Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15287
- Subject:
- XM_011240024.1
- Aligned Length:
- 3630
- Identities:
- 2128
- Gaps:
- 1284
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCCTCACAGCTGCAGGTGTTTTCGCCCCCATCAGTGTCGTCGAGTGCCTTCTGCAGTGCAAAGAAACTGAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AATAGAGCCCTCTGGCTGGGATGTTTCAGGACAGAGCAGCAACGACAAATACTATACCCACAGCAAAACCCTCC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CAGCTACACAAGGGCAAGCCAGCTCCTCTCACCAGGTAGCAAATTTCAATCTTCCTGCTTACGACCAGGGCCTC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CTTCTCCCAGCTCCTGCCGTGGAGCATATTGTGGTAACAGCTGCTGATAGCTCAGGCAGCGCCGCTACAGCAAC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 CTTCCAAAGCAGCCAGACCCTGACTCACAGGAGCAACGTTTCTTTGCTTGAGCCATATCAAAAATGTGGATTGA 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 AGAGAAAGAGTGAGGAAGTGGAGAGCAACGGTAGCGTGCAGATCATAGAAGAACACCCCCCTCTCATGCTGCAG 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 AACAGAACCGTGGTGGGTGCTGCTGCCACGACCACCACTGTGACCACCAAGAGTAGCAGTTCCAGCGGAGAAGG 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 GGATTACCAGCTGGTCCAGCATGAGATCCTTTGCTCTATGACCAACAGCTATGAAGTCCTGGAGTTCCTAGGCC 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 GGGGGACATTTGGACAGGTGGCAAAGTGCTGGAAGCGGAGCACCAAGGAAATTGTGGCCATTAAGATCTTGAAG 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 AACCACCCCTCCTATGCCAGACAAGGACAGATTGAAGTGAGCATCCTTTCCCGCCTAAGCAGTGAAAATGCTGA 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 TGAGTATAACTTTGTCCGTTCTTATGAGTGTTTTCAGCACAAGAATCATACCTGCCTTGTGTTTGAGATGTTGG 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 AGCAGAACTTGTACGATTTTCTAAAGCAGAACAAGTTTAGCCCACTGCCACTCAAGTACATAAGACCAATCTTG 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 CAGCAGGTGGCCACAGCCCTGATGAAGCTGAAGAGTCTTGGTCTGATTCATGCTGACCTTAAACCTGAAAACAT 962
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 963 AATGCTAGTCGATCCAGTTCGCCAACCCTACCGAGTGAAGGTCATTGACTTTGGTTCTGCTAGTCATGTTTCCA 1036
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1037 AAGCCGTGTGTTCAACCTACCTGCAATCACGCTACTACAGAGCTCCTGAAATTATCCTTGGATTACCATTCTGT 1110
Query 1 -----------------------------------------------------ATGG----TTT----TGATGT 13
|||| ||| ||.||.
