Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15373
- Subject:
- NM_007600.3
- Aligned Length:
- 2148
- Identities:
- 1842
- Gaps:
- 15
Alignment
Query 1 ATGTCGGAGGAGATCATCACGCCGGTGTACTGCACTGGGGTGTCAGCCCAAGTGCAGAAGCAGCGGGCCAGGGA 74
|||.|.||||||.|.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||.||.|||
Sbjct 1 ATGACAGAGGAGTTAATCACCCCTGTGTACTGCACCGGGGTGTCAGCCCAAGTACAGAAGAAGCGGGACAAGGA 74
Query 75 GCTGGGCCTGGGCCGCCATGAGAATGCCATCAAGTACCTGGGCCAGGATTATGAGCAGCTGCGGGTGCGATGCC 148
|||||||.|||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||...|||.||||...||||||
Sbjct 75 GCTGGGCTTGGGCCGCCATGAAAACGCCATCAAGTACCTGGGCCAGGATTATGAAACGCTTCGGGCAAGATGCC 148
Query 149 TGCAGAGTGGGACCCTCTTCCGTGATGAGGCCTTCCCCCCGGTACCCCAGAGCCTGGGTTACAAGGACCTGGGT 222
|||||||||||..||||||||..||.|||||||||||.|||||..|.||.||||||||.|.||||||.||||||
Sbjct 149 TGCAGAGTGGGGTCCTCTTCCAAGACGAGGCCTTCCCTCCGGTTTCTCATAGCCTGGGCTTCAAGGAACTGGGT 222
Query 223 CCCAATTCCTCCAAGACCTATGGCATCAAGTGGAAGCGTCCCACGGAACTGCTGTCAAACCCCCAGTTCATTGT 296
||..|||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 CCTCATTCCTCTAAAACCTATGGCATCAAATGGAAGCGGCCTACGGAACTGATGTCAAACCCCCAGTTCATCGT 296
Query 297 GGATGGAGCTACCCGCACAGACATCTGCCAGGGAGCACTGGGGGACTGCTGGCTCTTGGCGGCCATCGCCTCCC 370
|||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||.|||||||
Sbjct 297 GGATGGAGCCACCCGGACAGACATCTGCCAGGGAGCACTGGGGGACTGTTGGCTCCTGGCTGCCATTGCCTCCC 370
Query 371 TCACTCTCAACGACACCCTCCTGCACCGAGTGGTTCCGCACGGCCAGAGCTTCCAGAATGGCTATGCCGGCATC 444
||||.||||||||.||..|.|||||||||||||||||..|||||||||||||.|||.|||||||.||.||||||
Sbjct 371 TCACCCTCAACGAGACTATTCTGCACCGAGTGGTTCCCTACGGCCAGAGCTTTCAGGATGGCTACGCTGGCATC 444
Query 445 TTCCATTTCCAGCTGTGGCAATTTGGGGAGTGGGTGGACGTGGTCGTGGATGACCTGCTGCCCATCAAGGACGG 518
||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct 445 TTTCATTTCCAGCTGTGGCAGTTCGGGGAGTGGGTCGACGTGGTCATAGATGACTTGCTGCCCACCAAGGACGG 518
Query 519 GAAGCTAGTGTTCGTGCACTCTGCCGAAGGCAACGAGTTCTGGAGCGCCCTGCTTGAGAAGGCCTATGCCAAGG 592
||||||.||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 519 GAAGCTGGTGTTCGTGCACTCTGCCCAGGGCAACGAATTCTGGAGCGCACTGCTGGAGAAAGCCTATGCTAAAG 592
Query 593 TAAATGGCAGCTACGAGGCCCTGTCAGGGGGCAGCACCTCAGAGGGCTTTGAGGACTTCACAGGCGGGGTTACC 666
|.|||||||||||.|||||.||.||.||.|||.||||||||||||.|||.||||||||.||.||.|||||.||.
