Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15109
• Subject: NM_018343.3
• Aligned Length: 1659
• Identities: 1646
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGGGGAAAGTGAATGTGGCCAAGTTGCGTTACATGAGCCGAGATGACTTCAGGGTCTTGACCGCGGTTGAAAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGAAAGTGAATGTGGCCAAGTTGCGTTACATGAGCCGAGATGACTTCAGGGTCTTGACCGCGGTTGAAAT  74

Query   75  GGGCATGAAGAACCATGAAATTGTTCCCGGCAGTTTGATTGCTTCTATAGCCAGCCTTAAACATGGTGGCTGTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGCATGAAGAACCATGAAATTGTTCCCGGCAGTTTGATTGCTTCTATAGCCAGCCTTAAACATGGTGGCTGTA  148

Query  149  ATAAAGTTTTAAGAGAATTAGTGAAACATAAACTCATAGCTTGGGAGCGTACCAAAACTGTCCAGGGCTATCGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATAAAGTTTTAAGAGAATTAGTGAAACATAAACTCATAGCTTGGGAGCGTACCAAAACTGTCCAGGGCTATCGG  222

Query  223  TTGACAAATGCAGGATATGATTACCTAGCTTTGAAAACACTTTCTTCTAGGCAAGTAGTTGAGTCTGTTGGAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTGACAAATGCAGGATATGATTACCTAGCTTTGAAAACACTTTCTTCTAGGCAAGTAGTTGAGTCTGTTGGAAA  296

Query  297  CCAGATGGGTGTTGGCAAAGAATCAGATATTTACATTGTTGCAAATGAAGAAGGACAACAATTTGCATTAAAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGATGGGTGTTGGCAAAGAATCAGATATTTACATTGTTGCAAATGAAGAAGGACAACAATTTGCATTAAAGC  370

Query  371  TTCACAGACTAGGAAGAACCTCGTTTCGAAATTTGAAAAACAAACGCGATTATCATAAATATAGGCACAATGTG  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  371  TTCACAGACTAGGAAGAACCTCGTTTCGAAATTTGAAAAACAAACGCGATTATCATAAACATAGGCACAATGTG  444

Query  445  TCATGGCTATATTTATCTCGTCTCTCTGCCATGAAGGAATTTGCCTATATGAAGGCATTGTATGAGAGGAAATT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCATGGCTATATTTATCTCGTCTCTCTGCCATGAAGGAATTTGCCTATATGAAGGCATTGTATGAGAGGAAATT  518

Query  519  TCCAGTTCCAAAGCCAATTGATTACAATCGTCATGCAGTGGTCATGGAACTCATAAATGGTTATCCACTATGTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCAGTTCCAAAGCCAATTGATTACAATCGTCATGCAGTGGTCATGGAACTCATAAATGGTTATCCACTATGTC  592

Query  593  AGATACACCATGTTGAAGATCCTGCATCAGTATATGATGAAGCTATGGAACTAATTGTCAAACTTGCAAATCAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGATACACCATGTTGAAGATCCTGCATCAGTATATGATGAAGCTATGGAACTAATTGTCAAACTTGCAAATCAT  666

Query  667  GGGCTGATTCATGGAGATTTTAATGAATTTAATCTCATTTTGGATGAAAGTGACCATATCACCATGATTGATTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGGCTGATTCATGGAGATTTTAATGAATTTAATCTCATTTTGGATGAAAGTGACCATATCACCATGATTGATTT  740

Query  741  TCCACAGATGGTTTCAACTTCTCATCCCAATGCTGAGTGGTATTTTGAACAGGAG-----AAATGCATTAAAGA  809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     ||||||||||||||
Sbjct  741  TCCACAGATGGTTTCAACTTCTCATCCCAATGCTGAGTGGTATTTTG-ACA-GAGATGTTAAATGCATTAAAGA  812

Query  810  TTTCTTTATGAAACGTTTCAGCTACGAAAGTGAGCTTTTTCCAACTTTTAAGGATATCAGAAGAGAAGACACTC  883
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  813  TTTCTTTATGAAACGTTTCAGCTACGAAAGTGAGCTTTTTCCAACTTTTAAGGATATCAGGAGAGAAGACACTC  886

