Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15099
• Subject: XM_017019580.1
• Aligned Length: 1365
• Identities: 1255
• Gaps: 99

Alignment

Query    1  ATGCTCTGCGGCCGCCCGCGGTCCAGCTCCGACAACAGGAATTTTCTCCGAGAGCGGGCCGGGCTCAGTTCAGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTCTGCGGCCGCCCGCGGTCCAGCTCCGACAACAGGAATTTTCTCCGAGAGCGGGCCGGGCTCAGTTCAGC  74

Query   75  TGCTGTCCAGACCCGGATCGGCAACAGTGCCGCCTCCAGACGTTCTCCTGCCGCTCGCCCGCCCGTCCCAGCGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCTGTCCAGACCCGGATCGGCAACAGTGCCGCCTCCAGACGTTCTCCTGCCGCTCGCCCGCCCGTCCCAGCGC  148

Query  149  CCCCAGCCCTCCCGCGAGGGCGCCCCGGGACGGAAGGATCCACCAGTCTGTCGGCGCCCGCCGTTCTCGTGGTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCCAGCCCTCCCGCGAGGGCGCCCCGGGACGGAAGGATCCACCAGTCTGTCGGCGCCCGCCGTTCTCGTGGTC  222

Query  223  GCCGTCGCCGTCGTCGTGGTGGTAGTCTCCGCCGTCGCCTGGGCCATGGCCAATTACATCCACGTCCCTCCCGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCGTCGCCGTCGTCGTGGTGGTAGTCTCCGCCGTCGCCTGGGCCATGGCCAATTACATCCACGTCCCTCCCGG  296

Query  297  CTCCCCGGAGGTGCCCAAGCTGAACGTCACCGTTCAGGATCAGGAGGAGCATCGCTGCCGGGAGGGGGCCCTGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCCCCGGAGGTGCCCAAGCTGAACGTCACCGTTCAGGATCAGGAGGAGCATCGCTGCCGGGAGGGGGCCCTGA  370

Query  371  GCCTCCTGCAACACCTGCGGCCTCACTGGGACCCCCAGGAGGTGACCCTGCAGCTCTTCACAGATGGAATCACA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCTCCTGCAACACCTGCGGCCTCACTGGGACCCCCAGGAGGTGACCCTGCAGCTCTTCACAGATGGAATCACA  444

Query  445  AATAAACTTATTGGCTGTTACGTGGGAAACACCATGGAGGATGTAGTCCTGGTGAGAATTTATGGCAATAAGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATAAACTTATTGGCTGTTACGTGGGAAACACCATGGAGGATGTAGTCCTGGTGAGAATTTATGGCAATAAGAC  518

Query  519  TGAGTTATTAGTCGATCGAGATGAGGAAGTAAAGAGTTTTCGAGTGTTGCAGGCTCATGGGTGTGCACCACAAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAGTTATTAGTCGATCGAGATGAGGAAGTAAAGAGTTTTCGAGTGTTGCAGGCTCATGGGTGTGCACCACAAC  592

Query  593  TCTACTGTACCTTCAATAATGGACTATGCTATGAATTTATACAAGGAGAAGCACTGGATCCAAAGCATGTCTGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTACTGTACCTTCAATAATGGACTATGCTATGAATTTATACAAGGAGAAGCACTGGATCCAAAGCATGTCTGC  666

Query  667  AACCCAGCCATTTTCAGGCTAATAGCTCGTCAGCTTGCTAAAATCCATGCTATTCATGCACACAATGGCTGGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACCCAGCCATTTTCAGGCTAATAGCTCGTCAGCTTGCTAAAATCCATGCTATTCATGCACACAATGGCTGGAT  740

Query  741  CCCCAAATCTAATCTTTGGCTAAAGATGGGAAAGTATTTCTCTCTCATTCCCACAGGATTTGCAGATGAAGACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCCAAATCTAATCTTTGGCTAAAGATGGGAAAGTATTTCTCTCTCATTCCCACAGGATTTGCAGATGAAGACA  814

Query  815  TTAATAAAAGGTTCCTAAGTGATATCCCAAGCTCTCAGATTCTCCAGGAAGAGATGACTTGGATGAAGGAGATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTAATAAAAGGTTCCTAAGTGATATCCCAAGCTCTCAGATTCTCCAGGAAGAGATGACTTGGATGAAGGAGATT  888

Query  889  CTTTCCAACCTGGGCTCACCTGTTGTGCTTTGCCATAATGACCTATTGTGTAAGAATATAATCTACAATGAGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTTCCAACCTGGGCTCACCTGTTGTGCTTTGCCATAATGACCTATTGTGTAAGAATATAATCTACAATGAGAA  962

Query  963  ACAAGGTGATGTACAGTTCATTGATTATGAATATTCTGGATACAACTACCTGGCATATGATATTGGAAATCATT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACAAGGTGATGTACAGTTCATTGATTATGAATATTCTGGATACAACTACCTGGCATATGATATTGGAAATCATT  1036

Query 1037  TCAATGAATTTGCAGGTGTGAGTGATGTAGACTATAGTCTGTATCCAGATAGAGAACTACAGAGTCAGTGGCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCAATGAATTTGCAGGTGTGAGTGATGTAGACTATAGTCTGTATCCAGATAGAGAACTACAGAGTCAGTGGCTG  1110

Query 1111  CGTGCTTACCTTGAAGCCTACAAAGAATTTAAGGGCTTTGGGACTGAAGTTACTGAAAAGGAGGTAGAAATACT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGTGCTTACCTTGAAGCCTACAAAGAATTTAAGGGCTTTGGGACTGAAGTTACTGAAAAGGAGGTAGAAATACT  1184

Query 1185  CTTCATTCAAGTCAATCAGTTTGCATTGGCTTCTCATTTCTTTTGGGGATTGTGGGCTTTGATTCAAGCCAAAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||                                            |.
Sbjct 1185  CTTCATTCAAGTCAATCAGTTTGCATTG--------------------------------------------AC  1214

Query 1259  ACTCCACTATTGAGTTTGATTTCCTTGGGTATGCAAT-TGTTCGTTTTAAC-CAGTACTTTAAAATGAA-----  1325
            ||                             |||||| ||  |.||||..| ||.|.||.|||||.|||     
Sbjct 1215  AC-----------------------------TGCAATCTG--CCTTTTCCCTCACTGCTGTAAAAAGAAAATCA  1257

Query 1326  -GCCTGAGG-TTACTGCATTAAAAGTGCCTGAG  1356
             |  |.||| ||||  ||.|.|           
Sbjct 1258  GG--TAAGGCTTAC--CAATCA-----------  1275