Sbjct 1111 GAAGCTATTGACATGTGGTCACTGGGCTGTGTAATAGCTGAGCTGTTCCTGGGATGGCCTCTTTATCCTGGTGC 1184
Query 14 T-----------TCAGATTCGTTATATTTCACAAACACAAGGCTTGCCAGCTGAATATCTTCTCAGTGCCGGAA 76
| |||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTCAGAATACGATCAGATTCGCTATATTTCACAAACACAAGGCCTGCCAGCTGAGTATCTTCTCAGTGCCGGAA 1258
Query 77 CAAAAACAACCAGGTTTTTCAACAGAGATCCTAATTTGGGGTACCCACTGTGGAGGCTTAAGACACCTGAAGAA 150
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAAAAACAACCAGGTTTTTTAACAGAGATCCTAATTTGGGGTACCCACTGTGGAGGCTTAAGACACCTGAAGAA 1332
Query 151 CATGAACTGGAGACTGGAATAAAATCAAAAGAAGCTCGGAAGTACATTTTTAATTGCTTAGATGACATGGCTCA 224
||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1333 CATGAATTGGAAACTGGAATAAAGTCAAAAGAAGCTCGGAAGTACATTTTTAACTGTTTAGATGACATGGCTCA 1406
Query 225 GGTGAATATGTCTACGGACCTGGAGGGAACAGACATGTTGGCAGAGAAGGCAGACCGAAGAGAATACATTGATC 298
|||.|||||||||||.|||.|.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct 1407 GGTAAATATGTCTACAGACTTAGAGGGGACAGATATGTTAGCAGAGAAAGCAGATCGGAGAGAGTATATTGATC 1480
Query 299 TGTTAAAGAAAATGCTCACAATTGATGCAGATAAGAGAATTACCCCTCTAAAAACTCTTAACCATCAGTTTGTG 372
|..|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 1481 TTCTAAAGAAAATGCTGACGATTGATGCAGATAAGAGAATCACGCCTCTGAAGACTCTTAACCACCAATTTGTG 1554
Query 373 ACAATGACTCACCTTTTGGATTTTCCACATAGCAATCATGTTAAGTCTTGTTTTCAGAACATGGAGATCTGCAA 446
||.||||.||||||..||||.|||||.||.||||..||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ACGATGAGTCACCTCCTGGACTTTCCTCACAGCAGCCACGTTAAGTCCTGTTTCCAGAACATGGAGATCTGCAA 1628
Query 447 GCGGAGGGTTCACATGTATGATACAGTGAGTCAGATCAAGAGTCCCTTCACTACACATGTTGCCCCAAATACAA 520
|||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1629 GCGGAGGGTTCACATGTATGACACA------------------------------------------------- 1653
Query 521 GCACAAATCTAACCATGAGCTTCAGCAATCAGCTCAATACAGTGCACAATCAGGCCAGTGTTCTAGCTTCCAGT 594
||||||||||||||||||||.
Sbjct 1654 -----------------------------------------------------GCCAGTGTTCTAGCTTCCAGC 1674
Query 595 TCTACTGCAGCAGCTGCTACTCTTTCTCTGGCTAATTCAGATGTCTCACTACTAAACTACCAGTCAGCTTTGTA 668
||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1675 TCTACTGCAGCAGCAGCTACCCTTTCTCTGGCTAATTCAGATGTCTCGCTGCTAAACTACCAATCGGCTTTGTA 1748
Query 669 CCCATCATCTGCTGCACCAGTTCCTGGAGTTGCCCAGCAGGGTGTTTCCTTGCAGCCTGGAACCACCCAGATTT 742
||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1749 CCCATCGTCGGCAGCGCCAGTTCCTGGAGTTGCCCAGCAGGGTGTTTCCTTACAACCTGGAACCACCCAGATCT 1822
Query 743 GCACTCAGACAGATCCATTCCAACAGACATTTATAGTATGTCCACCTGCGTTTCAAACTGGACTACAAGCAACA 816
||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1823 GCACTCAGACAGATCCATTCCAGCAAACATTTATAGTATGCCCACCTGCTTTTCAGACTGGACTACAAGCAACA 1896
Query 817 ACAAAGCATTCTGGATTCCCTGTGAGGATGGATAATGCTGTACCAATTGTACCCCAGGCACCAGCTGCTCAGCC 890
