Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15373
- Subject:
- NR_040008.2
- Aligned Length:
- 2952
- Identities:
- 2071
- Gaps:
- 880
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GCTCTTCCTGGTTGGGCCCTGCCCTGAGCTGCCACCGGGAAGCCAGCCTCAGGGACTGCAGCGACCCCCAAACA 74
Query 1 -------------ATGTCGGAGGAGATCATCACGCCGGTGTACTGCACTGGGGTGTCAGCCCAAGTGCAGAAGC 61
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCCCTCCCCCAGGATGTCGGAGGAGATCATCACGCCGGTGTACTGCACTGGGGTGTCAGCCCAAGTGCAGAAGC 148
Query 62 AGCGGGCCAGGGAGCTGGGCCTGGGCCGCCATGAGAATGCCATCAAGTACCTGGGCCAGGATTATGAGCAGCTG 135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGCGGGCCAGGGAGCTGGGCCTGGGCCGCCATGAGAATGCCATCAAGTACCTGGGCCAGGATTATGAGCAGCTG 222
Query 136 CGGGTGCGATGCCTGCAGAGTGGGACCCTCTTCCGTGATGAGGCCTTCCCCCCGGTACCCCAGAGCCTGGGTTA 209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CGGGTGCGATGCCTGCAGAGTGGGACCCTCTTCCGTGATGAGGCCTTCCCCCCGGTACCCCAGAGCCTGGGTTA 296
Query 210 CAAGGACCTGGGTCCCAATTCCTCCAAGACCTATGGCATCAAGTGGAAGCGTCCCACGGAACTGCTGTCAAACC 283
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAAGGACCTGGGTCCCAATTCCTCCAAGACCTATGGCATCAAGTGGAAGCGTCCCAC----------------- 353
Query 284 CCCAGTTCATTGTGGATGGAGCTACCCGCACAGACATCTGCCAGGGAGCACTGGGGGACTGCTGGCTCTTGGCG 357
|||||||||||||||||||||
Sbjct 354 -----------------------------------------------------GGGGACTGCTGGCTCTTGGCG 374
Query 358 GCCATCGCCTCCCTCACTCTCAACGACACCCTCCTGCACCGAGTGGTTCCGCACGGCCAGAGCTTCCAGAATGG 431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 375 GCCATCGCCTCCCTCACTCTCAACGACACCCTCCTGCACCGAGTGGTTCCGCACGGCCAGAGCTTCCAGAATGG 448
Query 432 CTATGCCGGCATCTTCCATTTCCAGCTGTGGCAATTTGGGGAGTGGGTGGACGTGGTCGTGGATGACCTGCTGC 505
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 449 CTATGCCGGCATCTTCCATTTCCAGCTGTGGCAATTTGGGGAGTGGGTGGACGTGGTCGTGGATGACCTGCTGC 522
Query 506 CCATCAAGGACGGGAAGCTAGTGTTCGTGCACTCTGCCGAAGGCAACGAGTTCTGGAGCGCCCTGCTTGAGAAG 579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 523 CCATCAAGGACGGGAAGCTAGTGTTCGTGCACTCTGCCGAAGGCAACGAGTTCTGGAGCGCCCTGCTTGAGAAG 596
Query 580 GCCTATGCCAAGGTAAATGGCAGCTACGAGGCCCTGTCAGGGGGCAGCACCTCAGAGGGCTTTGAGGACTTCAC 653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 GCCTATGCCAAGGTAAATGGCAGCTACGAGGCCCTGTCAGGGGGCAGCACCTCAGAGGGCTTTGAGGACTTCAC 670
Query 654 AGGCGGGGTTACCGAGTGGTACGAGTTGCGCAAGGCTCCCAGTGACCTCTACCAGATCATCCTCAAGGCGCTGG 727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 671 AGGCGGGGTTACCGAGTGGTACGAGTTGCGCAAGGCTCCCAGTGACCTCTACCAGATCATCCTCAAGGCGCTGG 744
Query 728 AGCGGGGCTCCCTGCTGGGCTGCTCCATAGACATCTCCAGCGTTCTAGACATGGAGGCCATCACTTTCAAGAAG 801
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 745 AGCGGGGCTCCCTGCTGGGCTGCTCCATAGACATCTCCAGCGTTCTAGACATGGAGGCCATCACTTTCAAGAAG 818
Query 802 TTGGTGAAGGGCCATGCCTACTCTGTGACCGGGGCCAAGCAGGTGAACTACCGAGGCCAGGTGGTGAGCCTGAT 875
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 819 TTGGTGAAGGGCCATGCCTACTCTGTGACCGGGGCCAAGCAGGTGAACTACCGAGGCCAGGTGGTGAGCCTGAT 892
