Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15099
• Subject: XM_017019581.1
• Aligned Length: 1371
• Identities: 990
• Gaps: 375

Alignment

Query    1  ATGCTCTGCGGCCGCCCGCGGTCCAGCTCCGACAACAGGAATTTTCTCCGAGAGCGGGCCGGGCTCAGTTCAGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTCTGCGGCCGCCCGCGGTCCAGCTCCGACAACAGGAATTTTCTCCGAGAGCGGGCCGGGCTCAGTTCAGC  74

Query   75  TGCTGTCCAGACCCGGATCGGCAACAGTGCCGCCTCCAGACGTTCTCCTGCCGCTCGCCCGCCCGTCCCAGCGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCTGTCCAGACCCGGATCGGCAACAGTGCCGCCTCCAGACGTTCTCCTGCCGCTCGCCCGCCCGTCCCAGCGC  148

Query  149  CCCCAGCCCTCCCGCGAGGGCGCCCCGGGACGGAAGGATCCACCAGTCTGTCGGCGCCCGCCGTTCTCGTGGTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCCAGCCCTCCCGCGAGGGCGCCCCGGGACGGAAGGATCCACCAGTCTGTCGGCGCCCGCCGTTCTCGTGGTC  222

Query  223  GCCGTCGCCGTCGTCGTGGTGGTAGTCTCCGCCGTCGCCTGGGCCATGGCCAATTACATCCACGTCCCTCCCGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCGTCGCCGTCGTCGTGGTGGTAGTCTCCGCCGTCGCCTGGGCCATGGCCAATTACATCCACGTCCCTCCCGG  296

Query  297  CTCCCCGGAGGTGCCCAAGCTGAACGTCACCGTTCAGGATCAGGAGGAGCATCGCTGCCGGGAGGGGGCCCTGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCCCCGGAGGTGCCCAAGCTGAACGTCACCGTTCAGGATCAGGAGGAGCATCGCTGCCGGGAGGGGGCCCTGA  370

Query  371  GCCTCCTGCAACACCTGCGGCCTCACTGGGACCCCCAGGAGGTGACCCTGCAGCTCTTCACAGATGGAATCACA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCTCCTGCAACACCTGCGGCCTCACTGGGACCCCCAGGAGGTGACCCTGCAGCTCTTCACAGATGGAATCACA  444

Query  445  AATAAACTTATTGGCTGTTACGTGGGAAACACCATGGAGGATGTAGTCCTGGTGAGAATTTATGGCAATAAGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATAAACTTATTGGCTGTTACGTGGGAAACACCATGGAGGATGTAGTCCTGGTGAGAATTTATGGCAATAAGAC  518

Query  519  TGAGTTATTAGTCGATCGAGATGAGGAAGTAAAGAGTTTTCGAGTGTTGCAGGCTCATGGGTGTGCACCACAAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAGTTATTAGTCGATCGAGATGAGGAAGTAAAGAGTTTTCGAGTGTTGCAGGCTCATGGGTGTGCACCACAAC  592

Query  593  TCTACTGTACCTTCAATAATGGACTATGCTATGAATTTATACAAGGAGAAGCACTGGATCCAAAGCATGTCTGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTACTGTACCTTCAATAATGGACTATGCTATGAATTTATACAAGGAGAAGCACTGGATCCAAAGCATGTCTGC  666

Query  667  AACCCAGCCATTTTCAGGCTAATAGCTCGTCAGCTTGCTAAAATCCATGCTATTCATGCACACAATGGCTGGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACCCAGCCATTTTCAGGCTAATAGCTCGTCAGCTTGCTAAAATCCATGCTATTCATGCACACAATGGCTGGAT  740

Query  741  CCCCAAATCTAATCTTTGGCTAAAGATGGGAAAGTATTTCTCTCTCATTCCCACAGGATTTGCAGATGAAGACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCCAAATCTAATCTTTGGCTAAAGATGGGAAAGTATTTCTCTCTCATTCCCACAGGATTTGCAGATGAAGACA  814

Query  815  TTAATAAAAGGTTCCTAAGTGATATCCCAAGCTCTCAGATTCTCCAGGAAGAGATGACTTGGATGAAGGAGATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTAATAAAAGGTTCCTAAGTGATATCCCAAGCTCTCAGATTCTCCAGGAAGAGATGACTTGGATGAAGGAGATT  888

Query  889  CTTTCCAACCTGGGCTCACCTGTTGTGCTTTGCCATAATGACCTATTGTGTAAGAATATAATCTACAATGAGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTTCCAACCTGGGCTCACCTGTTGTGCTTTGCCATAATGACCTATTGTGTAAGAATATAATCTACAATGAGAA  962

Query  963  AC--------------AAGGTGATGTACAGTTCATTGATT-ATGAATATTCTGGATACAACTACCTGGCATATG  1021
            ||              |||.||||.|||||    .||.|| |.|||        ||||||.             
Sbjct  963  ACAAGCACAATACAAGAAGCTGATTTACAG----CTGTTTAAGGAA--------ATACAAA-------------  1011

Query 1022  ATATTGGAAATCATTTCAATGAATTTGCAGGTGTGAGTGATGTAGACTATAGTCTGTATCCAGATAGAGAACTA  1095
                                                                                      
Sbjct 1012  --------------------------------------------------------------------------  1011

Query 1096  CAGAGTCAGTGGCTGCGTGCTTACCTTGAAGCCTACAAAGAATTTAAGGGCTTTGGGACTGAAGTTACTGAAAA  1169
                                                                                      
Sbjct 1012  --------------------------------------------------------------------------  1011

Query 1170  GGAGGTAGAAATACTCTTCATTCAAGTCAATCAGTTTGCATTGGCTTCTCATTTCTTTTGGGGATTGTGGGCTT  1243
                                                                                      
Sbjct 1012  --------------------------------------------------------------------------  1011

Query 1244  TGATTCAAGCCAAATACTCCACTATTGAGTTTGATTTCCTTGGGTATGCAATTGTTCGTTTTAACCAGTACTTT  1317
                                                                                      
Sbjct 1012  --------------------------------------------------------------------------  1011

Query 1318  AAAATGAAGCCTGAGGTTACTGCATTAAAAGTGCCTGAG  1356
                                                   
Sbjct 1012  ---------------------------------------  1011