Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15154
• Subject: XM_005269152.3
• Aligned Length: 1265
• Identities: 1207
• Gaps: 41

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCTCCTCGGTCCCACCAGCCACGGTATCGGCGGCGACAGCAGGCCCCGGCCCAGGTTTCGGCTTCGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCTCCTCGGTCCCACCAGCCACGGTATCGGCGGCGACAGCAGGCCCCGGCCCAGGTTTCGGCTTCGC  74

Query   75  CTCCAAGACCAAGAAGAAGCATTTCGTGCAGCAGAAGGTGAAGGTGTTCCGGGCGGCCGACCCGCTGGTGGGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCCAAGACCAAGAAGAAGCATTTCGTGCAGCAGAAGGTGAAGGTGTTCCGGGCGGCCGACCCGCTGGTGGGTG  148

Query  149  TGTTCCTGTGGGGCGTAGCCCACTCGATCAATGAGCTCAGCCAGGTGCCTCCCCCGGTGATGCTGCTGCCAGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGTTCCTGTGGGGCGTAGCCCACTCGATCAATGAGCTCAGCCAGGTGCCTCCCCCGGTGATGCTGCTGCCAGAT  222

Query  223  GACTTTAAGGCCAGCTCCAAGATCAAGGTCAACAATCACCTTTTCCACAGGGAAAATCTGCCCAGTCATTTCAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACTTTAAGGCCAGCTCCAAGATCAAGGTCAACAATCACCTTTTCCACAGGGAAAATCTGCCCAGTCATTTCAA  296

Query  297  GTTCAAGGAGTATTGTCCCCAGGTCTTCAGGAACCTCCGTGATCGATTTGGCATTGATGACCAAGATTACTTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTTCAAGGAGTATTGTCCCCAGGTCTTCAGGAACCTCCGTGATCGATTTGGCATTGATGACCAAGATTACTTGG  370

Query  371  TGTCCCTTACCCGAAACCCCCCCAGCGAAAGTGAAGGCAGTGATGGTCGCTTCCTTATCTCCTACGATCGGACT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGTCCCTTACCCGAAACCCCCCCAGCGAAAGTGAAGGCAGTGATGGTCGCTTCCTTATCTCCTACGATCGGACT  444

Query  445  CTGGTCATCAAAGAAGTATCCAGTGAGNACATTGNTGACATNCATAGCAACNTNNCCAACTATCACCAGTACAT  518
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||.|||||||||.|..|||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGTCATCAAAGAAGTATCCAGTGAGGACATTGCTGACATGCATAGCAACCTCTCCAACTATCACCAGTACAT  518

Query  519  TGTGAAGTGCCATGGCAACACGCNTNTGCCCCAGTTCNTGGGGATGTACCGAGTCAGTGTGGACAACGAAGACA  592
            |||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTGAAGTGCCATGGCAACACGCTTCTGCCCCAGTTCCTGGGGATGTACCGAGTCAGTGTGGACAACGAAGACA  592

Query  593  GCTACATGCTTGTGATGCGCAATATGTTTAGCCACCGTCTTCCTGTGCACAGGAAGTATGACCTCAAGGGTTCC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct  593  GCTACATGCTTGTGATGCGCAATATGTTTAGCCACCGTCTTCCTGTGCACAGGAAGTATGACCTC---------  657

Query  667  CTAGTGTCCCGGGAAGCCAGCGATAAGGAAAAGGTTAAAGAATTGCCCACCCTTAANGATATGGACTTTCTCAA  740
                                          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  658  ------------------------------AAGGTTAAAGAATTGCCCACCCTTAAGGATATGGACTTTCTCAA  701

Query  741  CAAGAACCAGAAAGTATATATTGGTGANNNGNAGAAGAAAATATTTCTGGAGAAGCTGAAGAAGNNGATGTGGA  814
            |||||||||||||||||||||||||||...|.||||||||||||||||||||||||||||||  ..||||||||
Sbjct  702  CAAGAACCAGAAAGTATATATTGGTGAAGAGGAGAAGAAAATATTTCTGGAGAAGCTGAAGA--GAGATGTGGA  773

Query  815  GTTTCTAGTGCAGCTGAAGATCATGGACTACAGCCTTCTGCTAGGCATCCACGACATCATTCGGGGCTCTGAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  774  GTTTCTAGTGCAGCTGAAGATCATGGACTACAGCCTTCTGCTAGGCATCCACGACATCATTCGGGGCTCTGAAC  847

Query  889  CAGAGGAGGAAGCGCCCGTGCGGGAGGATGAGTCAGAGGTGGATGGGGACTGCAGCCTGACTGGACCTCCTGCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  848  CAGAGGAGGAAGCGCCCGTGCGGGAGGATGAGTCAGAGGTGGATGGGGACTGCAGCCTGACTGGACCTCCTGCT  921

Query  963  CTGGTGGGCTCCTATGGCACCTCCCCAGAGGGTATCGGAGGCTACATCCATTCCCATCGGCCCCTGGGCCCAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  922  CTGGTGGGCTCCTATGGCACCTCCCCAGAGGGTATCGGAGGCTACATCCATTCCCATCGGCCCCTGGGCCCAGG  995

Query 1037  AGAGTTTGAGTCCTTCATTGATGTCTATGCCATCCGGAGTGCTGAAGGAGCCCCCCAGAAGGAGGTCTACTTCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  996  AGAGTTTGAGTCCTTCATTGATGTCTATGCCATCCGGAGTGCTGAAGGAGCCCCCCAGAAGGAGGTCTACTTCA  1069

Query 1111  TGGGCCTCATTGATATCCTTACACAGTATGATGCCAAGAAGAAAGCAGCTCATGCAGCCAAAACTGTCAAGCAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1070  TGGGCCTCATTGATATCCTTACACAGTATGATGCTAAGAAGAAAGCAGCTCATGCAGCCAAAACTGTCAAGCAT  1143

Query 1185  GGGGCTGGGGCAGAGATCTCTACTGTCCATCCGGAGCAGTATGCTAAGCGATTCCTGGATTTTATTACCAACAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1144  GGGGCTGGGGCAGAGATCTCTACTGTCCATCCGGAGCAGTATGCTAAGCGATTCCTGGATTTTATTACCAACAT  1217

Query 1259  CTTTGCC  1265
            |||||||
Sbjct 1218  CTTTGCC  1224