Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15379
• Subject: XR_001750611.2
• Aligned Length: 1639
• Identities: 1204
• Gaps: 435

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ACAAAGGTGAATGCGGTTCATGAGGCTCGCTTGATTAAGAAGAGCTGAAACAGGAGCAAAGAGCAAAAGGCAAC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTGCAGCGAAAGCAAGGACTCAGGGAACCGGCAGACACAAGCAGCCTCTGCAGGTGTGCGAGCAGGATTGCTTC  148

Query    1  ----------------------------------------ATGGCCACTTCTTGGGGCACAGTCTTTTTCATGC  34
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCAACAAAAGCCTCCACCCAGCCACATCTTGGGAAAAGAATGGCCACTTCTTGGGGCACAGTCTTTTTCATGC  222

Query   35  TGGTGGTATCCTGTGTTTGCAGCGCTGTCTCCCACAGGAACCAGCAGACTTGGTTTGAGGGTATCTTCCTGTCT  108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGTGGTATCCTGTGTTTGCAGCGCTGTCTCCCACAGGAACCAGCAGACTTGGTTTGAGGGTATCTTCCTGTCT  296

Query  109  TCCATGTGCCCCATCAATGTCAGCGCCAGCACCTTGTATGGAATTATGTTTGATGCAGGGAGCACTGGAACTCG  182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCATGTGCCCCATCAATGTCAGCGCCAGCACCTTGTATGGAATTATGTTTGATGCAGGGAGCACTGGAACTCG  370

Query  183  AATTCATGTTTACACCTTTGTGCAGAAAATGCCAGGACAGCTTCCAATTCTAGAAGGGGAAGTTTTTGATTCTG  256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATTCATGTTTACACCTTTGTGCAGAAAATGCCAGGACAGCTTCCAATTCTAGAAGGGGAAGTTTTTGATTCTG  444

Query  257  TGAAGCCAGGACTTTCTGCTTTTGTAGATCAACCTAAGCAGGGTGCTGAGACCGTTCAAGGGCTCTTAGAGGTG  330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGAAGCCAGGACTTTCTGCTTTTGTAGATCAACCTAAGCAGGGTGCTGAGACCGTTCAAGGGCTCTTAGAGGTG  518

Query  331  GCCAAAGACTCAATCCCCCGAAGTCACTGGAAAAAGACCCCAGTGGTCCTAAAGGCAACAGCAGGACTACGCTT  404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCAAAGACTCAATCCCCCGAAGTCACTGGAAAAAGACCCCAGTGGTCCTAAAGGCAACAGCAGGACTACGCTT  592

Query  405  ACTGCCAGAACACAAAGCCAAGGCTCTGCTCTTTGAGGTAAAGGAGATCTTCAGGAAGTCACCTTTCCTGGTAC  478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTGCCAGAACACAAAGCCAAGGCTCTGCTCTTTGAGGTAAAGGAGATCTTCAGGAAGTCACCTTTCCTGGTAC  666

Query  479  CAAAGGGCAGTGTTAGCATCATGGATGGATCCGACGAAGGCATATTAGCTTGGGTTACTGTGAATTTTCTGACA  552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAAAGGGCAGTGTTAGCATCATGGATGGATCCGACGAAGGCATATTAGCTTGGGTTACTGTGAATTTTCTGACA  740

Query  553  GGTCAGCTGCATGGCCACAGACAGGAGACTGTGGGGACCTTGGACCTAGGGGGAGCCTCCACCCAAATCACGTT  626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTCAGCTGCATGGCCACAGACAGGAGACTGTGGGGACCTTGGACCTAGGGGGAGCCTCCACCCAAATCACGTT  814

Query  627  CCTGCCCCAGTTTGAGAAAACTCTGGAACAAACTCCTAGGGGCTACCTCACTTCCTTTGAGATGTTTAACAGCA  700
            ||||||||||||||                                                            
Sbjct  815  CCTGCCCCAGTTTG------------------------------------------------------------  828

Query  701  CTTATAAGCTCTATACACATAGTTACCTGGGATTTGGATTGAAAGCTGCAAGACTAGCAACCCTGGGAGCCCTG  774
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  829  --------------------AGTTACCTGGGATTTGGATTGAAAGCTGCAAGACTAGCAACCCTGGGAGCCCTG  882

Query  775  GAGACAGAAGGGACTGATGGGCACACTTTCCGGAGTGCCTGTTTACCGAGATGGTTGGAAGCAGAGTGGATCTT  848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  GAGACAGAAGGGACTGATGGGCACACTTTCCGGAGTGCCTGTTTACCGAGATGGTTGGAAGCAGAGTGGATCTT  956

Query  849  TGGGGGTGTGAAATACCAGTATGGTGGCAACCAAGAAGGGGAGGTGGGCTTTGAGCCCTGCTATGCCGAAGTGC  922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  TGGGGGTGTGAAATACCAGTATGGTGGCAACCAAGAAGGGGAGGTGGGCTTTGAGCCCTGCTATGCCGAAGTGC  1030

Query  923  TGAGGGTGGTACGAGGAAAACTTCACCAGCCAGAGGAGGTCCAGAGAGGTTCCTTCTATGCTTTCTCTTACTAT  996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  TGAGGGTGGTACGAGGAAAACTTCACCAGCCAGAGGAGGTCCAGAGAGGTTCCTTCTATGCTTTCTCTTACTAT  1104

Query  997  TATGACCGAGCTGTTGACACAGACATGATTGATTATGAAAAGGGGGGTATTTTAAAAGTTGAAGATTTTGAAAG  1070
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105  TATGACCGAGCTGTTGACACAGACATGATTGATTATGAAAAGGGGGGTATTTTAAAAGTTGAAGATTTTGAAAG  1178

Query 1071  AAAAGCCAGGGAAGTGTGTGATAACTTGGAAAACTTCACCTCAGGCAGTCCTTTCCTGTGCATGGATCTCAGCT  1144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179  AAAAGCCAGGGAAGTGTGTGATAACTTGGAAAACTTCACCTCAGGCAGTCCTTTCCTGTGCATGGATCTCAGCT  1252

Query 1145  ACATCACAGCCCTGTTAAAGGATGGCTTTGGCTTTGCAGACAGCACAGTCTTACAGCTCACAAAGAAAGTGAAC  1218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253  ACATCACAGCCCTGTTAAAGGATGGCTTTGGCTTTGCAGACAGCACAGTCTTACAGCTCACAAAGAAAGTGAAC  1326

Query 1219  AACATAGAGACGGGCTGGGCCTTGGGGGCCACCTTTCACCTGTTGCAGTCTCTGGGCATCTCCCAT--------  1284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct 1327  AACATAGAGACGGGCTGGGCCTTGGGGGCCACCTTTCACCTGTTGCAGTCTCTGGGCATCTCCCATTGAGGCCA  1400

Query 1285  --------------------------------------------------------------------------  1284
                                                                                      
Sbjct 1401  CGTACTTCCTTGGAGACCTGCATTTGCCAACACCTTTTTAAGGGGAGGAGAGAGCACTTAGTTTCTGAACTAGT  1474

Query 1285  --------------------------------------------------------------------------  1284
                                                                                      
Sbjct 1475  CTGGGGACATCCTGGACTTGAGCCTAGAGATTTAGGTTTAATTAATTTTACACATCTAATGTGAACTGCTGCCT  1548

Query 1285  -----------  1284
                       
Sbjct 1549  AACCACTCAAG  1559