Query  884  TTGATGTGGA-GTTTCTGCCAGTGGCTACACAAAGGAAATGCAGGCAGATGATGAACTGCTTCATCCCATTAGG  956
            |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  887  TTGATGTGGAGGTTTCTGCCAGTGGCTACACAAAGGAAATGCAGGCAGATGATGAACTGCTTCAT-CCATTAGG  959

Query  957  TCCAGATGATAAAAATATTGAACAAAAAGAGGGATCTGAATTCTCATTTTCAGATGGAGAAGTGGCAGAAAAAG  1030
            ||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  TCCAGATGATAAAAATATTGAAACAAAAGAGGGATCTGAATTCTCATTTTCAGATGGAGAAGTGGCAGAAAAAG  1033

Query 1031  CAGAGGTTTACGGGTCAGAAAATGAAAGTGAACGGAACTGTCTAGAAGAATCAGAGGGCTGCTATTGCAGATCA  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  CAGAGGTTTACGGGTCAGAAAATGAAAGTGAACGGAACTGTCTAGAAGAATCAGAGGGCTGCTATTGCAGATCA  1107

Query 1105  TCTGGAGACCCTGAACAAATAAAGGAAGACAGTTTATCAGAAGAGAGTGCTGATGCACGGAGTTTTGAAATGAC  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  TCTGGAGACCCTGAACAAATAAAGGAAGACAGTTTATCAGAAGAGAGTGCTGATGCACGGAGTTTTGAAATGAC  1181

Query 1179  TGAATTCAATCAAGCTTTAGAAGAAATAAAAGGGCAGGTTGTTGAAAACAACTCTGTAACTGAATTTTCTGAGG  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  TGAATTCAATCAAGCTTTAGAAGAAATAAAAGGGCAGGTTGTTGAAAACAACTCTGTAACTGAATTTTCTGAGG  1255

Query 1253  AGAAAAACAGAACTGAAAATTACAACAGGCAAGATGGTCAGAGAGTTCAAGGAGGAGTCCCTGCTGGCTCTGAC  1326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  AGAAAAACAGAACTGAAAATTACAACAGGCAAGATGGTCAGAGAGTTCAAGGAGGAGTCCCTGCTGGCTCTGAC  1329

Query 1327  GAGTATGAAGATGAATGCCCTCATCTAATTGCCTTGTCGTCATTAAATAGAGAATTCAGGCCTTTCAGAGATGA  1400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  GAGTATGAAGATGAATGCCCTCATCTAATTGCCTTGTCGTCATTAAATAGAGAATTCAGGCCTTTCAGAGATGA  1403

Query 1401  AGAAAATGTGGGAGCTATGAATCAGTATAGAACAAGAACTCTGAGTATCACTTCTTCAGGCAGTGCTGTAAGCT  1474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  AGAAAATGTGGGAGCTATGAATCAGTATAGAACAAGAACTCTGAGTATCACTTCTTCAGGCAGTGCTGTAAGCT  1477

Query 1475  GTTCAACAATTCCTCCAGAACTGGTGAAACAGAAGGTGAAACGTCAGTTGACAAAACAGCAAAAATCAGCTGTC  1548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  GTTCAACAATTCCTCCAGAACTGGTGAAACAGAAGGTGAAACGTCAGTTGACAAAACAGCAAAAATCAGCTGTC  1551

Query 1549  AGACGTCGATTGCAGAAAGGAGAAGCAAATATATTTACCAAGCAACGTAGGGAAAACATGCAAAATATCAAATC  1622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552  AGACGTCGATTGCAGAAAGGAGAAGCAAATATATTTACCAAGCAACGTAGGGAAAACATGCAAAATATCAAATC  1625

Query 1623  AAGTTTGGAAGCAGCCAGCTTTTGGGGAGAA  1653
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  AAGTTTGGAAGCAGCCAGCTTTTGGGGAGAA  1656