Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15319
• Subject: NM_001204118.1
• Aligned Length: 1135
• Identities: 1134
• Gaps: 1

Alignment

Query    1  ATGCATAATCTGTATTCCATCACTGGGTACCCGGACCCACCAGGGACCATGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCATAATCTGTATTCCATCACTGGGTACCCGGACCCACCAGGGACCATGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGA  74

Query   75  CTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCAGGGACCATGGAGGAGGAGGAGGAGGATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCAGGGACCATGGAGGAGGAGGAGGAGGATG  148

Query  149  ATGACTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCCAGGGACCATGGAGGAGGAGGAGGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGACTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAG-CCAGGGACCATGGAGGAGGAGGAGGA  221

Query  223  GGATGATGACTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCAGGTTCAAGTGCTCCACCAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  GGATGATGACTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCAGGTTCAAGTGCTCCACCAA  295

Query  297  GACCTCCAAGGGCAGCAAAGGAAACAGAGAAACCCCCACTTCCTTGCAAGCCCCGGAACATGACAGGCCTGGAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  GACCTCCAAGGGCAGCAAAGGAAACAGAGAAACCCCCACTTCCTTGCAAGCCCCGGAACATGACAGGCCTGGAC  369

Query  371  CTCGCCGCTGTCACCTGTCCACCTCCTCAACTGGCTGTGAATCTTGAGCCTTCTCCATTGCAGCCATCCCTGGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  CTCGCCGCTGTCACCTGTCCACCTCCTCAACTGGCTGTGAATCTTGAGCCTTCTCCATTGCAGCCATCCCTGGC  443

Query  445  CGCAACTCCAGTCCCCTGGCTCAATCAGAGGTCTGGAGGTCCTGGCTGCTGCCAGAAGAGGTGGATGGTGTACC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  CGCAACTCCAGTCCCCTGGCTCAATCAGAGGTCTGGAGGTCCTGGCTGCTGCCAGAAGAGGTGGATGGTGTACC  517

Query  519  TGTGTCTGCTGGTGGTGACTTCCCTGTTCCTGGGCTGCCTTGGTCTCACTGTGACCCTGATTAAGTACCAGGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  TGTGTCTGCTGGTGGTGACTTCCCTGTTCCTGGGCTGCCTTGGTCTCACTGTGACCCTGATTAAGTACCAGGAG  591

Query  593  TTGATGGAAGAACTGAGAATGTTAAGCTTTCAGCAGATGACGTGGCGAACAAATATGACTGGCATGGCAGGGCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  TTGATGGAAGAACTGAGAATGTTAAGCTTTCAGCAGATGACGTGGCGAACAAATATGACTGGCATGGCAGGGCT  665

Query  667  AGCTGGCCTGAAGCATGACATTGCCCGTGTAAGAGCTGACACCAACCAGTCCCTGGTGGAACTTTGGGGCTTAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  AGCTGGCCTGAAGCATGACATTGCCCGTGTAAGAGCTGACACCAACCAGTCCCTGGTGGAACTTTGGGGCTTAT  739

Query  741  TAGACTGCCGCCGAATTACCTGTCCTGAAGGCTGGCTGCCCTTTGAGGGCAAGTGTTACTACTTCTCCCCAAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  TAGACTGCCGCCGAATTACCTGTCCTGAAGGCTGGCTGCCCTTTGAGGGCAAGTGTTACTACTTCTCCCCAAGC  813

Query  815  ACCAAGTCATGGGATGAGGCCCGGATGTTCTGCCAGGAGAATTACTCTCACTTGGTCATCATCAATAGCTTTGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  ACCAAGTCATGGGATGAGGCCCGGATGTTCTGCCAGGAGAATTACTCTCACTTGGTCATCATCAATAGCTTTGC  887

Query  889  TGAGCACAATTTTGTGGCCAAGGCCCATGGCTCTCCACGGGTGTACTGGCTGGGGCTGAATGACAGGGCCCAGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  TGAGCACAATTTTGTGGCCAAGGCCCATGGCTCTCCACGGGTGTACTGGCTGGGGCTGAATGACAGGGCCCAGG  961

Query  963  AAGGGGACTGGAGGTGGCTGGATGGGTCTCCTGTGACATTAAGCTTCTGGGAGCCAGAGGAACCCAATAACATC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  AAGGGGACTGGAGGTGGCTGGATGGGTCTCCTGTGACATTAAGCTTCTGGGAGCCAGAGGAACCCAATAACATC  1035

Query 1037  CACGATGAGGACTGTGCTACCATGAACAAAGGTGGCACCTGGAATGATCTCTCTTGCTACAAAACTACGTATTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  CACGATGAGGACTGTGCTACCATGAACAAAGGTGGCACCTGGAATGATCTCTCTTGCTACAAAACTACGTATTG  1109

Query 1111  GATTTGTGAGCGGAAATGTTCCTGT  1135
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  GATTTGTGAGCGGAAATGTTCCTGT  1134