGGTGATGTACAGTTCATTGATTATGAATATTCTGGATACAACTACCTGGCATATGATATTGGAAATCATT  1036
            |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  696  ACAAGGTGACGTACAGTTCATTGATTATGAGTATTCTGGATACAACTACCTGGCATATGATATTGGAAATCATT  769

Query 1037  TCAATGAATTTGCAGGTGTGAGTGATGTAGACTATAGTCTGTATCCAGATAGAGAACTACAGAGTCAGTGGCTG  1110
            |||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||.||||.||.|||.|.|||||||||
Sbjct  770  TCAATGAATTTGCAGGTGTCAGCGATGTAGACTATAGTCTCTATCCAGATCGAGAGCTCCAGGGCCAGTGGCTG  843

Query 1111  CGTGCTTACCTTGAAGCCTACAAAGAATTTAAGGGCTTTGGGACTGAAGTTACTGAAAAGGAGGTAGAAATACT  1184
            ||..|||||||||||||.|||||.||.|.||||||||||||.|.|||.||.|||||.|||||.||.||.|..||
Sbjct  844  CGCTCTTACCTTGAAGCTTACAAGGAGTATAAGGGCTTTGGCAGTGATGTCACTGAGAAGGAAGTCGAGACTCT  917

Query 1185  CTTCATTCAAGTCAATCAGTTTGCATTGGCTTCTCATTTCTTTTGGGGATTGTGGGCTTTGATTCAAGCCAAAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  918  CTTCATTCAAGTCAATCAGTTTGCGTTGGCTTCTCATTTCTTTTGGGGACTCTGGGCTTTGATACAAGCTAAGT  991

Query 1259  ACTCCACTATTGAGTTTGATTTCCTTGGGTATGCAATTGTTCGTTTTAACCAGTACTTTAAAATGAAGCCTGAG  1332
            |||||||.||.|||||.||.||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  992  ACTCCACGATCGAGTTCGACTTCCTTGGGTATGCGGTTGTCCGTTTTAACCAGTACTTTAAAATGAAGCCTGAG  1065

Query 1333  GTTACTGCATTAAAAGTGCCTGAG  1356
            ||.||.|||.|||||.||||.|||
Sbjct 1066  GTCACAGCACTAAAAATGCCCGAG  1089