Query 876 CCGGATGCGGAACCCCTGGGGCGAGGTGGAGTGGACGGGAGCCTGGAGCGACAGCTCCTCAGAGTGGAACAACG 949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 893 CCGGATGCGGAACCCCTGGGGCGAGGTGGAGTGGACGGGAGCCTGGAGCGACAGCTCCTCAGAGTGGAACAACG 966
Query 950 TGGACCCATATGAACGGGACCAGCTCCGGGTCAAGATGGAGGACGGGGAGTTCTGGATGTCATTCCGAGACTTC 1023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 967 TGGACCCATATGAACGGGACCAGCTCCGGGTCAAGATGGAGGACGGGGAGTTCTGGATGTCATTCCGAGACTTC 1040
Query 1024 ATGCGGGAGTTCACCCGCCTGGAGATCTGCAACCTCACACCCGACGCCCTCAAGAGCCGGACCATCCGCAAATG 1097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041 ATGCGGGAGTTCACCCGCCTGGAGATCTGCAACCTCACACCCGACGCCCTCAAGAGCCGGACCATCCGCAAATG 1114
Query 1098 GAACACCACACTCTACGAAGGCACCTGGCGGCGGGGGAGCACCGCGGGGGGCTGCCGAAACTACCCAGCCACCT 1171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115 GAACACCACACTCTACGAAGGCACCTGGCGGCGGGGGAGCACCGCGGGGGGCTGCCGAAACTACCCAGCCACCT 1188
Query 1172 TCTGGGTGAACCCTCAGTTCAAGATCCGGCTGGATGAGACGGATGACCCGGACGACTACGGGGACCGCGAGTCA 1245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189 TCTGGGTGAACCCTCAGTTCAAGATCCGGCTGGATGAGACGGATGACCCGGACGACTACGGGGACCGCGAGTCA 1262
Query 1246 GGCTGCAGCTTCGTGCTCGCCCTTATGCAGAAGCACCGTCGCCGCGAGCGCCGCTTCGGCCGCGACATGGAGAC 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263 GGCTGCAGCTTCGTGCTCGCCCTTATGCAGAAGCACCGTCGCCGCGAGCGCCGCTTCGGCCGCGACATGGAGAC 1336
Query 1320 TATTGGCTTCGCGGTCTACGAGGTCCCTCCGGAGCTGGTGGGCCAGCCGGCCGTACACTTGAAGCGTGACTTCT 1393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337 TATTGGCTTCGCGGTCTACGAGGTCCCTCCGGAGCTGGTGGGCCAGCCGGCCGTACACTTGAAGCGTGACTTCT 1410
Query 1394 TCCTGGCCAATGCGTCTCGGGCGCGCTCAGAGCAGTTCATCAACCTGCGAGAGGTCAGCACCCGCTTCCGCCTG 1467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411 TCCTGGCCAATGCGTCTCGGGCGCGCTCAGAGCAGTTCATCAACCTGCGAGAGGTCAGCACCCGCTTCCGCCTG 1484
Query 1468 CCACCCGGGGAGTATGTGGTGGTGCCCTCCACCTTCGAGCCCAACAAGGAGGGCGACTTCGTGCTGCGCTTCTT 1541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485 CCACCCGGGGAGTATGTGGTGGTGCCCTCCACCTTCGAGCCCAACAAGGAGGGCGACTTCGTGCTGCGCTTCTT 1558
Query 1542 CTCAGAGAAGAGTGCTGGGACTGTGGAGCTGGATGACCAGATCCAGGCCAATCTCCCCGATGAGCAAGTGCTCT 1615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559 CTCAGAGAAGAGTGCTGGGACTGTGGAGCTGGATGACCAGATCCAGGCCAATCTCCCCGATGAGCAAGTGCTCT 1632
Query 1616 CAGAAGAGGAGATTGACGAGAACTTCAATGCCCTCTTCAGGCAGCTGGCAGGGGAGGACATGGAGATCAGCGTG 1689
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1633 CAGAAGAGGAGATTGACGAGAACTTCAAGGCCCTCTTCAGGCAGCTGGCAGGGGAGGACATGGAGATCAGCGTG 1706
Query 1690 AAGGAGTTGCGGACAATCCTCAATAGGATCATCAGCAAACACAAAGACCTGCGGACCAAGGGCTTCAGCCTAGA 1763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1707 AAGGAGTTGCGGACAATCCTCAATAGGATCATCAGCAAACACAAAGACCTGCGGACCAAGGGCTTCAGCCTAGA 1780
