Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15293
- Subject:
- XM_017016013.2
- Aligned Length:
- 1248
- Identities:
- 979
- Gaps:
- 264
Alignment
Query 1 ATGGCAACAGAGCCACCATCCCCCCTCCGGGTCGAGGCGCCGGGCCCCCCAGAAATGCGGACCTCACCGGCGAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGAGTCCACCCCTGAGGGCACCCCGCAGCCGGCGGGCGGCAGACTCCGCTTCCTCAACGGCTGCGTGCCCCTCT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CGCATCAGGTGGCCGGGCACATGTACGGGAAGGACAAAGTGGGTATACTGCAACATCCAGATGGCACAGTTTTG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AAACAGTTACAACCACCTCCAAGGGGCCCAAGAGAGCTGGAATTCTATAATATGGTTTATGCTGCTGACTGTTT 296
||..|| |.|..|||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------------ATGGTA-AGTGAGGTTTATGCTGCTGACTGTTT 32
Query 297 TGATGGTGTTCTTCTAGAGCTACGAAAATATTTGCCAAAATATTATGGCATCTGGTCACCTCCCACTGCACCAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 33 TGATGGTGTTCTTCTAGAGCTACGAAAATATTTGCCAAAATATTATGGCATCTGGTCACCTCCCACTGCACCAA 106
Query 371 ACGATTTATACCTAAAACTGGAAGATGTGACCCATAAATTTAATAAGCCCTGTATAATGGATGTAAAGATAGGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 107 ACGATTTATACCTAAAACTGGAAGATGTGACCCATAAATTTAATAAGCCCTGTATAATGGATGTAAAGATAGGG 180
Query 445 CAAAAAAGCTATGATCCTTTTGCCTCATCTGAGAAGATTCAGCAACAGGTCAGCAAGTACCCATTAATGGAAGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CAAAAAAGCTATGATCCTTTTGCCTCATCTGAGAAGATTCAGCAACAGGTCAGCAAGTACCCATTAATGGAAGA 254
Query 519 GATTGGGTTCTTGGTGCTTGGCATGAGGGTTTATCATGTTCATTCCGATAGCTATGAGACAGAAAACCAGCATT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 255 GATTGGGTTCTTGGTGCTTGGCATGAGGGTTTATCATGTTCATTCCGATAGCTATGAGACAGAAAACCAGCATT 328
Query 593 ACGGAAGAAGCTTAACAAAAGAAACTATAAAGGATGGAGTCTCCAGATTTTTTCATAATGGGTACTGCTTAAGA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 329 ACGGAAGAAGCTTAACAAAAGAAACTATAAAGGATGGAGTCTCCAGATTTTTTCATAATGGGTACTGCTTAAGA 402
Query 667 AAAGATGCTGTTGCTGCCAGTATTCAGAAGATTGAGAAAATTCTGCAGTGGTTTGAAAACCAGAAGCAGCTTAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 403 AAAGATGCTGTTGCTGCCAGTATTCAGAAGATTGAGAAAATTCTGCAGTGGTTTGAAAACCAGAAGCAGCTTAA 476
Query 741 TTTTTACGCAAGTTCATTACTCTTTGTTTATGAAGGTTCATCTCAGCCAACCACTACAAAATTGAATGACAGAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 TTTTTACGCAAGTTCATTACTCTTTGTTTATGAAGGTTCATCTCAGCCAACCACTACAAAATTGAATGACAGAA 550
Query 815 CTTTGGCAGAAAAGTTTTTGTCCAAAGGACAACTGTCAGACACAGAAGTACTAGAGTACAATAATAACTTTCAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 551 CTTTGGCAGAAAAGTTTTTGTCCAAAGGACAACTGTCAGACACAGAAGTACTAGAGTACAATAATAACTTTCAT 624
Query 889 GTGTTAAGTTCCACAGCTAATGGAAAAATAGAGTCTTCAGTGGGCAAAAGCTTGTCCAAGATGTATGCGCGTCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 625 GTGTTAAGTTCCACAGCTAATGGAAAAATAGAGTCTTCAGTGGGCAAAAGCTTGTCCAAGATGTATGCGCGTCA 698
Query 963 CAGGAAAATATATACAAAAAAGCATCACAGTCAGACTTCATTGAAAGTTGAAAATCTGGAGCAAGACAATGGGT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 699 CAGGAAAATATATACAAAAAAGCATCACAGTCAGACTTCATTGAAAGTTGAAAATCTGGAGCAAGACAATGGGT 772
Query 1037 GGAAAAGCATGTCACAGGAACATTTAAATGGAAATGTACTTTCCCAACTGGAAAAAGTTTTCTACCATCTTCCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 773 GGAAAAGCATGTCACAGGAACATTTAAATGGAAATGTACTTTCCCAACTGGAAAAAGTTTTCTACCATCTTCCC 846
Query 1111 ACTGGTTGCCAAGAGATTGCTGAAGTAGAAGTGCGAATGATAGATTTTGCTCATGTGTTCCCTAGCAACACAAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 847 ACTGGTTGCCAAGAGATTGCTGAAGTAGAAGTGCGAATGATAGATTTTGCTCATGTGTTCCCTAGCAACACAAT 920
Query 1185 AGATGAGGGATATGTTTATGGGCTAAAGCATTTAATTTCTGTACTTCGAAGTATTTTAGACAAT 1248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 921 AGATGAGGGATATGTTTATGGGCTAAAGCATTTAATTTCTGTACTTCGAAGTATTTTAGACAAT 984