Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15207
- Subject:
- NM_001348722.1
- Aligned Length:
- 1356
- Identities:
- 1086
- Gaps:
- 267
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCTGGAAACTTTCTGGAACCTGACCTCTATAGGAAAAAAGTGGAAAGACCAGAACATTGAATATGAGTACCA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTGTCACAGAAGAGAAAGTCAATGAAATTAAAGAAGACAGTCATTGTGGAG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGACAGGCTGAACTTCCAGAAGAAGAAAGCTTCTCCTGAAGTAAAATCATGT 222
Query 1 ---------------------------------------------ATGAACATCAGAGGTGACACTGGACACAA 29
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACAGCTTTGTGTGTGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTCTAATATGAACATCAGAGGTGACACTGGACACAA 296
Query 30 GGCATGTGAATGTCAGGAATATGGACCAAAGCCATGGAAGAGTCAACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATATCACC 103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGCATGTGAATGTCAGGAATATGGACCAAAGCCATGGAAGAGTCAACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATATCACC 370
Query 104 CCTCCTTGAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAAAGAAACCCTATGCTTGTAAAGAATGTGGAAAAAACATT 177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCTCCTTGAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAAAGAAACCCTATGCTTGTAAAGAATGTGGAAAAAACATT 444
Query 178 ATTTACCATTCAAGCATTCAAAGACACATGGTAGTGCACAGTGGGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGG 251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATTTACCATTCAAGCATTCAAAGACACATGGTAGTGCACAGTGGGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGG 518
Query 252 GAAAGCATTCCATTGTCTCAGTTTATATCTTATCCATGAAAGAACTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTA 325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAAAGCATTCCATTGTCTCAGTTTATATCTTATCCATGAAAGAACTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTA 592
Query 326 AACAATGTGGTAAATCTTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATGAAAGAACTCACATTGGAGAAAAGCCT 399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AACAATGTGGTAAATCTTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATGAAAGAACTCACATTGGAGAAAAGCCT 666
Query 400 TATGAATGTCAGGAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTCCCAGATCCTGTCACAGACATGAAAGGAGTCACATGGG 473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TATGAATGTCAGGAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTCCCAGATCCTGTCACAGACATGAAAGGAGTCACATGGG 740
Query 474 AGAGAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCATGTGTCCCCGTTATGTTCGTAGACATGAAAGGA 547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGAGAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCATGTGTCCCCGTTATGTTCGTAGACATGAAAGGA 814
Query 548 CCCACTCTAGGAAAAAACTTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACA 621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCCACTCTAGGAAAAAACTTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACA 888
Query 622 CACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGACATGTGGGAAAGGCTTTTATTCTGCCAAGTC 695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGACATGTGGGAAAGGCTTTTATTCTGCCAAGTC 962
Query 696 ATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACAGTGGAGAGAAACCGTATAAATGCAAGCAATGTGGTAAAGCCTTCACTC 769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACAGTGGAGAGAAACCGTATAAATGCAAGCAATGTGGTAAAGCCTTCACTC 1036
Query 770 GTTCCGGTTCCTTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAA 843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTTCCGGTTCCTTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAA 1110
Query 844 GCCTTCAGATCTGCCCCAAATCTTCAATCGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAACCGTATCAATGTAAGGA 917
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCCTTCAGATCTGCCCCAAATCTTCAATTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAACCGTATCAATGTAAGGA 1184
Query 918 ATGTGGGAAAGCTTTCAGATCTGCCTCACAACTTCGAATCCATCGTAGGATTCACACTGGAGAGAAACCCTATG 991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ATGTGGGAAAGCTTTCAGATCTGCCTCACAACTTCGAATCCATCGTAGGATTCACACTGGAGAGAAACCCTATG 1258
Query 992 AATGTAAGAAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTCCAGAACTTTCGATTTCATGAAAGGACAAACACACATAAG 1065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 1259 AATGTAAGAAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTCCAGAACTTTCGATTTCATGAAAGGACACAAACACATAAG 1332
Query 1066 AATGCACTCTGGAGAAAGACCTTA 1089
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AATGCACTCTGGAGAAAGACCTTA 1356