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1897 ACAAAGCATTCTGGATTCCCTGTGAGGATGGATAATGCTGTGCCAATTGTACCCCAGGCGCCTGCTGCTCAGCC 1970
Query 891 ACTACAGATTCAGTCAGGAGTTCTCACGCAGGGAAGCTGTACACCACTAATGGTAGCAACTCTCCACCCTCAAG 964
.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1971 GCTGCAGATCCAGTCAGGAGTACTCACACAGGGAAGCTGTACACCACTAATGGTAGCAACTCTCCACCCTCAAG 2044
Query 965 TAGCCACCATCACACCGCAGTATGCGGTGCCCTTTACTCTGAGCTGCGCAGCCGGCCGGCCGGCGCTGGTTGAA 1038
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2045 TAGCCACCATCACGCCGCAGTATGCGGTGCCCTTTACCCTGAGCTGCGCAGCAGGCCGGCCGGCGCTGGTTGAA 2118
Query 1039 CAGACTGCCGCTGTACTGCAGGCGTGGCCTGGAGGGACTCAGCAAATTCTCCTGCCTTCAACTTGGCAACAGTT 1112
||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||.|.|||||.|||.|
Sbjct 2119 CAGACTGCTGCTGTACTGCAAGCCTGGCCTGGAGGAACCCAACAAATTCTCCTGCCTTCAGCCTGGCAGCAGCT 2192
Query 1113 GCCTGGGGTAGCTCTACACAACTCTGTCCAGCCCACAGCAATGATTCCAGAGGCCATGGGGAGTGGACAGCAGC 1186
|||.|||||||||||.|||||||||||||||||..|.|||.||||||||||||||||||||||..|.||.||||
Sbjct 2193 GCCCGGGGTAGCTCTGCACAACTCTGTCCAGCCTGCTGCAGTGATTCCAGAGGCCATGGGGAGCAGCCAACAGC 2266
Query 1187 TAGCTGACTGGAGGAATGCCCACTCTCATGGCAACCAGTACAGCACTATCATGCAGCAGCCATCCTTGCTGACT 1260
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 2267 TAGCTGACTGGAGGAATGCCCACTCTCATGGCAACCAGTACAGCACTATTATGCAGCAGCCATCTTTGCTGACC 2340
Query 1261 AACCATGTGACATTGGCCACTGCTCAGCCTCTGAATGTTGGTGTTGCCCATGTTGTCAGACAACAACAATCCAG 1334
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 2341 AACCATGTGACCTTGGCCACTGCTCAGCCTCTGAATGTTGGTGTTGCCCATGTTGTCAGACAACAACAGTCTAG 2414
Query 1335 TTCCCTCCCTTCGAAGAAGAATAAGCAGTCAGCTCCAGTCTCTTCCAAGTCCTCTCTAGATGTTCTGCCTTCCC 1408
||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.||||||||.|
Sbjct 2415 TTCCCTCCCTTCAAAGAAGAATAAGCAGTCTGCTCCAGTTTCATCCAAATCCTCTCTGGAAGTCCTGCCTTCTC 2488
Query 1409 AAGTCTATTCTCTGGTTGGGAGCAGTCCCCTCCGCACCACATCTTCTTATAATTCCTTGGTCCCTGTCCAAGAT 1482
||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||.
Sbjct 2489 AAGTTTATTCTCTGGTTGGGAGTAGTCCTCTTCGTACCACATCTTCTTATAATTCCCTAGTTCCTGTCCAAGAC 2562
Query 1483 CAGCATCAGCCCATCATCATTCCAGATACTCCCAGCCCTCCTGTGAGTGTCATCACTATCCGAAGTGACACTGA 1556
|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2563 CAGCATCAGCCAATCATCATTCCAGATACCCCCAGCCCTCCTGTGAGTGTCATCACTATCCGTAGTGACACTGA 2636
Query 1557 TGAGGAAGAGGACAACAAATACAAGCCCAGTAGCTCTGGACTGAAGCCAAGGTCTAATGTCATCAGTTATGTCA 1630
|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||..|.||||||.|.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2637 TGAAGAAGAGGACAACAAATACAAGCCCAATAGCTCGAGCCTGAAGGCGAGGTCTAATGTCATCAGTTATGTCA 2710
Query 1631 CTGTCAATGATTCTCCTGACTCTGACTCTTCTTTGAGCAGCCCTTATTCCACTGATACCCTGAGTGCTCTCCGA 1704
||||||||||||||||.|||||||||||.||..||||||||||..||.||||.||.||.|||||||||||.||.