Query 1764 GTCGTGCCGCAGCATGGTGAACCTCATGGATCGTGATGGCAATGGGAAGCTGGGCCTGGTGGAGTTCAACATCC 1837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1781 GTCGTGCCGCAGCATGGTGAACCTCATGGATCGTGATGGCAATGGGAAGCTGGGCCTGGTGGAGTTCAACATCC 1854
Query 1838 TGTGGAACCGCATCCGGAATTACCTGTCCATCTTCCGGAAGTTTGACCTGGACAAGTCGGGCAGCATGAGTGCC 1911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855 TGTGGAACCGCATCCGGAATTACCTGTCCATCTTCCGGAAGTTTGACCTGGACAAGTCGGGCAGCATGAGTGCC 1928
Query 1912 TACGAGATGCGGATGGCCATTGAGTCGGCAGGCTTCAAGCTCAACAAGAAGCTGTACGAGCTCATCATCACCCG 1985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1929 TACGAGATGCGGATGGCCATTGAGTCGGCAGGCTTCAAGCTCAACAAGAAGCTGTACGAGCTCATCATCACCCG 2002
Query 1986 CTACTCGGAGCCCGACCTGGCGGTCGACTTTGACAATTTCGTTTGCTGCCTGGTGCGGCTAGAGACCATGTTCC 2059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2003 CTACTCGGAGCCCGACCTGGCGGTCGACTTTGACAATTTCGTTTGCTGCCTGGTGCGGCTAGAGACCATGTTCC 2076
Query 2060 GATTTTTCAAAACTCTGGACACAGATCTGGATGGAGTTGTGACCTTTGACTTGTTTAAGTGGTTGCAGCTGACC 2133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2077 GATTTTTCAAAACTCTGGACACAGATCTGGATGGAGTTGTGACCTTTGACTTGTTTAAGTGGTTGCAGCTGACC 2150
Query 2134 ATGTTTGCA----------------------------------------------------------------- 2142
|||||||||
Sbjct 2151 ATGTTTGCATGAGGCAGGGACTCGGTCCCCCTTGCCGTGCTCCCCTCCCTCCTCGTCTGCCAAGCCTCGCCTCC 2224
Query 2143 -------------------------------------------------------------------------- 2142
Sbjct 2225 TACCACACCACACCAGGCCACCCCAGCTGCAAGTGCCTTCCTTGGAGCAGAGAGGCAGCCTCGTCCTCCTGTCC 2298
Query 2143 -------------------------------------------------------------------------- 2142
Sbjct 2299 CCTCTCCTCCCAGCCACCATCGTTCATCTGCTCCGGGCAGAACTGTGTGGCCCCTGCCTGTGCCAGCCATGGGC 2372
Query 2143 -------------------------------------------------------------------------- 2142
Sbjct 2373 TCGGGATGGACTCCCTGGGCCCCACCCATTGCCAAGCCAGGAAGGCAGCTTTCGCTTGTTCCTGCCTCGGGACA 2446
Query 2143 -------------------------------------------------------------------------- 2142
Sbjct 2447 GCCCCGGGTTTCCCCAGCATCCTGATGTGTCCCCTCTCCCCACTTCAGAGGCCACCCACTCAGCACCACCGGCC 2520
Query 2143 -------------------------------------------------------------------------- 2142
Sbjct 2521 TGGCCTTGCCTGCAGACTATAAACTATAACCACTAGCTCGACACAGTCTGCAGTCCAGGCGTGTGGAGCCGCCT 2594
Query 2143 -------------------------------------------------------------------------- 2142
Sbjct 2595 CCCGGCTCGGGGAGGCCCCGGGGCTGGGAACGCCTGTGCCTTCCTGCGCCGAAGCCAACGCCCCCTCTGTCCTT 2668
Query 2143 -------------------------------------------------------------------------- 2142
Sbjct 2669 CCCTGGCCCTGCTGCCGACCAGGAGCTGCCCAGCCTGTGGGCGGTCGGCCTTCCCTCCTTCGCTCCTTTTTTAT 2742
Query 2143 -------------------------------------------------------------------------- 2142
Sbjct 2743 ATTAGTGATTTTAAAGGGGACTCTTCAGGGACTTGTGTACTGGTTATGGGGGTGCCAGAGGCACTAGGCTTGGG 2816
Query 2143 ------------------------------------------------------------------ 2142
Sbjct 2817 GTGGGGAGGTCCCGTGTTCCATATAGAGGAACCCCAAATAATAAAAGGCCCCACATCTGTCTGTGA 2882