Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15155
• Subject: XM_017007207.1
• Aligned Length: 2067
• Identities: 1434
• Gaps: 627

Alignment

Query    1  ATGCTGAAATTCCAAGAGGCAGCTAAGTGTGTGAGTGGATCAACAGCCATTTCCACTTATCCAAAGACCTTGAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGAAATTCCAAGAGGCAGCTAAGTGTGTGAGTGGATCAACAGCCATTTCCACTTATCCAAAGACCTTGAT  74

Query   75  TGCAAGAAGATACGTGCTTCAACAAAAACTTGGCAGTGGAAGTTTTGGAACTGTCTATCTGGTTTCAGACAAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCAAGAAGATACGTGCTTCAACAAAAACTTGGCAGTGGAAGTTTTGGAACTGTCTATCTGGTTTCAGACAAGA  148

Query  149  AAGCCAAACGAGGAGAGGAATTAAAGGTACTTAAGGAAATATCTGTTGGAGAACTAAATCCAAATGAAACTGTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGCCAAACGAGGAGAGGAATTAAAGGTACTTAAGGAAATATCTGTTGGAGAACTAAATCCAAATGAAACTGTA  222

Query  223  CAGGCCAATTTGGAAGCCCAACTCCTCTCCAAGCTGGACCACCCAGCCATTGTCAAGTTCCATGCAAGTTTTGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGCCAATTTGGAAGCCCAACTCCTCTCCAAGCTGGACCACCCAGCCATTGTCAAGTTCCATGCAAGTTTTGT  296

Query  297  GGAGCAAGATAATTTCTGCATTATCACGGAGTACTGTG------------------------------------  334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                    
Sbjct  297  GGAGCAAGATAATTTCTGCATTATCACGGAGTACTGTGAGGACCTCTCCAAGGAGAACTGCAAACCACTGCTCA  370

Query  335  --------------------------------------------------------------------------  334
                                                                                      
Sbjct  371  ATGAAATAAAAGAGGACACAAACAAATGGAAGAACATTCCATGCTCATGGGTAGGAAGAATCAATATCGTGAAA  444

Query  335  ----------------AGGGCCGAGATCTGGACGATAAAATTCAGGAATATAAACAAGCTGGAAAAATCTTTCC  392
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGGCCATACTGCCCAAGGGCCGAGATCTGGACGATAAAATTCAGGAATATAAACAAGCTGGAAAAATCTTTCC  518

Query  393  AGAAAATCAAATAATAGAATGGTTTATCCAGCTGCTGCTGGGAGTTGACTACATGCATGAGAGGAGGATACTTC  466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAAAATCAAATAATAGAATGGTTTATCCAGCTGCTGCTGGGAGTTGACTACATGCATGAGAGGAGGATACTTC  592

Query  467  ATCGAGACTTAAAGTCAAAGAATGTATTTCTGAAAAATAATCTCCTTAAAATTGGAGATTTTGGAGTTTCTCGA  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATCGAGACTTAAAGTCAAAGAATGTATTTCTGAAAAATAATCTCCTTAAAATTGGAGATTTTGGAGTTTCTCGA  666

Query  541  CTTCTAATGGGATCCTGTGACCTGGCCACAACTTTAACTGGAACTCCCCATTATATGAGTCCTGAGGCTCTGAA  614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTTCTAATGGGATCCTGTGACCTGGCCACAACTTTAACTGGAACTCCCCATTATATGAGTCCTGAGGCTCTGAA  740

Query  615  ACACCAAGGCTATGACACAAAGTCGGACATCTGGTCACTGGCATGCATTTTGTATGAGATGTGCTGCATGAATC  688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACACCAAGGCTATGACACAAAGTCGGACATCTGGTCACTGGCATGCATTTTGTATGAGATGTGCTGCATGAATC  814

Query  689  ATGCATTCGCTGGCTCCAATTTCTTATCCATTGTTTTAAAAATTGTTGAAGGTGACACACCTTCTCTCCCTGAG  762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGCATTCGCTGGCTCCAATTTCTTATCCATTGTTTTAAAAATTGTTGAAGGTGACACACCTTCTCTCCCTGAG  888

Query  763  AGATATCCAAAAGAACTAAATGCCATCATGGAAAGCATGTTGAACAAGAATCCTTCATTAAGACCATCTGCTAT  836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGATATCCAAAAGAACTAAATGCCATCATGGAAAGCATGTTGAACAAGAATCCTTCATTAAGACCATCTGCTAT  962

Query  837  CGAAATTTTAAAAATCCCTTACCTTGATGAGCAGCTACAGAACCTAATGTGTAGATATTCAGAAATGACTCTGG  910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGAAATTTTAAAAATCCCTTACCTTGATGAGCAGCTACAGAACCTAATGTGTAGATATTCAGAAATGACTCTGG  1036

