Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15154
• Subject: XM_011243288.2
• Aligned Length: 1510
• Identities: 1084
• Gaps: 303

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACGGCTGCGCAGGTGAGCACCGCTTCCGGGTCGGGCTTCGGAGTCGCGGCTAGCTCCCGCTTCCACTCGCT  74

Query    1  -----------------ATGGCGTCCTCCTCGGTCCCACCAGCCACGGTATCGGCGGCGACAGCAGGCCCCGGC  57
                             ||||||||||||||.|||||.||.|||||.|.|.|.|||||..|.|.||||||||||
Sbjct   75  CGGGTGCGCGGGAGACTATGGCGTCCTCCTCCGTCCCTCCCGCCACCGCACCCGCGGCAGCTGGAGGCCCCGGC  148

Query   58  CCAGGTTTCGGCTTCGCCTCCAAGACCAAGAAGAAGCATTTCGTGCAGCAGAAGGTGAAGGTGTTCCGGGCGGC  131
            ||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  149  CCGGGATTCGGCTTCGCCTCCAAAACCAAGAAGAAGCATTTCGTACAGCAGAAAGTGAAGGTGTTCCGGGCCGC  222

Query  132  CGACCCGCTGGTGGGTGTGTTCCTGTGGGGCGTAGCCCACTC--------------------------------  173
            .||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||                                
Sbjct  223  GGACCCGCTGGTGGGCGTGTTCCTGTGGGGCGTCGCTCACTCGGTCCAGCCCCAGGCTACAGGGACTGGCCAGG  296

Query  174  ---------------------------------------------------GATCAATGAGCTCAGCCAGGTGC  196
                                                               |||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  ATCCGGCTGCAGCCAGAGGGACATTAAGGGGAGTGGCTCTGAAGGGTTATTGATCAATGAGCTCAGCCAGGTAC  370

Query  197  CTCCCCCGGTGATGCTGCTGCCAGATGACTTTAAGGCCAGCTCCAAGATCAAGGTCAACAATCACCTTTTCCAC  270
            |.|||||.||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct  371  CGCCCCCAGTGATGTTGCTGCCAGATGACTTTAAAGCCAGCTCCAAGATCAAGGTCAACAATCACTTTTTCCAT  444

Query  271  AGGGAAAATCTGCCCAGTCATTTCAAGTTCAAGGAGTATTGTCCCCAGGTCTTCAGGAACCTCCGTGATCGATT  344
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||.||
Sbjct  445  AGAGAAAATCTTCCCAGTCATTTCAAGTTCAAGGAGTATTGTCCCCAGGTCTTCAGGAACCTGAGAGATCGGTT  518

Query  345  TGGCATTGATGACCAAGATTACTTGGTGTCCCTTACCCGAAACCCCCCCAGCGAAAGTGAAGGCAGTGATGGTC  418
            ||.|||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||.|||||||||||||||.|
Sbjct  519  TGCCATCGATGATCACGATTACTTGGTGTCCCTTACTCGAAGCCCCCCAAGCGAAACTGAAGGCAGTGATGGCC  592

Query  419  GCTTCCTTATCTCCTACGATCGGACTCTGGTCATCAAAGAAGTATCCAGTGAGNACATTGNTGACATNCATAGC  492
            |.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||..|.||||..||.||.||.|||
Sbjct  593  GTTTCCTTATCTCCTATGACCGCACTCTGGTCATCAAGGAAGTGTCGAGCGAAGATATTGCGGATATGCACAGC  666

Query  493  AACNTNNCCAACTATCACCAGTACATTGTGAAGTGCCATGGCAACACGCNTNTGCCCCAGTTCNTGGGGATGTA  566
            |||.|..|||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.|.|||||||||||.||||.|||||
Sbjct  667  AACCTCTCCAACTACCACCAGTACATAGTGAAATGTCATGGCAACACGCTTCTGCCCCAGTTCCTGGGCATGTA  740

Query  567  CCGAGTCAGTGTGGACAACGAAGACAGCTACATGCTTGTGATGCGCAATATGTTTAGCCACCGTCTTCCTGTGC  640
            ||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  741  CCGAGTCAGTGTAGAAAATGAAGACAGCTACATGCTCGTGATGCGCAATATGTTTAGTCATCGTCTTCCTGTGC  814

Query  641  ACAGGAAGTATGACCTCAAGGGTTCCCTAGTGTCCCGGGAAGCCAGCGATAAGGAAAAGGTTAAAGAATTGCCC  714
            |.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct  815  ATAGGAAGTATGACCTCAAGGGCTCTCTAGTGTCCCGGGAAGCCAGCGATAAGGAAAAGGTTAAAGAACTGCCA  888

Query  715  ACCCTTAANGATATGGACTTTCTCAACAAGAACCAGAAAGTATATATTGGTGANNNGNAGAAGAAAA-----TA  783
            ||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||     |||||||||     ||
Sbjct  889  ACACTAAAGGATATGGACTTTCTTAACAAGAACCAGAAAGTGTATATTGGTGA-----AGAAGAAAAGAAAGTA  957

Query  784  TTTCTGGAGAAGCTGAA--GAAGNNGATGTGGAGTTTCTAGTGCAGCTGAAGATCATGGACTACAGCCTTCTGC  855
            ||.||||||||||||||  ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.
Sbjct  958  TTCCTGGAGAAGCTGAAGCGA----GATGTGGAGTTTCTAGTGCAGCTGAAGATCATGGACTACAGCCTCCTGT  1027

Query  856  TAGGCATCCACGACATCATTCGGGGCTCTGAACCAGAGGAGGAAGCGCCCGTGCGGGAGGATGAGTCAGAGGTG  929
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|.|||.|||.|||||||.|||||.|||..|
Sbjct 1028  TGGGCATCCACGACATCATCCGGGGCTCTGAACCCGAGGAAGAGGGGCCTGTGAGGGAGGAGGAGTCTGAGTGG  1101

Query  930  GATGGGGACTGCAGCCTGACTGGACCTCCTGCTCTGGTGGGCTCCTATGGCACCTCCCCAGAGGGTATCGGAGG  1003
            |||||||||||.|.||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1102  GATGGGGACTGTAACCTGGCTGGACCTCCCGCCCTGGTGGGCTCCTATGGTACCTCCCCTGAGGGTATCGGAGG  1175

Query 1004  CTACATCCATTCCCATCGGCCCCTGGGCCCAGGAGAGTTTGAGTCCTTCATTGATGTCTATGCCATCCGGAGTG  1077
            |||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1176  CTACATCCATTCCCACCGGCCACTGGGCCCAGGAGAGTTTGAGTCCTTCATCGATGTCTATGCTATCCGGAGTG  1249

Query 1078  CTGAAGGAGCCCCCCAGAAGGAGGTCTACTTCATGGGCCTCATTGATATCCTTACACAGTATGATGCCAAGAAG  1151
            |.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1250  CGGAGGGGGCCCCCCAGAAGGAGGTGTATTTCATGGGCCTCATTGACATTCTGACACAGTATGATGCCAAGAAG  1323

Query 1152  AAAGCAGCTCATGCAGCCAAAACTGTCAAGCA------------------------------------------  1183
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||                                          
Sbjct 1324  AAAGCAGCTCATGCAGCCAAGACTGTCAAGCACGGGGTGAGGGTTCCCCACAGCCTTTCCTCTCCTGGCCTGAC  1397

Query 1184  ----------------------TGGGGCTGGGGCAGAGATCTCTACTGTCCATCCGGAGCAGTATGCTAAGCGA  1235
                                  ||||||.||||||||||||||.|||||||||||                   
Sbjct 1398  TGTTCTCTGGAAAGAACGCTTCTGGGGCGGGGGCAGAGATCTCCACTGTCCATCC-------------------  1452

Query 1236  TTCCTGGATTTTATTACCAACATCTTTGCC  1265
                                          
Sbjct 1453  ------------------------------  1452