Sbjct 593 TGAATGGCAGCTATGAGGCTCTTTCGGGAGGCTGCACCTCAGAGGCCTTCGAGGACTTTACCGGTGGGGTCACT 666
Query 667 GAGTGGTACGAGTTGCGCAAGGCTCCCAGTGACCTCTACCAGATCATCCTCAAGGCGCTGGAGCGGGGCTCCCT 740
|||||||||||..|||..|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||.|
Sbjct 667 GAGTGGTACGACCTGCAGAAGGCCCCCAGCGACCTCTACCAGATCATTCTAAAGGCCCTGGAACGAGGCTCCTT 740
Query 741 GCTGGGCTGCTCCATAGACATCTCCAG-----CGTTCTAGACATGGAGGCCATCACTTTCAAGAAGTTGGTGAA 809
|||||||||||||||..|.|||||| | ||| ||..|.|||||.||.|||||.|||||..||||||.
Sbjct 741 GCTGGGCTGCTCCATTAATATCTCC-GATATCCGT----GATTTAGAGGCTATTACTTTTAAGAACCTGGTGAG 809
Query 810 GGGCCATGCCTACTCTGTGACCGGGGCCAAGCAGGTGAAC-TACCGAGGCCAGGTGGTGAGCCTGATCCGGATG 882
|||||||||.|||||||||||.||.||||||||||| ||| ||||..||||||..|||||.|||.|||||||||
Sbjct 810 GGGCCATGCGTACTCTGTGACGGGCGCCAAGCAGGT-AACTTACCAGGGCCAGCGGGTGAACCTAATCCGGATG 882
Query 883 CGGAACCCCTGGGGCGAGGTGGAGTGGACGGGAGCCTGGAGCGACAGCTCCTCAGAGTGGAACAACGTGGACCC 956
||||||||||||||.||.||||||||||..|||.|||||||.||||||||||..|||||||||||.||||||||
Sbjct 883 CGGAACCCCTGGGGTGAAGTGGAGTGGAAAGGACCCTGGAGTGACAGCTCCTATGAGTGGAACAAAGTGGACCC 956
Query 957 ATATGAACGGGACCAGCTCCGGGTCAAGATGGAGGACGGGGAGTTCTGGATGTCATTCCGAGACTTCATGCGGG 1030
.||||||||.||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 957 CTATGAACGAGAGCAGCTGAGGGTCAAGATGGAGGATGGGGAGTTCTGGATGTCGTTCCGAGACTTCATCCGTG 1030
Query 1031 AGTTCACCCGCCTGGAGATCTGCAACCTCACACCCGACGCCCTCAAGAGCCGGACCATCCGCAAATGGAACACC 1104
|.||||||...|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||.|||||.||||.||.|||||.|||
Sbjct 1031 AATTCACCAAACTGGAAATCTGCAACCTTACACCGGACGCCCTTAAGAGCAGGACCCTCCGGAATTGGAATACC 1104
Query 1105 ACACTCTACGAAGGCACCTGGCGGCGGGGGAGCACCGCGGGGGGCTGCCGAAACTACCCAGCCACCTTCTGGGT 1178
|||.|.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||.|.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1105 ACATTTTACGAGGGCACCTGGCGTCGGGGAAGCACCGCTGGAGGCTGCAGGAACTACCCAGCTACCTTCTGGGT 1178
Query 1179 GAACCCTCAGTTCAAGATCCGGCTGGATGAGACGGATGACCCGGACGACTACGGGGACCGCGAGTCAGGCTGCA 1252
.|||||.|||||||||||||||.||||.|||..|||||||.|.||||||||.|...||||.|||||.|||||||
Sbjct 1179 AAACCCCCAGTTCAAGATCCGGTTGGAGGAGGTGGATGACGCAGACGACTATGACAACCGGGAGTCGGGCTGCA 1252
Query 1253 GCTTCGTGCTCGCCCTTATGCAGAAGCACCGTCGCCGCGAGCGCCGCTTCGGCCGCGACATGGAGACTATTGGC 1326
|||||.||||.|||||.||||||||.|||||.|||.|.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 1253 GCTTCTTGCTGGCCCTCATGCAGAAACACCGCCGCAGGGAGCGTCGCTTTGGCCGGGACATGGAGACCATCGGT 1326
Query 1327 TTCGCGGTCTACGAGGTCCCTCCGGAGCTGGTGGGCCAGCCGGCCGTACACTTGAAGCGTGACTTCTTCCTGGC 1400
||.||.||.|||.|||||||||.||||||||.|||.|||| |.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1327 TTTGCAGTGTACCAGGTCCCTCGGGAGCTGGCGGGTCAGC---CTGTGCACTTGAAGCGTGATTTCTTCCTGGC 1397
Query 1401 CAATGCGTCTCGGGCGCGCTCAGAGCAGTTCATCAACCTGCGAGAGGTCAGCACCCGCTTCCGCCTGCCACCCG 1474
|||.||.||||||||||..||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||.|||..||||||||||.||||
Sbjct 1398 CAACGCTTCTCGGGCGCAGTCAGAGCACTTCATCAACCTTCGGGAAGTCAGCAACCGTATCCGCCTGCCGCCCG 1471
Query 1475 GGGAGTATGTGGTGGTGCCCTCCACCTTCGAGCCCAACAAGGAGGGCGACTTCGTGCTGCGCTTCTTCTCAGAG 1548
|||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1472 GGGAGTACATAGTGGTGCCCTCCACCTTCGAGCCCAACAAAGAAGGCGACTTCCTGCTGCGCTTCTTCTCAGAG 1545
Query 1549 AAGAGTGCTGGGACTGTGGAGCTGGATGACCAGATCCAGGCCAATCTCCCCGATGAGCAAGTGCTCTCAGAAGA 1622
||||..||||||||...|||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.|||||
Sbjct 1546 AAGAAGGCTGGGACCCAGGAACTAGATGACCAGATCCAGGCCAACCTCCCTGATGAGAAAGTTCTCTCTGAAGA 1619
Query 1623 GGAGATTGACGAGAACTTCAATGCCCTCTTCAGGCAGCTGGCAGGGGAGGACATGGAGATCAGCGTGAAGGAGT 1696
|||||||||.||.||||||||..||.|.|||||..||.||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.
Sbjct 1620 GGAGATTGATGACAACTTCAAGACCTTGTTCAGCAAGTTGGCAGGGGATGACATGGAGATCAGCGTCAAGGAGC 1693
Query 1697 TGCGGACAATCCTCAATAGGATCATCAGCAAACACAAAGACCTGCGGACCAAGGGCTTCAGCCTAGAGTCGTGC 1770
|.|.|||.|||.|.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1694 TACAGACCATCTTGAACAGGATCATTAGCAAACACAAAGACCTGCGCACTAATGGCTTCAGCCTGGAGTCGTGC 1767
Query 1771 CGCAGCATGGTGAACCTCATGGATCGTGATGGCAATGGGAAGCTGGGCCTGGTGGAGTTCAACATCCTGTGGAA 1844
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1768 CGCAGCATGGTGAACCTCATGGATCGAGATGGCAACGGGAAGCTGGGTCTGGTGGAGTTCAACATCCTGTGGAA 1841
Query 1845 CCGCATCCGGAATTACCTGTCCATCTTCCGGAAGTTTGACCTGGACAAGTCGGGCAGCATGAGTGCCTACGAGA 1918
|||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1842 CCGCATCCGAAATTACCTGACCATCTTCCGGAAGTTTGACCTGGACAAGTCTGGCAGCATGAGTGCCTATGAGA 1915
Query 1919 TGCGGATGGCCATTGAGTCGGCAGGCTTCAAGCTCAACAAGAAGCTGTACGAGCTCATCATCACCCGCTACTCG 1992
||.||||||||||.|||.|.||||||||||||||.||||||||||||.|.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1916 TGAGGATGGCCATCGAGGCTGCAGGCTTCAAGCTTAACAAGAAGCTGCATGAACTCATAATCACCCGCTACTCG 1989
Query 1993 GAGCCCGACCTGGCGGTCGACTTTGACAATTTCGTTTGCTGCCTGGTGCGGCTAGAGACCATGTTCCGATTTTT 2066
||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1990 GAGCCCGACCTGGCCGTGGACTTTGACAACTTTGTGTGCTGTCTTGTGCGGCTGGAGACCATGTTCCGGTTTTT 2063
Query 2067 CAAAACTCTGGACACAGATCTGGATGGAGTTGTGACCTTTGACTTGTTTAAGTGGTTGCAGCTGACCATGTTTG 2140
||||..||||||||||||.||||||||.||||||||||||||..|.|||||||||.|.||||||||.|||||||
Sbjct 2064 CAAACTTCTGGACACAGACCTGGATGGTGTTGTGACCTTTGATCTATTTAAGTGGCTCCAGCTGACTATGTTTG 2137
Query 2141 CA 2142
|.
Sbjct 2138 CC 2139