Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15207
• Subject: XM_017026254.1
• Aligned Length: 1422
• Identities: 993
• Gaps: 336

Alignment

Query    1  ATGAACATCAGAGGTGACACTGGACACAAGGCATGTGAATGTCAGGAATATGGACCAAAGCCATGGAAGAGTCA  74
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct    1  ATGAACATCAGAGGTGACATTGGACACAAGGCATATGAGTATCAGGAATATGGACCAAAGCCATGTAAGTGTCA  74

Query   75  ACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATATCACCCCTCCTTGAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAAAGAAACCCT  148
            ||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct   75  ACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATACCGCCCCTCCTTTAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAGAGAAACCCA  148

Query  149  ATGCTTGTAAAGAATGTGGAAAAAACATTATTTACCATTCAAGCATTCAAAGACACATGGTAGTGCACAGTGGG  222
            ||||||||||||.|||||||||||.|.||||||.|||||||||..|||.|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  149  ATGCTTGTAAAGTATGTGGAAAAACCTTTATTTCCCATTCAAGTGTTCGAAGACACATGGTAATGCACAGTGGG  222

Query  223  GATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGTTTATATCTTATCCATGAAAGAAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.
Sbjct  223  GATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGATTATATCTTATCCATGAAAGAAT  296

Query  297  TCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTAAACAATGTGGTAAATCTTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATAC  370
            ||||||||||||||||||.|.||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCACACTGGAGAGAAACCATGTGAATGTAAACAGTGTGGTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATAC  370

Query  371  ATGAAAGAACTCACATTGGAGAAAAGCCTTATGAATGTCAGGAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTCCCAGATCC  444
            ||.||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  ATAAAAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATATCAGGAGTGTGGGAAAGCATTTCATAGTCCCAGATCC  444

Query  445  TGTCACAGACATGAAAGGAGTCACATGGGAGAGAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCATGTG  518
            |.||..|||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  445  TATCGTAGACATGAAAGGATTCACATGGGAGAAAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCACGTG  518

Query  519  TCCCCGTTATGTTCGTAGACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAAACTTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAG  592
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCCCGTTATGTTCGTATACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAATCTCTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAG  592

Query  593  CATTATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACACACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  593  CATTATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACACACGTAAGATTGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGATA  666

Query  667  TGTGGGAAAGGCTTTTATTCTGCCAAGTCATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACAGTGGAGAGAAACCGTATAA  740
            |||||.||||.|||||.|||||..||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  TGTGGAAAAGACTTTTGTTCTGTGAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAATTCACAGTGGAGAGAAACCCTATAA  740

Query  741  ATGCAAGCAATGTGGTAAAGCCTTCACTCGTTCCGGTTCCTTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGA  814
            |||.|||||.|||||||||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATGTAAGCAGTGTGGTAAAGCCTTCCCTCATTCCAGTTCCCTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGA  814

Query  815  AACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCCCAAATCTTCAATCGCATGGTAGGACTCAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.||||.|..||||||||||||||||
Sbjct  815  AACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCTCACACCTTCGAGTGCATGGTAGGACTCAC  888

Query  889  ACTGGAGAGAAACCGTATCAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCTTTCAGATCTG-------CCT------------  943
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||.||       |||            
Sbjct  889  ACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTGAATAACCTTCAAAGTCATGA  962

Query  944  -----------CACAACTTCGAATCCA-TC--------------------GTAGGAT-----------------  968
                       ||||..|..||||.|| ||                    |||.|||                 
Sbjct  963  AAGGACACAAACACACATAAGAATACACTCTGGAGAAAGACGTTATAAATGTAAGATATGTGGGAAAGGCTTTT  1036

Query  969  ----------------------------------TCACACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTAAGAAATGT--G  1006
                                              |||||||||||||||||.|||||||||.|||.||.||  .
Sbjct 1037  ATTGTCCCAAATCATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACACTGGAGAGAAACTCTATGAATGCAAGCAACGTTCA  1110

Query 1007  GGAAAGCCTTCAGATATGTCCAG-AACTTTCGATTTCATGAAAGGACAAACAC---ACATAAG-------AAT-  1068
            |.|...||||||| ||..||||| ..||||.|||.||||||||||||..||||   |.|.|||       ||| 
Sbjct 1111  GTAGTTCCTTCAG-TAGTTCCAGTTCCTTTTGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAGCCCTATAAATG  1183

Query 1069  ---GCACTCTGGAGAAAGACCTTA--------------------------------------------------  1089
               |||.|.||| ||||| ||||.                                                  
Sbjct 1184  CGAGCAATGTGG-GAAAG-CCTTCAGAGCTGTGTCAATCCTTTGAATGCATGGTAGGACTCACCCTGAAGAGAA  1255

Query 1090  --------------------------------------------------------------------------  1089
                                                                                      
Sbjct 1256  ACCCTATGAGTGTGAGCAATGACGGAAAGCCTTCAGATCTGCCCCACACCTTTGAATACGTGGTAGGACACACA  1329

Query 1090  --------------------------------------------------------------------------  1089
                                                                                      
Sbjct 1330  ATGGAGAGAAGCCCTATGCATGTAAGGAATGTGGGAAACCCTTCGGATCTGCCCAGAACCTTCGAATTCATGAA  1403

Query 1090  ----------------  1089
                            
Sbjct 1404  AGGACACAAACACACA  1419