Sbjct 2711 CTGTCAATGATTCTCCAGACTCTGACTCCTCCCTGAGCAGCCCACATCCCACAGACACTCTGAGTGCTCTGCGG 2784
Query 1705 GGCAATAGTGGATCCGTTTTGGAGGGGCCTGGCAGAGTTGTGGCAGATGGCACTGGCACCCGCACTATCATTGT 1778
|||||.|||||..||.||.|||||||.|||||||||..||..||||||||||.|||||||||.|||||||||||
Sbjct 2785 GGCAACAGTGGGACCCTTCTGGAGGGACCTGGCAGACCTGCAGCAGATGGCATTGGCACCCGTACTATCATTGT 2858
Query 1779 GCCTCCACTGAAAACTCAGCTTGGTGACTGCACTGTAGCAACCCAGGCCTCAGGTCTCCTGAGCAATAAGACTA 1852
||||||..|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||.||||||.|
Sbjct 2859 GCCTCCTTTGAAAACACAGCTTGGCGACTGCACTGTAGCAACACAGGCCTCAGGTCTCCTTAGCAGTAAGACCA 2932
Query 1853 AGCCAGTCGCTTCAGTGAGTGGGCAGTCATCTGGATGCTGTATCACCCCCACAGGGTATCGAGCTCAACGCGGG 1926
|||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 2933 AGCCAGTGGCCTCAGTGAGTGGGCAGTCATCTGGATGCTGTATCACTCCCACGGGGTACCGGGCTCAGCGAGGG 3006
Query 1927 GGGACCAGTGCAGCACAACCACTCAATCTTAGCCAGAACCAGCAGTCATCGGTGGCTCCAACCTCACAGGAGAG 2000
||..||||.||.|..||.||||||||.||||||||||||||||||||||||...|||.|||||||.|||||.||
Sbjct 3007 GGAGCCAGCGCGGTGCAGCCACTCAACCTTAGCCAGAACCAGCAGTCATCGTCAGCTTCAACCTCGCAGGAAAG 3080
Query 2001 AAGCAGCAACCCAGCCCCCCGCAGGCAGCAGGCGTTTGTGGCCCCTCTCTCCCAAGCCCCCTACACCTTCCAGC 2074
||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 3081 AAGCAGCAACCCTGCTCCCCGCAGACAGCAGGCATTTGTGGCCCCGCTCTCCCAAGCCCCCTACGCCTTCCAGC 3154
Query 2075 ATGGCAGCCCGCTACACTCGACAGGGCACCCACACCTTGCCCCGGCCCCTGCTCACCTGCCAAGCCAGGCTCAT 2148
||||||||||.||.||||||||.||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct 3155 ATGGCAGCCCACTGCACTCGACGGGGCACCCACACTTGGCCCCAGCCCCTGCTCACCTGCCAAGCCAGCCTCAC 3228
Query 2149 CTGTATACGTATGCTGCCCCGACTTCTGCTGCTGCACTGGGCTCAACCAGCTCCATTGCTCATCTTTTCTCCCC 2222
|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 3229 CTGTATACGTACGCTGCCCCCACTTCTGCTGCTGCATTGGGCTCCACCAGTTCCATTGCTCATCTGTTCTCCCC 3302
Query 2223 ACAGGGTTCCTCAAGGCATGCTGCAGCCTATACCACTCACCCTAGCACTTTGGTGCACCAGGTCCCTGTCAGTG 2296
.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 3303 CCAGGGTTCCTCAAGGCATGCTGCAGCTTATACCACACACCCTAGCACTCTGGTGCATCAGGTTCCTGTCAGTG 3376
Query 2297 TTGGGCCCAGCCTCCTCACTTCTGCCAGCGTGGCCCCTGCTCAGTACCAACACCAGTTTGCCACCCAATCCTAC 2370
|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 3377 TCGGGCCCAGCCTCCTCACTTCTGCCAGTGTGGCCCCTGCTCAGTACCAACACCAGTTTGCCACTCAGTCCTAC 3450
Query 2371 ATTGGGTCTTCCCGAGGCTCAACAATTTACACTGGATACCCGCTGAGTCCTACCAAGATCAGCCAGTATTCCTA 2444
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 3451 ATCGGGTCTTCCCGAGGCTCAACAATTTACACTGGATACCCGCTGAGTCCTACCAAGATCAGTCAGTATTCTTA 3524
Query 2445 CTTA 2448
|||.
Sbjct 3525 CTTG 3528
