Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15308
- Subject:
- NM_001346911.1
- Aligned Length:
- 1143
- Identities:
- 940
- Gaps:
- 198
Alignment
Query 1 ATGGAAAAGTATGAAAAATTAGCTAAGACTGGAGAAGGGTCTTATGGGGTTGTATTCAAATGCAGAAACAAAAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAAAAGTATGAAAAATTAGCTAAGACTGGAGAAGGGTCTTATGGGGTTGTATTCAAATGCAGAAACAAAAC 74
Query 75 CTCTGGACAAGTAGTAGCTGTTAAAAAATTTGTGGAATCTGAAGATGATCCTGTTGTTAAGAAAATAGCACTAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTCTGGACAAGTAGTAGCTGTTAAAAAATTTGTGGAATCTGAAGATGATCCTGTTGTTAAGAAAATAGCACTAA 148
Query 149 GAGAAATACGTATGTTGAAGCAAATTAAAACAATNCCAAATCTTGTGAACCTCATCGAAGGTGTTCAGGAGAAA 222
||||||||||||||||||||| |||||||||| .|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 149 GAGAAATACGTATGTTGAAGC-AATTAAAACA--TCCAAATCTTGTGAACCTCATCG-AGGTGTTCAGGAG-AA 217
Query 223 AAAGGAAAATGCATTTAGTTTTTGAATACTGTGATCATACACTTTTAAATGAGCTGGAAAGAAACCCAAATGGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 218 AAAGGAAAATGCATTTAGTTTTTGAATACTGTGATCATACACTTTTAAATGAGCTGGAAAGAAACCCAAATGGA 291
Query 297 GTTGCTGATGGAGTGATCAAAAGCGTATTATGGCAAACACTTCAAGCTCTTAATTTCTGTCATATACATAACTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 292 GTTGCTGATGGAGTGATCAAAAGCGTATTATGGCAAACACTTCAAGCTCTTAATTTCTGTCATATACATAACTG 365
Query 371 TATTCACAGAGATATAAAACCTGAAAATATTCTAATAACTAAGCAAGGAATAATCAAGATTTGTGACTTCGGGT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366 TATTCACAGAGATATAAAACCTGAAAATATTCTAATAACTAAGCAAGGAATAATCAAGATTTGTGACTTCGGGT 439
Query 445 TTGCACAAATTCTGATTCCAGGAGATGCCTACACCGATTATGTAGCTACGAGATGGTACCGAGCTCCTGAACTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 440 TTGCACAAATTCTGATTCCAGGAGATGCCTACACCGATTATGTAGCTACGAGATGGTACCGAGCTCCTGAACTT 513
Query 519 CTTGTGGGAGATACTCAGTATGGTTCTTCAGTCGATATATGGGCTATTGGTTGTGTTTTTGCAGAGCTCCTGAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514 CTTGTGGGAGATACTCAGTATGGTTCTTCAGTCGATATATGGGCTATTGGTTGTGTTTTTGCAGAGCTCCTGAC 587
Query 593 AGGCCAGCCACTGTGGCCTGGAAAATCAGATGTGGACCAACTTTATCTGATAATCAGAACACTAGGAAAATTAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 588 AGGCCAGCCACTGTGGCCTGGAAAATCAGATGTGGACCAACTTTATCTGATAATCAGAACACTAGGAAAATTAA 661
Query 667 TCCCAAGACATCAATCAATCTTTAAAAGTAACGGGTTTTTCCATGGCATCAGTATACCTGAGCCAGAAGACATG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662 TCCCAAGACATCAATCAATCTTTAAAAGTAACGGGTTTTTCCATGGCATCAGTATACCTGAGCCAGAAGACATG 735
Query 741 GAAACTCTTGAGGAAAAGTTCTCAGATGTTCATCCTGTGGCTTCTGAACTTCATGAANGGNTGTCTGAAGATGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 736 GAAACTCTTGAGGAAAAGTTCTCAGATGTTCATCCTGTGGC-TCTGAACTTCATGAAGGGGTGTCTGAAGATGA 808
Query 815 ATCCAGATGACAGATTAACCTGTTCCCAACTCCTGGAGAGCTCCTACTTTGATTCTTTTCAAGAGGCCCAAATT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 809 ATCCAGATGACAGATTAACCTGTTCCCAACTCCTGGAGAGCTCCTACTTTGATTCTTTTCAAGAGGCCCAAATT 882
Query 889 AAAAGAAAAGCACGTAATGAAGGAAGAAACAGAAGACGCCAA---CAGGTAC------------TTCC------ 941
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||.|| ||||
Sbjct 883 AAAAGAAAAGCACGTAATGAAGGAAGAAACAGAAGACGCCAACAGCAGGCACCTAAGTCTGCCTTTCCTAGGCT 956
Query 942 ---GCTCAAAA--------------GT----------------------------------------------- 951
.||||||| ||
Sbjct 957 TTTTCTCAAAACCAAGATCTGCCAGGTACAAAGGAATGAAACCCAGACATCTGGGAACCAAATTCTACCCAATG 1030
Query 952 -------------------------------------------------------------------------- 951
Sbjct 1031 GGCCAATATTGCAGAACAGTATGGTGACTGTTATGACAAACATTAATTCTGCAGTTTATCAGGTGACTGTCCTT 1104
Query 952 --------------------------------- 951
Sbjct 1105 CACTTGCTTTCAGAAAACTTTGAAGTTAAATCG 1137