Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15236
- Subject:
- XM_006722873.4
- Aligned Length:
- 1854
- Identities:
- 1549
- Gaps:
- 216
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------------------AT------GGA 5
|| |||
Sbjct 1 ATGCCCTGCTGTAGTCACAGGAGGTGTAGAGAGGACCCCGGGACATCTGAAAGCCAGGAAATGATGTTTCAGGA 74
Query 6 CCCAGTGGCTTTTAAGGATGTGGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAGGA 79
|||||||||.|||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCCAGTGGCCTTTGATGATGTTGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAGGA 148
Query 80 AACTCTACAGGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTTTAGGAAAAAGGTGGAAAGACCAGAAC 153
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 149 AACTCTACAAGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTGTAGGAAAAAGTTGGAAAGACCAGAAC 222
Query 154 ATTGAATATGAGCACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTCTCATAGAAGAAAAAGTCAATGAAATTAAAGA 227
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATTGAATATGAGTACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTCTCATAGAAAAGAAAGTCAATGAAATTAAAGA 296
Query 228 TGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGACAGACTGAACTTCCAGGAGAAGAAAGCTTCTC 301
|||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCAGGTTCCAGATGACAGGCTGAACTTCCAGGAGAAGAAAGCTTCTC 370
Query 302 CTGAAGTAAAATCATGTGAAAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTTTAATATGAACATC 375
|||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTGAAATAAAATCATGTGACAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTTTAATATGAACATC 444
Query 376 AGAGGTGACATTGGACACAAGGCATATGAGTATCAGGAATATGGACCAAAGCCATGTAAGTGTCAACAACCTAA 449
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGAGGTGACATTGGACACAAGGCCTATGAGTATCAGGAATATGGACCGAAGCCATGTAAGTGTCAACAACCTAA 518
Query 450 AAAAGCCTTCAGATACCGCCCCTCCTTTAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAGAGAAACCCAATGCTTGTA 523
|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 519 AAAAGCCTTCAGATATCACCCCTCCTTTAGAACACCACAAAGGGATCACACTGGAGAGAAACCCTATGCTTGTA 592
Query 524 AAGTATGTGGAAAAACCTTTATTTCCCATTCAAGTGTTCGAAGACACATGGTAATGCACAGTGGGGATGGACCT 597
|||.||||||||||||.|||||||||||||||||..|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAGAATGTGGAAAAACTTTTATTTCCCATTCAAGCATTCAAAGACACGTGGTAATGCACAGTGGGGATGGACCT 666
Query 598 TATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGATTATATCTTATCCATGAAAGAATTCACACTGG 671
|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TATAAATGTAAATTTTGTGGGAAAGCCTTCCATTGTCTCAGTTTATATCTTATCCATGAAAGAATTCACACTGG 740
Query 672 AGAGAAACCATGTGAATGTAAACAGTGTGGTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATAAAAGAA 745
|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||..||||||
Sbjct 741 AGAGAAACCATATGAATGTAAACAATGTGGTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCTTCGAATACACGAAAGAA 814
Query 746 CTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATATCAGGAGTGTGGGAAAGCATTTCATAGTCCCAGATCCTATCGTAGA 819
|||||||||||||||||||||||||||.||||.|.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 815 CTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATGTCAGCAATGTGGGAAAGCATTTCATAGTCCCAGATGCTATCGTAGA 888
Query 820 CATGAAAGGATTCACATGGGAGAAAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCACGTGTCCCCGTTA 893
||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct 889 CATGAAAGGATTCACACGGGAGAGAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCACGTGTCCCCAGTA 962
Query 894 TGTTCGTATACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAATCTCTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCT 967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGTTCGTATACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAAACCCTATGAATGTACGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCT 1036
Query 968 CTCTTACAAGTTTTCAAACACACGTAAGATTGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGATATGTGGAAAA 1041
|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037 CTCTTACAAGTTTTCAAACACACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGATATGTGGGAAA 1110
Query 1042 GACTTTTGTTCTGTGAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAATTCACAGTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAAGCA 1115
|.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111 GGCTTTTGTTCTGCCAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACAGTGGAGAGAAACCCTATAAATGCAAGCA 1184
Query 1116 GTGTGGTAAAGCCTTCCCTCATTCCAGTTCCCTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATG 1189
.|||||||||||||||..||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ATGTGGTAAAGCCTTCATTCATTCCAGTTCCCTTCGTTATCATGAAAGGATTCACACTGGAGAGAAACCCTATG 1258
Query 1190 AGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCTCACACCTTCGAGTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAG 1263
|||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGTGTAAGCAATGTGGGAAGGCCTTCAGATCTTCCTCACACCTTCAATTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAG 1332
Query 1264 AAACCGTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTGAATAACCTTCAAAGTCATGAAAGGACACA 1337
||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AAGCCCTATGAATGTCAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTATGAAGAACCTTCAAAGTCATGAAAGGACACA 1406
Query 1338 AACACACATAAGAATACACTCTGGAGAAAGACGTTATAAATGTAAGATATGTGGGAAAGGCTTTTATTGTCCCA 1411
|||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AACACACGTAAGAATACACTCTGGAGAAAGACCTTATAAATGTAAGCTATGTGGGAAAGGCTTTTATTGTCCCA 1480
Query 1412 AATCATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACACTGGAGAGAAACTCTATGAATGCAAGCAACGTTCAGTAGTTCCT 1485
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||...|.|| |||
Sbjct 1481 AATCATTGCAAAGACATGAAAAAACTCACACTGGAGAGAAACTCTATGAATGCAAGCAATGTGGTGAAG--CCT 1552
Query 1486 TCAGTAGTTCCAGTTCCTTTTGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAGCCCTATAAATGCGAGCAATGT 1559
||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
Sbjct 1553 TCAGTAGTTCCAGTTCCTTTCGATACCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATAAATGCAAGCAATGT 1626
Query 1560 GGGAAAGCCTTCAGAGCTGTGTCAATCCTTTGAATGCATGGTAGGACTCACCCTGAAGAGAAACCCTATGAGTG 1633
|||||||||||||||||||..|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1627 GGGAAAGCCTTCAGAGCTGCCTCAGTCCTTCGAATGCATGGTAGGACTCACCCTGAAGATAAACCCTATGAGTG 1700
Query 1634 TGAGCAATGACGGAAAGCCTTCAGATCTGCCCCACACCTTTGAATACGTGGTAGGACACACAATGGAGAGAAGC 1707
|.|||||
Sbjct 1701 TAAGCAA------------------------------------------------------------------- 1707
Query 1708 CCTATGCATGTAAGGAATGTGGGAAACCCTTCGGATCTGCCCATAACCTTCAAAGTCATGAAAGGACACAAACA 1781
Sbjct 1708 -------------------------------------------------------------------------- 1707
Query 1782 CACA 1785
Sbjct 1708 ---- 1707