Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15120
• Subject: XM_017027961.1
• Aligned Length: 2157
• Identities: 2154
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTTTGGGAAGAAAAAGAAAAAGATTGAAATATCTGGCCCGTCCAACTTTGAACACAGGGTTCATACTGGGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTTGGGAAGAAAAAGAAAAAGATTGAAATATCTGGCCCGTCCAACTTTGAACACAGGGTTCATACTGGGTT  74

Query   75  TGATGCACAAGAGCAGAAGTTTACCGGCCTTCCCCAGCAGTGGCACAGCCTGTTAGCAGATACGGCCAACAGGC  148
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGATCCACAAGAGCAGAAGTTTACCGGCCTTCCCCAGCAGTGGCACAGCCTGTTAGCAGATACGGCCAACAGGC  148

Query  149  CAAAGCCTATGGTGGACCCTTCATGCATCACACCCATCCAGCTGGCTCCTATGAAGACAATCGTTAGAGGAAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAAAGCCTATGGTGGACCCTTCATGCATCACACCCATCCAGCTGGCTCCTATGAAGACAATCGTTAGAGGAAAC  222

Query  223  AAACCCTGCAAGGAAACCTCCATCAACGGCCTGCTAGAGGATTTTGACAACATCTCGGTGACTCGCTCCAACTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAACCCTGCAAGGAAACCTCCATCAACGGCCTGCTAGAGGATTTTGACAACATCTCGGTGACTCGCTCCAACTC  296

Query  297  CCTAAGGAAAGAAAGCCCACCCACCCCAGATCAGGGAGCCTCCAGCCACGGTCCAGGCCACGCGGAAGAAAATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTAAGGAAAGAAAGCCCACCCACCCCAGATCAGGGAGCCTCCAGCCACGGTCCAGGCCACGCGGAAGAAAATG  370

Query  371  GCTTCATCACCTTCTCCCAGTATTCCAGCGAATCCGATACTACTGCTGACTACACGACCGAAAAGTACAGGGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCTTCATCACCTTCTCCCAGTATTCCAGCGAATCCGATACTACTGCTGACTACACGACCGAAAAGTACAGGGAG  444

Query  445  AAGAGTCTCTATGGAGATGATCTGGATCCGTATTATAGAGGCAGCCACGCAGCCAAGCAAAATGGGCACGTAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGAGTCTCTATGGAGATGATCTGGATCCGTATTATAGAGGCAGCCACGCAGCCAAGCAAAATGGGCACGTAAT  518

Query  519  GAAAATGAAGCACGGGGAGGCCTACTATTCTGAGGTGAAGCCTTTGAAATCCGATTTTGCCAGATTTTCTGCCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAAATGAAGCACGGGGAGGCCTACTATTCTGAGGTGAAGCCTTTGAAATCCGATTTTGCCAGATTTTCTGCCG  592

Query  593  ATTATCACTCACATTTGGACTCACTGAGCAAACCAAGTGAATACAGTGACCTCAAGTGGGAGTATCAGAGAGCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATTATCACTCACATTTGGACTCACTGAGCAAACCAAGTGAATACAGTGACCTCAAGTGGGAGTATCAGAGAGCC  666

Query  667  TCGAGTAGCTCCCCTCTGGATTATTCATTCCAATTCACACCTTCTAGAACTGCAGGGACCAGCGGGTGCTCCAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCGAGTAGCTCCCCTCTGGATTATTCATTCCAATTCACACCTTCTAGAACTGCAGGGACCAGCGGGTGCTCCAA  740

Query  741  GGAGAGCCTGGCGTACAGTGAAAGTGAATGGGGACCCAGCCTGGATGACTATGACAGGAGGCCAAAGTCTTCGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGAGCCTGGCGTACAGTGAAAGTGAATGGGGACCCAGCCTGGATGACTATGACAGGAGGCCAAAGTCTTCGT  814

Query  815  ACCTGAATCAGACAAGCCCTCAGCCCACCATGCGGCAGAGGTCCAGGTCAGGCTCGGGACTCCAGGAACCGATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCTGAATCAGACAAGCCCTCAGCCCACCATGCGGCAGAGGTCCAGGTCAGGCTCGGGACTCCAGGAACCGATG  888

Query  889  ATGCCATTTGGAGCAAGTGCATTTAAAACCCATCCCCAAGGACACTCCTACAACTCCTACACCTACCCTCGCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGCCATTTGGAGCAAGTGCATTTAAAACCCATCCCCAAGGACACTCCTACAACTCCTACACCTACCCTCGCTT  962

Query  963  GTCCGAGCCCACAATGTGCATTCCAAAGGTGGATTACGATCGAGCACAGATGGTCCTCAGCCCTCCACTGTCAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTCCGAGCCCACAATGTGCATTCCAAAGGTGGATTACGATCGAGCACAGATGGTCCTCAGCCCTCCACTGTCAG  1036

Query 1037  GGTCTGACACCTACCCCAGGGGCCCTGCCAAACTACCTCAAAGTCAAAGCAAATCGGGCTATTCCTCAAGCAGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGTCTGACACCTACCCCAGGGGCCCTGCCAAACTACCTCAAAGTCAAAGCAAATCGGGCTATTCCTCAAGCAGT  1110

