Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15154
• Subject: NM_001146260.2
• Aligned Length: 1265
• Identities: 1108
• Gaps: 146

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCTCCTCGGTCCCACCAGCCACGGTATCGGCGGCGACAGCAGGCCCCGGCCCAGGTTTCGGCTTCGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCTCCTCGGTCCCACCAGCCACGGTATCGGCGGCGACAGCAGGCCCCGGCCCAGGTTTCGGCTTCGC  74

Query   75  CTCCAAGACCAAGAAGAAGCATTTCGTGCAGCAGAAGGTGAAGGTGTTCCGGGCGGCCGACCCGCTGGTGGGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCCAAGACCAAGAAGAAGCATTTCGTGCAGCAGAAGGTGAAGGTGTTCCGGGCGGCCGACCCGCTGGTGGGTG  148

Query  149  TGTTCCTGTGGGGCGTAGCCCACTCGATCAATGAGCTCAGCCAGGTGCCTCCCCCGGTGATGCTGCTGCCAGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGTTCCTGTGGGGCGTAGCCCACTCGATCAATGAGCTCAGCCAGGTGCCTCCCCCGGTGATGCTGCTGCCAGAT  222

Query  223  GACTTTAAGGCCAGCTCCAAGATCAAGGTCAACAATCACCTTTTCCACAGGGAAAATCTGCCCAGTCATTTCAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACTTTAAGGCCAGCTCCAAGATCAAGGTCAACAATCACCTTTTCCACAGGGAAAATCTGCCCAGTCATTTCAA  296

Query  297  GTTCAAGGAGTATTGTCCCCAGGTCTTCAGGAACCTCCGTGATCGATTTGGCATTGATGACCAAGATTACTTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct  297  GTTCAAGGAGTATTGTCCCCAGGTCTTCAGGAACCTCCGTGATCGATTTGGCATTGATGACCAAGATTACTT--  368

Query  371  TGTCCCTTACCCGAAACCCCCCCAGCGAAAGTGAAGGCAGTGATGGTCGCTTCCTTATCTCCTACGATCGGACT  444
                                                                                      
Sbjct  369  --------------------------------------------------------------------------  368

Query  445  CTGGTCATCAAAGAAGTATCCAGTGAGNACATTGNTGACATNCATAGCAACNTNNCCAACTATCACCAGTACAT  518
                                                                                ||||||
Sbjct  369  --------------------------------------------------------------------GTACAT  374

Query  519  TGTGAAGTGCCATGGCAACACGCNTNTGCCCCAGTTCNTGGGGATGTACCGAGTCAGTGTGGACAACGAAGACA  592
            |||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  TGTGAAGTGCCATGGCAACACGCTTCTGCCCCAGTTCCTGGGGATGTACCGAGTCAGTGTGGACAACGAAGACA  448

Query  593  GCTACATGCTTGTGATGCGCAATATGTTTAGCCACCGTCTTCCTGTGCACAGGAAGTATGACCTCAAGGGTTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  449  GCTACATGCTTGTGATGCGCAATATGTTTAGCCACCGTCTTCCTGTGCACAGGAAGTATGACCTCAAGGGTTCC  522

Query  667  CTAGTGTCCCGGGAAGCCAGCGATAAGGAAAAGGTTAAAGAATTGCCCACCCTTAANGATATGGACTTTCTCAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  523  CTAGTGTCCCGGGAAGCCAGCGATAAGGAAAAGGTTAAAGAATTGCCCACCCTTAAGGATATGGACTTTCTCAA  596

Query  741  CAAGAACCAGAAAGTATATATTGGTGANNNGNAGAAGAAAATATTTCTGGAGAAGCTGAAGAAGNNGATGTGGA  814
            |||||||||||||||||||||||||||...|.||||||||||||||||||||||||||||||  ..||||||||
Sbjct  597  CAAGAACCAGAAAGTATATATTGGTGAAGAGGAGAAGAAAATATTTCTGGAGAAGCTGAAGA--GAGATGTGGA  668

Query  815  GTTTCTAGTGCAGCTGAAGATCATGGACTACAGCCTTCTGCTAGGCATCCACGACATCATTCGGGGCTCTGAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  669  GTTTCTAGTGCAGCTGAAGATCATGGACTACAGCCTTCTGCTAGGCATCCACGACATCATTCGGGGCTCTGAAC  742

Query  889  CAGAGGAGGAAGCGCCCGTGCGGGAGGATGAGTCAGAGGTGGATGGGGACTGCAGCCTGACTGGACCTCCTGCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  743  CAGAGGAGGAAGCGCCCGTGCGGGAGGATGAGTCAGAGGTGGATGGGGACTGCAGCCTGACTGGACCTCCTGCT  816

Query  963  CTGGTGGGCTCCTATGGCACCTCCCCAGAGGGTATCGGAGGCTACATCCATTCCCATCGGCCCCTGGGCCCAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  817  CTGGTGGGCTCCTATGGCACCTCCCCAGAGGGTATCGGAGGCTACATCCATTCCCATCGGCCCCTGGGCCCAGG  890

Query 1037  AGAGTTTGAGTCCTTCATTGATGTCTATGCCATCCGGAGTGCTGAAGGAGCCCCCCAGAAGGAGGTCTACTTCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  891  AGAGTTTGAGTCCTTCATTGATGTCTATGCCATCCGGAGTGCTGAAGGAGCCCCCCAGAAGGAGGTCTACTTCA  964

Query 1111  TGGGCCTCATTGATATCCTTACACAGTATGATGCCAAGAAGAAAGCAGCTCATGCAGCCAAAACTGTCAAGCAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  965  TGGGCCTCATTGATATCCTTACACAGTATGATGCTAAGAAGAAAGCAGCTCATGCAGCCAAAACTGTCAAGCAT  1038

Query 1185  GGGGCTGGGGCAGAGATCTCTACTGTCCATCCGGAGCAGTATGCTAAGCGATTCCTGGATTTTATTACCAACAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039  GGGGCTGGGGCAGAGATCTCTACTGTCCATCCGGAGCAGTATGCTAAGCGATTCCTGGATTTTATTACCAACAT  1112

Query 1259  CTTTGCC  1265
            |||||||
Sbjct 1113  CTTTGCC  1119