Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15118
• Subject: XM_011519591.3
• Aligned Length: 1158
• Identities: 1096
• Gaps: 45

Alignment

Query    1  ATGGCCCGGGAGAACGGCGAGAGCAGC-TCCTCC-TGGAAAAAGCAAGCTGAAGACATCAAGAAGAT-CTTCGA  71
                         |.||.||.|.||.| |.|||| ||                        ||||.| ||||..
Sbjct    1  -------------ATGGAGACACCACCATACTCCATG------------------------GAAGGTCCTTCCT  37

Query   72  GTTCAAAGAGACCCTCGGAACCGGGGCCTTTTCCGAAGTGGTTTTAGCTGAAGAGAAGGCAACTGGCAAGCTCT  145
            ||.|.|...|.||     ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   38  GTCCGATCTGTCC-----AAGCGGGGCCTTTTCCGAAGTGGTTTTAGCTGAAGAGAAGGCAACTGGCAAGCTCT  106

Query  146  TTGCTGTGAAGTGTATCCCTAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAAAGCAGCATAGAGAATGAGATAGCCGTCCTG  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  107  TTGCTGTGAAGTGTATCCCTAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAAAGCAGCATAGAGAATGAGATAGCCGTCCTG  180

Query  220  AGAAAGATTAAGCATGAAAATATTGTTGCCCTGGAAGACATTTATGAAAGCCCAAATCACCTGTACTTGGTCAT  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  AGAAAGATTAAGCATGAAAATATTGTTGCCCTGGAAGACATTTATGAAAGCCCAAATCACCTGTACTTGGTCAT  254

Query  294  GCAGCTGGTGTCCGGTGGAGAGCTGTTTGACCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTATACAGAGAAGGATGCCAGCA  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  255  GCAGCTGGTGTCCGGTGGAGAGCTGTTTGACCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTATACAGAGAAGGATGCCAGCA  328

Query  368  CTCTGATCCGCCAAGTCTTGGACGCCGTGTACTATCTCCACAGAATGGGCATCGTCCACAGAGACCTCAAGCCC  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  329  CTCTGATCCGCCAAGTCTTGGACGCCGTGTACTATCTCCACAGAATGGGCATCGTCCACAGAGACCTCAAGCCC  402

Query  442  GAAAATCTCTTGTACTACAGTCAAGATGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGATTGTCAAAAATGGA  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  403  GAAAATCTCTTGTACTACAGTCAAGATGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGATTGTCAAAAATGGA  476

Query  516  GGGCAAAGGAGATGTGATGTCCACTGCCTGTGGAACTCCAGGCTATGTCGCTCCTGAAGTCCTCGCCCAGAAAC  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  477  GGGCAAAGGAGATGTGATGTCCACTGCCTGTGGAACTCCAGGCTATGTCGCTCCTGAAGTCCTCGCCCAGAAAC  550

Query  590  CTTACAGCAAAGCCGTTGACTGCTGGTCCATCGGAGTGATTGCCTACATCTTGCTCTGCGGCTACCCTCCTTTT  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  551  CTTACAGCAAAGCCGTTGACTGCTGGTCCATCGGAGTGATTGCCTACATCTTGCTCTGCGGCTACCCTCCTTTT  624

Query  664  TATGATGAAAATGACTCCAAGCTCTTTGAGCAGATCCTCAAGGCGGAATATGAGTTTGACTCTCCCTACTGGGA  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  625  TATGATGAAAATGACTCCAAGCTCTTTGAGCAGATCCTCAAGGCGGAATATGAGTTTGACTCTCCCTACTGGGA  698

Query  738  TGACATCTCCGACTCTGCAAAAGACTTCATTCGGAACCTGATGGAGAAGGACCCGAATAAAAGATACACGTGTG  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  699  TGACATCTCCGACTCTGCAAAAGACTTCATTCGGAACCTGATGGAGAAGGACCCGAATAAAAGATACACGTGTG  772

Query  812  AGCAGGCAGCTCGGCACCCATGGATCGCTGGTGACACAGCCCTCAACAAAAACATCCACGAGTCCGTCAGCGCC  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  773  AGCAGGCAGCTCGGCACCCATGGATCGCTGGTGACACAGCCCTCAACAAAAACATCCACGAGTCCGTCAGCGCC  846

Query  886  CAGATCCGGAAAAACTTTGCCAAGAGCAAATGGAGACAAGCATTTAATGCCACGGCCGTCGTGAGACATATGAG  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  847  CAGATCCGGAAAAACTTTGCCAAGAGCAAATGGAGACAAGCATTTAATGCCACGGCCGTCGTCAGACATATGAG  920

Query  960  AAAACTACACCTCGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTTTCGAGCAGCCTCAGTTTGGCCAGCCAAA  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  921  AAAACTACACCTCGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTTTCGAGCAGCCTCAGTTTGGCCAGCCAAA  994

Query 1034  AAGACTGTCTGGCACCTTCCACGCTCTGTAGTTTCATTTCTTCTTCGTCGGGGGTCTCAGGAGTTGGAGCCGAG  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  995  AAGACTGTCTGGCACCTTCCACGCTCTGTAGTTTCATTTCTTCTTCGTCGGGGGTCTCAGGAGTTGGAGCCGAG  1068

Query 1108  CGGAGACCCAGGCCCACCACTGTGACGGCAGTGCACTCTGGAAGCAAG  1155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1069  CGGAGACCCAGGCCCACCACTGTGACGGCAGTGCACTCTGGAAGCAAG  1116