Query 1111  CACCAGTACCCGTCTGGGTACCACAAAGCCACCTTGTACCATCACCCCTCCCTGCAGAGCAGTTCGCAGTACAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CACCAGTACCCGTCTGGGTACCACAAAGCCACCTTGTACCATCACCCCTCCCTGCAGAGCAGTTCGCAGTACAT  1184

Query 1185  CTCCACGGCTTCCTACCTGAGCTACCTCAGCCTCTCATCCAGCACCTACCCGCCGCCCAGCTGGGGCTCCTCCT  1258
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCCACGGCTTCCTACCTGAGCTCCCTCAGCCTCTCATCCAGCACCTACCCGCCGCCCAGCTGGGGCTCCTCCT  1258

Query 1259  CCGACCAGCAGCCCTCCAGGGTGTCCCATGAACAGTTTCGGGCGGCCCTGCAGCTGGTGGTCAGCCCAGGAGAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCGACCAGCAGCCCTCCAGGGTGTCCCATGAACAGTTTCGGGCGGCCCTGCAGCTGGTGGTCAGCCCAGGAGAC  1332

Query 1333  CCCAGGGAATACTTGGCCAACTTTATCAAAATCGGGGAAGGCTCAACCGGCATCGTATGCATCGCCACCGAGAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCCAGGGAATACTTGGCCAACTTTATCAAAATCGGGGAAGGCTCAACCGGCATCGTATGCATCGCCACCGAGAA  1406

Query 1407  ACACACAGGGAAACAAGTTGCAGTGAAGAAAATGGACCTCCGGAAGCAACAGAGACGAGAACTGCTTTTCAATG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACACACAGGGAAACAAGTTGCAGTGAAGAAAATGGACCTCCGGAAGCAACAGAGACGAGAACTGCTTTTCAATG  1480

Query 1481  AGGTCGTGATCATGCGGGATTACCACCATGACAATGTGGTTGACATGTACAGCAGCTACCTTGTCGGCGATGAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGTCGTGATCATGCGGGATTACCACCATGACAATGTGGTTGACATGTACAGCAGCTACCTTGTCGGCGATGAG  1554

Query 1555  CTCTGGGTGGTCATGGAGTTTCTAGAAGGTGGTGCCTTGACAGACATTGTGACTCACACCAGAATGAATGAAGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTCTGGGTGGTCATGGAGTTTCTAGAAGGTGGTGCCTTGACAGACATTGTGACTCACACCAGAATGAATGAAGA  1628

Query 1629  ACAGATAGCTACTGTCTGCCTGTCAGTTCTGAGAGCTCTCTCCTACCTTCATAACCAAGGAGTGATTCACAGGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACAGATAGCTACTGTCTGCCTGTCAGTTCTGAGAGCTCTCTCCTACCTTCATAACCAAGGAGTGATTCACAGGG  1702

Query 1703  ACATAAAAAGTGACTCCATCCTCCTGACAAGCGATGGCCGGATAAAGTTGTCTGATTTTGGTTTCTGTGCTCAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACATAAAAAGTGACTCCATCCTCCTGACAAGCGATGGCCGGATAAAGTTGTCTGATTTTGGTTTCTGTGCTCAA  1776

Query 1777  GTTTCCAAAGAGGTGCCGAAGAGGAAATCATTGGTTGGCACTCCCTACTGGATGGCCCCTGAGGTGATTTCTAG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTTTCCAAAGAGGTGCCGAAGAGGAAATCATTGGTTGGCACTCCCTACTGGATGGCCCCTGAGGTGATTTCTAG  1850

Query 1851  GCTACCTTATGGGACAGAGGTGGACATCTGGTCCCTCGGGATCATGGTGATAGAAATGATTGATGGCGAGCCCC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCTACCTTATGGGACAGAGGTGGACATCTGGTCCCTCGGGATCATGGTGATAGAAATGATTGATGGCGAGCCCC  1924

Query 1925  CCTACTTCAATGAGCCTCCCCTCCAGGCGATGCGGAGGATCCGGGACAGTTTACCTCCAAGAGTGAAGGACCTA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCTACTTCAATGAGCCTCCCCTCCAGGCGATGCGGAGGATCCGGGACAGTTTACCTCCAAGAGTGAAGGACCTA  1998

Query 1999  CACAAGGTTTCTTCAGTGCTCCGGGGATTCCTAGACTTGATGTTGGTGAGGGAGCCCTCTCAGAGAGCAACAGC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CACAAGGTTTCTTCAGTGCTCCGGGGATTCCTAGACTTGATGTTGGTGAGGGAGCCCTCTCAGAGAGCAACAGC  2072

Query 2073  CCAGGAACTCCTCGGACATCCATTCTTAAAACTAGCAGGTCCACCGTCTTGCATTGTCCCCCTCATGAGACAAT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCAGGAACTCCTCGGACATCCATTCTTAAAACTAGCAGGTCCACCGTCTTGCATCGTCCCCCTCATGAGACAAT  2146

Query 2147  ACAGGCATCAC  2157
            |||||||||||
Sbjct 2147  ACAGGCATCAC  2157