Query  911  AAGACAAAAATTTGGATTGTCAGAAGGAGGCTGCTCATATAATTAATGCCATGCAAAAAAGGATCCACCTGCAG  984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGACAAAAATTTGGATTGTCAGAAGGAGGCTGCTCATATAATTAATGCCATGCAAAAAAGGATCCACCTGCAG  1110

Query  985  ACTCTGAGGGCACTGTCAGAAGTACAGAAAATGACGCCAAGAGAAAGGATGCGGCTGAGGAAGCTCCAGGCGGC  1058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACTCTGAGGGCACTGTCAGAAGTACAGAAAATGACGCCAAGAGAAAGGATGCGGCTGAGGAAGCTCCAGGCGGC  1184

Query 1059  TGATGAGAAAGCCAGGAAGCTGAAAAAGATTGTGGAAGAAAAATATGAAGAAAATAGCAAACGAATGCAAGAAT  1132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGATGAGAAAGCCAGGAAGCTGAAAAAGATTGTGGAAGAAAAATATGAAGAAAATAGCAAACGAATGCAAGAAT  1258

Query 1133  TGAGATCTCGGAACTTTCAGCAGCTGAGTGTTGATGTACTCCATGAAAAAACACATTTAAAAGGAATGGAAGAA  1206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGAGATCTCGGAACTTTCAGCAGCTGAGTGTTGATGTACTCCATGAAAAAACACATTTAAAAGGAATGGAAGAA  1332

Query 1207  AAGGAGGAGCAACCTGAGGGAAGACTTTCTTGTTCACCCCAGGACGAGGATGAAGAGAGGTGGCAAGGCAGGGA  1280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGGAGGAGCAACCTGAGGGAAGACTTTCTTGTTCACCCCAGGACGAGGATGAAGAGAGGTGGCAAGGCAGGGA  1406

Query 1281  AGAGGAATCTGATGAACCAACTTTAGAGAACCTGCCTGAGTCTCAGCCTATTCCTTCCATGGACCTCCACGAAC  1354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGAGGAATCTGATGAACCAACTTTAGAGAACCTGCCTGAGTCTCAGCCTATTCCTTCCATGGACCTCCACGAAC  1480

Query 1355  TTGAATCAATTGTAGAGGATGCCACATCTGACCTTGGATACCAT---------GGAGAC-----TGT-----AA  1409
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |.||||     |||     ||
Sbjct 1481  TTGAATCAATTGTAGAGGATGCCACATCTGACCTTGGATACCATGAGATCCCAGAAGACCCACTTGTGGCTGAA  1554

Query 1410  ----TCTA---------ATTTCA---CTA----------------GACGAATACTGGAAAAATGAAAAA-----  1446
                .|||         ||||.|   |||                ||.||     ||||.|| ||||.|     
Sbjct 1555  GAGTACTACGCTGATGCATTTGATTCCTATTGTGAAGAGAGTGATGAGGA-----GGAAGAA-GAAATAGCGTT  1622

Query 1447  --------------------------------------------------------------------------  1446
                                                                                      
Sbjct 1623  AGAAAGACCAGAGAAAGAAATCAGGAATGAGGGATCCCAGCCTGCTTACAGAACAAACCAACAGGACAGTGATA  1696

Query 1447  --------------------------------------------------------------------------  1446
                                                                                      
Sbjct 1697  TCGAAGCGTTGGCCAGGTGTTTGGAAAATGTCCTGGGTTGCACTTCTCTAGACACAAAGACCATCACCACCATG  1770

Query 1447  --------------------------------------------------------------------------  1446
                                                                                      
Sbjct 1771  GCTGAAGACATGTCCCCAGGACCACCAATTTTCAACAGTGTGATGGCCAGGACCAAGATGAAACGCATGAGGGA  1844

Query 1447  --------------------------------------------------------------------------  1446
                                                                                      
Sbjct 1845  ATCAGCCATGCAGAAGCTGGGGACAGAAGTATTTGAAGAGGTCTATAATTACCTCAAGAGAGCAAGGCATCAGA  1918

Query 1447  --------------------------------------------------------------------------  1446
                                                                                      
Sbjct 1919  ATGCTAGCGAAGCAGAGATCCGCGAGTGTTTGGAAAAAGTGGTGCCTCAAGCCAGCGACTGTTTTGAAGTGGAC  1992

Query 1447  ---------------------------------------------------------------------  1446
                                                                                 
Sbjct 1993  CAGCTCCTGTACTTTGAAGAGCAGTTGCTGATCACGATGGGAAAAGAACCTACTCTCCAGAACCATCTC  2061