Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15207
• Subject: NM_152262.2
• Aligned Length: 1497
• Identities: 1086
• Gaps: 408

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTGTCACTCTCACCCATCCTCCTCTACACATGTGAGATGTTTCAGGACCCAGTGGCTTTTAAGGATGTGGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAAGAATCTCTACAGGGAAGTGATGCTGG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AAACTTTCTGGAACCTGACCTCTATAGGAAAAAAGTGGAAAGACCAGAACATTGAATATGAGTACCAAAACCCC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  AGGAGAAACTTCAGGAGTGTCACAGAAGAGAAAGTCAATGAAATTAAAGAAGACAGTCATTGTGGAGAAACTTT  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  TACCCCAGTTCCAGATGACAGGCTGAACTTCCAGAAGAAGAAAGCTTCTCCTGAAGTAAAATCATGTGACAGCT  370

Query    1  --------------------------------------ATGAACATCAGAGGTGACACTGGACACAAGGCATGT  36
                                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGTGTGTGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTCTAATATGAACATCAGAGGTGACACTGGACACAAGGCATGT  444

Query   37  GAATGTCAGGAATATGGACCAAAGCCATGGAAGAGTCAACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATATCACCCCTCCTT  110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAATGTCAGGAATATGGACCAAAGCCATGGAAGAGTCAACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATATCACCCCTCCTT  518

Query  111  GAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAAAGAAACCCTATGCTTGTAAAGAATGTGGAAAAAACATTATTTACC  184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAAAGAAACCCTATGCTTGTAAAGAATGTGGAAAAAACATTATTTACC  592

Query  185  ATTCAAGCATTCAAAGACACATGGTAGTGCACAGTGGGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCA  258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATTCAAGCATTCAAAGACACATGGTAGTGCACAGTGGGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCA  666

Query  259  TTCCATTGTCTCAGTTTATATCTTATCCATGAAAGAACTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTAAACAATG  332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTCCATTGTCTCAGTTTATATCTTATCCATGAAAGAACTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTAAACAATG  740

Query  333  TGGTAAATCTTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATGAAAGAACTCACATTGGAGAAAAGCCTTATGAAT  406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGTAAATCTTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATGAAAGAACTCACATTGGAGAAAAGCCTTATGAAT  814

Query  407  GTCAGGAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTCCCAGATCCTGTCACAGACATGAAAGGAGTCACATGGGAGAGAAG  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTCAGGAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTCCCAGATCCTGTCACAGACATGAAAGGAGTCACATGGGAGAGAAG  888

Query  481  GCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCATGTGTCCCCGTTATGTTCGTAGACATGAAAGGACCCACTC  554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCATGTGTCCCCGTTATGTTCGTAGACATGAAAGGACCCACTC  962

Query  555  TAGGAAAAAACTTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACACACATAA  628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAGGAAAAAACTTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACACACATAA  1036

Query  629  GAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGACATGTGGGAAAGGCTTTTATTCTGCCAAGTCATTTCAA  702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGACATGTGGGAAAGGCTTTTATTCTGCCAAGTCATTTCAA  1110

Query  703  AGACATGAAAAAACTCACAGTGGAGAGAAACCGTATAAATGCAAGCAATGTGGTAAAGCCTTCACTCGTTCCGG  776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGACATGAAAAAACTCACAGTGGAGAGAAACCGTATAAATGCAAGCAATGTGGTAAAGCCTTCACTCGTTCCGG  1184

Query  777  TTCCTTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCA  850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTCCTTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCA  1258

Query  851  GATCTGCCCCAAATCTTCAATCGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAACCGTATCAATGTAAGGAATGTGGG  924
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GATCTGCCCCAAATCTTCAATTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAACCGTATCAATGTAAGGAATGTGGG  1332

Query  925  AAAGCTTTCAGATCTGCCTCACAACTTCGAATCCATCGTAGGATTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTAA  998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAAGCTTTCAGATCTGCCTCACAACTTCGAATCCATCGTAGGATTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTAA  1406

Query  999  GAAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTCCAGAACTTTCGATTTCATGAAAGGACAAACACACATAAGAATGCAC  1072
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTCCAGAACTTTCGATTTCATGAAAGGACACAAACACATAAGAATGCAC  1480

Query 1073  TCTGGAGAAAGACCTTA  1089
            |||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCTGGAGAAAGACCTTA  1497