Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15166
• Subject: NM_001253884.1
• Aligned Length: 1250
• Identities: 958
• Gaps: 249

Alignment

Query    1  MNNQKVVAVLLQECKQVLDQLLLEAPDVSEEDKSEDQRCRALLPSELRTLIQEAKEMKWPFVPEKWQYKQAVGP  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  EDKTNLKDVIGAGLQQLLASLRASILARDCAAAAAIVFLVDRFLYGLDVSGKLLQVAKGLHKLQPATPIAPQVV  148
                .......|......||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----MCRKRTRARTSAAEASLRASILARDCAAAAAIVFLVDRFLYGLDVSGKLLQVAKGLHKLQPATPIAPQVV  70

Query  149  IRQARISVNSGKLLKAEYILSSLISNNGATGTWLYRNESDKVLVQSVCIQIRGQILQKLGMWYEAAELIWASIV  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   71  IRQARISVNSGKLLKAEYILSSLISNNGATGTWLYRNESDKVLVQSVCIQIRGQILQKLGMWYEAAELIWASIV  144

Query  223  GYLALPQPDKKGLSTSLGILADIFVSMSKNDYEKFKNNPQINLSLLKEFDHHLLSAAEACKLAAAFSAYTPLFV  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  145  GYLALPQPDKKGLSTSLGILADIFVSMSKNDYEKFKNNPQINLSLLKEFDHHLLSAAEACKLAAAFSAYTPLFV  218

Query  297  LTAVNIRGTCLLSYSSSNDCPPELKNLHLCEAKEAFEIGLLTKRDDEPVTGKQELHSFVKAAFGLTTVHRRLHG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  219  LTAVNIRGTCLLSYSSSNDCPPELKNLHLCEAKEAFEIGLLTKRDDEPVTGKQELHSFVKAAFGLTTVHRRLHG  292

Query  371  ETGTVHAASQLCKEAMGKLYNFSTSSRSQDREALSQEVMSVIAQVKEHLQVQSFSNVDDRSYVPESFECRLDKL  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  293  ETGTVHAASQLCKEAMGKLYNFSTSSRSQDREALSQEVMSVIAQVKEHLQVQSFSNVDDRSYVPESFECRLDKL  366

Query  445  ILHGQGDFQKILDTYSQHHTSVCEVFESDCGNNKNEQKDAKTGVCITALKTEIKNIDTVSTTQEKPHCQRDTGI  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  367  ILHGQGDFQKILDTYSQHHTSVCEVFESDCGNNKNEQKDAKTGVCITALKTEIKNIDTVSTTQEKPHCQRDTGI  440

Query  519  SSSLMGKNVQRELRRGGRRNWTHSDAFRVSLDQDVETETEPSDYSNGEGAVFNKSLSGSQTSSAWSNLSGFSSS  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  441  SSSLMGKNVQRELRRGGRRNWTHSDAFRVSLDQDVETETEPSDYSNGEGAVFNKSLSGSQTSSAWSNLSGFSSS  514

Query  593  ASWEEVNYHVDDRSARKEPGKEHLVDTQCSTALSEELENDREGRAMHSLHSQLHDLSLQEPNNDNLEPSQNQPQ  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  515  ASWEEVNYHVDDRSARKEPGKEHLVDTQCSTALSEELENDREGRAMHSLHSQLHDLSLQEPNNDNLEPSQNQPQ  588

Query  667  QQMPLTPFSPHNTPGIFLAPGAGLLEGAPEGIQEVRNMGPRNTSAHSRPSYRSASWSSDSGRPKNMGTHPSVQK  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  589  QQMPLTPFSPHNTPGIFLAPGAGLLEGAPEGIQEVRNMGPRNTSAHSRPSYRSASWSSDSGRPKNMGTHPSVQK  662

Query  741  EEAFEIIVEFPETNCDVKDRQGKEQGEEISERGAGPTFKASPSWVDPEGETAESTEDAPLDFHRVLHNSLGNIS  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  663  EEAFEIIVEFPETNCDVKDRQGKEQGEEISERGAGPTFKASPSWVDPEGETAESTEDAPLDFHRVLHNSLGNIS  736

Query  815  MLPCSSFTPNWPVQNPDSRKSGGPVAEQGIDPDASTVDEEGQLLDSMDVPCTNGHGSHRLCILRQPPGQRAETP  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  MLPCSSFTPNWPVQNPDSRKSGGPVAEQGIDPDASTVDEEGQLLDSMDVPCTNGHGSHRLCILRQPPGQRAETP  810

Query  889  NSSVSGNILFPVLSEDCTTTEEGNQPGNMLNCSQNSSSSSVWWLKSPAFSSGSSEGDSPWSYLNSSGSSWVSLP  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  NSSVSGNILFPVLSEDCTTTEEGNQPGNMLNCSQNSSSSSVWWLKSPAFSSGSSEGDSPWSYLNSSGSSWVSLP  884

Query  963  GKMRKEILEARTLQPDDFEKLLAGVRHDWLFQRLENTGVFKPSQLHRAHSALLLKYSKKSELWTAQETIVYLGD  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  885  GKMRKEILEARTLQPDDFEKLLAGVRHDWLFQRLENTGVFKPSQLHRAHSALLLKYSKKSELWTAQETIVYLGD  958

Query 1037  YLTVKKKADKEMLFGFIIFIKKKFWGGMLGKTIRSRRGSGTTSLMWSDR-------------------------  1085
            |||||||......|...........|...||......|      .|...                         
Sbjct  959  YLTVKKKGRQRNAFWVHHLHQEEILGRYVGKDYKEQKG------LWHHFTDVERQMTAQHYVTEFNKRLYEQNI  1026

Query 1086  --------------------------------------------------------------------------  1085
                                                                                      
Sbjct 1027  PTQIFYIPSTILLILEDKTIKGCISVEPYILGEFVKLSNNTKVVKTEYKATEYGLAYGHFSYEFSNHRDVVVDL  1100

Query 1086  ------------------------------------------------------------------  1085
                                                                              
Sbjct 1101  QGWVTGNGKGLIYLTDPQIHSVDQKVFTTNFGKRGIFYFFNNQHVECNEICHRLSLTRPSMEKPCT  1166