Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15287
- Subject:
- NM_001301306.1
- Aligned Length:
- 1210
- Identities:
- 742
- Gaps:
- 439
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 MASQLQVFSPPSVSSSAFCSAKKLKIEPSGWDVSGQSSNDKYYTHSKTLPATQGQASSSHQVANFNLPAYDQGL 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 LLPAPAVEHIVVTAADSSGSAATATFQSSQTLTHRSNVSLLEPYQKCGLKRKSEEVESNGSVQIIEEHPPLMLQ 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 NRTVVGAAATTTTVTTKSSSSSGEGDYQLVQHEILCSMTNSYEVLEFLGRGTFGQVAKCWKRSTKEIVAIKILK 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 NHPSYARQGQIEVSILSRLSSENADEYNFVRSYECFQHKNHTCLVFEMLEQNLYDFLKQNKFSPLPLKYIRPIL 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 QQVATALMKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPVRQPYRVKVIDFGSASHVSKAVCSTYLQSRYYRAPEIILGLPFC 370
Query 1 ------------------------MVLMFQIRYISQTQGLPAEYLLSAGTKTTRFFNRDPNLGYPLWRLKTPEE 50
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Sbjct 371 EAIDMWSLGCVIAELFLGWPLYPGASEYDQIRYISQTQGLPAEYLLSAGTKTTRFFNRDPNLGYPLWRLKTPEE 444
Query 51 HELETGIKSKEARKYIFNCLDDMAQVNMSTDLEGTDMLAEKADRREYIDLLKKMLTIDADKRITPLKTLNHQFV 124
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Sbjct 445 HELETGIKSKEARKYIFNCLDDMAQVNMSTDLEGTDMLAEKADRREYIDLLKKMLTIDADKRITPLKTLNHQFV 518
Query 125 TMTHLLDFPHSNHVKSCFQNMEICKRRVHMYDTVSQIKSPFTTHVAPNTSTNLTMSFSNQLNTVHNQASVLASS 198
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Sbjct 519 TMSHLLDFPHSSHVKSCFQNMEICKRRVHMYDTVSQIKSPFTTHVAPNTSTNLTMSFSNQLNTVHNQASVLASS 592
Query 199 STAAAATLSLANSDVSLLNYQSALYPSSAAPVPGVAQQGVSLQPGTTQICTQTDPFQQTFIVCPPAFQTGLQAT 272
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Sbjct 593 STAAAATLSLANSDVSLLNYQSALYPSSAAPVPGVAQQGVSLQPGTTQICTQTDPFQQTFIVCPPAFQTGLQAT 666
Query 273 TKHSGFPVRMDNAVPIVPQAPAAQPLQIQSGVLTQGSCTPLMVATLHPQVATITPQYAVPFTLSCAAGRPALVE 346
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Sbjct 667 TKHSGFPVRMDNAVPIVPQAPAAQPLQIQSGVLTQ--------------------------------------- 701
Query 347 QTAAVLQAWPGGTQQILLPSTWQQLPGVALHNSVQPTAMIPEAMGSGQQLADWRNAHSHGNQYSTIMQQPSLLT 420
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Sbjct 702 ------QAWPGGTQQILLPSAWQQLPGVALHNSVQPAAVIPEAMGSSQQLADWRNAHSHGNQYSTIMQQPSLLT 769
Query 421 NHVTLATAQPLNVGVAHVVRQQQSSSLPSKKNKQSAPVSSKSSLDVLPSQVYSLVGSSPLRTTSSYNSLVPVQD 494
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Sbjct 770 NHVTLATAQPLNVGVAHVVRQQQSSSLPSKKNKQSAPVSSKSSLEVLPSQVYSLVGSSPLRTTSSYNSLVPVQD 843
Query 495 QHQPIIIPDTPSPPVSVITIRSDTDEEEDNKYKPSSSGLKPRSNVISYVTVNDSPDSDSSLSSPYSTDTLSALR 568
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Sbjct 844 QHQPIIIPDTPSPPVSVITIRSDTDEEEDNKYKPNSSSLKARSNVISYVTVNDSPDSDSSLSSPHPTDTLSALR 917
Query 569 GNSGSVLEGPGRVVADGTGTRTIIVPPLKTQLGDCTVATQASGLLSNKTKPVASVSGQSSGCCITPTGYRAQRG 642
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Sbjct 918 GNSGTLLEGPGRPAADGIGTRTIIVPPLKTQLGDCTVATQASGLLSSKTKPVASVSGQSSGCCITPTGYRAQRG 991
Query 643 GTSAAQPLNLSQNQQSSVAPTSQERSSNPAPRRQQAFVAPLSQAPYTFQHGSPLHSTGHPHLAPAPAHLPSQAH 716
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Sbjct 992 GASAVQPLNLSQNQQSSSASTSQERSSNPAPRRQQAFVAPLSQAPYAFQHGSPLHSTGHPHLAPAPAHLPSQPH 1065
Query 717 LYTYAAPTSAAALGSTSSIAHLFSPQGSSRHAAAYTTHPSTLVHQVPVSVGPSLLTSASVAPAQYQHQFATQSY 790
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Sbjct 1066 LYTYAAPTSAAALGSTSSIAHLFSPQGSSRHAAAYTTHPSTLVHQVPVSVGPSLLTSASVAPAQYQHQFATQSY 1139
Query 791 IGSSRGSTIYTGYPLSPTKISQYSYL 816
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Sbjct 1140 IGSSRGSTIYTGYPLSPTKISQYSYL 1165